首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

Seurat包的findmarkers函数只能根据划分好的亚群进行差异分析吗

这个问题有两个解决方案,第一个把已经划分为B细胞群的那些细胞的表达矩阵,重新走seurat流程,看看这个时候它们是否是否根据有没有表达目的基因来进行分群,如果有,就可以使用 findmarkers 函数...另外一个解决方案,就是人为划分,然后强行走seurat标准流程。...meta.data), cluster =sce@meta.data$seurat_clusters) head(phe) table(phe$cluster) 可以看到, 走默认代码,划分的是...这个时候,学员的问题可以简化为,不满意上图里面的0那个亚群,觉得它可以继续划分,比如根据感兴趣的目的基因,强行把0那个红色亚群继续划分为高低表达(或者是否表达)目的基因的亚群。...根据高低表达(或者是否表达)目的基因划分亚群 其实在这个FindMarkers函数的说明书里面,就有一个现成的例子: # Take all cells in cluster 2, and find markers

14.9K62

JS魔法堂:再识ASCII实体、符号实体和字符实体

本文打算对三类HTML实体及JS相关操作作进一步的整理和小结,若有纰漏请大家指正,谢谢。...三、3种实体类型                                        实体分为ASCII实体、字符实体和符号实体。...四、通过outerHTML,innerHTML,innerText,textContent和value操作实体    首先我们需要将3种实体类型分成两类,ASCII实体为一类,字符实体和符号实体为一类。...对于字符实体和符号实体      只能获取对应的字符,无法直接获取实体名和实体编号。 五、总结                                     若有纰漏请大家指正,谢谢。

2.2K80
领券