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MAF:Mutation Annotation Format格式简介

Mutation Annotation Format, 简称MAF, 是由TCGA制定的一种文件格式,用来存储突变注释信息。在TCGA中,对于突变数据有以下四种类型 ?..., 体细胞突变的原始文件,格式为VCF, 文件后缀为vcf.gz Aggregated Somatic Mutation, protected的突变注释文件,需要账号和权限才可以下载,格式为MAF, 文件后缀为...MAF和VCF类似,也是一个纯文本的格式,由\t分隔的许多列构成,从GDC下载的MAF文件的截图如下 ?...Tumor_Normal_Barcode,配对的正常样本的barcode 每一列的详细含义见如下链接 https://docs.gdc.cancer.gov/Data/File_Formats/MAF_Format...在实际使用中, 对于VCF文件,可以通过vcf2maf将其转换为MAF格式,在后续文章中会具体介绍该软件的用法。

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Python格式化函数format详解

format用法 相对基本格式化输出采用‘%’的方法,format()功能更强大,该函数把字符串当成一个模板,通过传入的参数进行格式化,并且使用大括号‘{}’作为特殊字符代替‘%’使用方法由两种:b.format...(a)和format(a,b) format 函数可以接受不限个参数,位置可以不按顺序 1、不带编号,即“{}” print('{} {}'.format('hello','world'))# 不设置指定位置...,按默认顺序 #hello world 2、带数字编号,可调换顺序,即“{1}”、“{2}” print('{0} {0}'.format('hello','world')) #hello hello...print('{0} {1}'.format('hello','world')) #hello world print('{1} {0}'.format('hello','world')) #...world hello print('{0} {0}'.format('hello')) #hello hello 3、带关键字,即“{a}”、“{tom}” print('{x} {y}'.format

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Python高效办公|format嵌套格式

项目由来 最近在用ArcGIS结合Python做一些批量处理的事情,其中一个场景就是根据用户指定的宽度,格式化输出数字,不足的部分补零,例如用户输入为3,则为001、002、003、......099。...之前我们说过这类格式化的写法,{:03d}。但是现在有一个问题,就是这里面的3是用户输入的,所以需要一个format,然后格式化数字,还需要一个format,这就是嵌套的问题。...之前时间紧,就没去查怎么format嵌套的写法,用了一个比较笨的方法,先把格式化写好,然后再格式化数字。...print(style.format(i)) format嵌套格式format嵌套格式化其实也很简单,在花括号外层再嵌套两个花括号即可。...外面加了两个花括号,使用一个format时,外面就还有一层花括号,这样就还能使用一次format函数。

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Python格式化字符串format

引言 Python中格式化字符串的方式有,一种是用%操作符来进行字符串格式化,一种是使用str.format()来进行字符串格式化,本文主要介绍str.format()方式,这种方式更主流,也是官方推荐的方式...格式化字符串 2.1 基本语法 格式化字符串包含用大括号{}括起来的“替换字段”,。大括号中不包含的内容被视为正常文本,会原样输出。...::= 2.2 位置参数标识符 格式化字符串中,默认情况下{}中可以不加位置标识符,即'{} {}'.format(a,.... 2.4 格式化说明(format_spec) 格式化说明包含了值表示的说明,包括字段宽度、对其方式、填充、小数准确率等,其以:开头。...b表示二进制格式,c表示将整数转换为字符,d表示十进制整数,o表示八进制格式,x,X表示十六进制格式,x大于9的字母为小写,X大于9的字母为大写。默认为d。 其它说明符的具体解释可参考文档[1]。

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python格式化输出之format用法

format用法(一种设置格式化输出的方式) 相对基本格式化输出采用‘%’的方法,format()功能更强大,该函数把字符串当成一个模板,通过传入的参数进行格式化,并且使用大括号‘{}’作为特殊字符代替...print('{0} is {0:>10.2f}'.format(1.123)) # 取2位小数,右对齐,取10位 10 1.123 is 1.123、多个格式化'b' - 二进制。...g' - 一般格式。将数值以fixed-point格式输出。当数值特别大的时候,用幂形式打印。'n' - 数字。当值为整数时和'd'相同,值为浮点数时和'g'相同。...将数值乘以100然后以fixed-point('f')格式打印,值后面会有一个百分号。...print() ... 5 5 5 101 6 6 6 110 7 7 7 111 8 8 10 1000 9 9 11 1001 10 A 12 1010 11 B 13 1011另,可在字符串前加f以达到格式化的目的

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