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fasta序列按指定格式输出

前言:有时在处理fasta文件时,我们需要序列按照规定的格式排列。 很多人应该遇到过需要将序列排列到一行上,或者每行按照规定的bp数显示。...我也经常遇到像60bp,70bp的不等长fasta序列共存于同一个fasta文件中的情况,为了避免不同长度对后面的处理造成影响,一般最好将格式统一。...biopython中默认是按照60bp每行输出的,如果去查查它的帮助文档,可以查到FastaWriter可以在写出文件中指定fasta序列的wrap(换行?)...数目: 我写了一个biopython版本的,可以用它指定的参数nwrap完成上面的两种操作,设置nwrap为0时即显示到一行上。...describe.add_argument("orgf",help="Original fasta")#原始fasta文件describe.add_argument("optf",help="Output fasta")#修改格式后的输出文件

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1、Python 日期时间格式输出

今天帮朋友写自动化脚本,又需要用格式日期,又忘记怎么写了,还是写到自己博客里面,方便日后需要的时候看一眼吧。So,临时加一篇 Python 的文章。...1、Python的time模块 import time print(time.time()) #输出的是时间戳 print(time.localtime(time.time())) #作用是格式化时间戳为本地的时间...: 下面是time.strftime的参数: strftime(format[, tuple]) -> string 将指定的struct_time(默认为当前时间),根据指定格式化字符串输出...python中时间日期格式化符号: %y 两位数的年份表示(00-99) %Y 四位数的年份表示(000-9999) %m 月份(01-12) %d 月内中的一天(0-31) %H 24小时制小时数...%X 本地相应的时间表示 %Z 当前时区的名称 %% %号本身 3、其它格式输出 (1)输出年月日时分秒 print(time.strftime('%Y-%m-%d %H:%M:%S',time.localtime

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【C++】输入输出流 ⑧ ( cout 输出格式控制 | 设置进制格式 - dex、hex、oct | 指定输出宽度 填充 - setw setfill | 指定浮点数格式 )

文章目录 一、cout 输出格式控制 1、cout 输出格式控制的两种方式 2、格式输出 控制符 二、指定输出进制 - dex、hex、oct 1、cout 输出进制设置 2、代码示例 - cout...- cout 指定输出宽度 / 填充 四、指定浮点数格式 - setprecision / setiosflags 1、cout 指定浮点数格式 2、代码示例 - cout 指定浮点数格式 指定输出格式...1、cout 输出格式控制的两种方式 在使用 cout 标准输出输出数据时 , 默认不指定 输出格式 , 系统会根据输出的类型 输出 默认的字符格式 , 如果开发者希望指定数据的 输出格式 , 如...: 指定 十六进制 / 八进制 显示 , 小数点位数要求 等 ; 可以使用以下两种方式 指定 输出格式 : 使用 cout 对象的 成员函数 指定输出格式 , 上一篇博客 【C++】输入输出流 ⑦ (...cout.setf 函数 就是指定 输出格式 ; 使用 控制符 指定输出格式 , 本篇博客中着重讲解 ; 2、格式输出 控制符 输出流 中 格式输出 控制符 : std::left : 左对齐 ;

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【C++】输入输出流 ⑧ ( cout 输出格式控制 | 设置进制格式 - dex、hex、oct | 指定输出宽度 填充 - setw setfill | 指定浮点数格式 )

文章目录 一、cout 输出格式控制 1、cout 输出格式控制的两种方式 2、格式输出 控制符 二、指定输出进制 - dex、hex、oct 1、cout 输出进制设置 2、代码示例 - cout...- cout 指定输出宽度 / 填充 四、指定浮点数格式 - setprecision / setiosflags 1、cout 指定浮点数格式 2、代码示例 - cout 指定浮点数格式 指定输出格式...1、cout 输出格式控制的两种方式 在使用 cout 标准输出输出数据时 , 默认不指定 输出格式 , 系统会根据输出的类型 输出 默认的字符格式 , 如果开发者希望指定数据的 输出格式 , 如...: 指定 十六进制 / 八进制 显示 , 小数点位数要求 等 ; 可以使用以下两种方式 指定 输出格式 : 使用 cout 对象的 成员函数 指定输出格式 , 上一篇博客 【C++】输入输出流 ⑦ (...cout.setf 函数 就是指定 输出格式 ; 使用 控制符 指定输出格式 , 本篇博客中着重讲解 ; 2、格式输出 控制符 输出流 中 格式输出 控制符 : std::left : 左对齐 ;

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