首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    Trimmomatic 数据过滤

    Trimmomatic 是一个很常用的 Illumina 平台数据过滤工具。支持 SE 和 PE 测序数据。...:1:TRUE LEADING:20 TRAILING:20 SLIDINGWINDOW:4:15 -threads 8 MINLEN:50 done 处理步骤及主要参数: Trimmomatic 过滤数据的步骤与命令行中过滤参数的顺序有关...,通常的过滤步骤如下: ILLUMINACLIP: 过滤 reads 中的 Illumina 测序接头和引物序列,并决定是否去除反向互补的 R1/R2 中的 R2。...SLIDINGWINDOW: 从 reads 的 5’ 端开始,进行滑窗质量过滤,切掉碱基质量平均值低于阈值的滑窗。...MAXINFO: 一个自动调整的过滤选项,在保证 reads 长度的情况下尽量降低测序错误率,最大化 reads 的使用价值。 LEADING: 从 reads 的开头切除质量值低于阈值的碱基。

    1.4K30

    illumina数据质控过滤

    背景 我们拿到测序的原始数据后,其实并不是所有的都是能用的数据,我们需要先做质控与过滤。首先认识下碱基的指标Q20(百分之一出错率),质量值>=Q20:好碱基,质量值<Q20:坏碱基。...fastqc -f fastq -o illumina_qc/ illumina_1.fastq.gz illumina_2.fastq.gz 碱基质量分布图 碱基含量分布图 二、数据过滤...学习目标: 1、知道为何要进行数据过滤; 2、掌握数据过滤的内容; 3、掌握数据过滤软件 fastp 以及 SOAPnuke 的使用; 4、了解其他过数据滤软件...; 利用 fastp 进行数据过滤 fastp 数据过滤 fastp -i illumina_1.fastq.gz -I illumina_2.fastq.gz -o clean.1.fq.gz -O...1、不要求100%精确,原则是不影响后续分析 2、可以根据最终结果,重新过滤数据 三、过滤完质控 过滤完质控 mkdir illumina_clean fastqc -f fastq

    2.8K30

    Vue.js入门教程-过滤

    1.2 注意 (1)Vue 中的过滤器 不能替代 methods、computed 或者 watch,因为过滤器 不改变真正的 data,而只是改变渲染的结果,并返回过滤后的版本。...(2)在很多不同的情况下,过滤器都是有用的,比如尽可能保持API响应的干净,并在前端处理数据的格式。在你希望避免重复和连接的情况下,他们也可以有效地封装成可重用代码块背后的所有逻辑。...————Vue的作者 三、定义过滤器 Vue 有两种不同的方式注册过滤器:①本地过滤器②全局过滤器。你可以跨所有组件访问全局过滤器,而本地过滤器只允许你在其定义的组件内部使用。...3.1 本地过滤器 你可以在一个组件的选项中定义本地的过滤器。 ? 3.2 全局过滤器 在创建Vue 实例之前全局定义过滤器。 ? 3.3 示例 下面这个例子用到了 capitalize 过滤器。...四、过滤器串连 4.1 说明 (1)过滤器能够使用管道(|)符号进行串连,并通过一系列过滤器转换一个值。 ?

    1.3K20

    vue.js过滤器的基本使用

    过滤器分为两种: 全局过滤器 自定义过滤器 使用过滤器,我们可以对数据进行格式化处理 过滤器 具体代码 代码解析: 全局过滤器 Vue.filter('formatMsg', function (msg.../g, arg); }); Vue.filter('formatAgain', function (msg, arg) { return msg + ",然而我还是很想念她"; }); 自定义过滤器...app", data: { msg: '我的生涯一片无悔,我想起那天夕阳下的奔跑,那是我逝去的青春' }, filters: { // 定义私有的过滤器...test: function (msg) { return msg + ", 青涩美好又有些疼痛的青春"; } } }) 注意: 过滤器可以多层引用...,多个过滤器用管道符 | 隔开 当全局过滤器与自定义过滤器同名时,优先使用自定义过滤器 如想了解更多的vue实例,请查阅我的vue笔记目录

    1.4K50
    领券