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获取基因有效长度N种方法

我总结了几种获取基因有效长度(或非冗余总外显子长度、总转录本长度方法,现整理如下: 一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言,RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到上游软件就是...之前一直以为featureCountsLength只是单纯基因长度,后来经过多种方法比较后发现其实Length这一列就已经是基因有效长度了...在文章后面我也会展示这几种方法比较结果) 因此,最方便做法就是在下游获取...首先看看从gtf文件中获取基因有效长度两种方法是否有差异。...gtf中获取efflen比较 总结: 获取基因有效长度最简便方法是直接从featureCounts或salmon输出文件中提取。...在没有上游原始输出文件情况下,也可以采取直接从gtf文件中计算方法,获取每个基因非冗余外显子总长度得到基因有效长度

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js中for in碰到Array.prototype问题

最近一个js项目中使用了for(let i in arr) {} 循环,for in好处就是被遍历对象可以是数组,可以是对象,就算是null和undefined都没有问题,不会报错,所以被大量使用,...自定义方法,结果项目开始报错,最后发现问题出现在for in时候会遍历枚举对象属性,包括prototype中enumerable为true对象属性,所以就出现问题了。...刚开始我找问题,发现给Array增加自定义方法可以用以下2种办法: Array.prototype.last = function () { console.log('do last'); }...但是我们不可能把所有使用Array.prototype都去设置一下,继续找找别的办法吧,继续发现了通过hasOwnProperty判断是是否为自有属性,2种写法如下: for (let idx in...()方法可以获取所有自有属性为数组,再使用es6for of去遍历,而且兼容对象,再改改: for (let idx of Object.keys(arr)) { let b = arr[idx

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四种获取fasta序列长度方法

在处理fasta序列时候,我们经常需要获取每一条fasta序列长度。今天小编就跟大家来分享四种获取fasta序列长度方法。 一、awk awk '/^>/{if (l!...fai文件如下,前两列正好就是fasta序列名字和长度。....fai文件每一列具体含义 第一列 NAME : 序列名称,只保留“>”后,第一个空白之前内容; 第二列 LENGTH: 序列长度, 单位为bp; 第三列 OFFSET :...第一个碱基偏移量, 从0开始计数,换行符也统计进行; 第四列 LINEBASES : 除了最后一行外, 其他代表序列碱基数, 单位为bp; 第五列 LINEWIDTH : 行宽, 除了最后一行外..., 其他代表序列长度, 包括换行符, 三、seqkit conda install seqkit seqkit fx2tab --length --name --header-line test.fasta

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如何获取yml配置数据?

当我们在yml进行一些配置时候,在Java中需要拿到yml中自定义配置,我们可以使用 @ConfigurationProperties 注解去读取yml中配置数据。...Token前缀字符 tokenPrefix: Sans- # 过期时间 单位秒 1天后过期=86400 7天后过期=604800 expiration: 86400 # 配置不需要认证接口...antMatchers: /index/**,/login/**,/favicon.ico 在配置类中获取prefix @Getter @Component @ConfigurationProperties...void setAntMatchers(String antMatchers) { this.antMatchers = antMatchers; } } 注意: prefix名称要和...yml配置名称一致 yml定义属性一定不要使用下划线,要使用驼峰命名,否则会导致获取yml属性为Null 重启项目 使用 @Autowired EncryptConfig encryptConfig

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python如何获取preview文件?

问题如下: 请教一下各位大佬,python如何获取preview文件? 二、实现过程 这里【提请问粘给图截报错贴代源码】给了一个思路:requests这个链接就可以了。...后来粉丝自己请求时候,发现了一个问题:我请求头都是按照抓到东西写,请问各位大佬为什么会报404。 后来【瑜亮老师】指导道:post请求,一般都会加上data,内容就在payload中。...顺利地解决了粉丝问题。 粉丝自己在请求参数时候,带了明文密码,这个还是不建议,也提醒下大家记得加密! 如果你也有类似这种Python相关小问题,欢迎随时来交流群学习交流哦,有问必答!...通过这个粉丝需求问答,我们确切感受到了AI助力Python实战需求能力了,我最近也是一直在接触AIGC,从最开始ChatGPT到最近火爆出圈Sora,也建立了自己AIGC分享群,目前也带动了500...以上AIGC爱好者一起学习,群每周都会分享AIGC相关内容,从认识AIGC,到使用AIGC,再到利用AIGC变现,我会带大家一起进军AIGC时代。

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Linux下设置Vim编辑器Tab长度行号

这时设置tab键占用长度,可以调节界面的松紧度,使其达到令人满意效果。 在针对个别用户和所有用户来设置时,与编辑SSH相应配置文件十分类似。...一.设置当前用户Tab键长度   编辑配置文件~/.vimrc即可 vim ~/.vimrc set tabstop=2 //设置Tab长度为2个字节   保存并退出 二.设置所有用户Tab...键长度   这里编辑配置文件/etc/vimrc,在文件末尾添加set tabstop参数即可 vim /etc/vimrc set tabstop=2 //设置Tab长度为2个字节 如果想要刚进入文件编辑界面时就能显示行号...与上面设置Tab长度一样,~/.vimrc对应当前用户,/etc/vimrc对应所有用户。...总结 以上所述是小编给大家介绍Linux下设置Vim编辑器Tab长度行号 ,希望对大家有所帮助,如果大家有任何疑问欢迎给我留言,小编会及时回复大家

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