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多组学在线分析工具

对于这样有多组学数据的情况,除了基本的单一组学的分析,也可以尝试着融合多个组学一起分析。所以,今天就介绍一个多组学分析工具。...由于是从开开始分析工具,所以第一步也就是来上传原始数据。在 OmicsAnalyst 当中主要支持五种高通量测序的数据分析。...在数据上传的同时,OmicsAnalyst 还对上传的数据进行了一些简单的处理比如:缺失值处理,低表达数据过滤,组间分析 由于也是在线工具类的,不会特别的智能,所以也一定要满足这个工具的要求。...关于批次效应的去除可以查看:[[批次效应去除工具]] 结果展示 相关网络构建 对于不同组学之间的关联性分析,可以通过相互作用网络来进行构建。...另外,如果是单一组学的常规分析的话,可以使用[[Quickomics-表达谱数据一站式分析工具]] 最后,如果是想要 TCGA的数据库进行聚类分析的话,则可以使用[[COMSUC-在线聚类分析工具]]这个工具直接进行

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在线网站技术分析工具

Wappalyzer:在线网站技术分析工具 Wappalyzer 网站是一个可以分析不同网站所使用的各种技术的工具,对于有自身经验的网站开发者而言可以通过代码开分析网站的构架和所采用的技术,不过现在你可以通过工具来获得网站技术的参数报告了...Wappalyzer 工具致支持分析目标网站所采用的平台构架、网站环境、服务器配置环境、JavaScript框架、编程语言等参数,同时还可以显示目标站点使用该技术的网站比例,例如有多少网站使用的是Wordpress...、有多少网站使用AddThis第三方服务,其他还有网页服务器、分析工具、CDN、留言系统、控制台、网络空间等等,可以让你从使用比例中得出目前最流行的技术。...,点选就能开启Wappalyzer的网站分析功能。...2.安装完Wappalyzer 后,浏览器网址列右侧会出现一个小图示,开启你要分析、检测的网页后,点选该图示即可看到网站使用的相关技术和服务。

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jvm 性能调优工具jstack

概述 jstack是jdk自带的线程堆栈分析工具,使用该命令可以查看或导出 Java 应用程序中线程堆栈信息。 Jstack 用法 image 参数说明: -l 长列表....-F 当’jstack [-l] pid’没有相应的时候强制打印栈信息 -m 打印java和native c/c++框架的所有栈信息....Jstack 使用 通过使用 jps 命令获取需要监控的进程的pid,然后使用 jstack pid 命令查看线程的堆栈信息。 image 通过 jstack 命令可以获取当前进程的所有线程信息。...死锁示例 下面通过一个例子,来演示 jstack 检查死锁的一个例子,代码如下: public static void deathLock() { Thread t1 = new Thread(...}; t1.setName("mythread1"); t2.setName("mythread2"); t1.start(); t2.start(); } 使用 jstack

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webgestalt:基因富集分析在线工具

在组学数据分析中,基因富集分析是最常用的方法之一,所有的基因数据分析最终都要落实到功能上去,富集分析作为一种最基础的功能研究方法,通过go, kegg pathway等不同的基因功能注释数据库,再结合对应的富集分析算法...富集分析的必要性和重要性不言而喻,有很多的成熟的软件可以来进行这样的分析,比如clusterProfiler, GSEA等等,然而这些工具的使用还是具备一定的门槛,对于没有编程经验的生物学家而言通过这些软件得到富集分析的结果并不是一件容易的事情...为了方便广大科研工作者进行富集分析,有很多的在线工具被开发出来,其操作简便,更易上手,最著名的当属DAVID这个网站了,有接近4000次的引用。...webgestalt是一个专注于富集分析在线网站,支持多种富集分析算法,而且涵盖的功能注释数据库较为全面,在今年5月份刚刚升级了版本,对数据库进行了更新。...富集分析的表格 ? 2. 富集分析的柱状图 ? 3. GSEA富集分析结果图 ? 4. GO DAG 有向无环图 ?

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微博话题在线分析工具

微博话题在线分析和评论在线分析类似,所不同的是,它支持从本地上传文件进行分析。 在上方 DataSelect 上传好文件后,下方 DataShow 实时展示分析结果。...下方 DataShow 第一个 Tab 是原始数据展示,后面的 Tab 就是分析的结果,包括趋势分析、情感分析、词云生成等诸多功能。基本和评论类似。...趋势分析可以按照月、天、小时、分钟维度进行实时可视化,除了发布微博数趋势,新加入了情感分析均值趋势。...属地分析 Tab 只对上传的 CSV 文件包括 location 字段有效,如果上传的 CSV 文件中不包含 location 字段,无法分析属地。...其他的 Tab 基本和 微博评论在线分析 类似,不再赘述~ 页面地址为: https://weibo-crawl-visual.buyixiao.xyz/topic-weibo-visual

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JVM 监控工具 jstack 和 jvisualvm 的使用

Jvm监控工具 一、jstack 介绍: jstack用于打印出给定的java进程ID或core file或远程调试服务的Java堆栈信息。...如果是在64位机器上,需要指定选项"-J-d64",Windows的jstack使用方式只支持以下的这种方式:jstack [-l] pid 如果java程序崩溃生成core文件,jstack工具可以用来获得...另外,jstack工具还可以附属到正在运行的java程序中,看到当时运行的java程序的java stack和native stack的信息, 如果现在运行的java程序呈现hung的状态,jstack...2、jstack dump当前线程状态 ?...3、根据当前抓取到的信息进行进一步的分析 二、jvisualvm远程监控tomcat 1、在 $CATALINA_HOME/bin/startup.sh 倒数第二行(也就是exec "$PRGDIR"/

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jstack分析多线程死锁,来吧老铁们

在线程a进入到invoke方法时锁住了A对象,线程b也进入到invoke方法锁住了B对象。...,看下结果: 当前线程:aThread | 进入了A 获取到资源 | 准备调用:B 当前线程:bThread | 进入了B 获取到资源 | 准备调用:A 2、查找进程日志 我们使用jps查找进程,再用jstack...dump的时候忘记加磁盘标识,结果dump的文件到C:\Users\Administrator这个目录里面去了 3、分析 下面我们看看日志里面是怎么记录的,首先,我们全文搜索【deadlock】关键字,...找到这些关键字,再找到具体的线程进行分析,最后根据线程死锁的执行的方法,去查看代码。 结束语 本篇到此把jstack命令介绍完了,下一篇将使用jmap的分析内存泄漏。

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在线工具

图片 在线工具地址 之前学习的时候,都会看到网络上一些在线工具的网站,比如获取时间戳,编码转化,正则表达式等等,这些对于一些初学者在电脑上没有安装相对应的工具,往往就会百度搜索在线工具,然后就能实现自己所要完成的目的...这些工具很是方便,或多或少都会用到。但一些在线工具并不能满足我日常开发中的个别需求,于是乎我也准备自己写一个这样的在线工具网站。...不做代码分析与演示,可自行在网站上测试与 clone 源码进行查看。...网站实现​ 上面所介绍的都是作为一个工具库的功能,我只是将其封装成一个在线工具使用,并非主要重点。而主要是对一些网站的功能实现,例如复制与下载等等。...最主要还是希望能成为我日常开发中常用的在线工具类,而不是简简单单 Demo 学习。

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metascape: 最强大的基因富集分析在线工具

metascape是一个web工具,提供了基因富集分析,蛋白质互作网络分析等多种功能,对应的文章发表在nature communications上, 链接如下 https://www.nature.com...,目前已有451篇文章引用了该工具,其可视化方式如下所示 1. circos plot ?...Analysis 对于单个基因列表,默认进行富集分析和PP分析,如下所示,输入基因列表,选定物种, 然后点击Express Analysis即可 ?...富集分析的柱状图 默认使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多个数据库进行富集分析,结果如下所示 ? 用柱状图的形式展示top15个显著富集的terms, 示意如下 ?...通过自定义分析,可以实现多个数据库的功能分析。该数据库目前支持人,小鼠,大鼠等10个物种的基因分析,是一个非常强大的基因功能分析工具

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LinkedOmics在线工具

今天给大家介绍一个闻着伤心听着落泪的网站,分析TCGA数据的工具这么多,我只服这一个,让人不得不感叹,做肿瘤真好!...注册后登录打开界面是这样的: 整个分析一共包括五步: (1)选择肿瘤类型,一共收录了32个癌种的各个类型的数据,比如我们选择肝癌LIHC: (2)选择数据类型,我们可以看到数据的类型有microRNA...,SNP,甲基化,临床数据和突变,我们先演示microRNA的,所以选第一个: 第二步里面还有一个可选项目:样本类型,可以进一步对样本根据分子分型、分期等数据进行分析,打开是这样的: 可以进一步选择...(5)选择统计方法,一般会给出几个选项,比如这个: 选好后接下来就是分析了, 我们看一下: 单击View按钮: 就可以看到hsa-mir-125a与临床信息的关系了,比如生存分析、TNM分期、种族等...当然,这里还有一个相关基因的功能富集,分别是ORA和GSEA: 我们选GSEA看看, 富集分析的选项包括了GO分析等: 我们选个KEGG pathway吧,提交后大家要等一下: 好了以后的界面:

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在线ps工具

随着互联网技术的发展,越来越多的工具可以在线使用,其中在线PS工具也受到了广泛欢迎。它不仅方便快捷,而且功能强大,让许多人在没有安装PS软件的情况下也能够进行图片处理。...在线使用:https://ps.gitapp.cn在线PS工具具有多种功能,可以满足用户不同的需求。首先,它可以进行照片修复,可以轻松消除照片中的瑕疪,使照片更加完美。...在线PS工具的实际应用价值也非常高。...总之,在线PS工具是一种非常实用的工具,它可以消除照片中的瑕疪、改变图像的颜色、亮度等,还可以添加水印、支持多人协作等。它具有多种功能、方便快捷、用户体验良好等优点,在实际应用中具有很高的价值。...如果你还没有使用过在线PS工具,不妨试试看,相信它会给你带来许多惊喜。

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分享一款JVM线程堆栈在线分析工具

如题所述,今天与大家分享的是如何分析JVM的线程堆栈以及如何从堆栈信息中找出问题。线程堆栈分析尽管不是初学者一门必备的技术,但是对于自身走向高程来说应该是必备的傍身技能。...这也是你花费最多分析时间的地方,因为Java栈跟踪向提供了你将会在稍后的练习环节了解到的导致诸多类型的问题的根本原因,所需要的90%的信息。...-l 8564 > 8564.stack 下载8564.stack并打包为zip格式上传到GCeasy,生成分析报告如下: ?...吃不吃精,喜不喜欢,界面话报告分析,总有一项让你喜欢。...命令 命令格式: jstack [ option ] pid jstack [ option ] executable core jstack [ option ] [server-id@]remote-hostname-or-IP

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