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基因的可变剪切_如何确认发现了可变剪切

什么是基因的可变剪切?...有些基因的前体mRNA(pre-mRNA)通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点)产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接(或者选择性剪切)(Alternative Splicing)。...常见的可变剪切可以分成6类: 1、外显子跳跃(Exon Skipping) 2、内含子保留(Intron Retention) 3、5’端可变剪接(Alternative 5′ splice Site)...可变剪切是调节基因表达和产生蛋白组多样性的重要原因,是导致真核生物基因与蛋白质数量差异效果的主要原因。...可变剪切预测软件 使用Cufflinks软件,与基因原有的剪接模型进行比较,对Mapped Data中的跨内含子Reads,进行新可变剪接事件(Alternative Splicing Events)预测

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PyQt 剪切板的使用

PyQt 中的 QApplication 的 clipboard() 方法会返回一个剪切板对象。通过这个对象可以向剪切板或者从剪切板进行文本,图片或者其他数据的写入和读出。...clipboard = QApplication.clipboard()#创建剪切板对象 clipboard.setText() #用于向剪切板写入文本 clipboard.setPixmap()#用于向剪切板写入图片...clipboard.text()#用于从剪切板读出文本 clipboard.pixmap()#用于从剪切板读出图片 QApplication.clipboard()返回的是操作系统的全局剪切板,我们通过它拷贝其它应用程序的数据...如果要通过剪切板操作Html文本,或者自定义数据,就还要使用到 QMimeData对象。下面以Html为例进行讲解,关于自定义数据的操作请再参考《PyQt拖放事件(二)》。...#写到剪切板 mimeData = QMimeData() mimeData.setHtml("Bold and Red") clipboard

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生信中的可变剪切噪起来

此外,还有很多方法可用于识别可变剪切。 很多方法识别可变剪切均是基于剪切图谱(splice graph)。...上中图是对可变剪切矩阵的箱线图可视化结果,可用于直观比较不同肿瘤类型中某种可变剪切类型的差异。...可变剪切图谱的应用与解读:下图是基于右上角选中基因(如FBLN2),构建的可变剪切图谱。...根据可变剪切矩阵,可以知道该基因发生的是外显子11跳过事件,而该剪切图谱就是阐释为什么发生的是外显子11跳过事件,而不是其他类型的可变剪切事件。...3.3 可变剪切事件与剪切因子表达的相关性分析 可绘制剪切因子表达与可变剪切事件PSI相关性的汇总圈图(上方的A图,绿色的连线表示为负相关,红色的连线表示正相关),也可绘制单个剪切因子表达与可变剪切事件

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弹性厚板的剪切锁定(shear locking)

Kirchhoff 薄板理论忽略了剪切变形, 即γzx = 0, γzy = 0。但对于厚板来说,不考虑剪切变形会产生较大的误差。下面结合厚板理论作简要分析。...(一) 弹性厚板理论 如图所示,同Timoshenko beam理论一样,实际的横向剪应力在板厚度方向的分布并不均匀,而变形假定横向剪应变在厚度方向为常量,因此在剪应力计算时引入剪切修正系数k,用以考虑应力分布的不均匀性...一般取k=5/6 (二) 厚板的剪切锁定(shear locking) 现在以4节点矩形单元为例,来简要说明剪切锁定现象。 缩减积分方法可以克服这一问题。...比如建立8节点矩形单元时,弯曲刚度矩阵采用3x3高斯积分,而剪切刚度矩阵采用2x2高斯积分。

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Android使用剪切板传递数据

在Activity之间传递数据还可以利用一些技巧,不管windows还是Linux操作系统,都会支持一种叫剪切板的技术,也就是某一个程序将一些数据复制到剪切板上,然后其他的任何程序都可以从剪切板中获取数据...使用剪切板会用到,ClipboardManager对象,这个对用剪切板会用到,ClipboardManager象用来操作剪切板,但是没有提供public的构造函数(单例模式),需要使用Activity.getSystemService...使用cm.getPrimaryClip()方法获取剪切板的ClipData数据对象,cd。 通过cd.getItemAt(0)获取到传递进来的数据。...存入数据:获取ClipboardManager,并对通过Base64类对MyData对象进行序列化,再存入剪切板中。...,剪切板为Android系统管理的,所以在一个地方存入的数据,在这个Android设备上任何应用都可以访问的到,但是正是因为此设备访问的都是同一个剪切板,可能会导致当前程序存入的数据,在使用前被其他程序覆盖掉了

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利用Python实现多重剪切

该程序要做的事情如下: 识别命令行参数; 什么时候保存剪切板内容? 什么时候删除剪切板内容? 如何呈现剪切板内容?全部呈现还是按照关键字呈现? 如何清空剪切板? 清空剪切板后在粘贴,会看到什么内容?...python3 # mcb.pyw - 程序的名称,用来保存和加载多重剪切板 # 导入用到的模块 import shelve, pyperclip, sys # 初始化 shelf 文件 mcb. mcbShelf...= shelve.open('mcb') # 获取命令行参数 command = sys.argv[1].lower() # TODO: 保存剪切板内容,并为每次复制的内容设置一个关键字. # TODO...: 列出所有关键字. # TODO: 删除某个关键字,并清除该关键字对应的内容. # TODO: 删除所有关键字,清空剪切板. # TODO: 根据命令行参数,显示某关键字对应的内容. mcbShelf.close...() 下面依次补充每个步骤的命令 保存剪切板内容,并为每次复制的内容设置一个关键字 if command == 'save': mcbShelf[sys.argv[2]] = pyperclip.paste

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揭秘可变剪切研究的本质

可变剪切指的是一个基因由于剪切方式的不同从而产生了不同的转录本,很多人对于可变剪切的研究有很多的困惑,比如有没有现成的软件可以研究单个样本中的可变剪切事件,多组间的可变剪切差异分析是基于什么原理?...从这个例子可以看出,判断可变剪切事件的本质,就是将从数据中得到的转录本序列和已知的转录本序列比较,去分析和鉴别符合各种可变剪切类型的转录本。...是否存在可变剪切事件,通过转录本组装和比较就可以得出结论,对于可变剪切的差异分析,其实就是对那些可变剪切产生的isofrom进行定量,然后进行差异分析,定量和差异分析是转录组分析的核心步骤,有很多成熟的软件可以使用...,而现有的可变剪切差异分析软件,比如rmats, 其原理也是一样,只不过定量的模型和差异分析的算法更加有针对性,是专门对可变剪切事件设计的。...综上,可变剪切分析包含以下4个步骤 转录本组装 可变剪切事件识别 可变剪切转录本定量 差异分析 在这几步中,核心是可变剪切事件的识别,重点是理解各种可变剪切事件的类型,对于定量,需要理解表达量的衡量标准

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PTA题解 --- 剪切粘贴(C语言)

今天是PTA题库解法讲解的第五天,今天我们要讲解剪切粘贴,题目如下: 解题思路: 为了解决这个问题,你可以按照以下步骤进行: 读取输入字符串:首先读取原始字符串。...进行操作:根据输入的次数,循环读取每次操作的详细信息,包括剪切的起始和结束位置,以及粘贴的前后字符串。...剪切和粘贴:对于每次操作,先进行剪切,然后根据给定的前后字符串确定粘贴位置,如果找不到精确匹配的位置,就将内容粘贴在字符串末尾。 输出结果:最后输出操作完成后的字符串。...after[]) {    int len = strlen(str), clipLen = 0, i, j, pos = -1;    char temp[201];        // 剪切...对于每次操作,首先执行剪切操作,然后根据提供的前后字符串确定粘贴位置,进行粘贴操作。最后输出编辑后的字符串。注意,代码考虑了当找不到匹配的粘贴位置时,直接在字符串末尾进行粘贴的情况。

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