随着 Kubernetes 越来越流行,不管大公司还是小公司都往 Kubernetes 迁移,每个公司最少有两套集群(测试和生产),但是多个集群就有多个 Kubeconfig 用户授权文件。虽然官方文档中有介绍多个 Kubeconfig 文件合并成一个 Kubeconfig,但是对于一些新手来说,看得不是很明白。
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群主想看到,HCC,CHC,CC这3组,跟healthy的分开比较,然后3个火山图,3个热图。
https://github.com/mingongge/Learn-a-Linux-command-every-day
该项目脱胎于 mergeKubeConfig[1] 项目,最早写该项目的目的是在一堆杂乱无章的 kubeconfig 中自由的切换。随着需要操作的 Kubernetes 集群越来越多,在不同的集群之间切换也越来越麻烦,而操作 Kubernetes 集群的本质不过是通过 kubeconfig 访问 Kubernetes 集群的 API Server,以操作 Kubernetes 的各种资源,而 kubeconfig 不过是一个 yaml 文件,用来保存访问集群的密钥,最早的 mergeKubeConfig[1] 不过是一个操作 yaml 文件的 Python 脚本。而随着 golang 学习的深入,也就动了重写这个项目的念头,就这样 kubecm[2] 诞生了。
高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。
Kubernetes 生态在很多企业广泛应用的当下,相信很多运维和开发人员都会同时管理和维护多个 Kubernetes 集群,比如:开发环境、测试环境、预发布环境、生产环境等等。
上面说的是打包.是指文件可以合并到一起.但不能压缩. 压缩有两种方式,一种是 gzip 一种是bzip2 (2念做two)
在linux下最常见的压缩文件通常都是以.tar.gz 为结尾的,除此之外还有.tar .gz .bz2 .zip等等
打包:指将多个文件(或目录)合并成一个文件,方便在不同节点之间传递或在服务器集群上部署。
文件操作是计算机的核心操作,不同系统之间都类似,主要包括文件创建,复制,粘贴,剪切,重命名,删除,修改,运行,解压缩,打包等。
TeamTalk介绍 项目框架 TeamTalk是蘑菇街的开源项目,github维护的最后时间是2015但是仍然是一款值得学习的好项目,麻雀虽小五脏俱全,本项目涉及到多个平台、多种语言,简单关系如下图 image.png 服务端: CppServer:TTCppServer工程,包括IM消息服务器、http服务器、文件传输服务器、文件存储服务器、登陆服务器 java DB Proxy:TTJavaServer工程,承载着后台消息存储、redis等接口 PHP server:TTPhpServer工程,te
前言: 最近刚安装了Linux系统, 所以学了一些最基本的操作, 在这里把自己总结的笔记记录在这里. 1,V8:192.168.40.10 V1:192.168.40.11 Linux ip:192.168.40.128 2,Linux是一个操作系统, 与windows的区别: Linux:图形化界面简单,性能很快,在企业中当做服务器来使用. Windows:图形化界面很炫,性能相对差,大众用户. windows的服务器: windows2003,windows2008,windows2012 3,Lin
原文:https://ostechnix.com/how-to-view-the-contents-of-an-archive-or-compressed-file-without-extracting-it/
虽然有点难度,但其实确实是可以的,对生信工程师来说,就是整理流程(把Linux命令替换成为R语言代码)工作量比较大。如果大家感兴趣而且确实有需求,不妨看看这个文档:《RNASeqR : RNA-Seq analysis based on one independent variable》
容器非常神奇。它们允许简单的进程表现得像虚拟机。在这种优雅的底层是一组模式和实践,最终使一切运作起来。在设计的根本是层。层是存储和分发容器化文件系统内容的基本方式。这种设计既出人意料地简单,同时又非常强大。在今天的帖子[1]中,我将解释什么是层以及它们的概念性工作原理。
日常工作中需要对日志文件进行分析,当日志文件过大时,Linux中使用vim、cat、vim、grep、awk等这些工具对大文件日志进行分析将会成为梦魇,具体表现在:
2、压缩后的文件太大,需要将cm-11.tar.gz分割成N个指定大小的文件,怎么办?一条命令搞定
file命令可查看文件是压缩文件或者test文件等,如file 1.txt 可查看1.txt是什么类型的文件 linux压缩打包介绍 在windows下我们接触最多的压缩文件就是.rar格式的了。但在linux下这样的格式是不能识别的,它有自己所特有的压缩工具。但有一种文件在windows和linux下都能使用那就是.zip格式的文件了。它不仅能节省磁盘空间而且在传输的时候还能节省网络带宽。 在linux下最常见的压缩文件通常都是以.tar.gz 为结尾的,除此之外还有.tar, .gz, .bz
一、HDFS分布式文件系统的shell操作 HDFS的shell操作基本和Linux的shell命令差不多,我这边重点介绍几个常用的文件操作的命令,其它更多的操作命令很少用到,当然你也可以通过“fs -help”查看所有命令。 重点在第二部分,介绍HDFS的基本工作机制。 1)–ls显示当前目录结构 -ls:该命令选项表示查看指定路径的当前目录结构,参数:-R递归显示目录结构,后面跟hdfs路径。 hadoop fs -ls / hadoop fs -ls hdfs://Hadoop1:9000/ha
大家好,我是邓飞。前一段时间有小伙伴在星球提问:想将不同版本的SNP数据合并,不想重新call snp,想把绵羊的V2和V4版本的数据合并,具体来说,是V2转为V4然后与V4合并。
做为一个k8s的学习或者使用者,避免不了会操作不同的k8s集群,每次操作不同集群的时候,可能都会使用--kubeconfig指定要操作集群的配置文件,这样显得格外的麻烦,我使用过一段时间的alias,通过alias做命令别名,但是依旧不是那么清爽,前段时间看到一个kubecm[1]工具,简洁高效,解决了多集群切换以及kubeconfig文件内容管理的问题。
搭建FTP,或者是搭建网络文件系统,这些方法都能够实现Linux的目录共享。但是FTP和网络文件系统的功能都过于强大,因此它们都有一些不够方便的地方。比如你想快速共享Linux系统的某个目录给整个项目团队,还想在一分钟内做到,怎么办?
一、linux系统简介 》 图片 命令格式:命令+参数+文件 图片 举例 tar -zxvf Data.tar.gz 二、文件夹与文件管理命令 1.pwd:printworking dire
文件 ls -rtl # 按时间倒叙列出所有目录和文件 ll -rt touch file # 创建空白文件 rm -rf dirname # 不提示删除非空目录(-r:递归删除 -f强制) dos2unix # windows文本转linux文本 u
Prometheus 是一个开源监控工具,实现了高维数据模型。Prometheus 有多种数据可视化模式,其中一种是集成 Grafana。Prometheus 以高效的自定义格式将时间序列数据存储在内存和本地磁盘上。
一、原理阐述 在 linux 下可以用几个最基本的命令制作一个自解压的程序。其原理是:利用 cat 命令可以将两个文件连起来(用>>追加也能达到同样效果),前一个文件是 shell 脚本,负责执行解压和安装;后一个文件是一个压缩包。 把这两个文件通过 cat 连接成一个新的可执行文件,前面是解压程序,后面是压缩包,当你执行这个自解压文件时,会先执行前面的 shell 脚本,利用 tail -n 取得后面的压缩包内容并往下执行解压和调用动作。这样就具有自动解压和安装的功能了。这里比较重要的命令是 tail -
不过对于其它物种,猫狗猪,甚至其它你叫不出来名字的昆虫,鱼类,这个分析策略还是蛮常见的。比如发表在Front. Genet., 18 March 2019 | https://doi.org/10.3389/fgene.2019.00196的文章
这次推文继续和大家分享近期一些实用的生信小工具。今天给大家带来的是Heng Li大神,最新写的一款小工具Bedtk。
在PCA(Principal Component Analysis)分析中,常用的工具有EIGENSOFT工具的smartpca,GCTA工具的PCA模块和R包中做PCA分析的princomp函数或glPCA功能。EIGENSOFT工具只支持linux系统,从安装到使用都很复杂。GCTA工具支持不同平台(wins/linux/mac),常用于群体遗传相关分析。在群体遗传中,R包从读取vcf文件、PCA分析到可视化,对内存要求较高。
众所周知,cat(concatenate)命令是一个用于查看、合并和复制文本文件的Unix命令,这个命令是GNU/Linux和类Unix操作系统中每天最常用的命令之一。如果你经常使用cat命令,那么你可以尝试一下’Ccat’。它与cat命令非常相似,ccat会显示带有语法高亮显示的内容。目前支持的语言是JavaScript,Java,Ruby,Python,Go,C和JSON。 安装 [root@py data]# wget --no-check-certificate https://github.com
$ yum install curl-devel expat-devel gettext-devel openssl-devel zlib-devel
PaddlePaddle还可以迁移到Android或者Linux设备上,在这些部署了PaddlePaddle的设备同样可以做深度学习的预测。在这篇文章中我们就介绍如何把PaddlePaddle迁移到Android手机上,并在Android的APP中使用PaddlePaddle。
这里设置的副本数只是记录在namenode的元数据中,是否真的会有这么多副本,还得看datanode的数量。因为目前只有3台设备,最多也就3个副本,只有节点数的增加到10台时,副本数才能达到10。
本次分享小菌带来的是关于在HDFS中shell的常用命令!
CNS图表复现之旅前面我们已经进行了9讲,你可以点击图表复现话题回顾。如果你感兴趣也想加入交流群,自己去:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞)找到我们的拉群小助手哈。
linux系统简介命令格式:命令+参数+文件修改命令行配色echo 'export PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\]\u \033[35;1m\t\033[0m \[\033[36;1m\]\w\[\033[0m\]\n\[\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"' >> ~/.bashrcsource ~/.bashrc文件夹管理或路径有关的符号.当前目录..上一级目录~家目录/只有当/在路径最前端时才是根目录,其他位置的都是目录层级分隔符|管道符:前面
其中有一个资源是最新的(2023年10月)NC文章《Genome-wide association analysis of plasma lipidome identifies 495 genetic associations》里面的数据在GWAS catalog ,里面的索引号是 GCST90277238-GCST90277416,但是这个公众号的小伙伴却不知道该如何批量下载, 或者说发现规律去写代码,而且手动整理好全部的链接后下载然后把它当做是宝贝来宣传。。。。
今天收到领导的一个需求:有一个rar压缩文件,文件里有许多个zip压缩包,每个包里有些个xlsx表格,现在需要提取并合并这些表到一张表里;下载下来解压一看,我去! 上百张表手工一张张合并得啥时候去了。越优秀的程序员越会偷懒,重复次数大于三次以上,手工是不可能的手工的,summer记录一波骚操作!
https://www.cnblogs.com/hongten/p/hongten_hadoop_hbase.html
本文分享嵌入式Linux系统使用的操作手册,其中详细内容,主要涵盖了:LinuxSDK安装、Linux系统镜像编译/生成、Linux系统文件替换说明、U-Boot命令说明和环境说明、内存分配说明、Linux设备驱动说明、主频调节说明、文件系统使用说明等,感兴趣的嵌入式工程师朋友可以查阅。
这是GATK Best Practice系列学习文章中的一篇,本文尝试使用: Gatk RNA -Seq Germline spns-indels Pipeline 来分析鼻咽癌(NPT) 分析流程如
据网络上不完全统计,Git的市场占有率基本上已经超过三分之二,如果此时还未使用Git进行代码托管,可能需要反思一下你的开发“环境”(技术比较守旧)了。
小白也能学会的 Linux 基础命令(中)
Linux以其强大的命令行称霸江湖,Shell命令是数据极客的必修兵器。探索性数据分析,在需求和数据都不太明确的环境下,使用各种命令进行一次探索与挖掘。从基础的文件查看到简单的统计,再到一些常用的探索性分析命令,其目的都只是为了更好的做数据分析与挖掘而已。 01 Shell命令行 对于经常和数据打交道的人来说,数据工程师应该也是常常和Linux打交道。Linux以其强大的命令行称霸江湖,因此,Shell命令也是数据极客的必修兵器。 利用Linux命令行的几个命令,就可以完成一些简单的统计分析工作,比如利用w
Linux是最适合开发的操作系统,它是把所有的操作权都交给了用户,有什么操作,就会呈现出什么样的格局。开放、自由、诚实,就是它最大的魅力。
为了写这个教程,我特意在唐医生的共享云服务器上面测试了,从头到尾运行过,验证过,你一定可以follow成功的哈! 首先是安装miniconda https://mirrors.tuna.tsinghu
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