因为一个R包让我不得不对电脑的R进行升级，正好整理下整个升级的过程。我们是在Rstudio中进行的升级操作。用到了包installr。...install.MikTeX, install.git,install.git, install.GraphicsMagick,install.ImageMagick, check.for.updates.R,...我们不在此一一介绍，今天主要介绍updateR这个函数： updateR()主要要来升级R软件，升级过程中会遇到下面的一些选项： 会提示当前版本已经后面最新的升级版本： ?...我们设置好后关闭Rstudio，再次打开Rstudio新版本的R就可以用了。 ? 当然，我们如果需要安装github的包的时候，Rtools软件老版本也不再适用，需要下载新版本的Rtools。...下载链接：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/。 ? 当然这个包有一个缺陷，暂时还不能完成Linux系统下的R升级。
Linux下我们安装软件，可能会需要安装各种包来支持，你可以从安装介质中找到rpm，手动安装，但最常用的，可能还是yum，省了很多烦恼。 但要知道yum同样需要升级，yum怎么升级？...碰巧看到杨大师的一篇文章《LINUX环境下如何重建yum源并更新》，介绍了整个操作。 1. ...升级所有包 yum update -y 注意： (1) 第一次运行yum安装软件前，建议更新yum。 (2) yum update -y改变软件设置和系统设置，系统版本内核都升级，需几分钟耐心等待。...另外，熟悉Linux的亲，可能还熟悉升级方式有upgrade，这里简述下区别： yum -y update：升级所有包同时，也升级软件和系统内核； yum -y upgrade：只升级所有包，不升级软件和系统内核
然后对“ 我非常喜欢《跟着菜鸟一起学R语言》这个微信公众号 ”这句话进行分词。 ?...分词结果为： "我" "非常" "喜欢" "跟" "着" "菜" "鸟" "一起" "学" "R语言" "这个" "微信" "公众" "号"...结果为： "我" "非常" "喜欢" "跟" "着" "菜鸟" "一起" "学" "R语言" "这个" "微信" "公众号" 但是如果我们不需要...“菜鸟”这个分词了怎么办，这个时候我们就可以使用deleteWords（）函数来从词典中删除这个分词。..."我" "非常" "喜欢" "跟" "着" "菜" "鸟" "一起" "学" "R语言" "这个" "微信" "公众" "号" 接下来我们使用一下搜狗的扩展词库
许多 R 包中含有数据集，可以通过data函数查看或加载这些数据集，通过?获得数据集的帮助文档。...基本数据集 基本包 datasets含有 100 多个数据集（R version 4.2.0），涉及医学、自然、社会学等各个领域。...Hair and Eye Color of Statistics Students ## # … with 94 more rows datasets中的数据集在 R...最后总结 data(package = "package_name")，查看 R 包里有哪些数据集 data(dataset_name)，加载数据集 ?dataset_name，查看数据集的帮助文档
最近在学习Linux，被命令行深深吸引了，陷入其中不能自拔，考虑到Windows上也有cmd命令行，但对新人来说不是很友好。这次我们就先讲一下Win+R运行框里的快捷键，绝对能提高不少效率！...什么是Win+R 防止有些小白看不懂，所以说明一些，使用Windows+R快捷键就可以打开如下图的运行窗口，在里面输入命令可以方便快捷地打开很多东西，而且本文的所有操作都是在这个运行框里输入的，不要与cmd...计算机管理 在Win+R运行框里输入compmgmt.msc，就会弹出Windows自带的计算机管理器，日常用到它的情况也比较多，如下图。 为什么说它重要呢，连它的每一个小的分项都自带命令！...快速打开文件和软件 一般的我们通过Win+R能直接打开的是office软件，但输入的命令名并不完全是这三个软件的名字，而是winword，excel，powerpnt。...（打开本机用户文件的目录） \ （打开资源管理器下的C盘） %temp%（打开临时文件夹） 控制面板 在Win+R运行框里输入control命令就会进入到控制面板，这个命令特别好用，尤其是升级到Win10
接上文，朋友告诉我，并不是只求一个 p 值，而是要计算许多 p 值，即批量进行 fisher 检验。
一、R软件下载 下载地址：https://cran.r-project.org/ 图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件，不是zip压缩格式文件，可以直接点击安装。...最后一步是设置系统环境变量： 四、R使用教程 图 2 R主界面 图 3 R中执行一个简单程序 五、RStudio使用教程 图 6 RStudio主界面 Source...可点击左上角的【File】→【New File】→【R Script】将Source区打开，如下图。 上面步骤将新建一个名为“Untitled1”的R代码文件（后缀名默认为.R）。...RStudio一些其它小技巧： 切换不同R版本 R允许多个版本共存，比如我在电脑上同时安装了3个版本（如下图）。通过RStudio可以很方便在各个R版本间进行切换。...老版本的R安装包下载链接，Windows：https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/，Mac： https://cran.r-project.org
使用系统：centos 6.4 64bit 在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png(“aa.png”)可以生成图片。...怎么解决： 1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。 2.不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。...:33 out.png -rw-r–r–. 1 root root 71 5月 13 10:32 test.r 到此这篇关于linux命令行下使用R语言绘图实例讲解的文章就介绍到这了,更多相关linux...命令行下使用R语言绘图内容请搜索脚本之家以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持脚本之家！...您可能感兴趣的文章:R语言绘制空间热力图实例讲解 R语言实现对数据框按某一列分组求组内平均值 R语言写2048游戏实例讲解 R语言归一化处理实例讲解 R语言的xtabs函数实例讲解 R语言基本语法深入讲解
安装R包 rm(list=ls()) options(stringsAsFactors = F) # BiocManager::install("msa") suppressMessages(library...www.uniprot.org/uniprot/P48754.fasta 同理，我们也获取到human的该基因蛋白序列: https://www.uniprot.org/uniprot/P38398.fasta R中继续操作...接下来才是重点 上面函数使用很简单，关键是我们得到了比对的结果，怎么提取我想要的位点呢 其实之前biostar上也有人提出了这个问题：https://www.biostars.org/p/467870/...所以不知道应该怎么去统计 ? 这里给出我自己的理解 首先明确，比对前后的差异在什么地方？...) > hg_site [1] "Q" 原以为这样就结束了，其实并没有 我测试了好多个，结果都对，但又随机挑选了一个502位点，发现了错误： 正确的应该是：ST，但我得到的是：SR
Linux 系统版本： [root@bogon ~]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.3.1611 (Core) 图 1 查看Linux....1.1 /usr/lib64/libssl.so.1.1 ln -s /usr/local/lib64/libcrypto.so.1.1 /usr/lib64/libcrypto.so.1.1 如上升级...openssl版本后, 导致某些服务编译安装失败的坑, 如果短时间解决不来, 最好回滚到之前的默认版本: openssl由默认的OpenSSL 1.0.1e升级到OpenSSL 1.1.1e后, 编译安装...openssh 出现下面报错: 由于openssl升级后, 可能会导致一个应用编译安装失败, 遇到的有nginx, keepalived等, 不得已的办法就是将openssl回滚到之前默认的版本状态..., 操作方法如下: 查看openssl, 然后删除升级后的openssl [root@localhost ~]# find / -name openssl [root@localhost ~]# rm
说明 R 语言是一个功能十分强大的工具，几乎绝大多数的数据分析工作都可以在 R 中完成，并且拥有很极强的绘图功能支持，能让你手中的数据以各种姿势进行可视化呈现，而且支持 Windows、Mac OS、Linux...R 语言简单实例 主要工作已经完成，让我们动动小手，优雅的单击（或双击）R Studio 图标，来感受一下R 语言的魅力。...小结 到此为止，R 语言就已经顺利的收入囊中了，恭喜你，又掌握了一门语言（的 Hello world）了。...【此处应有掌声】 接下来，会继续介绍 R 语言的基本用法和其中比较重要的函数使用方法，目标是能使用 R 语言对数据进行初步分析，以便能在生活和工作之中有所应用。...之所以开始写 R 语言相关的文章，是因为在工作中察觉到了数据的重要性，虽说应该让专业的人来做专业的事情，但如果对此一无所知，又怎么知道专业的人能够做什么事情呢，何况如果一点点小事情就要找数据的同学提需求未免不太合适
1 更加智能，自动添加多结果统计学差异 在某科研论坛上有一个问题，横线表示p值，可以在prism软件中画出，那每根柱子上面的线表示什么意思，怎么用Prism画出来？ ?...有一个小问题，如果我不想显示没有差异的比较该怎么办？ 那么请双击自动划线工具，点击Comparisons on graph，不勾选不想显示的比较两组，即可去除画线与ns： ? ?
过去一个月实验比较忙，很久没有写点东西了，今天要给amina画图，因此学习了一下R语言的基础画图。
有朋友问两个比值数据，怎么求他们的 p 值？ 例如，两组人，分别接受两种药物治疗，想知道疗效之间是否有差异，计算 p 值。 接受药物 1 治疗，30 人，其中 20 人有疗效，10 人没有疗效。...这种情况可以用 fisher 检验来探索，R 代码如下： fisher.test(matrix(c(20, 10, 10, 20), ncol = 2)) ## ## Fisher's Exact
R的版本升级比较频繁，很多R包对R版本的要求也比较高，我的R还停留到3.4版本，完全跟不上了。...又懒得卸载原来的R再下载新的，搜了一下，以下方法实测好用（来自https://zhuanlan.zhihu.com/p/39349696）： # install.packages('devtools')
其实，我们还可以在 R 里直接模拟出符合特定分布的数据，R 提取了一些以“r”开头的函数来实现，常见的有下面这 4 个： rnorm，生成服从正态分布的随机数 runif，生成均匀分布的随机数 rbinom...，生成服从二项分布的随机数 rpois，生成服从泊松分布的随机数 例如： r1 = rnorm(n = 1000, mean = 0, sd = 1) r2 = runif(n = 1000, min...= 0, max = 100) r3 = rbinom(n = 1000, size = 100, prob = 0.1) r4 = rpois(n = 1000, lambda = 1) 正态分布...hist(r1) 均匀分布 hist(r2) 二项分布 hist(r3) 泊松分布 hist(r4) 写在最后 模拟数据有些时候是非常很有用的，特别是在学习统计作图时。
今天继续学习R语言基础的R包使用，以R包：dplyr为例 数据准备 01 R包的安装 install.packages(“dplyr”) 或BiocManager::install(“dplyr”)...#务必要打引号 02 R包的调用/加载 library(dplyr) 或require(dplyr) #这里不用引号 部分人可能会因为镜像的问题失败，解决方法https://mp.weixin.qq.com...:102),] 这里的“,”怎么理解呢，在我们上一期推文中提到，提取元素时z[x,y]指代提取z中第x行，第y列，如果我们只需要提取行，则应该写作z[x,],同理，如果只需要提取列，应该写作z[,y]...经过这几期的R语言基础，你应该能够入门R了，渐渐的也要自己去学会看帮助文档，去搜报错，还记得怎么搜命令和R包的帮助文档吗？ ?...+命令 #搜命令帮助文档 help(package='R包') #搜R包帮助文档 如果你能独立处理这些问题，那么恭喜你，你的R应该没问题啦！ 应该没问题了！！！！吧？
学习生信时，最常用的可视化软件就是R，可大家在使用的时候又好像用的是Rstudio，究竟什么是R和Rstudio？ R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。...RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。...01 安装R 进入R的官网https://www.r-project.org/ 第一步 点击红框中的download R 第二步 在镜像这里中选择第一个 第三步 接下来按照红框点点点就能完成R的安装...第四步 第五步 R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。...1.显示文件列表 dir() #查看工作路径下文件，类似于Linux系统下的ls list.files() #同上 示例 2.加减乘除 和其他编程语言相同，直接输入即可 示例 3.赋值 赋值符号
一、R语言安装 首先进入官网：https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows，即可开始下载
导语 GUIDE ╲ 你是否有过这样的困扰：想使用一个R包，但由于没有root权限而感到束手束脚？ 别慌……你只需要用自己的账户重新安装一款R软件，进入到自己目录下的R就可以自由安装R包啦！...背景介绍 非Root权限的账户在linux上安装R时，会遇到各种各样的问题，小编作为资深“踩坑”专家，今天就好好为大家“排排坑”！...配置环境所需文件 在配置环境时，你可能用到的文件及下载地址有（可以直接用wget+下载地址获取）： 环境配置 01 安装R语言（以3.6.2 version为例） 首先将R-3.6.2.tar.gz.../xz-5.2.2/lib -Wl,-rpath=/your/path/bzip2-1.0.6/lib -Wl,-rpath=/your/path/xz-5.2.2/lib make instal R语言安装成功后...，就可以进入到自己路径下的R，去尽情安装你喜欢的R包啦。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
