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Linux Shell工具篇 - 文本排序工具sort

介绍 sort命令在Linux里非常有用,它将文本文件内容进行排序,并将排序结果标准输出或重定向输出到指定文件。...语法 1 sort (options) 参数 选项 说明 -n number,依照数值的大小排序 -r reverse, 以相反的顺序来排序 -t 分隔字符 设置排序时所用的分隔字符, 默认空格是分隔符...-k 指定需要排序的列 -d 排序时,处理英文字母、数字及空格字符外,忽略其他的字符 -f 排序时,将小写字母视为大写字母 -b 忽略每行前面开始出的空格字符 -o 输出文件 将排序后的结果存入指定的文件...-u 意味着是唯一的(unique),输出的结果是去完重了的 -m 将几个排序好的文件进行合并 参数:指定待排序文本文件 演示 数据文件准备:sort.txt 1234567 张三 30 李四...数字升序去重 先按照“空格分割,然后按照第2列数字升序排序,最后对所有列去重: 1 sort -t " " -k2n,2 -uk1,2 sort.txt 运行效果 注意: 先排序再去重 3.数字升序去重结果保存到文件

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Linux下的文本排序让我很意外

我分享给大家的ngs流程里面经常是需要制作配置文件,里面的每个样品名字都有两个测序文件,因为目前都是双端测序,制作配置文件的过程其实就是Linux下的文本处理,代码如下所示: echo A_{1..25...这个文本处理的结果如下所示: A_10_1.fq.gz A_10_2.fq.gz A_11_1.fq.gz A_11_2.fq.gz A_1_1.fq.gz A_12_2.fq.gz...fq.gz A_12_1.fq.gz A_1_2.fq.gz A_2_1.fq.gz A_22_2.fq.gz A_22_1.fq.gz A_2_2.fq.gz 出现了少量样品的排序混乱情况...引用: (公众号推文) linux命令行文本操作一文就够 (公众号推文)linux系统环境变量一文就够 (公众号推文)构建shell脚本一文就够 (公众号推文) conda管理生信软件一文就够 shell...中的扩展(Expansions) https://opengers.github.io/linux/linux-shell-brace-parameter-command-pathname-expansion

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Linux文本

我之前已经用文本编辑器修改过文本。现在,我们要深入理解所谓的“文本”。...(说句题外话,如果看过骇客帝国的话,一定会对文本流印象深刻。) ?...命令行随后调用/bin/ls得到结果("a.txt"),最后这个输出的文本流("a.txt")流到屏幕,显示出来,比如说: a.txt 假设说我们不想让文本流流到屏幕,而是流到另一个文件,我们可以采用重新定向...比如cat命令,它可以从标准输入读入文本流,并输出到标准输出: $cat < a.txt 我们将cat标准输入指向a.txt,文本会从文件流到cat,然后再输出到屏幕上。...a.txt中的文本先流到cat,然后从cat的标准输出流到wc的标准输入,从而让wc知道自己要处理的是a.txt这个字符串。 Linux的各个命令实际上高度专业化,并尽量相互独立。

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关于文本排序的那些事

这里讨论的文本排序不是一个排序算法,而是作为某个排序算法的底层依赖,常常在多语言环境下需要考虑,比如说中文的排序,日文的排序。...本文讨论的文本排序就属于本地化范畴。 一个系统要做到全球化,需要仔细考虑文本排序,因为文本排序可能会影响到系统的架构。...之前就遇到过一个关于文本排序的问题,问题的原型是: 有一个电商平台,商家可以在平台上开店,在商家的后台产品管理界面,商家看到的产品列表默认以名字排序。...编程语言的支持 对于文本排序,各个开发语言也都有很好的支持。...文本搜索:字典树,Trie,按照字典排序。具体可以阅读:看动画轻松理解「Trie树」。

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一个命令帮你对文本排序

前言 在Linux下,有时候需要对文本内容进行排序,例如按照字典顺序排序,按照数字排序或者按照特定列排序等等。今天我们就借助一个命令-sort来满足我们对文本排序的需求。...按照字典顺序排序 假如有文本内容test1.txt如下(偷偷问一句:你在使用哪个linux发行版?)...: Debian Gentoo Gentoo CentOS Fedora ubuntu Kali redhat Arch OpenSuse 现在要对文本内容按照字典升序排序,只需使用下面的命令即可:...例如: sort -c test1.txt #打印结果,并告知无序开始的行数 sort -C test1.txt #不打印结果,但是命令的返回结果为1 合并已排序文本 可以使用-m选项来合并已经排好序的文本...例如: sort -m file1 file2 总结 以上就是使用sort命令对文本进行排序的常见使用方法,更多内容可使用man命令进行查看。

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Linux-sort排序

概述 sort命令是在Linux里非常有用,它将文件进行排序,并将排序结果标准输出。sort命令既可以从特定的文件,也可以从stdin中获取输入。...---- 语法 sort (选项) (参数) 选项 -b:忽略每行前面开始出的空格字符; -c:检查文件是否已经按照顺序排序; -d:排序时,处理英文字母、数字及空格字符外,忽略其他的字符;...-f:排序时,将小写字母视为大写字母; -i:排序时,除了040至176之间的ASCII字符外,忽略其他的字符; -m:将几个排序号的文件进行合并; -M:将前面3个字母依照月份的缩写进行排序...; -n:依照数值的大小排序; -o:将排序后的结果存入制定的文件; -r:以相反的顺序来排序; -t:指定排序时所用的栏位分隔字符; +-<...using GNU software: For complete documentation, run: info coreutils 'sort invocation' ---- 栗子 sort将文件/文本的每一行作为一个单位

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Linux文本处理

cat命令 cat 命令可以用来显示文本文件的内容(类似于 DOS 下的 type 命令),也可以把几个文件内容附加到另一个文件中,即连接合并文件。...cat 文件名 ------查看文本内容 image.png cat -n 文件名 ---------- 显示行号。...image.png cat -A 文件名 ---------- 查看文本中的所有隐藏符号,包括回车符($)、Tab 键(^I)等 image.png more命令 more 命令可以分页显示文本文件的内容...不仅如此,为了方面用户浏览文本内容,less 命令还提供了以下几个功能: 使用光标键可以在文本文件中前后(左后)滚屏; 用行号或百分比作为书签浏览文件; 提供更加友好的检索、高亮显示等操作; 兼容常用的字处理程序...查看 文本最后 3 行的数据内容。 image.png

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Linux文本编辑命令

1.cat 用于查看纯文本文件 格式:cat[选项][文件] [root@linuxprobe ~]# cat -n initial-setup-ks.cfg 1 #version=RHEL7...格式:tr[原始字符][目标字符] 很多时候我们想快速替换文本中的一些词汇,又或者把整个文本内容都进行替换,如果进行手工替换,难免工作了太大,尤其是需要处理大批量的内容时,进行手工替换更是不现实。...这时,可以用cat命令读取待处理文本,然后通过管道符,把这些内容传递给tr命令进行替换操作 [root@linuxprobe ~]# cat anaconda-ks.cfg| tr [a-z] [A-Z...、字数、字节数 格式:wc[参数]文本 -l 只显示行数 -w 只显示单词数 -c 只显示字节数 [root@linuxprobe ~]# wc -l /etc/passwd 38 /etc/passwd...格式:cut[参数]文本Linux中如何准确的提取最想要的数据,一般而言,按基于“行”的方式,来提取数据比较简单,只需要设置好要搜索的关键词即可。

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Linux grep 文本搜索工具

前言grep 是一个常用的文本搜索工具,通常用于在文本文件中查找特定模式或字符串。它的名字是 "global regular expression print" 的缩写。...可以帮助你在文本文件中查找特定的内容,无论是简单的字符串还是复杂的正则表达式模式。基本用法grep pattern filenamepattern:要搜索的正则表达式模式或字符串。...,而不显示匹配行grep -l pattern filename显示只包含匹配文本的文件名,而不显示匹配行:grep -l "pattern" directory/*-E:使用扩展的正则表达式语法grep...():捕获组,用于捕获一个子表达式中的匹配文本,以便后续引用。例如,(abc)+ 匹配 "abc"、"abcabc"、"abcabcabc" 等。^:匹配字符串的开头(或行的开头,如果使用多行模式)。...://[^\s]+" file.txt匹配空白行:匹配空白行:grep "^\s*$" file.txt匹配引号内的文本:匹配双引号内的文本:grep "\"[^\"]*\"" file.txt匹配单引号内的文本

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linux(六)之文本操作

接下来我们一起来看一下再linux中怎么去对文本进行操作的 一、文本文件 既然要操作文本,所以我们要对文本有一个了解,那什么是文本文件呢。 文本文件是一种由若干行字符构成的计算机文件。...文本文件存在于计算机文件系统中。通常,通过在文本文件最后一行后放置文件结束标志来。 文本文件通常有系统配置文件,网页,程序源代码等等。...ASCII码进行排序 a:97 A:65   2.2.2、举例   cat可以同时显示多个文件到屏幕中 cat /etc/passwd...举例: 显示/etc/passwd文件的倒数第五行到倒数第十行的内容 tail -10 /etc/passwd | head -5 2.5、sort 读取文件中的内容,按行排序。...读取管道中的内容,按行排序。 可以加选项“-u”,表示重复行(相同并且相邻则视为重复行)只显示一次。 举例: 提取系统中所有的用户名,按用户名(行)排序

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