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Bash 读写文件 | Linux 中国

安装 Bash 如果你在使用 Linux,你可能已经有了 Bash。如果没有,你可以在你的软件仓库里找到它。...命令来将一个文件读入,这个行为称为 “sourcing”,英文原意为“一次性(试)采购”、“寻找供应商”、“获得”等,考虑到 Bash 的语境和发音,我建议可以翻译为“援引”,或有不当,供大家讨论参考...先用管道把它传送到一个合适的解析器是 Bash 读取数据的常用方法。例如, 假设 include.sh 是一个配置文件, 它的键和值对一个等号(=)分开....你可以 awk 甚至 cut 来获取值: #!.../stream.sh 42 Bash 将数据写入文件 无论你是要存储用户用你的应用创建的数据,还是仅仅是关于用户在应用中做了什么的元数据(例如,游戏保存或最近播放的歌曲),都有很多很好的理由来存储数据供以后使用

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把bam文件读入R,并且转为grange对象

假如你的Windows电脑有个bam文件,不想传输到linux服务器去使用samtools等命令行工具来探索它,就可以使用R语言!...有成熟的R包可以把bam文件读入R,比如Rsamtools,很简单的代码: library(Rsamtools) bamFile="alignResults.BAM" quickBamFlagSummary...genbioconductor/html/Rsamtools.html bam <- scanBam(bamFile) bam 值得注意的是,这里我虽然不再演示了,但是作为初学者的你,应该是知道 但是把读入的数据变成...关于 grange对象 三年前我在生信菜鸟团博客就多次强调过这个重点了,在R里面处理生物信息学数据是躲不过这个定义的,有点类似于各式各样的生物信息学文件格式,是一个标准。...length GRanges对象还有很多其它类型的操作,非常好玩的,split,shift,resize,flank,reduce,gaps,disjoin,coverage 其它求交集并集和都可以,

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Python中Json文件读入和写入以及simplejson

在python中使用Json Import json .json文件读入 with open(filePath,'r')as f: data = json.load(f) data是字典类型...可以通过for k,v in data.items()来遍历字典 .json文件的写入 首先存放为.json类型的文件一般是k-v类型的,一般是先打包成字典写入 jsFile = json.dumps...函数1dumps(dict):将python字典json化,接收参数为字典类型 函数2sort_keys:设置是否排序字典 函数3dump():对文件对象的处理 函数4 loads(str)解析json...的字符串 函数5 load() from StringIO import StringIO io = StringIO() #创建文件流对象 json.dump(['cynthia istesting...'], io) #把 json编码数据导向到此文件对象 io.getvalue() #取得文件流对象的内容 from StringIO import StringIO io = StringIO(

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linux中vi编辑器保存文件命令_linuxvi编辑文件

工具: Linux 方法: 1、首先进入Linux的命令行界面.在目录下创建一个用于测试的文本文件(touch filename).这里就新建了一个test12文本文件.当然这个名字是可以随便取得....2、”vi test12″命令进入vi命令行模式(vi filename)....如果要想编辑文本文件.必须要转换到插入模式下,也就是按一下键盘上的”i”就可以了.这样就可以编辑文本,删除文本中的内容.按键盘上的上下左右键.来回移动了.就跟在windows 系统中编辑文本一样. 3...6、查找 ”/”加上要查找的内容.例如”/hello”或者是”?hello”也是可以的. 7、替换   「r」:替换光标所在处的字符。 ,按一下”r”然后输入要即可.

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linux通配符取数据文件,Linux 通配符「建议收藏」

概述 本章节主要介绍关于linux通配符的用法,熟练运用通配符可以提高工作效率并且可以简化一些繁琐的处理步骤。...例:只查询字母文件 ll [a-zA-Z] 例:查询以“.log”结尾且“.log”前只有两个字符的文件且第二个字符是数字 ll?...[0-9].log “^” 表示匹配结果取反的意思,注意这个通配符必须要在[]中使用 例:查询不是以“.log”结尾的文件 ll*[^txt]* “{}” 表示符合括号内包含的多个文件 例:查询‘....log’和“.txt”结尾的文件 ll {*.log,*.txt} 注意: “.”这个符合比较特殊,如果匹配的条件加上了该符合那么说明查询结果文件就包含带“.”的文件 例如前面的“^”的例子,如果我这样查询...[^txt]*”,那么结果就不一样了 删除操作 例如:删除a、b、c和以.txt结尾的文件 rm-f {[abc],*.txt} 总结 当然既然可以查询当然也可以使用通配符匹配的方式进行移动文件,如果需要在存在很多文件文件夹中移动某些类型的文件那么使用通配符匹配的效率就显而易见了

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ranger 在 Linux 文件的海洋中导航

ranger 是一款独特且非常方便的文件系统导航器,它允许你在 Linux 文件系统中移动,进出子目录,查看文本文件内容,甚至可以在不离开该工具的情况下对文件进行修改。...它提供了一个多级的文件显示,让你很容易看到你在哪里、在文件系统中移动、并选择特定的文件。 要安装 ranger,请使用标准的安装命令(例如,sudo apt install ranger)。...使用右方向键可移动到更深的目录或查看文件内容。 如果你继续按下方向键移动到列表的文件部分,你会注意到第三列将显示文件大小(而不是文件的数量)。...“当前选择”行也会显示当前选择的文件名,而最右边的一列则会尽可能地显示文件内容。...该工具提供了一种非常不同的方式来列出 Linux 系统上的文件并与之交互,一旦你习惯了它的多级的目录和文件列表方式,并使用方向键代替 cd 命令来移动,就可以很轻松地在 Linux文件中导航。

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Linux密码加密和解密文件

age 是一个简单的、易于使用的工具,允许你一个密码来加密和解密文件文件的保护和敏感文档的安全加密是用户长期以来关心的问题。...它是一个小型且易于使用的工具,允许你一个密码加密一个文件,并根据需要解密。 安装 age age 可以从众多 Linux 软件库中 安装。... age 加密和解密文件 age 可以公钥或用户自定义密码来加密和解密文件。...公钥解密 如需解密加密文件,使用 age 命令和 --decrypt 选项: $ age --decrypt -i key.txt -o mypass.tar.gz mypass.tar.gz.age...使用密码加密 不使用公钥的情况下对文件进行加密被称为对称加密。它允许用户设置密码来加密和解密一个文件

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testdisk 恢复 Linux 上已删除的文件

当你在 Linux 系统上删除一个文件时,它不一定会永远消失,特别是当你最近才刚刚删除了它的时候。...除非你 shred 等工具把它擦掉,否则数据仍然会放在你的磁盘上 —— 而恢复已删除文件的最佳工具之一 testdisk 可以帮助你拯救它。...有趣的是,它不仅是一个 Linux 工具,而且还适用于 MacOS、Solaris 和 Windows。 文档可在 cgsecurity.org 中找到。...当你 testdisk 恢复被删除的文件时,你最终会将恢复的文件放在你启动该工具的目录下,而这些文件会属于 root。出于这个原因,我喜欢在 /home/recovery 这样的目录下启动。...Partition Start End Size in sectors > 1 P Linux filesys. data 2048

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如何在 Linux密码加密和解密文件

age 是一个简单的、易于使用的工具,允许你一个密码来加密和解密文件文件的保护和敏感文档的安全加密是用户长期以来关心的问题。...它是一个小型且易于使用的工具,允许你一个密码加密一个文件,并根据需要解密。 安装 age age 可以从众多 Linux 软件库中 安装。... age 加密和解密文件 age 可以公钥或用户自定义密码来加密和解密文件。...公钥解密 如需解密加密文件,使用 age 命令和 --decrypt 选项: $ age --decrypt -i key.txt -o mypass.tar.gz mypass.tar.gz.age...使用密码加密 不使用公钥的情况下对文件进行加密被称为对称加密。它允许用户设置密码来加密和解密一个文件

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开源的 VeraCrypt 加密你的文件 | Linux 中国

Linux 上,它需要 wxGTK3、makeself 和通常的开发栈(Binutils、GCC 等)。 当你安装后,从你的应用菜单中启动 VeraCrypt。...在本文中,我创建了一个文件容器。VeraCrypt 容器和其他文件很像:它保存在硬盘、外置硬盘、云存储或其他任何你能想到的存储数据的地方。与其他文件一样,它可以被移动、复制和删除。...选择一个文件系统 在创建卷的过程中,你会被要求选择一个文件系统来决定你放在保险库中的文件的存储方式。微软 FAT 格式是过时的、非日志型,并且限制了卷和文件的大小,但它是所有平台都能读写的一种格式。...除此之外,NTFS 适用于 Windows 和 Linux。开源的 EXT 系列适用于 Linux。...在你手动在 VeraCrypt 中挂载之前,文件都是加密的,在那里,文件会保持解密,直到你再次关闭卷。

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