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R语言实现GWAS数据文件格式转化

全基因组关联分析(GWAS)大家都不陌生,今天我们给大家介绍下各种格式之间转化在R语言是怎么实现的。首先我们来看下GWAS都有哪些数据格式: 1....HapMap格式,这也是当时全基因组计划的简称,自此这个也成为了其主要的一种文件格式。...今天我们主要讲下在包SNPRelate中如何实现这些数据结构之间的转化。...plink数据格式为gds的包 接下来看下里面数据转化的主要函数: 函数名称 功能 snpgdsPED2GDS 将ped/map文件转化为GDS snpgdsBED2GDS 将BED/BIM/FAM文件转化为...GDS snpgdsGDS2PED 将GDS文件转化为PED/MAP文件 snpgdsGDS2BED GDS转化为BED/BIM/FAM文件 snpgdsVCF2GDS VCF文件转化为GDS文件 通过以上函数的转化

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什么是文件格式

java 字节流汇总: java 字节流入门(读文件) 有了之前 4 篇对文件的操作工具之后,终于到了文件格式的介绍部分!本文介绍文件格式的定义,并实现一个自己的文件格式。...这个文件格式十分简单,只用来说明原理。...有了文件格式,你就可以将数据写成这种格式的文件,并且将数据从这种格式的文件中读出来。文件格式的本质就是一种协议。...下面介绍一个自己的文件格式: 实现自己的文件格式! 这个文件格式的功能为:写 int 数据;读取所有数据。...总结 是不是很开心,今天我们对文件格式有了一个初步了解,并且实现了一个自己的文件格式。你也可以自己设计文件格式

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文件格式猜测

0×01 实验内容 1.了解010Editor.exe的使用方法 2.了解文件格式的查看 3.判断文件的格式 0×02 实验原理 有些文件格式被设计用于存储特殊的数据, 例如: 图像文件中的JPEG...文件格式仅用于存储静态的图像,而GIF既可以存储静态图像,也可以存储简单动画; Quicktime 格式则可以存储多种不同的媒体类型。...0×03 实验笔记 我觉得这个实验分为两个阶段 1.第一阶段是直接给你文件格式,通过010编辑器去分析查找文件是什么格式。...说白了就是一阶段直接给你文件格式了,你知道文件是啥格式;第二阶段是没有给你文件格式,你需要自己通过010编辑器去分析查找这个文件的格式。 在第二阶段中,通过010编辑器分析查找1-4文件内容。...74 ASCLL字符串: P.o.w.e.r.P.o.i. n.t. .D.o.c.u.m. e.n.t 在ASCLL字符串内容中可以发现是PPT的英文全称,所以显而易见这个1-4文件是PPT文件格式

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