Pandoc 是由 John MacFarlane 开发的标记语言转换工具,可实现不同标记语言间的格式转换,堪称该领域中的「瑞士军刀」。Pandoc 使用 Haskell 语言编写,以命令行形式实现与用户的交互,可支持多种操作系统;Pandoc 采用 GNU GPL 授权协议发布,属于自由软件。
GEMMA (Genome-wide Efficient Mixed Model Association) 是基于混合模型进行全基因组关联分析的工具。运行速度非常快,结果准确,使用也十分方便,非常适合初学者做GWAS分析。
您的计算机上有媒体文件吗?您可以通过以更节省空间的文件格式存储数据来节省大量磁盘空间。
首先运行命令sudo apt-get update更新软件源库 再运行sudo apt-get install wapiti安装wapiti 再运行sudo apt-get -f install安装依赖包,就可以直接使用了
做转录组测序,通常公司是不给分析的,分析也要自己多花钱,当然不同公司收费不一样,有的可能带有简单的分析。之前测序的第一家公司给了简单的分析,后面换了一家测序公司,不给分析。所以我得自己分析啦,在分析的时候顺便写一下教程。分享给大家,要分析转录组数据,首先得知道测序原理【参考文章:illumina、Sanger、第三代和第四代测序技术原理】,还有就是了解生信分析中一些文件格式【参考文章:生信中常见的数据文件格式】,当然,还有其他一些生物背景知识,除此以外,还需要会Linux,这个是一个漫长的学习过程。本文就介绍转录组数据分析的第一步分析:质控,主要就是fastqc这个软件的使用和结果解读。
nasm -f <format> <filename> [-o <output>]
在 【FFmpeg】Windows 搭建 FFmpeg 命令行运行环境 博客中 , 搭建 FFmpeg 命令行 运行环境 , 就可以在 任意 目录位置 , 执行 ffmpeg 命令 ,
今天给大家介绍的是一款名叫Findomain的工具,这是一款能够帮助我们快速枚举/搜索子域名的跨平台工具。
1. ledock需要联网使用,至少ledock的linux版本是,所以请保持网络通畅
简介 Linux 上常用的压缩/解压工具,介绍了zip、rar、tar的使用。 文件打包和压缩 Linux 上的压缩包文件格式,除了 Windows 最常见的*.zip、*.rar、.7z 后缀的压缩文件,还有 .gz、.xz、.bz2、.tar、.tar.gz、.tar.xz、tar.bz2
然后百度查了下,发现这是由于脚本文件在保存时使用了DOS文件格式造成的,所以在linux下先创建脚本编辑就没问题了。
杂项题目主要是以文件附件作为题目,但是给的文件不一定是有后缀名的,这就需要我们识别这些文件
将一个 100×100 的灰度值数组写入当前文件夹中的 PNG 文件。
随着计算机技术的不断发展,三维建模软件成为建筑设计、景观设计、室内家具设计等领域中必不可少的工具之一。SketchUp软件作为一款功能强大、易于学习的三维建模软件,已经成为该领域中主要的软件之一。然而,有些用户可能会遇到使用SketchUp软件时的问题,如模型不稳定、导出文件格式错误等。因此,本文将探讨如何正确地使用SketchUp软件,并结合实际案例说明如何解决常见问题。
每一个链接过程都由链接脚本(linkerscript, 一般以lds作为文件的后缀名)控制. 链接脚本主要用于规定如何把输入文件内的section放入输出文件内, 并控制输出文件内各部分在程序地址空间内的布局. 但你也可以用连接命令做一些其他事情. 连接器有个默认的内置连接脚本, 可用ld--verbose查看. 连接选项-r和-N可以影响默认的连接脚本(如何影响). -T选项用以指定自己的链接脚本, 它将代替默认的连接脚本。你也可以使用<暗含的连接脚本>以增加自定义的链接命令. 以下没有特殊说明,连接器指的是静态连接器.
PFX(Personal Information Exchange)和PEM(Privacy-Enhanced Mail)是两种常见的证书和密钥文件格式,用于在加密通信和身份验证中存储和传输数字证书和私钥。它们在文件结构和编码方面存在一些区别。
在PCA(Principal Component Analysis)分析中,常用的工具有EIGENSOFT工具的smartpca,GCTA工具的PCA模块和R包中做PCA分析的princomp函数或glPCA功能。EIGENSOFT工具只支持linux系统,从安装到使用都很复杂。GCTA工具支持不同平台(wins/linux/mac),常用于群体遗传相关分析。在群体遗传中,R包从读取vcf文件、PCA分析到可视化,对内存要求较高。
0. 前言 接前一篇文章,上篇文章我们介绍了数字签名、数字证书等基本概念和原理 本篇我们尝试自己生成证书 参考文献:TLS完全指南(二):OpenSSL操作指南 1. OpenSSL 简介 OpenSSL 是一个开源项目,其组成主要包括三个组件: openssl:多用途的命令行工具 libcrypto:加密算法库 libssl:加密模块应用库,实现了ssl及tls OpenSSL 主要用于秘钥证书管理、对称加密和非对称加密 1.1 指令 常用指令包括:genrsa、req、x509 1.1.1 genrs
其实我现在已经不写软件教程了! fastqc对原始测序reads质控 NCBI的blast++软件使用说明书 SRA工具sratoolkit把原始测序数据转为fastq格式 目录 一:下载安装该软件 二:准备数据 三:运行命令 四:输出文件解读 正文 一:下载安装该软件 在NCBI的ftp站点里面可以找到blast++的下载链接 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.ta
在linux中输入vi Makefile 来实现创建Makefile文件 注意:命令行前必须加TAB键 例如:将两个文件led.c和crt0.S汇编文件,制作一个Makefile文件 1 1 led
Adobe Media Encoder(以下简称 ME)是 Adobe 公司推出的一款视频编码软件,与 Premiere Pro、After Effects 等应用程序相互搭配使用,为用户提供了高效的编码和导出功能。
file命令用来识别文件类型,对文件的检查分为文件系统、魔法幻数检查和语言检查三个过程,也可用来辨别一些文件的编码格式。它是通过查看文件的头部信息来获取文件类型,而不是像Windows通过扩展名来确定文件类型的。
项目需求,对上传的文档进行一些预处理,如果用户上传了doc格式的文档,需要将其处理为docx或者pdf格式,以便后续的流程对文档内容进行提取。
什么是数据?数据是指对客观事件进行记录并可以鉴别的符号,是对客观事物的性质、状态以及相互关系等进行记载的物理符号或这些物理符号的组合。它是可识别的、抽象的符号。数据可以是连续的值,也可以是离散的。
led.bin : crt0.S led.c 指的是依赖关系,led.bin是目标文件,:后面是依赖文件
在客户端我们可以用 PhotoShop 等 GUI 工具处理静态图片或者动态 GIF 图片,不过在服务器端对于 WEB 应用程序要处理图片格式转换,缩放裁剪,翻转扭曲,PDF解析等操作, GUI 软件就很难下手了,所以此处需要召唤命令行工具来帮我们完成这些事。
Apache JMeter 是一个强大的开源工具,广泛用于性能测试和负载测试。为了更好地记录和分析测试结果,JMeter 提供了多个监听器(Listener)来收集数据。Flexible File Writer 是一个非常有用的插件,它允许用户以自定义格式将测试结果写入文件中。本指南将详细介绍如何安装、配置和使用 Flexible File Writer 插件。
Upscayl 中文版是一款免费开源的 AI 图片放大软件,支持在 MacOS、Linux 和 Windows 操作系统上使用。它可以通过命令行来使用,并可检测到计算机中的多个显卡,用户可以通过设置 GPU ID 来控制使用哪个显卡进行图片放大处理。
在上一篇文章漫谈模式之简单工厂和工厂方法模式,我们提到工厂方法模式处理的一个产品等级结构(以文件导入处理器为例,包含Excel、Csv的处理器)。本文在此基础上,再来增加一个导出文件处理器工厂,也包含Excel、Csv的导出处理器。也就是产生多个产品等级结构的场景,我们一起来感受一下。
CDO在处理气候及模式数据方面有着非常强大的功能,而且其中包含有一些简单的统计和计算函数,数据选择以及空间差值函数。支持常见的气象数据格式,比如GRIB,NetCDF等。
要想了解底层,链接是一个不得不过的一关,我总结了下学习的心得,首先要了解链接器到底是如何工作的,链接器分为两类,一个是静态链接,一个是动态链接,先来讲解静态链接,静态链接要干两件事:
在生物信息分析中,通常要借助于大型服务器来处理各种数据,而Linux系统是比较通用的服务器操作系统。在Linux系统中,我们一般通过命令行指令来执行各种任务。无论是个人PC版Linux系统,还是远程服务器,我们一般通过图形界面X Window软件与计算机进行交互。个人PC版Linux系统自带图形界面,可以打开终端(terminal)输入指令;对于远程服务器,我们则需要模拟终端软件的帮助,最常用的为Xshell,其界面如下所示:
在Linux系统中,我们一般通过命令行指令来执行各种任务。无论是个人PC版Linux系统,还是远程服务器,我们一般通过图形界面X Window软件与计算机进行交互。个人PC版Linux系统自带图形界面,可以打开终端(terminal)输入指令;对于远程服务器,我们则需要模拟终端软件的帮助,最常用的为Xshell,其界面如下所示:
经常写博客的小伙伴经常会需要上传运行的效果图,也就是 GIF 动态图,网上有些GIF录制或者转换的软件或者网站都需要付费,目前有以下方式可供选择。
nmon 是 Nigel's performance Monitor for Linux on POWER, x86, x86_64, Mainframe & now ARM (Raspberry P
已经太久没有遇到很基础性的问题,因此很多刚开始学代码时候的问题已经忘了。因此写这部分并没有那么容易,要拼命回忆可能的常见问题。
pg_dump是用于备份一种PostgreSQL数据库的工具。即使数据库正在被并发使用,它也能创建一致的备份。pg_dump不阻塞其他用户访问数据库(读取或写入)。
-sh: ./test.sh: /bin/bash^M: bad interpreter: No such file or directory
最近我们实验室的GPU服务器数据空间不够用了,老师让我联系公司来增加硬盘。我这里记录一下对Amax公司生产的GPU服务器增加硬盘的步骤。 机器的参数:
载荷这个东西比较多,这个软件就是根据对应的载荷payload生成对应平台下的后门,所以只有选对payload,再填写正确自己的IP,PORT就可以生成对应语言,对应平台的后门了!!!
PE表示 paired-end 数据的质量控制,SE也即single-end 数据。以下以PE为例。
ffmpeg的remuxing.c是一个用于将多媒体文件从一种容器格式转换为另一种容器格式的命令行工具。它可以将音频、视频和字幕等元素从源文件中提取出来,并按照用户指定的方式重新封装到目标文件中。在本篇文章中,我将对ffmpeg的remuxing.c进行介绍,并讨论其关键功能和技术实现。
考虑到很多小伙伴初次学习linux,对很多linux的常用命令不是很熟悉。虽然小菌已经分享了一些linux的一些"硬核"操作在之前的博文中,(感兴趣的小伙伴可以自行观看,这里就不设置传送门了)但考虑到更多的人,小菌决定还是尽自己的一点绵薄之力,为大家带来Linux的常用命令~
对大家来说,耳熟能详的软件就是 MaxQuant 啦,在综述文章《Bioinformatics Methods for Mass Spectrometry-Based Proteomics Data Analysis》有详细的介绍各种软件的对比汇总。
在现代数字化工作环境中,文件格式的兼容性和转换需求变得尤为重要。特别是对于设计师、工程师和办公人员来说,能够方便快捷地转换文件格式,是提升工作效率的关键。本文将介绍一款强大的在线云库工具,展示其在多种矢量和文档格式转换中的应用与技术优势。
Eplan软件是一款被广泛应用于电气设计、机械工程、自动化等各个领域的工程绘图软件。由于它高效易用、功能丰富、支持多种文件格式,已成为不少企业和工程师的首选工具。本文将详细介绍Eplan软件的特点和使用方法,并结合实际案例进行演示和说明。
转录组分析 | 使用trim-galore去除低质量的reads和adaptor
curl和wget都是命令行工具,用于从Web服务器下载文件或数据。它们之间的区别在于:
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