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命令行 一键完成 所有R包更新

问题来源 昨天我们发现需要更新BioManager至3.18的话,就需要更新600多个r包。R包安装失败怎么办?(一)msigdbr 有没有办法解放双手,后台更新R包,避免一直看着更新的进度条?...解决办法 在命令行中实现BiocManager::install(version = "3.18"),即在R的命令行界面之外安装Bioconductor版本或R包,可以通过调用R脚本执行。...install_bioconductor.R),并包含以下内容: ​#如果指定想要的r包安装路径#####安装archr包##别处复制.libPaths(c("/home/data/t040413/R/x86_64-pc-linux-gnu-library...install.packages("BiocManager")​# 使用BiocManager安装特定版本的Bioconductor,并自动更新所有包而无需询问BiocManager::install(version = "3.18...命令提示符或PowerShell)中,切换到包含你的R脚本的目录,然后运行: nohup Rscript install_bioconductor.R >myout.log 2>&1 &​ 这是一条在Linux

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Linux Kernel 4.19敲定为下个长期支持版本

Linux Kernel开发者和维护总负责人 Greg Kroah-Hartman今天正式敲定,即将发布的4.19分支将会是长期支持版本。...目前Linux Kernel 4.17已经结束生命周期,而4.18并不具备成为长期支持版本的必要因素,因此LTSI社区就此事和Greg Kroah-Hartman进行了商谈。 ?...最终答案是,即将到来的Linux 4.19分支内核将会成为长期支持版本,意味着在正式发布之后将会持续支持数年时间。...现阶段长期支持分支包括Linux 4.14, Linux 4.9, Linux 4.4以及Linux 3.16 and Linux 3.18。...Linux Kernel 4.19带来了诸多改进,包括升级驱动、改进图形和网络,架构更新,核心内核和网络改进,更新的文件系统,以及文档和工具更新等等。

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基于 eBPF 实现容器运行时安全

2014 年 6 月 BPF JIT 组件提交到 Linux 3.15 中。2014 年 12 月 系统调用 bpf 提交到 Linux 3.18 中。...下面是 cBPF 和 eBPF 的对比: 纬度 cBPF eBPF 内核版本 Linux 2.1.75(1997 年) Linux 3.18(2014 年)[4.x for kprobe/uprobe/...tracepoint/perf-event](注:虽然 eBPF 在 Linux 3.18 版本以后引入,并不代表只能在内核 3.18+ 版本上运行,低版本的内核升级到最新也可以使用 eBPF 能力,只是可能部分功能受限...2.3.BPF 与传统 Linux 内核模块的对比 BPF 看上去更像内核模块,所以总是会拿来与 Linux 内核模块方式进行对比,但 BPF 与内核模块不同。...下面是 BPF 与 Linux 内核模块的对比: 维度 Linux 内核模块 BPF kprobes、tracepoints 支持 支持 安全性 可能引入安全漏洞或导致内核 Panic 通过验证器进行检查

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centos升级内核版本以支持overlay2

搬瓦工新入的KVM架构的机器,默认内核版本是4.10.4,如果是本地用ISO安装的系统,默认内核版本可能更低,比如3.10.0,如果我们想要获取到最新的Linux特性,那么就必须升级内核版本到最新,我们可以用很简单的几个命令就可做到...PS.用下面的命令查看当前系统的内核版本,多个平台适用 uname -sr # 老高的不同的机器返回的不同结果 # Linux 4.10.4-1.el7.elrepo.x86_64 # Linux 3.10.0...& grub2-set-default 0 至此,我们重启系统就已经完成了内核的升级,内核升级是完成了,我们就可以使用一些新特性了,比如在此老高以docker的新文件驱动overlay2为例,使用一下Linux...kernel 4.0以后才支持的overlay2(Linux kernel 3.18以后才支持的叫overlayFS)。...# 我们可以先检查Linux是否加载了overlay模块 lsmod|grep over # 如果有返回则说明已经加载 # 如果确定内核是最新那么可以执行 modinfo overlay # 此处应该有类似

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