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Linux - awk

生信技能树学习笔记 图片 在读取一行文本时,会用预定的字段分隔符划分每个数据字段,并分配给一个变量 默认的字段分隔符是任意空白字符(如空格或制表符),也可以用 -F 参数自定义分隔符 $0 代表整个文本行...'{print $9}' | less -S ## 此时指定分隔符为制表符 如果不指定 cat Data/example.gtf | awk '{print $9,$10}' | head ## 中间用空格连接...cat Data/example.gtf | awk '{print $9$10}' | head ## 直接连接 cat Data/example.gtf | awk '{print $9"@"$10...}' | head cat Data/example.gtf | awk '{print $9"\t"$10}' | head 匹配模式 cat Data/example.gtf | awk '/UTR...OFS=":"} {print NR,$9}' | head -5 awk 条件和循环语句 图片 ##判断第三列是否是基因 cat Data/example.gtf | awk '{if($3=="gene

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linux——awk(7):awk数组详解

awk中数组的使用。我们在其他语言中经常会使用到数组,awk中也可以使用。...示例如下: 与其他不同的是,awk中的数组元素值可以设置为”空字符串“,当设定某一个元素为”空字符串“时,打印出的值就是为”空“(注:”空格“不为”空“)。...鉴于awk中,元素的值可以为”空“,我们就不能根据元素的值是否为”空“去判断元素是否存在了。...那在awk中如何判断元素的存在呢: 可以使用if(下标 in 数组名),从而判断数组元素是否存在,如上所示,虽然test[1]=””,但是该数组元素依旧存在,只是为”空“。...在awk中,数组的下标不仅可以为”数字“,还可以为”任意字符“。

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Linux 命令 | awk

Linux 命令 awk命令解析 awk 命令是一种强大的文本处理工具,它可以根据指定的模式对文本进行处理、分析和格式化。...awk 的一般形式如下: awk 'pattern1 {action1} pattern2 {action2}...' filename pattern 是模式,用来匹配处理文本的内容; action...为方便读者理解,林一写个具体的 demo 现有有一个文件 linyi.txt,格式如下,计算文本文件中第一列数字的和: 1 abc 2 def 3 ghi 可以使用以下 awk 命令: awk '...Linux 命令 awk 命令注意事项 读者需要注意模式和动作的书写顺序不能颠倒;模式和动作可以省略,但大括号不能省略。 awk 命令还有许多内置变量和函数,可以用于进一步处理文本。...awk 命令还支持正则表达式,可以用来匹配复杂的文本模式。

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Linux awk学习

awkLinux三剑客之一,在我们处理文件等方面还是特别方便的 介绍 我们先来说一说awk是用来干什么的,awk是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时...简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。 我们可以先来看一下awk的版本号 ?...用法 awk命令是由模式和动作的组合组成的 awk [options] 'pattern {action}' file 模式,pattern,可以理解为sed的模式匹配,可以由表达式组成,也可以是两个正斜杠之间的正则表达式...我们先用一个语句来说一下awk的运作方式 ?...awk是通过一行一行来处理文件的,上面这条语句执行的过程就是: 1.awk读入一行内容 2.判断是否符合模式中的条件(NR>=2),如果匹配到则执行对应的动作({print $0}),如果没有匹配到,继续读取下一行

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Linux awk 命令

但有以下限制,不识别:/x、函数关键字、func、换码序列以及当fs是一个空格时,将新行作为一个域分隔符;操作符**和**=不能代替^和^=;fflush无效。...'{[pattern] action}' {filenames} # 行匹配语句 awk '' 只能用单引号实例:# 每行按空格或TAB分割,输出文本中的1、4项 $ awk '{print $1...is a test 3 Are you like awk This's a test 10 There are orange apple # 使用多个分隔符.先使用空格分割,然后对分割结果再使用","...= ==关系运算符空格连接+ -加,减* / %乘,除与求余+ - !...)FILENAME当前文件名FNR各文件分别计数的行号FS字段分隔符(默认是任何空格)IGNORECASE如果为真,则进行忽略大小写的匹配NF一条记录的字段的数目NR已经读出的记录数,就是行号,从1开始

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Linux awk命令

除了使用 sed 命令,Linux 系统中还有一个功能更加强大的文本数据处理工具,就是 awk。 曾有人推测 awk 命令的名字来源于 awkward 这个单词。...awk 命令的基本格式为: [root@localhost ~]# awk [选项] '脚本命令' 文件名 此命令常用的选项以及各自的含义 awk 的强大之处在于脚本命令,它由 2 部分组成,分别为匹配规则和执行命令...前面说过,在 awk 中,默认的字段分隔符是任意的空白字符(例如空格或制表符)。 在文本行中,每个数据字段都是通过字段分隔符划分的。awk 在读取一行文本时,会用预定义的字段分隔符划分每个数据字段。...awk 脚本命令使用多个命令 awk 允许将多条命令组合成一个正常的程序。...awk BEGIN关键字 awk 中还可以指定脚本命令的运行时机。

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linux AWK学习

简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。.../bin/awk 3.将所有的awk命令插入一个单独文件,然后调用: awk -f awk-script-file input-file(s) 其中,-f选项加载awk-script-file中的awk...这里,逗号的作用与输出文件的分隔符的作用是一样的,只是后者是空格而已。 printf函数,其用法和c语言中printf基本相似,可以格式化字符串,输出复杂时,printf更加好用,代码更易懂。    ...awk编程  变量和赋值 除了awk的内置变量,awk还可以自定义变量。

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Linux Awk用法总结

Awk是什么 Awk、sed与grep,俗称Linux下的三剑客,它们之前有很多相似点,但是同样也各有各的特色,相似的地方是它们都可以匹配文本,其中sed和awk还可以用于文本编辑,而grep则不具备这个功用...而每个记录由进一步地被分隔成多个字段(Field),默认情况下字段的分隔符是空白符,例如空格、制表符等等,也可以通过-F ERE选项或者内置变量FS更改。...awk中的变量名同一般的编程语言无太多区别,但是不能同awk的保留关键字重名,可以查看awk的man手册查询哪些是保留关键字。而变量值只有两种形式:字符串和数值。...这样我们可以用表达式$n ~ /ere/: 有时候我们只想显示特定和行,例如显示第一行: 正则表达式(Regular Expression) 正则表达式的内容介绍起来太麻烦,还是推荐同学阅读现有的文章(如 Linux...system 这个函数很简单,就是用于执行外部命令,例如: 结束语 快速了解Awk系列的几篇文章相对比较粗糙,我是参考Awk的man手册以及《Sed & Awk》附录B总结而成的,但是应该可以让大家对awk

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linux awk命令详解

简单来说awk就是把文件逐行的读入,以空格为默认分隔符将每行切片,切开的部分再进行各种分析处理。...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。.../bin/awk 3.将所有的awk命令插入一个单独文件,然后调用: awk -f awk-script-file input-file(s) 其中,-f选项加载awk-script-file中的awk...这里,逗号的作用与输出文件的分隔符的作用是一样的,只是后者是空格而已。 printf函数,其用法和c语言中printf基本相似,可以格式化字符串,输出复杂时,printf更加好用,代码更易懂。  ...awk编程  变量和赋值 除了awk的内置变量,awk还可以自定义变量。

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