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使用UniMoVib+PyVibMS显示其他量化程序振动分析结果

1. 前言 在之前的《使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式》一文中,笔者介绍了PyVibMS插件的基本使用方法。目前对于量子化学程序计算的分子体系,PyVibMS已经可以原生支持高斯、ORCA、xtb和Q-Chem四款主流软件。然而对于CFOUR、MOLPRO、BDF等较少使用的量子化学程序计算的振动分析的结果,PyVibMS支持通过先载入XYZ坐标文件、再载入mode文本文件的方式进行振动可视化。其中,mode文本文件的准备可能需要用户有一定的脚本编写水平。 本文介绍一种不需要用户编写脚本制作mode文件就可以对非主流量子化学程序计算得到的振动分析结果进行可视化的方法。此方法的基本原理是先利用UniMoVib程序读取量子化学计算程序给出的Hessian矩阵信息,然后生成可以让PyVibMS读取的统一格式的XYZ和mode文件,最后将这两个文件载入PyVibMS即可。 UniMoVib是一款可以从近30种量子化学计算程序中读取Hessian、坐标等数据计算谐振频率和(可选)红外强度的Fortran程序。可以将它理解成一个加强版的freqchk程序。目前UniMoVib的代码、手册和例子文件在GitHub上托管:

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数字电路实验(四)——寄存器、计数器及RAM

1、实验步骤: A、指令计数器PC: 1个vhd文件,用来定义顶层实体 1个vwf文件,用来进行波形仿真,将验证的波形输入 1、新建,编写源代码。 (1).选择保存项和芯片类型:【File】-【new project wizard】-【next】(设置文件路径+设置project name为【C:\Users\lenovo\Desktop\笔记\大二上\数字电路\实验课\实验四\PC】)-【next】(设置文件名【junmo】)-【next】(设置芯片类型为【cyclone-EP1CT144C8】)-【finish】 (2).新建:【file】-【new】(【design file-VHDL file】)-【OK】 2、写好源代码,保存文件(junmo.vhd)。 3、编译与调试。确定源代码文件为当前工程文件,点击【processing】-【start compilation】进行文件编译。编译结果有一个警告,文件编译成功。 4、波形仿真及验证。新建一个vector waveform file。按照程序所述插入clock、ld_pc,in_pc,input,output五个节点(clock,ld_pc,in_pc,input为输入节点,output为输出节点)。(操作为:右击 -【insert】-【insert node or bus】-【node finder】(pins=all;【list】)-【>>】-【ok】-【ok】)。任意设置clock,ld_pc,in_pc,input的输入波形…点击保存按钮保存。(操作为:点击name(如:clock))-右击-【value】-【count】(如设置binary;start value=0;end value=1;count every=10ns),同理设置name ld_pc,in_pc,input(如0,1,5),保存)。然后【start simulation】,出name output的输出图。 5、功能仿真,即没有延迟的仿真,仅用来检测思路是否正确。

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DEAP数据集--一个重要的情绪脑电研究数据集(更新)

DEAP[1](Database for Emotion Analysis usingPhysiological Signals),该数据库是由来自英国伦敦玛丽皇后大学,荷兰特温特大学,瑞士日内瓦大学,瑞士联邦理工学院的Koelstra 等人通过实验采集到的,用来研究人类情感状态的多通道数据,可以公开免费获取。该数据库是基于音乐视频材料诱发刺激下产生的生理信号,记录了32名受试者,观看40分钟音乐视频(每一个音乐视频1分钟)的生理信号和受试者对视频的Valence, Arousal, Dominance,Liking的心理量表,同时也包括前22名参与者的面部表情视频。该数据库可以研究多模态下的生理信号,对情绪脑电的研究具有非常重要的意义。

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