chemdraw20的全称为ChemDraw Professional 20是ChemBiooffice核心工具之一,是一套完整易用的专业的化学结构绘制工具。它提供常见的通路元素(膜、DNA、酶、受体等)以及导入其他实体生物途径绘图功能,能够绘制生物通路图、绘制化学结构、反应式等生物化学构造。同时它还可以编辑和建立分子式、立体图形、实验装置、结构式、方程式等生物化学构造,辅助专业学科工作者及相关科技人员的交流活动和研究开发工作。chemdraw20是绘制化学结构最快速、最精确的工具,是款非常受欢迎的化学绘图软件!
ChemDraw Professional 20是一款专业的化学绘图软件,可以帮助化学研究人员、教育工作者和制药行业从业者轻松地创建高质量的分子结构和化学反应方程式。该软件提供了丰富的化学符号和模板,支持多种文件格式的导入和导出。
想必不少读者都用过ChemDraw和Chem3D来建模,先用ChemDraw画出体系的结构式,保存为cdx格式文件,再用Chem3D打开,用自带的MM2或MMFF94力场粗略优化结构,最后保存成一些量子化学程序支持的格式,例如Gaussian的gjf文件。这个过程对小分子来说经常屡试不爽,有时候比直接在GaussView的构建结构要方便得多。但是有时候对于大一些的体系,Chem3D在打开cdx文件将结构转化为立体结构时,得到的结构会与我们期望的结果大相庭径。这时我们可以借助Chem3D中的Edit → Paste Special → Preserve Coordinates来获得稍微理想一些的结构,以下举两个实例。
写论文、做学术研究时,想必大家都希望有一款编辑神器,尤其是遇到超级多的图表和公式需要编辑时更是如此。在众多的公式编辑器中,我们就不得不提 Mathpix Snip,这款数学公式识别神器只需要截个图,公式自动转化为 LaTex 代码表达式。
内容概要:从哈工大、哈工程被禁用数学基础软件 Matlab,到近日 ChemOffice 在中国境内严查盗版,国内的学者的科研路愈发艰难。
For this tutorial, the ADFR software suite, providing a number of software tools for automated docking and peripheral tasks, and the Python package meeko, for preparing ligands for example, are necessary.
作者/凯霞 「有机化合物怎么命名啊?」、「有机化合物命名规则是什么?」、「这个药物的有效成分叫什么?」、「有没有查找有机化合物命名的软件或程序?」、「某某命名软件还花钱。」、「某软件命名不准确。」...... 注:部分来自知乎问题。 总之,有机化合物命名太难、规则太繁琐、还没有开源软件...... AI 发展「风生水起」,能否解决以上问题? 现在,来自莫斯科罗蒙诺索夫国立大学和 Syntelly 初创公司的研究人员开发了一种基于 Transformer 的人工神经方法,可根据 IUPAC 命名系统生成
CDK是结构化学信息学和生物信息学的开源Java库。 该项目由Christoph Steinbeck,Egon Willighagen与Jmol和JChemPaint的开发人员Dan Gezelter于2000年发起。迄今为止,它是在科学界广泛支持下开展的最活跃的开源化学信息学项目之一。
不用chemdraw画分子,截图即刻识别;支持复杂天然产物的识别;可抵抗低分辨率、扭曲变形、无关字符、彩色背景等干扰;支持pdf批量自动定位自动识别
代谢重编程是目前疾病研究比较火热的一个话题,代谢常常影响着多种疾病,以癌症为例,通过代谢通路研究,可以靶向寻找肿瘤细胞能量供应途径,从而抑制肿瘤细胞增殖,其中脂代谢可以称为疾病代谢机制研究中十分重要的一员。随着对脂质在细胞生物学,生理学和病理学中的多种生物学作用的更好的理解,脂质的研究已经发展成为越来越重要的研究领域。
继哈工大、哈工程等受“实体清单”影响被禁止使用 Matlab 商业软件后,化学行业软件公认的大佬 ChemOffice 开始清查国内的盗版软件使用者,并通过邮件的方式通知高校学生不要使用盗版。
本文简单介绍一下怎么用高斯的DFT计算NMR化学位移和耦合常数,以及如何在GaussView里观看计算生成的图谱。计算和可视化所用的软件分别是G16 A.03, GV 6.0.16。
Docking非原生配体 在前面的例子中,AutoDock Vina能把配体构象调整到几乎原生的构象,验证了这一预测方法的准确度。下面,我们尝试docking另外一个配体药物nelfinavir奈非那韦,来展示如何寻找小分子在蛋白内的结合位点。这个过程可以进一步地凝练和扩展作为“虚拟筛选(virtual screening)”的步骤。 重复上述步骤执行docking 获取nelfinavir.pdb:为教程提供的pdb文件(可从1OHR.pdb获得) 按照上述步骤对配体文件进行预处理获得pdbqt格式文件。
基因组学(genomics)是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科,基因组学的目的是对一个生物体所有基因进行集体表征和量化,并研究它们之间的相互关系及对生物体的影响 。机器学习已经被广泛应用于基因组学研究中,利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测,深度学习,可以进行预测和降维分析。深度学习模型的能力更强且更灵活,在适当的训练数据下,深度学习可以在较少人工参与的情况下自动学习特征和规律。调控基因组学,变异检测,致病性评分成功应用。深度学习可以提高基因组数据的可解释性,并将基因组数据转化为可操作的临床信息。改善疾病诊断方案,了解应该使用哪些药物和给谁服用药物,最大限度的减少副作用,最大限度的提高疗效,所有这些都要求从基因组原始数据开始进行分析。这将是一项非常耗时的过程,因为涉及到的变量太多了,而深度学习恰恰能帮助缩短这一过程,近两年国内外顶尖课题组MIT、Harvard University、UPenn、清华大学、复旦大学等都在从事深度学习基因组学的研究,这一研究成果更是多次发表在Nature Reviews Genetics、Nature Methods、Science Advances、Cancer Cell、Nature Biotechnology 等知名国际顶刊上,为我们发表顶刊鉴定了基础。
化学共振理论的一大用处就是确定有机化合物最合理的结构式,这对于共轭分子尤为重要,因为可能存在不止一种满足电子八隅律的结构式画法。例如,萘分子可以画出三种可能的Kekulé结构式(即只由C—C单键和C=C双键构成、满足八隅律的Lewis结构),如图1所示:
插图功能是利用 TeX 的特定编译程序提供的机制实现的,不同的编译程序支持不同的图形方式。不同 LaTeX 编译程序对应的插图格式如下表所示:
近年来,深度学习领域的迅速进步对蛋白质设计产生了显著影响。最近,深度学习方法在蛋白质结构预测方面取得了重大突破,使我们能够得到数百万种蛋白质的高质量模型。结合用于生成建模和序列分析的新型架构,这些方法在过去几年里极大改变了蛋白质设计领域,提高了识别新蛋白质序列和结构的准确性和能力。深度神经网络现在能够学习和提取蛋白质结构的基本特征,预测它们与其他生物分子的相互作用,并且有潜力创造用于治疗疾病的新型药物。
我们在Linux中使用自带的gcc和g++编译器进行编译的程序是针对X86架构的。而我们开发板大多都是ARM或者其他架构的开发板,我们就需要编译出针对其他架构的程序。
centos系统内核如何升级,有些小伙伴在使用centos系统时可能会遇到网卡不能使用,亮度不能调节,触摸板不能识别,等等问题,这些都是内核版本过低而导致,只需要把内核升级一下就可以, 下面为大家分享一下centos系统内核升级方法。
arm-none-linux-gnueabi-gcc是 Codesourcery 公司(目前已经被Mentor收购)基于GCC推出的的ARM交叉编译工具。可用于交叉编译ARM系统中所有环节的代码,包括裸机程序、u-boot、Linux kernel、filesystem和App应用程序。使用时,按照主机平台,可以下载以下任一版本中的一个,结果是一样的:
本文是为那些没有接触过Linux系统的人写的。了解Linux系统对于一个技术来人员可谓是必须的(即便不是和计算机直接相关的),而对于广大普通用户而言,只了解Windows虽然已经足够,不过来了解一下Linux这个系统我想还是有益处的(虽然很难立马显现)。 下面我就用一问一答的简单形式带大家初步了解Linux是什么: Q:用一句话概括Linux? A : linux是一个操作系统,就和windows一样。 要了解linux,请先了解开放源代码运动。这是由理查德·斯托曼先生在上世纪80年代发起的一项运动。其主要
本文是为那些没有接触过Linux系统的人写的。了解Linux系统对于一个技术来人员可谓是必须的(即便不是和计算机直接相关的),而对于广大普通用户而言,只了解Windows虽然已经足够,不过来了解一下Linux这个系统我想还是有益处的(虽然很难立马显现)。
Linux服务(Linux services)对于每个应用Linux的用户来说都很重要。关闭不需要的服务,可以让Linux运行的更高效,但并不是所有的Linux服务都可以关闭。今天安装了一次CentOs Linux,发现Linux启动的时候启动了好多服务,大部分都不知道是干什么的。因此着重了解了一下那些Linux服务(Linux services)可以关闭,那些Linux服务(Linux services)不能随意关闭。 在关闭Linux服务之前,需要了解一些概念: 什么是Linux服务/后台进程(Linu
Oracle 11g RAC中,发现oc4j以及gsd服务都处于offline状态,这是Oracle 11g RAC默认情形。即便如此,并不影响数据库的使用,因为 oc4j 是用于WLM 的一个资源, WLM在 11.2.0.2 才可用。GSD则是用于支持dbca,srvctl,oem等的交互工具。本文描述将这两个服务切换到online。
有些小伙伴在使用Linux系统时可能会遇到网卡不能使用,亮度不能调节,触摸板不能识别,等等问题,这些都是内核版本过低而导致,只需要把内核升级一下就可以, 下面为大家分享一下Linux系统内核升级方法。
状态为 deinstall 即已经卸载,如果觉得看着不舒服的话可以使用 purge 连配置文件里一起彻底删除,清理内核列表
1991 年的 8 月 25 日,来自芬兰赫尔辛基大学的 Linus Torvalds 用 Minix 操作平台建立了一个新的操作系统内核,并把它发回 Minix Usenet 新闻组。此时,年仅 21 岁的大学生 Linus 不会意识到,自己当做兴趣爱好开发的一个小项目会在 29 年后发展成统治世界的庞大操作系统内核。
当Linux在1991年8月25日诞生时,它不过是当时21岁的Linus Torvalds的一个爱好。今天,Linux社区估计有超过8600万的强大用户。
需要分别清楚header和image,可以直接用apt-get remove来清除。
Linux 与 Linux 内核其实是不一样的,关于这个问题,我在之前的一篇文章中讲过(《Linux,Unix,GNU 到底有什么样的渊源?》)。Linux 的内核是由 Linus Torvalds 在1991年首次编写。它是操作系统的核心,包括设备驱动、文件系统、进程管理、网络通信等。但是操作系统光有内核,用户是没有办法操作的,所以很多厂商和 Linux 社区就在内核之上开发了很多工具,比如我们常用的 GNome桌面,FireFox浏览器、GIMP 图片编辑器等等。Linux 内核和这些应用一起打包后就被称作 Linux 发行版本。Linux 有很多的发行版本,我在之前的文章中(《这么多Linux版本,你究竟该怎么选择?》),对不同的版本做过比较。
操作系统堪称是IT皇冠上的明珠,Linux阅码场专注Linux操作系统内核研究, 它的文章云集了国内众多知名企业一线工程师的心得,畅销著作有《linux设备驱动开发详解 》等。
在现在的生活,生产,研究等领域,Linux已经无所不在,从我们使用的手机,车载设备,到服务器,桌面电脑等,Linux已经成为这个世界方方面面的基石。尤其对于参与技术有关工作的你学习Linux是必须的,那么,该如何有效的学习呢?Linux从诞生至今,已经是一个非常庞大且复杂的系统,下图是Linux系统代码行数的统计(参考linuxcounter):
此文在网络社区搜集,如果有侵权,请联系本人删除! 在1991年的八月,网络上出现了一篇以此为开篇话语的帖子——这是一个芬兰的名为Linus Torvalds的大学生为自己开始写作一个类似minix,可运行在386上的操作系统寻找志同道合的合作伙伴。1991年10月5日,LinusTorvalds在新闻组comp.os.minix发布了大约有一万行代码的Linux v0.01版本。到了1992年,大约有1000人在使用Linux,值得一提的是,他们基本上都属于真正意义上的hacker。1993年,大约有100
随着android的大热,基于linux的开发也更热了。linux的开发包括driver的开发以及应用程序的开发。 由于我们习惯了windows,在开始使用linux的时候可能感觉很茫然,不知道如何下手。这里就介绍下过来者的一些经验。 学会使用linux 要学习linux,首先你得会使用linux。从安装linux操作系统开始吧。记得当初我把主流的linux发行版本都折腾过,redhat,ubuntu, Fedora,archlinux opensuse等等。学会使用linux包括会使用linux进行日
种基础构件,包括队列、交换器、绑定、虚拟主机等,他们组成了AMQP协议消息通信的基础,而这些构件以元数据的形式存在
1.为啥我们要学习Linux? 我们干嘛要学习Linux? Linux能给我们带来什么价值呢? Linux给我的感觉就是稳定,免费,性能好. 稳定,体现在哪里?我们使用PC机,安装的操作系统一般是wi
与 Microsoft Windows 和 Apple macOS 不同,Linux 有数千种变体,受到全球社区和企业的支持。这些版本称为发行版,它们为你提供的选项远多于其他操作系统。
Linux一直是很多人入行IT的首选,无论是从入行难度还是职业寿命来说,Linux运维都比开发有着更大的优势。为了得到高薪工作,很多人在Linux学习过程中付出了非常大的努力,最终也得到了不错的收获。到了2018年,Linux的优势还有这么大吗?今天我们就带大家来了解一下。
Linux操作系统是开源的、免费的、高效的操作系统,在信息安全领域中得到了广泛的应用。然而,在选择Linux版本时,我们需要考虑许多因素,如安全性、稳定性、易用性、兼容性等。本文将分析Linux操作系统的版本选择,重点突出Kali Linux版本对信息安全的优势,并分析CentOS停止更新的危害。
文 | 糖豆 图 | 来源网络 糖豆贴心提醒,本文阅读时间6分钟,文末有秘密! Linux cat命令 cat 命令用于连接文件并打印到标准输出设备上。 Linux chattr命令 Linux chattr命令用于改变文件属性。 Linux chgrp命令 Linux chgrp命令用于变更文件或目录的所属群组。 在UNIX系统家族里,文件或目录权限的掌控以拥有者及所属群组来管理。您可以使用chgrp指令去变更文件与目录的所属群组,设置方式采用群组名称或群组识别码皆可。 Linux chmo
十多年来,我一直是 Linux 桌面端的忠实拥护者,在桌面和服务器使用平台选择时,Linux 始终是我的第一顺位。虽然我很热爱 Linux,但是也不得不承认 Linux 在桌面端的表现并不是那么理想。
Linux 是最受欢迎的操作系统之一,用户群快速增长。超过 600 个 Linux 发行版可用于满足各种用户需求。此外,世界上最快的超级计算机包含Linux,超过10万台Web服务器也在Linux上。Linux的巨大普及和重要性证明了它是现代技术的重要组成部分。
今日,Linux基金会在Twitter上发布推文宣布,其小企鹅的标志“Tux”已经30周岁了,还为其设计了一系列的庆祝海报,以便大家转发分享。
Linux是自由软件和开放源代码软件发展中最著名的例子。只要遵循GNU通用公共许可证,任何个人和机构都可以自由地使用Linux的所有底层源代码,也可以自由地修改和再发布。随着Linux操作系统飞速发展,各种集成在Linux上的开源软件和实用工具也得到了应用和普及,因此,Linux也成为了开源软件的代名词
许多人认为 10 月 5 日是 Linux Kernel 的周年纪念日,因为这是 Linux 项目在 1991 年首次对外公开发布的时间。
对于很多初学者来说,linux的入门都是非常的困难的,有的人看到一大堆命令就头痛,今天小编就和大家讲述下我学Linux的过程。
许多人认为10月5日是 Linux 系统的周年纪念日,因为这是 Linux 在1991年首次对外公布的时间。不过,你可能不知道的是,早在1991年8月25日,当年还是大学生的 Linus Torvalds 就向 comp.os.minix 新闻组的人透露了由于“业余爱好”他正在研究操作系统的消息。因此,该时间也被许多爱好者视为 Linux 的真正诞生日期。
在使用openstack的过程中,我们经常会添加好几台计算节点来部署虚拟机,在后续使用中由于某些原因,一些计算节点出现了问题,需要将这些出了问题的计算节点从openstack的控制节点中踢出去!但是很多时候,在删除计算节点的时候由于删除不彻底而导致了后面使用openstack出现了诸多问题。 下面记录了在openstack中彻底删除计算节点linux-node2.openstack的操作: 在控制节点上操作 查看计算节点 [root@linux-node1 src]# openstack host list
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