linux fnr_linux awk fnr_FNR - 腾讯云开发者社区

sample.fq FASTQ DNA 3 141 47 47 47 # 统计多个压缩文件 seqkit stat *.fq.gz 用Linux...cat sample.fq | awk 'BEGIN{OFS="\t"}{if(FNR%4==0) base+=length}END{print FNR/4/1000000 " million", base...million 1.41e-07 G # 统计多个文件 for i in *.fq; do cat sample.fq | awk -v name=${i} 'BEGIN{OFS="\t"}{if(FNR...%4==0) base+=length}END{print name, FNR/4/1000000 " million", base/10^9 " G";}' done # sample.fq...%4==0) base+=length}END{print name, FNR/4/1000000 " million", base/10^9 " G";}' done

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Linux 常用命令

执行了这条命令之后，该条shell命令将不会输出任何信息到控制台，也不会有任何信息输出到文件中 2 Linux应用日志定时清理编辑shell脚本 #!...3 Linux 监控 iotop iotop 查看某些进程使用了多少你宝贵的 I/O 资源。...awk '{print FNR,$0}' f.txt cpf.txt # FILENAME 当前输入文件的名 awk '{print FNR,FILENAME,$0}' f.txt cpf.txt #...awk '{print FILENAME,"NR="NR,"FNR="FNR,"$"NF"="$NF}' f.txt cpf.txt echo 1:2:3:4 | awk -F: '{print $1,...FNR:在awk处理多个输入文件的时候，在处理完第一个文件后，NR并不会从1开始，而是继续累加，因此就出现了FNR，每当处理一个新文件的时候，FNR就从1开始计数，FNR可以理解为File Number

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Linux Shell学习简单小结(更新中……)

test_performance_ubclient2_nshead_single_nonblock.cpp 2352 =================================================== linux...b.txt 解法一 awk 'NR==FNR{a[NR]=$1; b[NR]=$2} NR > FNR{print $1 + a[FNR], $2+b[FNR]}' a.txt b.txt 运行结果...744 768 792 ------------------------------------------------------------------------------- 参考拓展： Linux...Make（Makefile）由浅入深的学习与示例剖析 shell if语句示例：文件或目录是否存在或有执行权限 linux实现两个文件内容相加 awk中NR与FNR 百度面试及总结4 shell基础知识...关于RANDOM 的例子 shell函数(传参)的使用参考推荐： Linux Shell函数返回值 Linux 之 shell 比较运算符（推荐） Linux Shell学习简单小结（推荐）

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Linux学习 - 常用和不太常用的实用awk命令

Linux学习系列文章是生信宝典最开始主推的一块，力图从一个新额视角帮助初学者快速入门Linux系统，熟悉Linux下的文件和目录，文件操作，文件内容操作。...而且教程摒弃了完美操作，列举出常见错误和解决方式，管道、标准输入输出解惑Linux下多种信息输出方式。在文件排序和FASTA文件操作中简述了awk和sed的使用，作为一个引子。...NF (number of fields)文件多少列；NR (number of rows) 文件读了多少行: FNR 当前文件读了多少行，常用于多文件操作时。...%4==1) ID=$0; else if(FNR%4==2) seq_len=length($0); else if(FNR%4==0) {quality_len=length($0); if(seq_len...}' shengxinbaodian SXBD 学会了基本命令，生信分析中还有一大块是使用已经安装好的工具，针对软件安装中遇到的问题，推出了系列文章：环境变量和可执行属性彻底释义环境变量的概念；列举出Linux

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linux awk 内置变量实例

ARGIND 当前被处理文件的ARGV标志符 CONVFMT 数字转换格式 %.6g ENVIRON UNIX环境变量 ERRNO UNIX系统错误消息 FIELDWIDTHS 输入字段宽度的空白分隔字符串 FNR...3）记录条数（NR，FNR） awk 'BEGIN{FS=":"}{print NR, $1, $NF, "\t", $0}' /etc/passwd 结果： 1 root /bin/bash ...结果： 1##root##/bin/bash 注： OFS设置默认字段分隔符， FNR当前记录行 5）行记录分隔符（ORS） awk 'BEGIN{FS=":"; ORS="##"}{print FNR...注： ENVIRON是子典型数组，可以通过对应键值获得它的值，linux 环境变量还有$HOME，$PWD等，可以通过linux 命令 env 查看参考推荐： awk 实例（IBM）沉于思考...，默默学习 linux awk 内置函数实例

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大厂程序员必知的排错调试方法

,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FNR,FILENAME,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FILENAME,"NR="NR,"FNR="FNR...`FNR`: 在awk处理多个输入文件的时候，在处理完第一个文件后，NR并不会从1开始，而是继续累加，因此就出现了FNR，每当处理一个新文件的时候，FNR就从1开始计数，FNR可以理解为File Number...-name "*.txt" |xargs cat 更多请参考：Linux sed 命令在新窗口打开或者 Linux sed命令详解在新窗口打开文件操作文件监听 - tail 最常用的tail...系统信息命令 # /proc/ cat /proc/cpuinfo ：查看CPU相关参数的linux系统命令 cat /proc/partitions ：查看linux硬盘和分区信息的系统信息命令 cat.../proc/meminfo ：查看linux系统内存信息的linux系统命令 cat /proc/version ：查看版本，类似uname -r cat /proc/ioports ：查看设备io端口

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Linux排查Java问题工具单

Linux排查Java问题工具单记录一些在Linux中排查Java问题的工具，可以让后续忘记了可快速翻阅 Linux命令 tail 最常用的tail -f tail -200f error.log...FNR:在awk处理多个输入文件的时候，在处理完第一个文件后，NR并不会从1开始，而是继续累加，因此就出现了FNR，每当处理一个新文件的时候，FNR就从1开始计数，FNR可以理解为File Number

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学习笔记0411----正则三剑客之sed、awk

:100::/home/user1:/bin/bash [root@linux-01 ceshi]# 1.3 sed 替换字符 ## 把1到10行中出现的root替换为测试 ## [root@linux...}' /bin/bash /sbin/nologin /sbin/nologin [root@linux-01 ~]# ## 变量NR的使用方法，用做判断 ## [root@linux-01 ~]#...c:d”|awk -F “:” -v get_a=$a ‘{print $get_a}’ image.png 7. awk 合并一个文件 awk ‘NR==FNR {a[1]=2} NR>FNR {print...0,a[1]}’ 1.txt 2.txt 说明： awk ‘{print NR,FNR}’ 1.txt 2.txt //首先理解NR和FNR的不同（awk支持同时操作多个文件内容）当NR==FNR...其实就是第一个文件的内容当NR>FNR，其实就是第二个文件的内容扩展 paste 1.txt 2.txt 8.把一个文件多行连接成一行方法一： a=cat file;echo $a image.png

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Linux之awk命令详解(一)

Linux之awk命令详解今天来讲讲awk命令的使用方法吧。一直以来，对于这个命令我都怀有一种崇敬之情，如果一个人在我面前敲下awk三个字母，我一定会觉得他是Linux界的精英。...awk命令和sed命令以及grep命令被人们成为linux命令中的三剑客，grep适合单纯的查找或者匹配查找结果，set适合编辑匹配到的文本，而awk命令更适合格式化文本，对文本进行较为复杂的格式处理。...pattern以及action三个方面对awk命令进行了一些介绍，接下来我们看看awk命令当中的有些内置变量，常用的内置变量有： NR 行号，当前处理文本行的行号 NF 当前行的字段的个数 FNR...program this#is#a#test#program this#is#a#shell#test#program [root@dev01 yeyz_shell]# awk {'print FNR...FILENAME 显示文件名称 [root@dev01 yeyz_shell]# awk {'print FILENAME,FNR,$0'} awk_test3.txt awk_test4.txt

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awk详解「建议收藏」

awk是linux中处理文本的强大工具，或者说是一种专门处理字符串的语言，它有自己的编码格式。awk的强大之处还在于能生成强大的格式化报告。...NR和FNR FNR表示处理文件的当前记录号，NR表示所有处理文件已处理的输入记录个数。...root@lzj-virtual-machine:/home/lzj/demo# awk -F: '{print "NR="NR, "FNR="FNR, $2}' file file1 NR=1 FNR...the park NR=3 FNR=3 There is a big tiger and a litle tiger in the park NR=4 FNR=1 There is a big dog...参考:linux脚本教程宝典发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn/157379.html原文链接：https://javaforall.cn

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妙啊，这份问题排查工具清单！

Linux命令类 tail 最常用的tail -f tail -300f shopbase.log #倒数300行并进入实时监听文件写入模式 grep grep forest f.txt #...'SHOPBASE' awk 1.基础命令： awk '{print $4,$6}' f.txt awk '{print NR,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FNR...,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FNR,FILENAME,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FILENAME,"NR="NR,"FNR="FNR...FNR：在awk处理多个输入文件的时候，在处理完第一个文件后，NR并不会从1开始，而是继续累加，因此就出现了FNR，每当处理一个新文件的时候，FNR就从1开始计数，FNR可以理解为File Number

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OpenWRT简易版serverchan脚本推送至企业微信

By HKL, on Monday 2021-05-31 15:20, tagged: ️Linux...tmp/tmp/hostname_online.txt ] && echo "接入设备名称" > /tmp/tmp/hostname_online.txt # 上线 awk 'NR==FNR...awk 'NR==FNR{a[$0]++} NR>FNR&&!...newhostname_uniqe_online.txt | grep -v "^$" >> /tmp/tmp/hostname_online.txt fi # 下线 awk 'NR==FNR...{a[$0]++} NR>FNR&&!

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正则复习2

FNR{print 0,a[1]}’ 1.txt 2.txt ?...命令解释：NR表示的是读取的行数（NR会一直累加），FNR则表示读取的当前行数，先读完1.txt的行数再读2.txt的行数，所以其实NR==FNR 就表示读取1.txt的时候。...流程：当读取1.txt时第一行时：NR=0,FNR=0, 第二行时：NR=1,FNR=1, …… 最后一行时，NR=3,FNR=3, 然后开始读2.txt 读2.txt第一行时，NR=4,FNR=0...,此时NR>FNR,所以开始打印第一行1 ab aa 第二行时，NR=5,FNR=2,同样满足NR>FNR,所以开始打印第二行2 cd bb …… 2.txt最后一行时，NR=7,FNR=4,打印最后一行...5 de 从上面我们发现几个特点： 1、第二个文件有几行，就打印几行，因为只有读到第二个文件时，才满足NR>FNR，才能打印 2、NR、FNR都是从零开始计数，NR不清零，FNR读完一个文件后清零 3、

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机器学习-基础知识 - Precision, Recall, Sensitivity, Specificity, Accuracy, FNR, FPR, TPR, TNR, F1 Score, Bal

本文介绍机器学习中的二分类性能评估指标Precision, Recall, Sensitivity, Specificity, Accuracy, FNR, FPR, TNR, TPR, F1 Score...3}=0 FPR_{预测2}=\frac{FP}{FP+TN}=\frac{1}{1+2}\approx0.33 FPR_{预测3}=\frac{FP}{FP+TN}=\frac{3}{3+0}=1 FNR...含义：预测误判为负样本的正样本数量占实际所有正样本的比例： FNR=\frac{FN}{FN+TP}=1-Recall 预测用例FNR： FNR_{预测1}=\frac{FN}{FN+TP}=...\frac{4}{4+3}\approx0.57 FNR_{预测2}=\frac{FN}{FN+TP}=\frac{2}{2+5}\approx0.29 FNR_{预测3}=\frac{FN}{FN+TP

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【linux工具】awk学习笔记

AWK是linux中面向行(line)的编程语言，用于文本处理、提取、格式化、运算等各类文本操作命令行awk => 最简单用法 -F -v var=value...常用变量 FS ( -F) awk -F'-' '{print $1}' a.txt FS="-" NF $NF 当前记录的总域数 NR, FNR Number of...a : b } I/O 控制 getline set $0, NR, NF, FNR getline <file set $0, NF...getline var set var, NR, FNR getline var <file command | getline [var] command...|& getline [var] co-process next nextfile FILENAME, ARGIND, FNR=1 system()

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用awk数组处理两个文件的例子

529::/home/dz02/s2002408032823:/bin/pw [Copy to clipboard] [ - ] CODE: awk 'BEGIN{OFS=FS=":"} NR==FNR...{a[$1]=$2}NR>FNR{$2=a[$1];print}' shadow passwd NR==FNR,第一个文件shadow，以$1为下标，将$2的值赋给数组a NR>FNR，第二个文件passwd...400.00 20050622 66666 0014FFF 500.00 20050401 55555 [Copy to clipboard] [ - ] CODE: awk 'NR==FNR...[Copy to clipboard] [ - ] CODE: awk 'BEGIN{FS="[ |,]";OFS=","}NRFNR{print $1,$2,a[...{a[$1]=$1"x"$2"x"$3} > NR>FNR{b=substr($4,3);c=$3"x"b"x"$6;if(c==a[$3]) print}' file1 file2 01 1111

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Linux-awk及内置变量

ARGIND 当前被处理文件的ARGV标志符 CONVFMT 数字转换格式 %.6g ENVIRON UNIX环境变量 ERRNO UNIX系统错误消息 FIELDWIDTHS 输入字段宽度的空白分隔字符串 FNR...设置输出字段分隔符（OFS使用方法) 指定分隔符为^^ [root@entel2 ~]# awk 'BEGIN{FS=":";OFS="^^"}/^root/{print FNR,$1,$NF}' /...etc/passwd 1^^root^^/bin/bash 默认字段分隔符： [root@entel2 ~]# awk 'BEGIN{FS=":"}/^root/{print FNR,$1,$NF}...,$1,$NF}' [root@entel2 ~]# cat /etc/passwd|head -n 5|awk 'BEGIN{FS=":";ORS="^^"}{print FNR,$1,$NF}' 1...获得linux环境变量（ENVIRON使用） [root@entel2 ~]# awk 'BEGIN{print ENVIRON["PATH"];}' /etc/passwd .

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一份超详细的Java问题排查工具单

Linux命令类 tail 最常用的tail -f tail -300f shopbase.log #倒数300行并进入实时监听文件写入模式 grep grep forest f.txt #文件查找...c 'SHOPBASE' awk 1.基础命令 awk '{print $4,$6}' f.txt awk '{print NR,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FNR...,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FNR,FILENAME,$0}' f.txt cpf.txt awk '{print FILENAME,"NR="NR,"FNR="FNR...FNR:在awk处理多个输入文件的时候，在处理完第一个文件后，NR并不会从1开始，而是继续累加，因此就出现了FNR，每当处理一个新文件的时候，FNR就从1开始计数，FNR可以理解为File Number

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Linux 的 awk 命令教程手册，建议收藏！

Linux 的 awk 命令相信不少人都用过，但是真正研究它的人应该不多。因为，我们多数人都是面向百度编程的。今天我们抽个时间，简单的来说一下它。...awk 是处理文本文件的一个应用程序，几乎所有 Linux 系统都自带这个程序。...$ awk 'BEGIN{printf "%4s %4s %4s %4s %4s %4s %4s %4s %4s\n","FILENAME","ARGC","FNR","FS","NF","NR","OFS...,FS,NF,NR,OFS,ORS,RS}' xttblog.txt FILENAME ARGC FNR FS NF NR OFS ORS RS ----------------...$ awk '{print NR,FNR,$1,$2,$3}' xttblog.txt 1 1 2 this is 2 2 3 Are you 3 3 5 www.xttblog.com,业余草 4 4

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详解Linux三剑客之awk

awk不仅仅是linux系统中的一个命令，而且是一种编程语言；它可以用来处理数据和生成报告（excel）；处理的数据可以是一个或多个文件；可以是直接来自标准输入，也可以通过管道获取标准输入；awk可以在命令行上直接编辑命令进行操作...[root@creditease awk]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.5.1804 (Core) [root@creditease...{a[FNR]=$1}NR!...=FNR{print a[FNR],$2}' file1.txt file2.txt a 2 c 4 e 6 g 8 i 10 解析：NR==FNR处理的是第一个文件，NR!...把输出的结果放入一个新文件new.txt中： [root@creditease awk]# awk 'NR==FNR{a[FNR]=$1}NR!

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统计测序数据reads数和碱基数的几种方法

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