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scRNA-seq揭示非病变性狼疮皮肤有助于骨髓细胞的炎症进展并引发皮肤炎症

CLE 患者病变和非病变皮肤的 KCs 表现出病理性 I 型 IFN 特征 大多数细胞是角质细胞,进一步对角质细胞聚类发现14个亚群,包括(5,6,8和13)由狼疮患者的KCs组成(但是这里看起来11亚群的...KCs比例也挺高)。...这与 KCs 形成了有趣的对比,其中非病变和病变性 KCs 在大多数亚集群中显示出较高的 IFN 模块评分。...将KCs,FBs,T细胞和髓细胞分成各自的子集,关于基质细胞,KC亚群表达的配体主要向EC上的受体发出信号,这表明KCs可能影响免疫细胞组织浸润的机制。IFN FB是所有细胞亚群中最活跃的。...在分析中包含的基质细胞类型中,上皮细胞(此处为KCs)比EC更常出现在CD16+ DC附近,支持CD16+ DC和基底KCs之间的相互作用。

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不应该让细胞数量成为你单细胞项目的限制

pattern of UV-induced cutaneous squamous cell carcinoma》 使用的是 Smart-seq2,总共就350 cells,分成了5个亚群,normal KCs...) 即使是就区区几百个细胞,它的降维聚类分群分析完全不受影响 ,如下所示: 降维聚类分群分析 可以很清晰的看到主要的5个亚群,以及各自的标记基因也很清晰: KRT15, KRT7 (normal KCs...单细胞转录组数据的降维聚类分群 07.单细胞转录组数据处理之细胞亚群注释 08.把拿到的亚群进行更细致的分群 09.单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较 这个文章主要的下游分析就是 cSCC and normal KCs...的差异,就是KCs (Cluster 0) and cSCCs (Cluster 2) 的对比,主要的在cSCCs单细胞亚群里面的上调基因是: seven keratin encoded genes

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Linux - Linux内存管理

为了解决内存紧缺的问题,Linux引入了虚拟内存的概念。为了解决快速存取,引入了缓存机制、交换机制等。...要深入了解Linux内存运行机制,需要知道下面提到的几个方面。 首先,Linux系统会不时地进行页面交换操作,以保持尽可能多的空闲物理内存。...其次,Linux进行页面交换是有条件的,不是所有页面在不用时都交换到虚拟内存中,Linux内核根据“最近最经常使用”算法,仅仅将一些不经常使用的页面文件交换到虚拟内存中。...Linux虽然可以在一段时间内自行恢复,但是恢复后的系统已经基本不可用了。...Linux下可以使用文件系统中的一个常规文件或者一个独立分区作为交换空间。同时Linux允许使用多个交换分区或者交换文件。

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