Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言，运行在超过 100 种计算机平台上，适用广泛，从大型机到便携设备，从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域，Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发，系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux（主要是 CentOS）、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
B. 当IIS中的ASP仅用于后台，同时使用人数较少.前台页面主要以HTML静态页面展示，ASP用来做的事情较少，本身对系统的负担很轻
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题，因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的，尤其是分量很重的VEP，所以即使你再如何如何的讨厌perl，也不得不与之打交道。 这种细节问题问我，我当然无法直接给出答案咯。毕竟，我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客，才意识到，我竟然已经写了7篇教程，关于perl的模块。目录如下： ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
linux的发行版非常多，其实本质上差别不大，哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用，当然ubuntu本身也有版本的区别，目前是16，我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端，建立目录： Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样，用QQ、微信的客户端，都是通过命令行来进行聊天交流的，大概是为了提升逼格吧。
下载： http://mirrors.kernel.org/gnu/m4/m4-1.4.13.tar.gz 拷贝到centos系统上，并解压：
CustomLog ” /var/log/httpd/access_log” combined
centos7不支持mysql，内部集成了mariadb， 而安装mysql的话会和mariadb文件冲突，所以需要先卸载mariadb， 以下为卸载mariadb，安装mysql的步骤
目前最新版本是1.1.1，可以通过修改版本号的方式下载最新版本，最新版本可以在这个网站下载：https://www.openssl.org/source
本文介绍使用XtraBackup工具，将云mysql数据库物理备份恢复到自建数据库
搭建基于apache的nagios系统比较容易，网上的资料也比较多。可是在nginx环境下就有点费劲了，因为nginx本身不支持CGI，所以需要在三方程序的配合下，才能实现CGI的解析。
周末宅在家里，捣鼓了一天，在本地用虚拟机搭建了 4 个 Linux 的集群环境，机器之间实现了相互访问。从此以后我的本地就有一套集群环境了，真正意义上可以模拟分布式的环境了！后面还可以模拟大型电商项目的高并发场景，美滋滋！
下载地址：http://www.erlang.org/download.html
利用转录组数据比对到细胞器参考基因组得到vcf文件，比对工具使用GSNAP或者BWA，检测变异使用GATK或者SAMtools.
在linux/unix环境下使用perl当然很方便了，常用的Vim就能搞定。但毕竟工作的机器使用的是Windows，又不想嫌麻烦去安装虚拟机(机器又会变慢)，所以就想在windows下跑perl了
本文介绍了git在windows和linux下的安装方法，包括下载、编译和安装步骤，并提供了安装过程中可能出现的错误的解决方法。
官网下载地址： https://www.openssl.org/source/ Github地址：https://github.com/openssl/openssl/releases
背景 最近正在拓展 MySQL 数据库知识 发现很多提及 "PerconaTookit" 管理工具的建议 会方便对数据库在线状态下的结构调整 在此，先进行安装一番 … 环境 MySQL版本： mysql 5.7.32 Linux 版本： CentOS7.9 PerconaTookit : 3.0.7 安装步骤 1). 安装第三方依赖包 首先需要安装几个第三方依赖包 yum install -y perl-DBI perl-DBD-MySQL perl-IO-Socket-SSL perl-
大多数人可能在系统磁盘存储不足的情况下执行释放空间这个操作，也可能在 Linux 系统磁盘存储满了的情况下执行这个操作。
circos对于小伙伴们应该都不会陌生，现在应用场景非常的广泛。小编在工作的时候也为了做出惊艳的circos曾大伤脑筋。为了能够让小伙伴们不再做重复性的基础工作，小编系统的整理分享perlcircos 的安装、配置和使用。perl 版本的circos 是Martin Krzywinski在2009年发表在Genome Research 上的一篇题为“Circos: An information aesthetic for comparative genomics”开发的软件。从发表到今天（2019/05/03）引用次数竟高达4296次。很多作图都是非常好看，甚至让人惊艳的。下边小编从官网转过来一些，请大家鉴赏。
关于Th3inspector Th3inspector是一款功能强大的网络侦查信息收集工具，该工具整合了多种信息收集组件，可以帮助广大研究人员在网络侦查活动中完成各种信息收集任务。 值得一提的是，该工具支持在Linux和Windows，甚至是Android操作系统平台上运行。 工具安装 Linux安装 广大研究人员可以使用下列命令将该项目源码克隆至本地： git clone https://github.com/Moham3dRiahi/Th3inspector.git（向右滑动，查看更多）
下载地址：http://dev.mysql.com/downloads/mysql/5.6.html#downloads
本文档是基于CentOS 6.8最小化安装镜像制作，适用于RedHat 6和CentOS 6，Ubuntu等其他linux系统可以参照操作。如有错误，欢迎发送邮件联系我修正，谢谢。
这篇文章中，将会介绍如何利用 Metasploitable 2 上 Unreal IRCd service 存在的漏洞；学习如何对网络服务进行枚举，及如何定义和检索关键信息；分析和使用 msfvenom 来生成 payload 。 为了获取更多关于 Unreal IRCd 的信息，我们还将使用 hexchat IRC 客户端，连接进入到 IRC 频道。 例如：有时我们使用 Nmap 无法获取到具体的版本号时，我们仍可以继续通过当前处理的信息，进行近一步的漏洞评估和发现。在这篇文章中，我们同样将通过，手动
依赖库： + gmp 5.0.4 or gmp 5.0.5 + mpfr 3.1.0 + mpc 0.8.2 or mpc 0.9 + ppl 1.12 or ppl 1.12.1 + isl 0.10 + cloog 0.16.1 or cloog 0.16.2
华盛顿大学的安全研究员Andre'DiMino注意到了多个IP地址试图利用一个已修复PHP漏洞劫持Linux服务器，他很好奇攻击者如何成功控制一台Linux服务器，因此设立了一个蜜罐，运行旧版本的PHP，让攻击者劫持，进行观察。 DiMino发现，攻击者发出了包含多个指令的HTTP POST请求，下载一个伪装成PDF文件的Perl脚本，执行之后删除。为了确保成功，攻击者使用curl、fetch、lwp-get请求重复上述步骤。Perl脚本编程休眠一段时间，猜测可能是避开管理员的观察。最终被感
这篇文章主要介绍了 24 种编程语言的 Hello World 程序，包括熟知的 Java、C 语言、C++、C#、Ruby、Python、PHP 等编程语言，需要的朋友可以参考下。
1、下载安装包“mysql-5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz”
需要Linux版本：centos7 64位 好，我们开始了 1、下载安装包“mysql-5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz” # 安装依赖 yum -y install perl perl-devel autoconf 2、把下载的安装包移动到/usr/local/下。 3、解压 tar zxvf mysql -5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz 4、复制解压后的mysql目录到系统的本地软件目录 cp mysq
1. XMAPP简介 ????? XAMPP（Apache+MySQL/MariaDB+PHP+Perl）开头的X代表X-OS，代表可以在任何常见操作系统下使用，包括Windows、Mac、Linux
最近一段时间在研究后台服务器测试技术，需要对后台服务器的各项性能指标进行实时监控和统计，也由此让我回运维
XAMPP（Apache+MySQL/MariaDB+PHP+Perl）开头的X代表X-OS，代表可以在任何常见操作系统下使用，包括Windows、Mac、Linux，开源平台。
安装 [url]http://sourceforge.net/projects/awstats/[/url] 下载安装包后： GNU/Linux：tar zxf awstats-version.tgz awstats的脚本和静态文件缺省都在wwwroot目录下：将cgi-bin目录下的文件都部署到 cgi-bin/目录下：/home/apache/cgi-bin/awstats/ mv awstats-version/wwwroot/cgi-bin /path/to/apache/cgi-bin/awstats 把图标等文件目录复制到WEB的HTML文件发布目录下，例如：/home/apache/htdocs/ 下发布 更多的批量更新脚本等在tools 目录下，可以一并放到cgi-bin/awstats/ 目录下 升级国内主要 搜索引擎和蜘蛛定义，安装GeoIP的应用库：C [url]http://www.maxmind.com/download/geoip/api/c/[/url] 解包，编译安装 perl -MCPAN -e ‘install “Geo::IP”‘ 或者使用纯Perl包 perl -MCPAN -e ‘install “Geo::IP::PurePerl”‘ 下载GeoIP/GeoIPCityLite包：解包并部署到awstats目录下:
LAMP是 linux Apache MySQL PHP的简写，即把Apache MySQL PHP 安装在linux系统上，组成一个环境来运行PHP网站。这里的Apache是httpd服务。这些可以安装在一个机器上，也可以安装在多台机器上，但是httpd和PHP安装在一台机器上（php作为httpd的一个模块存在的。 他们两者必须要在一起，才能实现效果）
其中star比对过程已经是超级简单了，但是perl脚本就比较麻烦，因为perl本身是上古语言，STAR-Fusion 这个perl脚本依赖的环境会难倒很多人，如下所示的代码架构：
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目，包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具，您可以安装，删除，并在之间切换Perl版本。
在渗透过程中，通常会需要向目标主机传送一些文件，来达到权限提升、权限维持等目的，本篇文章主要介绍一些windows和Linux下常用的文件下载方式。
一、下载 1.官网下载 官网地址:https://dev.mysql.com/downloads/file/?id=482460 2.wget直接下载 wget http://dev.mysql.
对于经常使用SQLplus的网友来说，SQLplus没有提供类似DOS工具的翻页功能，故不能实现SQL语句的来回翻动。现在我们有了Uniread， 减轻了代码的反复输入的工作量，真是让人大快人心。下面是安装方法。 一、所需的安装文件(你可以Google这些文件，或给本人留言留下Email) IO-Tty-1.07.tar.gz Term-ReadLine-Gnu-1.16.tar.gz uniread-1.01.tar.gz 二、查看刚刚下载的安装文件，下面是本人的路径： [root@linux ~]# ll /robinson
ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器。它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎，基于RESTful web接口。Elasticsearch是用Java开发的，并作为Apache许可条款下的开放源码发布，是第二最流行的企业搜索引擎。设计用于云计算中，能够达到实时搜索，稳定，可靠，快速，安装使用方便。目前网络公开部署Elasticsearch大概有数万台服务器，内部网络部署就不计其数了。Elasticsearch用了两个危险性的脚本MVEL和Groovy。2014年5月MVEL爆出来命
在实际的渗透测试中，有的时候需要自己创建一个http服务，来辅助我们的渗透测试，往往我们会遇到各种各样不同的环境，所以使用简单的方式在不同环境下创建一个HTTP服务还是非常有用的。下面我们就简单介绍下，在不同环境下使用一句话启动HTTP服务的各种姿势。
Nginx (“engine x”) 是一个高性能的 HTTP和反向代理服务器，也是一个 IMAP/POP3/SMTP 服务器。 正向代理：
图 1. Webmin 配置屏幕 用户也可以使用 Webmin有一个图标用来配置可选的 Usermin 软件包,这个软件包提供了一个基于 Web 的工具,用户可以借助它完成修改密码、管理系统邮件等任务。使用 Usermin 不能访问系统配置文件。Usermin 和 Webmin 都将是免费的产品。 System 窗体可以进行操作系统的总体配置。在这里,您可以配置文件系统、用户、组和系统通常的引导行为。您可以控制系统中运行的服务,通过选择 Bootup 和 Shutdown 图标来决定它们是否自动启动。不过,对那些服务的具体配置是由 Servers 窗体完成的。尤其要注意“Software Package”工具,它可以方便地查看您系统中已经安装的软件包,以及到发行版本升级库和 rpmfind.net 的接口,rpmfind.net 是 Internet 上的一个公用的 RPM 库。 Servers 窗体可以对您可能会在系统中运行的各个服务进行配置。BIND 和 DHCP 工具非常便捷。同时 Samba 工具也很好用,可以为 Windows 和其他客户机配置文件和打印机的共享。SMTP 服务器 Sendmail 以其极复杂的配置文件而出名。Webmin Sendmail 工具同样为您解决了这一问题。
支持FUSE，相对比较轻量级，对master服务器有单点依赖，用perl编写，性能相对较差，国内用的人比较多，易用，稳定，对小文件很高效。 + 支持文件元信息 + mfsmount 很好用 + 编译依赖少，文档全，默认配置很好 + mfshdd.cfg 加 * 的条目会被转移到其它 chunk server，以便此 chunk server 安全退出 + 不要求 chunk server 使用的文件系统格式以及容量一致 + 开发很活跃 + 可以以非 root 用户身份运行 + 可以在线扩容 + 支持回收站 + 支持快照 - master server 存在单点故障 - master server 很耗内存 测试性能还不错。吞吐量在15MB/秒以上
1、virtual box 官网下载最新 (opens new window)（本次笔记使用的是 VirtualBox-6.0.4-128413-Win.exe），安装完成之后，需要先配置下虚拟电脑的默认位置：管理 -> 全局设定 -> 虚拟电脑位置
杀毒软件公司Eset的研究人员披露了一个正在进行中的恶意程序攻击，被取名为Operation Windigo（PDF） 的恶意攻击感染了超过1万台Linux和Unix服务器，这些服务器被用于发送大量垃圾信息，重定向用户到恶意网页。Windigo的活跃至少始于 2011年，入侵的系统包括了属于Linux基金会的kernel.org和cPanel Web的服务器。 在三年时间内， Windigo感染了超过2.5万台服务器，每天发送3500万垃圾信息，对Windows的访问者发动偷渡下载攻击，向用户
bed格式文件至少包括前3列，分别是：染色体的名字、染色体上的起始位置、染色体上的终止位置。这一步无论用写字板、excel、R等进行处理都可以，文件的后缀名也不重要，因为强行将文件后缀改为bed时，在后面的Linux系统中进行bedtools处理时也会报错。所需的bed格式文件参见下图。
微星笔记本（SMI）相对于常规的GPU服务器要便携很多，对于需要经常搬动的场景，确实很适用。但毕竟微星笔记本定位是玩游戏的，不是做linux服务器，所以尝试把它变成GPU服务器的过程遇到不少坑，这里记录下相关经验。
Annovar是一款对基因组数据进行注释的软件。所谓注释，可以这样简单理解：我们知道二代测序下机后的序列经过比对后，会得到一系列变异数据，这些变异数据只是告诉我们在基因组的某个位置发生了一段序列的改变，至于这个改变会不会影响生物学功能，我们并不清楚。而注释就是将基因组的序列变异数据转化为我们更关心的生物学功能变化的信息。
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