生信技能树学习笔记 sed 流编辑器,一般用来对文本进行增删改查 图片 图片 图片 常见功能: 增 删 改 查 图片 cat readme.txt | sed '1,2i Well' ## 在第一行和第二行的前面增加...well cat readme.txt | sed '1,3d' ## 删除第1-3行 cat readme.txt | sed -e '2i Well' -e '2a Well' ## 第二行的前后加...| sed 's/is/IS/g' ##t 替换全部 cat readme.txt | sed ‘1~3s/ee/EE’ ##1 4 7 ...行的默认第一个ee替换成EE cat readme.txt...| sed '/www/ s/ee/EE' ## 匹配到有www的那一行进行替换 cat readme.txt | sed ‘/ee/p’ ## 有ee那一行多打印一次 cat readme.txt...head -2 Data/example.fa | sed '1d' | sed 'y/ATCG/TAGC/' | rev ##反向互补序列 head Data/example.fa | sed '1d
sed 传入变量: 1 chrI="chr2";sed -n "/$chrI/p" clippointpos.csv #变量用$var表示,把sed的单引号变为双引号即可 awk 传入变量: 1 chrI...="chr2";awk '/"'$chrI'"/{print $0}' clippointpos.csv #变量用$var表示,变量两边再加上"' R脚本传入变量: 1 arg <- commandArgs...(T) 2 filename=arg[1] 3 outputfile=arg[2] python脚本传入变量: 1...."reading %s..." % options.filename 14 15 16 if __name__ == "__main__": 17 main() 2.sys模块传入变量...1 import sys 2 print sys.argv[0] #python程序名 3 print sys.argv[1] #传入的第一个变量
[root@localhost ~]# sed 's/System Administrator/Desktop User/' data3 The first meeting of the Linux System...[root@localhost ~]# sed 'N ; s/System.Administrator/Desktop User/' data3 The first meeting of the Linux.../ ' data3 The first meeting of the Linux Desktop User's group will be heald on Tuesday..../ ' data3 The first meeting of the Linux Desktop User's group will be heald on Tuesday....[root@localhost ~]# sed -n 'N;/System\nAdministrator/P' data3 The first meeting of the Linux System
Linux 命令 sed 命令解析 sed 是一种流编辑器,主要用来对文本进行替换、删除、新增、选取等操作。...sed 的一般形式如下: sed [options] 'command' filename options是可选参数 command是要执行的操作命令 filename是要处理的文件名。...I'm studying sed. 现在要用 sed 命令将其中的第一行 Hello world! 替换为 Hi there!...源码演示: sed '1s/Hello/Hi there/' test.txt Linux 命令 sed 命令注意事项 sed 命令一般不会对原始文件进行修改,而是将修改后的结果输出到标准输出流中,如果需要修改原始文件...sed 命令支持多种操作符,如查找、替换、删除、插入等操作。 sed 命令可以通过正则表达式进行模式匹配,以实现更灵活的操作。
简介 sed 是一种在线编辑器,它一次处理一行内容。...sed使用参数 [root@www ~]# sed [-nefr] [动作] 选项与参数: -n :使用安静(silent)模式。...在一般 sed 的用法中,所有来自 STDIN 的数据一般都会被列出到终端上。但如果加上 -n 参数后,则只有经过sed 特殊处理的那一行(或者动作)才会被列出来。...-e :直接在命令列模式上进行 sed 的动作编辑; -f :直接将 sed 的动作写在一个文件内, -f filename 则可以运行 filename 内的 sed 动作; -r :sed 的动作支持的是延伸型正规表示法的语法...就利用 sed 啊!透过 sed 直接修改/取代的功能,你甚至不需要使用 vim 去修订!
Linux命令之sed 在开始写文章之前,再次重复那句话:sed,grep和awk被称之为Linux三剑客。...这句话我一直在强调,足以说明这三个命令在linux中的重要性,废话不多说,今天我们来看看sed的一些操作。...先来说说sed命令的原理和一些概念,sed之所以能以行为单位的编辑或修改文本,其原因在于它使用了两个空间:一个是活动的“模式空间(pattern space)”,另一个是起辅助作用的“暂存缓冲区(holdingspace...模式空间:sed处理文本内容行的一个临时缓冲区,模式空间中的内容会主动打印到标准输出,并自动清空模式空间 保持空间:sed处理文本内容行的另一个临时缓冲区,不同的是保持空间内容不会主动清空,也不会主动打印到标准输出...sed执行模板如下: sed ‘模式{命令1;命令2}’ 即逐行读入模式空间,执行命令,最后输出打印出来. 01 n命令和N命令 首先来说n命令: 这个命令简单来讲就是读取下一行
sed命令选项 -e script 在处理输入时,将script中指定的命令天到运行的命令中。...'s/wangzi/tiancai w/' this is tiancai w sed编辑器本身不会修改文本文件的数据。...s/pattern/replacement/flags 有四种替换标记 1、数字 表明新文本将替换地挤出模式匹配的地方 2、g 表明新文本将会替换所有已有文本出现的地方 3、p 表明原来行的内容要打印出来...'d' data3 [root@pppoe ~]# sed '2d' data3 one line of test. thress line is test [root@pppoe ~]# sed...[root@pppoe ~]# sed '2,$d' data3 one line of test.
参数详解 [root@linux ~]# sed [-nefr] [动作] 参数: -n :使用安静(silent)模式。...在一般 sed 的用法中,所有来自 STDIN 的数据一般都会被列出到屏幕上。但如果加上 -n 参数后,则只有经过 sed 特殊处理的那一行(或者动作)才会被列出来。...-e :直接在指令列模式上进行 sed 的动作编辑; -f :直接将 sed 的动作写在一个档案内, -f filename 则可以执行 filename 内的 sed 动作; -r :sed...*inet//g' | sed 's/netmask....*$//g' | sed '/^$/d' 使用sed直接修改文件 将所有.修改成! [root@localhost tmp]# sed -i 's/\./\!
sed 把每一行都存在临时缓冲区中,对这个副本进行编辑,所以不会修改原文件。 2. 定址 定址用于决定对哪些行进行编辑。地址的形式可以是数字、正则表达式、或二者的结合。...如果没有指定地址,sed 将处理输入文件的所有行。 地址是一个数字,则表示行号;是“$"符号,则表示最后一行。...范围可以用数字、正则表达式、或二者的组合表示。...6.11 y 命令 该命令与 UNIX/Linux 中的 tr 命令类似,字符按照一对一的方式从左到右进行转换。...使用 sed 脚本时,不再用引号来确保 sed 命令不被 shell 解释。
sed意为“流编辑器(stream editor)” 字符串筛选工具。 对一个文档中的行进行操作 和vi编辑很相似。...可以查看vim使用命令详解 1 sed基本格式 第一种 sed 参数 '脚本语句(/pattern/action)' 待操作文件 第二种 sed 参数 -f '脚本文件' 待操作文件 参数 ?...sed参数 a 追加append i 插入insert d 删除delete s替换substitution $ cat seqtest #!...命令 6.1打印包含特定字符的行 相当于grep命令 $ sed -n '/BUF/p' seqtest read BUF case "$BUF" in 如果不加-n是下面输出 $ sed '/BUF/...扩展sed -r 和grep不同,sed用参数r进行扩展 8 sed一次指定多条不同的替换命令,用";"隔开 9 明白下面例子 $ sed 's/*]>//g' t.html <
在Linux系统中,sed命令是一种非常强大和灵活的工具,可以帮助用户进行多种文本操作,如文本替换、删除、插入、打印等等。...下面是sed命令的详细介绍和使用示例: 命令格式 sed命令的基本格式为: sed [选项] '动作' 文件名 其中,选项用于指定sed的行为,动作则是对文件进行的操作,文件名表示需要处理的文件。...常用操作 sed命令支持多种操作,这里介绍一些常用的操作: 1. 替换操作 sed命令可以用来替换文件中的文本。...例如: $ cat test.txt hello world hello sed $ sed 's/hello/hi/g' test.txt hi world hi sed 上面的命令将文件中的所有hello...删除操作 sed命令可以用来删除文件中的某些行。删除操作的格式为: sed '行号d' 文件名 其中,d表示删除操作。
Linux sed 命令是利用脚本来处理文本文件。sed 可依照脚本的指令来处理、编辑文本文件。Sed 主要用来自动编辑一个或多个文件、简化对文件的反复操作、编写转换程序等。...testfile #查看testfile 中的内容 HELLO LINUX!...Linux is a free unix-type opterating system. This is a linux testfile!...Linux test 使用sed命令后,输出结果如下:$ sed -e 4a\newline testfile #使用sed 在第四行后添加新字符串 HELLO LINUX!...#testfile文件原有的内容 Linux is a free unix-type opterating system. This is a linux testfile!
地址的形式可以是数字、正则表达式、或二者的结合。如果没有指定地址,sed将处理输入文件的所有行。 sed命令功能 命令 功能 a\ 在当前行后添加一行或多行。...& 符号在sed命令中代表上次匹配的结果 sed 's/world/hello_&/g' yum.log ?...备注:范围可以用数字、正则表达式、或二者的组合表示 显示中5到10行里匹配root,把行内所有的root替换为FTL,并打印到屏幕上 sed '5,10 s/root/FTL/g' yum.log【仅显示用...】 sed -i sed '5,10 s/root/FTL/g' yum.log【-i 会真正替换信息】 ?...|sed -n '2p' | sed -r 's#.
Hi, 我是小萝卜算子 既然重温了linux工具——grep文本处理器, 怎能少了sed.........一、介绍 sed是Linux中最常用的"文本处理工具"之一,常规情况下,每次匹配一行内容到模式空间,经过处理变化之后,输出结果 针对个别特殊情况,比如想连续操作多行数据,可使用hold空间以及t,b分支控制输出...-i:对执行文件进行修改 -n:只显示处理过的行 -r:扩展正则表达式 --select(筛选) 筛选条件 (下面英文是我自己想的,同学们看明白即可,开始和结束可自由匹配) num: 具体数字 ,指定具体行比如...:非,类似linux工具——神奇的正则表达式 中的!...r,w 读写(我用的比较少) --content operate(内容操作) s:替换 替换掉匹配的内容,与linux工具——vim文本编辑器整理中命令行模式的替换类似,基本用法:s/src/dest
https://blog.csdn.net/haluoluo211/article/details/77985202 sed 来源 stream editor" 本文主要内容: sed输出指定行...-p:打印和sed -n结合使用 ---- sed输出指定行、排除指定行输出、非连续行输出、行替换显示 ---- 输出指定行sed -n 'n1,n2 p',例如2-3行,sed -n '2,3p'...filename 删除指定行 sed '2,3d' filename 指定行后面添加,字符串,例如 第二行后面添加’after line 2’ sed '2a after line 2' 指定行替换...sed 's/$/Z/g' 最后一个字符替换为’Z’ , sed 's/....$/Z/g' 最后一个字符为0-9则替换为’Z’, sed 's/[0-9]$/Z/g' 行首添加’B’, sed ‘s/^/B/g’ 行首添字符0-9替换为’B’, sed ‘s/^[0-9]/B/g
Sed(Stream Editor)是一个流编辑器,用于文本转换。它可以从标准输入、文件或管道中读取文本,并将其输出到标准输出。Sed主要用于文件处理、文本替换、数据处理和格式化等方面。...在本文中,我们将介绍 Sed 命令的一些常见用法和示例。 用 Sed 命令打印文件内容 sed -n 'p' filename 上述命令将打印 filename 文件的每一行。...用 Sed 命令从文件中提取特定行 sed -n '3p' filename 上述命令将从 filename 文件中提取第三行的文本。...使用 Sed 命令将文本文件按字母顺序排序 sed -e 's/^[[:space:]]*//' -e 's/[[:space:]]*$//' filename | sed 's/ /\n/g' | sort...用 Sed 命令删除文件中的重复行 sed -n 'G; s/\n/&&/; /^\([ -~]*\n\).
Linux Sed命令在工作中的使用 一个线上问题的引发的思考 昨天在处理一个日常运维工单的时候,出现了一个问题,大概是这样的:快到双十一了,公司需要拓展业务,开发的同事想要在一个数据库里面的所有表中添加几个字段...首先,定义两个时间类型的变量,一个起始时间,一个终止时间,然后进行循环,对那7个SQL语句中的时间进行替换,然后将起始时间+1,再去参与到下一轮的循环当中。...在这个过程中,我们对每一轮循环时候的起始时间进行了echo打印,为了实验效果好,我们把时间设定为2018.10.28---2018.11.01,只有4天,跑这个脚本,在Linux的控制终端 我们会看到如下的结果...回过头来再看这个脚本,这个脚本中最重要的一句是: sed -i "s/20181028/${startdate}/g" /home/yeyz/alter_table.sql 这句话的linux里面的sed...这个命令还有很多其他的功能,明天把sed这个命令详细讲一讲吧。
选择第5行 > sed -n '5p' rumenz.txt 选择2到5行,共4行 > sed -n '2,5 p' rumenz.txt > sed -n '2,+3 p' rumenz.txt 选择奇数行...> sed -n '1~2 p' rumenz.txt 选择偶数行 > sed -n '2~2 p' rumenz.txt 从第2行开始打印到文本最后 > sed -n '2,$ p' rumenz.txt...四个字符来替换 > sed '/aaa/s/\/etc/\/usr/g' rumenz.txt > sed '/aaa/s@/etc@/usr@g' rumenz.txt > sed '/aaa/s^/...etc^/usr^g' rumenz.txt > sed '/aaa/s|/etc|/usr|g' rumenz.txt > sed '/aaa/s!...> sed -n '/^rumenz/w 1.txt' rumenz.txt 原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-sed-skills.html
y 表示把一个字符翻译为另外的字符(但是不用于正则表达式) \1 子串匹配标记 & 已匹配字符串标记 4、sed元字符集 ^ 匹配行开始,如:/^sed/匹配所有以sed开头的行。...$ 匹配行结束,如:/sed$/匹配所有以sed结尾的行。 . 匹配一个非换行符的任意字符,如:/s.d/匹配s后接一个任意字符,最后是d。...* 匹配0个或多个字符,如:/*sed/匹配所有模板是一个或多个空格后紧跟sed的行。 [] 匹配一个指定范围内的字符,如/[ss]ed/匹配sed和Sed。...echo sksksksksksk | sed 's/sk/SK/4g' skskskSKSKSK 3、删除文件 删除空白行: sed '/^$/d' file 删除文件的第2行: sed '2d'...file 删除文件的第2行到末尾所有行: sed '2,$d' file 删除文件最后一行: sed '$d' file 删除文件中所有开头是test的行: sed '/^test/'d file
选择第5行 > sed -n '5p' rumenz.txt 选择2到5行,共4行 > sed -n '2,5 p' rumenz.txt > sed -n '2,+3 p' rumenz.txt...选择奇数行 > sed -n '1~2 p' rumenz.txt 选择偶数行 > sed -n '2~2 p' rumenz.txt 从第2行开始打印到文本最后 > sed -n '2,$ p'...四个字符来替换 > sed '/aaa/s/\/etc/\/usr/g' rumenz.txt > sed '/aaa/s@/etc@/usr@g' rumenz.txt > sed '/aaa/s^/...etc^/usr^g' rumenz.txt > sed '/aaa/s|/etc|/usr|g' rumenz.txt > sed '/aaa/s!...-name "*.php" | xargs sed -i.bak '/^[ ]*#/d' 以first开头end结尾的所有行全部打印 > sed -n '/^first.
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