老规矩，总结一下linux 的文本处理。包括但不限于awk, sed, paste,split,grep....
最近在向Linux内核提交一些驱动程序，在提交的过程中，发现自己的代码离Linux内核的coding style要求还是差很多。当初自己对内核文档里的CodingStyle一文只是粗略的浏览，真正写代码的时候在很多细节上会照顾不周。不过， 在不遵守规则的程序员队伍里，我并不是孤独的。如果去看drivers/staging下的代码，就会发现很多驱动程序都没有严格遵守内核的coding style，而且在很多驱动程序的TODO文件里，都会把"checkpatch.pl fixes"作为自己的目标之一（checkpatch.pl是用来检查代码是否符合coding style的脚本）。
在从Windows下移植某脚本文件到Linux环境之后会出现无法编译的情况，遇到类似如下的错误提示：
在使用MySQL的过程中，我们知道可以通过mysqldump或者select into outfile的方法将MySQL中的数据给转换成csv文件，这里简单介绍一下：
从ENSEMBL的注释来看，人基因组中包含60,676个注释的基因，19968个蛋白编码基因。这些基因长度不同、位置不同、转录出的转录本不同，下面我们用几篇推文一步步去了解下基因组中的基因都有哪些令我们惊讶的地方。
我有一个制表符分隔的文件，有超过2亿行。 什么是最快的方式在Linux中将其转换为CSV文件？ 这个文件确实有多行标题信息，我需要在路上去除，但标题的行数是已知的。 我已经看到了sed和gawkbuild议，但是我想知道是否有“首选”的select。
awk、grep、sed 是 linux 操作文本的三大利器，也是必须掌握的 linux 命令之一。三者的功能都是处理文本，但侧重点各不相同，其中属 awk 功能最强大，但也最复杂。grep 更适合单纯的查找或匹配文本，sed 更适合编辑匹配到的文本，awk 更适合格式化文本，对文本进行较复杂格式处理。
这是linux文本操作常用的几个命令，现在进行总结下 命令 常用用法 参数意义/示例 常用作用 cut cut -d '分隔符号'-f fileds cut -d ":" -f 3,5 切，纵向切，切列，相当于剪切,取的是某1列或某几列 cut -c 字符范围 cut -c 12- 切割排列整齐的信息 paste paste [-d] file1 file2 -d后面是分隔符，默认[tab]分隔 追加列，纵向添加，和cut反向对应 cat file1|paster file2 - -如果是管道命令，fi
最近，米老鼠经常需要处理大型文本（500M以上），用R和Python感觉有点太慢，所以就直接使用Linux指令处理了。
[] eg: TATA-box 则可表示为：TATAATAAT. (这里的塔塔盒是指TATAWAWN 其中W=A/T N=ATC/G)
简介 本文主要介绍 Linux 系统的两个神级工具：sed 和 awk ，他们是Linux高手们必备的技能，很值得我们去研究的东西。 这里是我在网上书上收集的相关资料，因为这两个工具很有名也很重要，所以这些资料会帮助我更好的了解和熟悉它们。 什么是sed 在《sed and awk》一书中（1.2 A Stream Editor）的解释是： Sed本质上是一个编辑器，但是它是非交互式的，这点与VIM不同；同时它又是面向字符流的，输入的字符流经过Sed的处理后输出。这两个特性使得Sed成为命令行下面非常有用的
Linux常用命令汇总 dirname、basename作用 去除路径最后一级，即/home/test.sh 输出:/home 输出路径最后一级，即/home/test.sh 输出:te
grep awk sed是Linux下文本处理常用的命令，能完成很多神奇的操作，今天就分享一下这三个命令最常见的用法
文章涉及到vim\grep\cat\more\less\echo\sed\awk的入门用法。
简介： 在 linux 处理文本时要用到工具，执行命令和结果很多时候也是文本方式，处理文本三剑客：grep sed awk。我们常说linux系统中一切皆文件，对服务配置也都是需要编辑相应的配置文件的。对于我们来说，先查看这些配置文件才是重点。在linux中查看文本文件最常见的命令包括cat、tail、more和head。
print working directory，目录连接链接时，-L 输出连接路径，-P 输出物理路径。
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精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
作者精心整理了生物信息学中常用的 Linux 命令，很不容易。所有命令的用法都经本人亲自测试。掌握这些命令，是每一个生信人基本的自我修养。
正则表达式，林林总总说了几篇，还是有不少的内容需要补充。 -->星号 字符出现0次或者多次 $ echo "ik"|sed -n '/e*/p' ik $ echo "ieek"|sed -n '/e*/p' ieek $ echo "This is a color TV"|sed -n '/colou*r/p' --colour中的u可以出现0次或者多次。出现0次的时候color就符合条件 This is a color TV $ echo "This is a colour TV"|sed -n
sed 本身也是一个管线命令，可以分析 standard input ! 而且 sed 还可以将数据进行取代、删除、新增、撷取特定行等等的功能!
继续总结一下linux 的文本处理。包括但不限于awk, sed, paste,split,grep....
编写shell脚本时，您可能需要将多行文本或代码块传递给交互式命令，例如tee，cat或sftp。在Bash和其他类似Zsh的shell中，Here document（Heredoc）是一种重定向，允许您将多行输入传递给命令。
date - print or set the system date and time
碎碎念 今天梳理了这篇文章，同一个地方只能跌一次跟头，再重复错误肯定被老码农敲脑袋 梳理这篇文章源于3月份参加NOI Online测试赛没有全文比较输出文件内容，只是对比了几个值，导致爆零(￣﹏￣；) 标题是老码农起的，心灵鸡汤太多了，以后想管他叫”唐鸡汤“了。(*^_^*) 准备测试文件 mode_ex1.ans 4 1 5 1 4 2 4 8 2 1 2 3 4 5 mode_ex1-2.ans 修改了第13行数据：4 -> 6 4 1 5 1 4 2 4 8 2 1 2 3 6 5 mode_ex
今天写了一个简单的Shell脚本，可以通过这个脚本来得到一个MySQL元数据变化的列表。
All Unix-like operating systems rely heavily on text files for several types of datastorage. So it makes sense that there are many tools for manipulating text. In thischapter, we will look at programs that are used to “slice and dice” text. In the nextchapter, we will look at more text processing, focusing on programs that are used toformat text for printing and other kinds of human consumption.
-多年互联网运维工作经验，曾负责过大规模集群架构自动化运维管理工作。 -擅长Web集群架构与自动化运维，曾负责国内某大型金融公司运维工作。 -devops项目经理兼DBA。 -开发过一套自动化运维平台（功能如下）： 1)整合了各个公有云API，自主创建云主机。 2)ELK自动化收集日志功能。 3)Saltstack自动化运维统一配置管理工具。 4)Git、Jenkins自动化代码上线及自动化测试平台。 5)堡垒机，连接Linux、Windows平台及日志审计。 6)SQL执行及审批流程。 7)慢查询日志分析web界面。
最近在使用阿里云 ECS 时，发现 Centos 无法进行 tab 补全，特别影响操作效率，本文简单记录下 Linux 下的 tab 命令补全功能，希望对 Linux 初学者有所帮助。
Linux命令中有一些常用符号，看到时不一定好查询它们的功能和含义，这里列举一些常见的符号和解释，欢迎大家补充完善。
bash-complete-partial-path 通过添加不完整的路径展开（类似于 Zsh）来增强 Bash（它在 Linux 上，macOS 使用 gnu-sed，Windows 使用 MSYS）中的路径补全。如果你想在 Bash 中使用这个省时特性，而不必切换到 Zsh，它将非常有用。
问题导读 1.Shell该如何学习？ 2.Shell和传统编程语言有哪些相同？ 3.Shell和传统编程语言有哪些不同? 4.你认为Shell还有哪些便捷的地方？ 由于行业的发展，对程序员的要求越来越
本文介绍了如何使用流编辑器sed和编程语言awk对文本进行编辑和处理。首先介绍了流编辑器sed，它是一种非交互式编辑器，可以用于删除、替换和插入文本。然后介绍了编程语言awk，它是一种功能强大的文本处理工具，可以用于各种文本处理任务，包括从文本中提取信息、过滤和转换文本以及处理文本数据。
由于工作需要，最近重新开始拾掇 shell 脚本。虽然绝大部分命令自己平时也经常使用，但是在写成脚本的时候总觉得写的很难看。而且当我在看其他人写的脚本的时候，总觉得难以阅读。毕竟 shell 脚本这个东西不算是正经的编程语言，他更像是一个工具，用来杂糅不同的程序供我们调用。因此很多人在写的时候也是想到哪里写到哪里，基本上都像是一段超长的 main 函数，不忍直视。同时，由于历史原因，shell 有很多不同的版本，而且也有很多有相同功能的命令需要我们进行取舍，以至于代码的规范很难统一。
现在很多人命名的时候都喜欢用空格，例如“An Introduction.doc”。但是这种命名方式给Linux命令行工具和Shell带来了困扰，因为大多数命令中，都是默认以空格做为值与值之间的分隔符，而不是做为文件名的一部分。
In this chapter, we continue our look at text related tools, focusing on programs that areused to format text output, rather than changing the text itself. These tools are often usedto prepare text for eventual printing, a subject that we will cover in the next chapter. Theprograms that we will cover in this chapter include:
awk -F ‘:’ ‘BEGIN{语句} {if(条件){语句1;语句2;语句3} } END{语句}’ filename
----------文本操作命令---------- sed命令：文本编辑工具 sed是一个很好的文件处理工具，本身是一个管道命令，主要是以行为单位进行处理，可以将数据行进行替换、删除、新增、选取等特定工作，下面先了解一下sed的用法 sed命令行格式为： sed [-nefri] ‘command’ 输入文本 常用选项： -n∶使用安静(silent)模式。在一般 sed 的用法中，所有来自 STDIN的资料一般都会被列出到萤幕上。但如果加上 -n 参数
注意：linux通配符和三剑客(grep，awk，sed)正则表达式是不一样的，因此，代表的意义也是有较大区别的。
为了达到更高效的训练，我们要做两件事情：第一，总结归纳；第二，触类旁通。Linux的命令也是如此，一个问题，通常会有多种解决方式，要通过变化找出其中的共性。
在执行命令时，如果找到单个匹配项的可执行文件，则一个 tab 就会将可执行命令自动补全。
由于工作需要，最近重新开始拾掇shell脚本。虽然绝大部分命令自己平时也经常使用，但是在写成脚本的时候总觉得写的很难看。而且当我在看其他人写的脚本的时候，总觉得难以阅读。毕竟shell脚本这个东西不算是正经的编程语言，他更像是一个工具，用来杂糅不同的程序供我们调用。因此很多人在写的时候也是想到哪里写到哪里，基本上都像是一段超长的main函数，不忍直视。同时，由于历史原因，shell有很多不同的版本，而且也有很多有相同功能的命令需要我们进行取舍，以至于代码的规范很难统一。 考虑到上面的这些原因，我查阅了一些相关的文档，发现这些问题其实很多人都考虑过，而且也形成了一些不错的文章，但是还是有点零散。因此我就在这里把这些文章稍微整理了一下，作为以后我自己写脚本的技术规范。
正则表达式（或称Regular Expression，简称RE）就是由普通字符（例如字符 a 到 z）以及特殊字符（称为元字符）组成的文字模式。
描述：在进行shell脚本语言编写的时候,不仅要注意写的功能,更要注意他的美观以及通用性，还需要让其他参与运维的人都能看懂;
一、 正则表达式： 正则表达式（或称 Regular Expression，简称 RE）就是由普通字符（例如字符a 到z）以及特殊字符（称为元字符）组成的文字模式。 该模式描述在查找文字主体时待匹配的一个或多个字符串。 正则表达式作为一个模板，将某个字符模式与所搜索的字符串进行匹配。简单的说，正则表示式就是处理字符串的方法，它是以行为单位来进行字符串的处理行为，正则表示式通过一些特殊符号的辅助，可以让使用者轻易的达到搜寻/删除/取代某特定字符串的处理程序。vim、grep、find、awk、sed
Sed is a stream editor. sed全称是：stream editor 流编辑器 对文件的操作无非就是”增删改查“，sed命令就是实现对文件的”增删改查“。
1.操作系统概念 人与计算机交流的中介 管理和控制计算机中硬件和软件资源 处于上层应用程序和底层硬件之间的软件平台 2.操作系统组成 内核：直接控制管理硬件 内核直接识别计算机二进制语言 解释器：把c c++ java python等语言解释成二进制，常见的解释器：bash 软件程序：不同程序，完成不同需求 3.Linux系统介绍 开放源代码的，可以自由传播的类Unix操作系统 多用户、多任务，支持多线程和多cpu的操作系统 4.Linux发展史 AT&T 美国电话局 unix(肯.汤普逊，丹尼斯.里奇) 1970 美国加州大学，伯克利分校 UNIX小组 FreeBSD--macOS、IOS NETBSD OPENBSD minix--荷兰，詹宁邦 1980 Linux--芬兰 赫尔辛基大学 林纳斯.托瓦斯 1991
Linux下文件内容操作 常用的文件内容操作有文件压缩解压缩、文件大小行数统计、文件内容查询等。 gzip: 压缩文件; gunzip: 解压缩文件 # gzip -c 把压缩的文件输出到标准输出 (一般是屏幕) # '>' 输出重定向，输出写入文件 ct@ehbio:~/ehbio_project$ gzip -c ehbio.fa >ehbio.fa.gz # 多了一个.gz文件 ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ehbio3.fa ehbio4.fa ehbio5.fa
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