Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言,运行在超过 100 种计算机平台上,适用广泛,从大型机到便携设备,从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux(主要是 CentOS)、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
EXPORT_SYMBOL只出现在2.6内核中,在2.4内核默认的非static 函数和变量都会自动导入到kernel 空间的, 都不用EXPORT_SYMBOL() 做标记的。 2.6就必须用EXPORT_SYMBOL() 来导出来(因为2.6默认不到处所有的符号)。
在 Linux 系统命名文件则没有 Windows 系统这么多限制,上述 Windows 的保留字符都可以出现在 Linux 系统中。因此,当跨平台同步文件时,会出现 Windows 系统上的文件同步到 Linux 系统没有问题,但 Linux 上文件名带有上述 Windows 系统的保留字符的文件则无法同步到 Windows 系统上。为了解决这个问题,本人采用的方法是在 Linux 系统中将带有上述 Windows 系统保留字符的文件名进行修改,将其中的保留字符替换成中文环境下的字符(大部分为全角),具体替换映射如下:
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KRIe是一款功能强大的带有eBPF的Linux内核运行时安全检测工具,该工具旨在利用eBPF的功能来检测Linux内核中的安全问题。KRle远远不止是一种防御策略那么简单,该项目的主要目标是增加攻击者的攻击难度,并防止那些开箱即用的漏洞利用策略直接在目标设备内核上发挥作用。
/proc/kallsyms会显示内核中所有的符号,但是这些符号不是都能被其他模块引用的(绝大多数都不能),能被导出的是符号的类型是大写的那些(例如T,U)。
系统调用 跟用户自定义函数一样也是一个函数,不同的是 系统调用 运行在内核态,而用户自定义函数运行在用户态。由于某些指令(如设置时钟、关闭/打开中断和I/O操作等)只能运行在内核态,所以操作系统必须提供一种能够进入内核态的方式,系统调用 就是这样的一种机制。
若要安装最新版 dotnet-symbol NuGet 包,请使用 dotnet tool install 命令:
最近在进行词典笔的离线解码器测试,遇到了各种内存泄漏以及崩溃问题,为了协助开发定位问题,用到了Valgrind和BreakPad工具,下面就简单介绍一下这两个小工具吧。
值得注意的是,里面的 AnnoProbe包是可以根据不同物种的ENSEMBL信息去转为SYMBOL信息,实际上它这个转换是基于我对人类和小鼠的gtf文件的解析。
进程调度(SCHED)、内存管理(MM)、虚拟文件系统(VFS)、网络接口(NET)和进程间通信(IPC)
前言: ELF只linux是最常用的可执行文件格式,这里简单分析一下ELF格式,介绍几个常用命令,并分享几个不常见的问题。 分析: 1,dynamically link 老习惯,从“Hello W
前段时间有人在 opentelemetry-cpp 提出了api组件在动态库中单例无法工作的 issue ,( https://github.com/open-telemetry/opentelemetry-cpp/issues/1520 ) 。
kprobe机制用于在内核中动态添加一些探测点,可以满足一些调试需求。本文主要探寻kprobe的执行路径,也就是说如何trap到kprobe,以及如何回到原路径继续执行。
Golang是静态编译型语言,在编译时就将所有引用的包(库)全部加载打包到最终的可执行程序(或库文件)中,因此并不能在运行时动态加载其他共享库。Go Plugin提供了这样一种方式,能够让你在运行时动态加载外部功能。go在1.8 支持了这个功能,类似c语言的动态链接库。
将一个字符串转换成一个整数(实现Integer.valueOf(string)的功能,但是string不符合数字要求时返回0),要求不能使用字符串转换整数的库函数。数值为0或者字符串不是一个合法的数值则返回0。
作 者 段聪,腾讯社交平台部高级工程师 商业转载请联系腾讯WeTest获得授权,非商业转载请注明出处。 WeTest 导读 近期测试反馈一个问题,在旧版本微视基础上覆盖安装新版本的微视APP,首次打开拍摄页录制视频合成时高概率出现crash。 那么我们直奔主题,看看日志: 另外复现的日志中还出现如下信息: '/data/data/com.tencent.weishi/appresArchiveExtra/res1bodydetect/bodydetect/libxnet.so: strtab
前言: 在《[linux][pthread]qemu的一次pthread create失败的分析》中分析了pthread失败的原因以及解决方法。修改了pidmax之后,一直没有看到现象发生,但是不能证明问题被解决了,因为当时的环境只有coredump文件,没有找到固定的复现规律。继续观察中。 坏消息是问题又复现了。 好消息是问题能复现了。 分析: 1,clone fail 作者写了脚本,批量启动大量的qemu进程。在启动很大量的qemu之后,会有部分qemu进程crash。结合之前的分析过程,作者判断,
我们可以直接使用apt安装cflow。graphviz则是用于在最后一步将dot文件转换成图片,我们先提前将其安装好。
Inline Hook技术能够帮助我们完成函数的动态拦截和跳转,但要实现缺陷函数的自动化热修复则会面临更加复杂的挑战。本文从一个实际例子出发,阐述了在对二进制形式的Linux固件做自动化安全加固的时遇到的技术难题和解决办法。
Linux 内核源码 linux-4.12\mm\memblock.c#34 位置 , 定义了 struct memblock 类型的变量 , 在该结构体赋值时 , .bottom_up = false 将 bottom_up 设置为了 false , 表示内存从 高地址向下分配 ;
Zint是一个软件,允许在任何广泛的公共领域条形码标准中轻松编码数据,并允许将这种功能集成到您自己的程序中。
原文链接:https://wetest.qq.com/lab/view/421.html
因为某个场景的需求,要在一个国产系统Rocky4.2(国产凝思4.2操作系统)上安装Apache,虽说此系统是基于Redhat 5.8开发的,但是发现yum安装源包管理,RPM命令倒是能用,但是底层依赖完全没有,这就尴尬了,so,只能源码编译安装了。
介绍 今天给大家推荐的这个代码库将允许原生Linux程序从一个WindowsDLL文件中加载或调用功能函数。下面是一个简单的演示示例,我将Windows Defender“移植”到了Linux平台。 $ ./mpclient eicar.com main(): Scanning eicar.com... EngineScanCallback(): Scanning input EngineScanCallback(): Threat Virus:DOS/EICAR_Test_Fileidentified
本文适用于CentOS 6.4, CentOS 6.5,估计也适用于其他Linux发行版。
转变 C/C++的 .h文件为python模块源文件,所有匹配都基于c++限定名,使用正则表达式。
Google breakpad是一个跨平台的崩溃转储和分析框架和工具集合。 Breakpad由三个主要组件:
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今天写周报的时候提到了这个话题,顺便就记录一下如何逃离 Rust 编译时的内存溢出。
使用maven来进行源码,真的是靠运气,特别是你网络很差的情况下,再特别是你没有本地库的时候,靠运气吃饭。。。
最近打算学一下QT应用程序开发,所以打算装一个QT桌面环境QtCreator,捣鼓了一阵,把电脑弄坏重装系统之后,终于安装好了,这里分享一下安装的过程
Linux下经常碰到需要解压文件的情况,需要用到tar命令,本文主要介绍一下tar命令。
利用linux kernel 动态追踪技术,排查问题本身就可能会变成一个非常有趣的过程,让我们遇到线上的诡异问题就感到兴奋,就仿佛好不容易又逮着机会,可以去解一道迷人的谜题。
部门用来开发的服务器之前的系统是ubuntu16.04的,已经好多年了,因为数据量庞大,更新系统怕有风险,一直没有升级。老系统局限性太多了,现在好多项目需要安装的软件版本太低,像openwrt、fenix一些工程编译所需要的最低系统环境都满足不了,所以最近终于把系统升到了ubuntu22.04,估计又可以用好几年了。
根据当前帧的eip(x86)来调用 CodeModules::GetModuleForAddress()返回当前frame所属的模块信息
前言 很抱歉各位粉丝啊,博主好久没有更新原创文章,从今天起开始恢复写文章的时光。前段时间各种不顺利,到时心情低落。现在恢复状态了。 简介 本文主要来讲讲Linux内核驱动中,EXPORT_SYMBOL()宏定义的用法。 在阅读的Linux内核驱动源码的时候,我们会发现很多的函数带有EXPORT_SYMBOL()宏定义。 📷 从这个宏定义的理解为输出符号。那么他究竟有什么作用。 EXPORT_SYMBOL()宏定义作用 EXPORT_SYMBOL宏定义定义的函数或者符号将对内核代码公开,不用修改内核代码就在
我们的撮合引擎作为一个相对通用的组件,其实就是一个黑箱,如果想将它应用到各种不同的交易系统,只要有标准的输入和输出,对接是很容易的。
AT&T公司于20世纪70年代发布了UNIX系统。经过多年的发展,Unix不再是某一个具体操作系统的名称,而是对遵循Unix规范、设计和哲学的一类操作系统的统称。还有一些操作系统,它们遵循Unix设计、有着与Unix类似的规范和标准,这些操作系统被称为类Unix系统(Unix-like),Linux就是其中的一员。
https://zetaoyang.github.io/post/2016/11/05/linux-shared-object.html
libHaru是一个用来生成PDF文件的C语言、跨平台开发开源包,能再Windows、Linux、FreeBSD等等下使用。它支持线条、文本、图片、轮廓、文本注释、链接注释、文档压缩、图片嵌入、TrueType字体、加密PDF、支持多种字符集。libHaru目前的稳定版本是V2.3版。 编译libHaru这个开源库,需要其它的开源作为依赖,下面我们在Windows下编译libHaru。 1,下载zlib库,这个在官方网站上有最新的windows版本bin,不需要编译。 2,下载libpng,这个没有wi
同时官方文档也提示了:Currently plugins are only supported on Linux and macOS .它目前支持Linux和Mac操作系统(不支持windows)
ftrace(FunctionTracer)是Linux内核的一个跟踪框架,它从2008年10月9日发布的内核版本2.6.27开始并入Linux内核主线[1]。官方文档[2]中的描述大致翻译如下:
熟悉高通平台的童鞋可能会比较熟悉,高通有ramdump功能,当系统crash后通过warm reset重启来抓取ram中的数据,然后利用Trace32进行故障现场的查看来排查问题。这实际上用到的就是trace32的simulator功能,也就是仿真器功能,我们只需要获取到设备的内存快照来进行指令集的仿真,以此查看故障现场,而不用真实的连接目标板来实时调试。
Cytoscape项目致力于为用户提供一个开源的网络显示和分析软件。软件的核心提供榴莲网络显示、布局、查询等方面的基本功能。软件的核心可以通过插件构架进行扩展,能快速地开发新的功能。
在讲解各编译器之前,必须先了解一下以下这些文件。这些文件在编译器目录下或者编译生成目标平台的可执行程序时经常见到。此外,还需要注意区分 Windows 平台 和 Linux 平台的文件。
前言:之前的文章介绍了基于 tracepoint 静态追踪技术的实现,本文再介绍基于 kprobe 的动态追踪即使的实现。同样,动态追踪也是排查问题的利器。
Linux学习系列文章是生信宝典最开始主推的一块,力图从一个新额视角帮助初学者快速入门Linux系统,熟悉Linux下的文件和目录,文件操作, 文件内容操作。而且教程摒弃了完美操作,列举出常见错误和解决方式,管道、标准输入输出解惑Linux下多种信息输出方式。 在文件排序和FASTA文件操作中简述了awk和sed的使用,作为一个引子。本篇则详细列举关于awk常用的操作和一些偏门的操作。 awk基本参数解释 awk擅长于对文件按行操作,每次读取一行,然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是a
在 Linux 上遇到性能问题时,可使用 perfcollect 收集跟踪,以便收集有关出现性能问题时计算机上发生的状况的详细信息。
关于gcc问题解决 最近gcc编译出来的so库之类的使用总有问题,收集资料后简单整理下解决方法: 首先使用ldd 或者ldd -r XXX 查看文件所连接的so库有没有问题,目前我看到的经常是出现(undefined symbol: lua_getfield)在c中,动态库中的symbol就是函数名,所以一看到就知道是lua库没有链接导致函数找不到加上-llua即可以解决。 而c++由于允许重载,就出现同一个函数名可能对应多个实际的函数问题,于是就会有name mangling ,而且这个mangling完
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