vSphere是VMware推出的虚化平台套件,包含 ESXi、vCenter Server 等一系列的软件。其中 vCenter Server 为 ESXi 的控制中心,可从单一控制点统一管理数据中心的所有 vSphere 主机和虚拟机,使得 IT 管理员能够提高控制能力,简化入场任务,并降低 IT 环境的管理复杂性与成本。
1 解压命令 tar -xvf filename.tar tar -zxvf filename.tar.gz tar -zxvf filename.tgz tar -jxvf filename.tar.bz2 tar -xZvf filename.tar.Z unrar e filename.rar # 解压到当前目录 unrar x filename.rar /path/to/extract unzip filename.zip -d filepath tar.xz文件解压:先xz -d xxx.tar.xz到tar,然后tar xvf xxx.tar 2 压缩命令 tar -zcvf filename.tar.gz filename tar -zcvf filename.tgz filename tar -jcvf filename.tar.bz2 filename zip filename.zip filename zip -r location.zip location gzip -d filename.gz filename rar -a filename.rar filename 3 多个压缩文件 如果遇到某个文件夹过大,需要将压缩文件跟个成 N 个指定大小的文件,便于邮件等方式传输,可以使用下边的方法
2、压缩后的文件太大,需要将cm-11.tar.gz分割成N个指定大小的文件,怎么办?一条命令搞定
split命令:可以将一个大文件分割成很多个小文件,有时需要将文件分割成更小的片段,比如为提高可读性,生成日志等。
高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库。
**注意:**NCBI其实已经更新了一个多线程抽取工具fasterq-dump,可以在sratools的bin目录里找到,但是文档没有写,没有特殊需求的话,可以考虑直接用新工具替代。
Python os模块提供了一个统一的操作系统接口函数,通过python os模块可以实现对系统本身的命令,文件,目录进行操作,官方参考文档( http://docs.python.org/library/os)。 1)os.sep 可以取代操作系统特定的路径分割符(在Linux、Unix下它是'/',在Windows下它是'\\',而在Mac OS下它是':')。
linux一切都在命令行下操作,有着丰富的命令行工具。但是当你对命令不熟(再优秀的程序员也无法记住全部),却想做什么的时候却有点懵,比如用于打包解压缩命令的tar,怎么用?
SRAtoolkit是NCBI提供的SRA文件处理工具集, SRA文件是NCBI的SRA数据库数据的储存格式,许多公开的scRNA-seq数据都会上传到该数据库。SRAtoolkit将NCBI的SRA数据库中SRA文件转换为FastQ文件。
近日需要给服务器做备份,在网上找到了一个现成的金山快盘的api:https://github.com/deren/python-kuaipan (感谢!) 试了一下,遂决定备份到金山快盘上。
通过封装Paramiko这个SSH模块,我们可以实现远程批量管理Linux主机,在上一篇文章中我们封装过一个MySSH类,这个类可以执行命令上传下载文件等,我们在这个类的基础上,实现一个简单的任务执行功能。
作为一名测试人员,在测试过程中,我们需要去部署测试环境,查看服务器上面的日志,登陆数据库,甚至做一些shell脚本类的工具开发,必不可少都会用到Linux命令。所以无论是开发还是测试,Linux命令已经成为常规操作,很有必要去学习。
scTCR可以更细致的获取肿瘤免疫微环境的变化,比如单细胞转录组可以获取不同样本,不同分组(癌和癌旁,是否治疗,是否响应)的celltype组成,可以知道哪些celltype发生变化。
paramiko 是一个用于在Python中实现SSHv2协议的库,它支持对远程服务器进行加密的通信。目前该模块支持所有平台架构且自身遵循SSH2协议,支持以加密和认证的方式,进行远程服务器的连接,你可以在Python中实现SSH客户端和服务器,并进行安全的文件传输和远程命令执行。
nodejs + cheerio + request-promise + mongoose
用命令查询系统是32位还是64位 getconf LONG_BIT or getconf WORD_BIT 例如: [root@sy02 /]# getconf LONG_BIT 64 file command 例如: [root@sy02 /]# file /bin/ls /bin/ls: ELF 64-bit LSB executable, AMD x86-64, version 1 (SYSV), for GNU/Linux 2.4.0, dynamically linked (uses share
QT6从2020年12月8号就开始发布了,具体可以参考Qt 6.0 Released这篇博客,如下图所示:
python写的系统常用命令,linux和windows通用,用的时候直接from util import *导入即可使用,很方便,本来是一个脚本,但是博文有字数限制,只能分成两部分发了,第二部分连接:http://wangwei007.blog.51cto.com/68019/960000 。
本地模式:你可以在你的本地机器上开发测试你的topology, 一切都在你的本地机器上模拟出来;
SPAdes 是由俄罗斯科学院 St. Petersburg Academic University 与美国科学家合作开发的主要应用于小型基因组如细菌,真菌等基因组测序数据的拼接软件。目前的最新版本 v3.6.2 可以支持常见的 illumina miseq/hiseq 和 ion torrent 测序数据,对单分子测序平台的 pacbio 和 nanopore 的测序数据也能进行拼装,还能进行混合数据的拼装。在 GAGE-B 的测拼里,在 Miseq 平台上的结果获得了最好的评价。
https://www.php.net/manual/zh/install.fpm.install.php
在安装 pyspider 的时候我就遇到了这个问题, pyspider 依赖 pycurl 这个库,而 pycurl 要求系统中存在相对应的库。
① max file descriptors [4096] for elasticsearch process is too low, increase to at least [65535]
原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-useful-cmd.html
原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-bak-system-file.html
安装SRA tools Linux环境下按照以下步骤怎样获得一个自己的服务器请看以下教程“站长,没钱买高配置电脑咋做转录组分析?” 下载SRA toolswget "ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz"解压tar -xzf sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz添加环境变量export PATH=$PATH:~/downlo
NameError: global name 'Image' is not defined
一个项目正式交付客户使用了,对于版本的升级和代码更新是个一直困扰的问题,由于之前一直都是内部人员使用,可以让他们每次都下载完整压缩包(压缩后大概 40-50MB),但对于正式的终端用户,这个体验是不可接受。 参考过 Electron 官方文档,里面提及的方案兼容性并不好(Linux 不支持),需要准备的东西不少,而且交互上也不满意;本文介绍方案的细节及中间遇到的一些坑。
这些命令可能你没怎么用过,但记住他们,需要的时候可以帮大忙! pgrep pgrep名字前有个p,我们可以猜到这和进程相关,又是grep,当然这是进程相关的grep命令。不过,这个命令主要是用来列举进程ID的 想要找到 SSH 服务器的 PID > pgrep ssh 1529 28439 28442 28719 pgrep会在每一行打印一个匹配的进程。-d选项允许你指定一个分隔符 > pgrep ssh -d " " 1529 28439 28442 28719 28810 28813 -l选项告诉pgr
pgrep pgrep名字前有个p,我们可以猜到这和进程相关,又是grep,当然这是进程相关的grep命令。不过,这个命令主要是用来列举进程ID的 想要找到 SSH 服务器的 PID > pgrep ssh 1529 28439 28442 28719 pgrep会在每一行打印一个匹配的进程。-d选项允许你指定一个分隔符 > pgrep ssh -d " " 1529 28439 28442 28719 28810 28813 -l选项告诉pgrep显示名称和 ID: > pgrep -l ssh 1529
pgrep名字前有个p,我们可以猜到这和进程相关,又是grep,当然这是进程相关的grep命令。不过,这个命令主要是用来列举进程ID的。
微软近期开源了一个新的名为 Open Service Mesh[1] 的项目并准备捐赠给 CNCF[2] 。
os.makedirs('dirname1/dirname2') 可生成多层递归目录
猫头虎博主在此为大家带来了《Linux系统常用命令100条速记指南》。在Linux系统操作中,掌握基础命令对于优化工作效率至关重要。为了帮助初学者和老手们更快捷地掌握这些命令,这篇文章精心总结了Linux系统中的常用命令,并为大家提供了丰富的实例演示。本文涵盖了文件操作、系统查询、网络工具等多方面内容,同时为了搜索引擎优化,特地加入了Linux、速记、命令等 ,让大家更容易找到这篇宝典!
Linux是最适合开发的操作系统,它是把所有的操作权都交给了用户,有什么操作,就会呈现出什么样的格局。开放、自由、诚实,就是它最大的魅力。
在Linux操作系统上编写shell脚本时, 主要涉及到执行系统命令, 目录和文件操作. 那么在python中怎么办呢, 这主要是几个模块的使用: os, os.path, shutil和sys...
Sqoop是一个用来将Hadoop(Hive、HBase)和关系型数据库中的数据相互转移的工具,可以将一个关系型数据库(例如:MySQL ,Oracle ,Postgres等)中的数据导入到Hadoop的HDFS中,也可以将HDFS的数据导入到关系型数据库中。
这里采用makefile来打包,目标是运行在linux上,所以需要进行交叉编译,其中@表示控制台不输出,<my_app>表示编译后的可执行二进制文件名称,<muduleA>要编译的模块,该模块下必须包含main.go文件
其实我现在已经不写软件教程了! fastqc对原始测序reads质控 NCBI的blast++软件使用说明书 SRA工具sratoolkit把原始测序数据转为fastq格式 目录 一:下载安装该软件 二:准备数据 三:运行命令 四:输出文件解读 正文 一:下载安装该软件 在NCBI的ftp站点里面可以找到blast++的下载链接 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.ta
本文介绍了如何利用 Spark 进行大数据分析,包括数据处理、数据挖掘、机器学习等方面的应用。通过介绍 Spark 的架构、数据处理流程、编程模型、性能优化等方面的内容,让读者对 Spark 有更深入的了解。同时,本文还提供了实践案例,让读者更好地理解 Spark 在实际项目中的应用。
Kallisto是由Nicolas Bray主导开发的一款专门用于从 RNA-Seq 数据中量化转录本的表达丰度的工具。发表于 2016 年的《Nature Biotechnology》期刊,其具有以下特性:
5、修改【hadoop-2.7.3】以及【jdk1.8.0_112】文件夹名称为【hadoop】以及【jdk】(5分)
还没走出期中考试,期末开始又要来了,为了期末成绩,为了完成flag,快和大雄一起加油学习吧!
一些重要文档格式之间的互转在目前显得尤为重要,pdf作为通用格式在现在各个平台上兼容性是最好的,所以写python脚本将这些word文档批量转换pdf是最好的解决方案。
Linux是最适合开发的操作系统。它是把所有的操作权都交给了用户,有什么操作,就会呈现出什么样的格局。开放、自由、诚实,就是它最大的魅力。
注:在使用源码安装时,需要使用到gcc编译和python开发环境,所以,需要先执行:
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