我分享给大家的ngs流程里面经常是需要制作配置文件,里面的每个样品名字都有两个测序文件,因为目前都是双端测序,制作配置文件的过程其实就是Linux下的文本处理,代码如下所示: echo A_{1..25...fq.gz A_12_1.fq.gz A_1_2.fq.gz A_2_1.fq.gz A_22_2.fq.gz A_22_1.fq.gz A_2_2.fq.gz 出现了少量样品的排序混乱情况...引用: (公众号推文) linux命令行文本操作一文就够 (公众号推文)linux系统环境变量一文就够 (公众号推文)构建shell脚本一文就够 (公众号推文) conda管理生信软件一文就够 shell...fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com.../3578.html VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
转载自:实现一个简单的进度条 我们平常总会在下载东西或者安装软件的时候看到进度条,这里我们就在linux下实现这个进度条的功能。...在这里需要解释一下'\r'和'\n'这两个概念: 回车:'\r',表示回到当前行的行首 换行:'\n',表示光标进入下一行 ---- 2、加入睡眠时间,否则结果一下子就全部打印出来了,就不是进度条了...---- 3、手动刷新缓冲区 现在来看一下UNIX里面关于标准IO的几种缓冲机制: 全缓冲:指的是系统在填满标准IO缓冲区之后,才进行实际的IO操作 ;磁盘上的文件通常由标准IO库实施全缓冲
Linux下根据文件大小展示 按文件从大到小 其是按照由大到小排序 ls -Sl or ll -S 如果想要从小到大: ls -Slr or ll -Sr 如果想要输入是按照“便于人类阅读的方式
Linux 下可以使用 pdfimages 命令来从 PDF 文件中提取图片文件。如果你的 Linux 发行版上没有该命令,需要安装 poppler-utils 软件。...pdfimages 命令的语法格式如下: pdfimages -f -l -png # 指定范围页面从 PDF 文件中提取图片并输出为
本节内容,介绍在linux系统查找指定的文件,并按时间顺序进行排序的方法。...例如,查找当前目录下的所有 version.ini文件,并按时间排序,运行命令: find ./ -name version.ini |xargs ls -lta 查找当前目录下的 .metadata...文件夹,按时间顺序排序,并且将文件夹下面的文件列出,运行命令: find ./ -name .metadata |xargs ls -lt 列出所有文件,运行命令: find ./ -name .metadata
Linux下pip换源遇到的坑 #1 环境及需求 1.1 环境 CentOS 6.9 Python 3.4 #1.2 需求 pip镜像国外的下载速度慢,需要将pip镜像源换成国内镜像 #2 开始 #2.1
工作中使用MapReduce任务导出一批含有路径的文件,共计行数300W+,需要检测文件是否在对应的服务器中存在,而文件所在的服务器并非hadoop集群的服务器...
事件背景 最近几天在Linux系统部署服务过程中,常常会用到tar(压缩/解压缩)命令,如果只有个别两个xx.tar.gz文件,还能通过tar -xvf xx.tar.gz命令快速实现解压缩操作,但如果几十...实现思路: 在存放可执行程序的目录下创建一个可执行脚本文件 将上述批量解压缩命令写在可执行文件中 赋予该文件执行权限、重新加载配置 实现过程 1.创建shell脚本 Linux下存放脚本目录及作用 目录
详解Linux 下开发微信小程序安装开发工具 1. git clone https://github.com/yuan1994/wechat_web_devtools 然后创建一个文件夹 mkdir /
1.1.3 异步阻塞 按下开关后,傻等水开(阻塞),水开后自动断电(异步)。 ? 网络编程中不存在的模型。 1.1.4 异步非阻塞 按下开关后,该干嘛干嘛 (非阻塞),水开后自动断电(异步)。 ?...Linux在处理文件和网络连接时,都需要打开和关闭FD。...将数据从内核拷贝到进程中(CPU闲置)。 怎么优化呢? 对于一次I/O访问(以read举例),数据会先被拷贝到操作系统内核的缓冲区,然后才会从操作系统内核的缓冲区拷贝到应用程序的地址空间。...缺点: 跨平台,Linux 支持最好。 底层实现复杂。 同步。 ...文章来源:宜信技术学院 & 宜信支付结算团队技术分享第8期-宜信支付结算部支付研发团队高级工程师周胜帅《从操作系统层面理解Linux的网络IO模型》 分享者:宜信支付结算部支付研发团队高级工程师周胜帅
冒泡法是相邻元素两两比较,每趟将最值沉底即可确定一个数在结果的位置,确定元素位置的顺序是从后往前,其余元素可以作相对位置的调整。可以进行升序或降序排序。...可进行降序排序或升序排序。 2.冒泡法: 算法分析: 如果有n个数,则要进行n-1趟比较。在第1趟比较中要进行n-1次相邻元素的两两比较,在第j趟比较中要进行n-j次两两比较。...代码如下(对10个整数进行升序排序): #include int main() { int i,j,t,a[10]={5,4,8,3,6,9,7,222,64,88}; //...排序 for(i=1;i<10;i++) //外循环控制排序趟数,n个数排n-1趟 { for(j=0;j<10-1;j++) //内循环每趟比较的次数,第j趟比较n-i次 {...printf("排序前的序列为:\n"); for(i=0;i<10;i++) //输出排序前的序列 { printf("%5d",a[i]); } printf("\n"); for
前提提要 在上篇文章中,我们已经设计好了这次要开发的融合小程序的系统架构,给大家复习下: [bnt4vhw5v8.png] 下面让我们跟着这个思路,搭建属于自己的融合小程序~ 小程序前端开发 由于本文主要介绍小程序端调用人脸融合云接口...sdk的接口,里面封装好大部分请求云API的操作: 公共参数处理:组装好包括service、version、action,以及用于身份校验的sercetId、secretKey等参数 处理图片数据:由于小程序从本地相册或相机获取的图片数据...,云服务无法直接处理,因此小程序需要将这些图片先上传,再请求云函数 在这个demo采取的方式是先将图片上传的云开发的数据库,获取到fileId,在云函数请求云API之前,通过云开发提供的cloud.getTempFileURL...参考官网文档,实现小程序调用云函数即可: 人脸检测:获取本地图片后执行人脸检测,获取人脸框信息: const self = this; // 选择本地图片 chooseImage(async function...,有兴趣的同学可以体验一下: [9ouwbfsxjp.png] 感谢阅读两篇文章的小伙伴,对使用人脸融合服务有问题的同学可以评论区留言,下来一起讨论下。
zxvf hadoop-2.4.0-src.tar.gz 解压完毕,我们会看到相应的文件夹: 三、解压完毕,我们开始准备编译所需要的软件 这里软件的准备,很多文章写的都不全,这里整理一下。...这里需要说明的是有的Linux有自带的这些工具,这个需要仔细看一下版本是否匹配,不匹配则升级一下,有些不能升级,那么就重装一下吧 1、jdk的安装 步骤下载压缩包、解压、配置环境变量 (1)jdk下载...链接: http://pan.baidu.com/s/1jGr41SU 密码: rawv (2)jdk解压 tar zxvf jdk-7u51-linux-x64.tar.gz 然后重命令为:
http://blog.csdn.net/jnu_simba/article/details/25158661 注:在linux下开发常用的辅助小工具: readelf 、hexdump、od、objdump...、nm、telnet、nc 等,具体可以man一下。...This GDB was configured as "i686-linux-gnu"....参数压栈传递,并且是从右向左依次压栈。 2. ebp总是指向当前栈帧的栈底。 3. 返回值通过eax寄存器传递。...参考: 《linux c 编程一站式学习》 《网络渗透技术》
生成的可执行文件的文件名 (示例: hello.exe) 文件名2: 带编译的源文件 (示例: hello.c) 指定生成的可执行文件的文件名: 编译c++代码: 首先如果没有安装g++命令,可以先安装一下。...mycode.cc -o mycode.exe 编译原理: 这里分享一篇不错的博客: .c到.exe的故事 四个阶段 (图片来源于上推荐文章,图片稍作修改了) 4.1 “预处理”阶段: 前面我们是直接从....vim使用小技巧: 可以在底行模式下,可以使用vs + 文件名 的方式,同时查看打开两个文件。...在C++中,我们建议用const常量、enum、以及inline代替宏 补充小知识: 上面我们提到了gcc -E test.c -o test.i指令。...由于二进制文件默认情况下vim也不认识,我们可以使用xxd命令+b选项,将其重定向到mycode文件中。 xxd -b test.o>mycode 打开后: 4.4 “链接”阶段 总结:
This GDB was configured as "i686-linux-gnu"....当main函数最后一条指令执行完是info r 一下可以发现: esp 0xbffff6b0 0xbffff6b0 ebp 0x0 0x0...可以看到0xb7e394cf 处的指令 call *0x70(%esp) ,即将下一条地址压栈,打印一下 esp+4+0x70 指向的地址为0x804840c,也就是main函数的入口地 址。...参数压栈传递,并且是从右向左依次压栈。 2. ebp总是指向当前栈帧的栈底。 3. 返回值通过eax寄存器传递。...参考: 《linux c 编程一站式学习》 《网络渗透技术》
从小到大: // 从小到大顺序排序 minSort (arr) { var min for (var i = 0; i < arr.length; i++) {...arr[j] = arr[i] arr[i] = min } } } return Arr } 从大到小
部署不同主从结构的MySql集群 一主一从 一主多从 主从从 主从同步使用的复制模式介绍配置 食用方式:了解Linux、MySql即可 理解不足小伙伴帮忙指正 嗯,都要努力生活下去 ^_^ ----...即使在不稳定的网络环境下,远程复制也可以工作。 负载均衡 通过MySQL复制可以将读操作分布到多个服务器上,实现对读密集型应用的优化,并且实现很方便,通过简单的代码修改就能实现基本的负载均衡。...Linux虚拟服务器(LinuxVirtual Server,LVS)也能够很好地工作。..., 0 rows affected (0.00 sec) MariaDB [(none)]> select user,host from mysql.user -> ; ###在mysql库下的...┌──[root@vms155.liruilongs.github.io]-[~] └─$ 查看数据是否拷贝成功,修改/var/lib/mysql 下所有文件的属性,重启服务 ┌──[root@vms155
在做Linux系统优化的时候,物理内存是其中最重要的一方面。自然的,Linux也提供了非常多的方法来监控宝贵的内存资源的使用情况。...下面的清单详细的列出了Linux系统下通过视图工具或命令行来查看内存使用情况的各种方法。 1./proc/meminfo 查看RAM使用情况最简单的方法是通过 /proc/meminfo。...它显示的是各种系统资源(CPU, memory, network, I/O, kernel)的综合,并且在高负载的情况下进行了彩色标注。...你可以使用 “–sort”选项对进程进行排序,例如按RSS进行排序: \$ ps aux --sort -rss 10.smem smem命令允许你统计基于/proc信息的不同进程和用户的内存使用情况。...你可以根据内存的使用和大小来进行排序。 \$ top 12.vmstat vmstat命令显示实时的和平均的统计,覆盖CPU、内存、I/O等内容。例如内存情况,不仅显示物理内存,也统计虚拟内存。
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