1、Windows上操作 用notepad++编译器打开脚本，编辑->文档格式转换->转换为UNIX格式，然后保存。 重新上传、运行，问题解决 ?...2、Linux上操作 用vi/vim命令打开脚本文件，输入“：set fileformat=unix”，回车，保存退出。 重新执行脚本，问题不在出现。
里面就有很多R代码 ： 代码文件很多 如果把这些R代码文件一个个打开，然后一个个运行，工作量也不小，所以我们推荐一个技巧： fs=list.files('..../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) 这个技巧有一个小问题，就是有一些脚本可能是缺包或者里面有小...其实理论上应该是在运行每个脚本的时候加上try catch，不过咱们的目标是批量运行每个代码并且保证成功，所以跳过那些运行失败的解决不了问题，反而应该是勇往直前解决问题。...需要基本生信背景知识 当然需要读者具备计算机基础知识，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门...Linux(2019更新版)》 其中，R语言可能更重要一点，我把R的知识点路线图搞定，如下： 了解常量和变量概念 加减乘除等运算（计算器） 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子） 多种数据结构（向量，矩阵
今天，我们利用健明老师推荐的批量运行多个R脚本代码，见证一下该代码的优势。...patients with liver transplantation》的 GitHub (https://github.com/sangho1130/KOR_HCC) ，我们发现其共包含19个R脚本...然后，我们一个一个打开脚本检查了一下其所用到的R包，下载好所要用到的所有R包。但是在下载R包过程中我们发现RGtk2和rsgcc这两个包一直报错，没有解决掉这个问题。...所以，我们把包含这两个包的5个脚本剔除，把剩下的14个R脚本进行批量运行。 #这两个R包下载失败了,如果你们下载成功了，也欢迎分享以下方法！.../',pattern = '*.R$') fs lapply(fs, function(x){ print(x) source(x) }) #正常运行结果 [1] "Figure_1A.R
Linux 运行 sh 脚本时可能报 \r 相关错误，本文记录解决方案。...问题复现 在 Windows 下建立脚本文件 test.sh echo "Hello World" echo "finish" 在 Linux 下运行 ..../test.sh: line 1: $'\r': command not found ./test.sh: line 2: $'\r': command not found Hello World ....\r'' 问题原因 Unix体系里，每行结尾只有“”，即“\n”； Windows体系里面，每行结尾是“”，即“\n\r” Unix 执行 Windows 生成的脚本就可能报错...解决方案 核心目标为将 \r 删除掉 方法一：运行下面的语句 sudo sed -i 's/\r//' test.sh 方法二：运行下面的语句，然后再运行sudo bash test1215.
下面和大家一起分享下如何在Apache和Nginx禁止上传目录里PHP的执行权限。...Apache下禁止指定目录运行PHP脚本 在虚拟主机配置文件中增加php_flag engine off指令即可，配置如下 Options FollowSymLinks
vim编辑器的配置文件为：/etc/vimrc 通过：sudo vim /etc/vimrc 打开vim的配置文件 在结尾添加如下内容即可指定F5为测试脚本的快捷键： 注...：此方式便于对脚本进行单元测试。...firefox %.html &" endif endfunc vim编写的脚本内容 vim 编写的testF5.py内容 vim编写完成后不退出直接按F5后结果： 一键执行结果
开始研究Linux下的自动上传脚本。 UPDATE：2014.3.10.已验证，使用密钥最好，http://www.linuxidc.com/Linux/2014-03/97976.htm。...还有与ssh共存的sftp，而且公司统一都用ssh登陆linux服务器，所以服务器上一般都装有sftp。 ftp有s参数，自动读取文本内容，执行文件中的命令。...恩，研究了一下sftp也有-b参数，运行batchfile。 擦！！...然后就卡在这里了，-b参数赫然写到只能运行cmd命令而不能进行密码自动认证，想要避免输入密码就必须要使用ssh的publickey秘钥认证啊！！...经过了多次度娘和谷歌的查找，现想到方法如下： 1、安装lftp，网上已经有大量lftp结合sftp进行自动密码认证的脚本 附： lftp -u $USERNAME,$PASSWORD sftp://$HOST
问题描述 前几天编写的shell小脚本，测试自动安装MySQL的，今天测试运行，然后出现如下错误 $’\r’:command not found, 问题分析 检查脚本，没有问题，只是有空行。...提示这个错误也不是代码本身错误，怀疑可能是编码格式等错误，：脚本是Linux下编辑完成测试。后期我又做了简单修改，是在在window下修改后完成，然后上传到Linux服务器的。...注意到：win下的换行是回车符+换行符，也就是\r\n,而unix下是换行符\n。 Linux下不识别\r为回车符，如果脚本有\r回车符那么会导致脚本编码执行出现问题。...处理问题 在linux上执行 dos2unix 脚本名，转换后，在执行该脚本。...然后执行脚本 脚本执行完毕，MySQL直接到登录界面。完成。 在学习中尽量慢慢养成好的习惯，在Linux下编码 测试 更新等 结尾 在工作和学习中遇到的问题和大家分享，希望对大家有所帮助。
使用 Top 命令脚本模式的方法 在 Centos8 中，我们执行本文中的命令。下面命令按照 CPU 使用率对数据进行排序，并打印命令中指定的前 20 行。...9500 8112 S 0.0 0.5 0:00.04 /usr/lib/systemd/systemd --user 上面命令中关于top命令使用的选项解释如下： -b: 运行脚本模式...在批处理模式下，使用 top 命令根据进程的使用的时间排列数据。它显示进程自启动以来消耗的 CPU 时间总量。...下面可以将top的输出结果保存到文件中： [root@localhost ~]# top -bc | head -30 > top-information.txt 总结 top 命令用于显示 Linux...它将显示 CPU 和内存使用情况及其他信息，例如正在运行的程序。可以利用脚本模式的选项将top命令输出传输到其他应用程序或文件。
曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》，介绍了批量运行R脚本的思路，同时也提出了一些问题，今天就这个学徒作业，我们来探究一下。 首先前往github[1]下载R脚本。...打开以后可以发现这里有19个R脚本，如果把这些R代码文件一个个打开再运行，无疑增加了很多工作量。...实测在我的R环境下，运行到第3个代码遇到了报错，此时Fig 1A和Fig 1B的结果已经产生。 这个时候我们希望脚本继续运行，同时打印各个脚本的运行情况。...，再用for in循环依次执行tryCatch，依次运行每一个脚本，如果运行过程中有warning，就会提示「warning @ 脚本名 @ warning的具体内容」，如果运行中有error，就会提示...因为有个R包始终装不上，查看一下已经被移除了CRAN，就不继续折腾了，以提供思路为主。
在 Linux 中有两种运行 shell 脚本的方法。你可以使用： bash script.sh 或者，你可以像这样执行 shell 脚本： ./script.sh 这可能很简单，但没太多解释。...在 Linux 中运行一个 Shell 脚本 记住，将其作为参数传递的需要是一个 shell 脚本。一个 shell 脚本是由命令组成的。如果你使用一个普通的文本文件，它将会抱怨错误的命令。...大多数情况下，你都在同一个目录中，因此你可以像这样使用它： ....为什么当你在同一个目录下，却不能使用脚本名称？这是因为你的 Linux 系统会在 PATH 环境变量中指定的几个目录中查找可执行的文件来运行。.../bin/bash 时，你是具体指定 bash 作为解释器来运行脚本。如果你不这样做，并且以 ./script.sh 的方式运行一个脚本，它通常会在你正在运行的 shell 中运行。 有问题吗？
Systemd 是一种用于管理 Linux 系统的初始化和服务管理工具。它提供了强大的功能，允许用户在关机或重启系统之前运行自定义脚本。这对于执行清理任务、保存数据或执行其他系统管理操作非常有用。...本文将详细介绍如何在 Systemd 下配置并运行关机前的脚本。图片了解 Systemd 关机过程在开始配置之前，我们需要了解 Systemd 的关机过程。...运行以下命令刷新 Systemd 配置：sudo systemctl daemon-reload配置关机前运行的脚本要配置 Systemd 在关机前运行脚本，需要创建一个关联关系。...删除脚本配置如果您不再需要在 Systemd 下运行关机前的脚本，可以按照以下步骤进行删除。...总结在 Systemd 下运行关机前的脚本可以让您在系统关机或重启之前执行自定义操作。
但有的linux系统加在crontab -e会无效，这种方法不会对语法进行校验。...具体操作步骤为： crontab -e 添加定时任务，如每周一3点执行python脚本 0 3 * * 1 python /data/www/test.py wq保存退出，完毕 语法为 # Example...etc/crontab 比 crontab -e 多了一个用户名字段，该方法是系统级的，必须root权限使用 步骤： vi /etc/crontab 在后面添加定时任务，如每周一3点执行python脚本
CentOS下停止Tomcat运行脚本，已经验证通过。 #!/bin/sh # # Firstly find the process of the tomcat.......*tomcat' | grep -v grep` CHECK_STR_LENGTH=${#TOMCAT_PROCESS_CHECK_STR} # 传递到脚本的参数个数； if [ $CHECK_STR_LENGTH
在Linux系统下运行.sh文件有两种方法，比如我在root目录下有个datelog.sh文件 第一种（这种办法需要用chmod使得文件具备执行条件(x): chmod u+x datelog.sh）：...1、在任何路径下，输入该文件的绝对路径/root/datelog.sh就可执行该文件（当然要在权限允许情况下） ?...第二种（这种办法不需要文件具备可执行的权限也可运行）： 1、在该文件路径下sh加上文件名字即可，sh datelog.sh ?...2、在任意路径下，sh 加上文件路径及文件名称：sh /root/ datelog.sh ?...： 1、修改可执行权限：chmod u+x hello.sh 2、任意打开一个文件夹，选择左上角的【编辑】->【首选项】 选择【打开可执行文本文件时运行它们】即可实现双击运行。
第一步：打开我们的linux命令行，准备好，以便开展接下来的工作。...第二步：找到php的安装目录，以宝塔为例，php可执行文件的目录为： /www/server/php/72/bin/php 第三步：找到要运行的php文件所在的目录 /www/wwwroot/dabenshi.link.../gencode.php 第四步：接下来就要正式开始运行了。...打开刚刚第一步打开的linux命令行，输入： cd /www/wwwroot/dabenshi.link 这一步是为了跳转至gencode.pnp目录以执行该文件 回车，接着输入： /www/server...适用于：已安装好php环境的linux系统。
Linux下运行jar包 首先查看将要运行的端口是否被其他java进程占用 sudo netstat -plten |grep java 如果端口存在java进程，需要终止进程，否则无法运行SpringBoot...项目. kill 进程PID Linux下进入jar包目录，使用 nohup java -jar 包名 & 命令可以将jar包运行，关闭终端不会停止，该命令会返回java进程的PID，并且在jar包目录下会生成
首先把tomcat解压到linux 文件夹下：如/usr/local下 #vi(gedit) /etc/profile 在其中加入 ##########first tomcat########### CATALINA_BASE...的环境变量### export CATALINA_BASE=$CATALINA_2_BASE export CATALINA_HOME=$CATALINA_2_HOME 最后把tomcat_2/conf下的...这样就可以在linux下同时运行两个tomcat了。运行更多tomcat方法是一样的。
1 简介 经常碰到机器断电之后需要重启一大堆服务，为了防止这种事情发生，设置开机自启的脚本十分的重要，我们习惯性的做法就是编写一个重启脚本，然后在 /etc/rc.local 中去完成开机执行。...首先在命令行输入： $ crontab -e 然后添加以下内容： @reboot /root/script/restart.sh 完成后，这个脚本就可以在重启的时候自动执行了。...其它的一些进阶玩法： 在启动完成后的指定时间内运行脚本 # 在启动 5 分钟后运行指定脚本 @reboot sleep 300 && /home/wwwjobs/clean-static-cache.sh...default.target 然后启用这个 Systemd 服务： $ systemctl daemon-reload $ systemctl enable restart.service 完成后，这个服务对应的脚本就可以自动开机自启了...4 参考文档 https://www.google.com https://tinyurl.com/6ryafefw https://www.cyberciti.biz/faq/linux-execute-cron-job-after-system-reboot
1简介 经常碰到机器断电之后需要重启一大堆服务，为了防止这种事情发生，设置开机自启的脚本十分的重要，我们习惯性的做法就是编写一个重启脚本，然后在 /etc/rc.local 中去完成开机执行。...首先在命令行输入： $ crontab -e 然后添加以下内容： @reboot /root/script/restart.sh 完成后，这个脚本就可以在重启的时候自动执行了。...其它的一些进阶玩法： 在启动完成后的指定时间内运行脚本 # 在启动 5 分钟后运行指定脚本 @reboot sleep 300 && /home/wwwjobs/clean-static-cache.sh...default.target 然后启用这个 Systemd 服务： $ systemctl daemon-reload $ systemctl enable restart.service 完成后，这个服务对应的脚本就可以自动开机自启了...4参考文档 https://www.google.com https://tinyurl.com/6ryafefw https://www.cyberciti.biz/faq/linux-execute-cron-job-after-system-reboot
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