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《可信计算3.0工程初步》读书笔记

美国国防部于20世纪80年代初提出了《可信计算机安全评估准则》(TCSEC),该评估准则定义系统中实现安全功能的软件和硬件的总和为可信计算基,明确安全机制首先要做到“可信”;有一点要意识到的是,可信不等于安全,但可信是安全的前提。1999年, IBM、HP、Intel和微软等著名IT企业发起成立了可信计算平台联盟(TCPA, Trusted Computing Platform Alliance),这标志着可信计算进入产业界。2003年,TCPA 改组为可信计算组织(TCG, Trusted Computing Group)。目前,TCG已经制定了一系列的可信计算技术规范,如可信PC、可信平台模块(TPM)、可信软件栈(TSS)、可信网络连接(TNC)、可信手机模块等,且不断地对这些技术规范进行修改完善和版本升级。

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rkt项目

说明:rkt(发音为“rocket”)是一个CLI,适合在Linux上运行应用程序容器。rkt旨在安全、可组合和基于标准。rkt的一些主要功能和目标包括:Pod-native:rkt的基本执行单元是一个pod,它将资源和用户应用程序连接在一个独立的环境中;安全性:rkt的开发遵循“默认安全”原则,并包含许多重要的安全功能,如支持SELinux,TPM测量以及在硬件隔离的VM中运行应用程序容器;可组合性:rkt旨在与init系统(如systemd,upstart)和集群编排工具(如Kubernetes和Nomad)进行一流集成,并支持可交换的执行引擎;开放标准和兼容性:rkt实现了appc规范,支持容器网络接口规范,并且可以运行Docker镜像和OCI镜像。对OCI镜像和运行的更广泛原生支持正在开发中。

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全长转录组 | 三代全长转录组分析流程(PacBio & ONT )-- IsoQuant

今天我们介绍一款使用三代全长转录本数据进行转录本注释和定量的工具 - IsoQuant。2023年1月2日,康奈尔大学医学院Hagen U. Tilgner团队和圣彼得堡国立大学Andrey D. Prjibelski团队合作在Nature Biotechnology(NBT)杂志发表题为 “Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads” 的文章 (图1)。作者开发了 IsoQuant -- 一款使用内含子图(intron graphs)的计算工具,在有参考基因组注释或者无参的情况下能够利用长度长序列准确重构转录本。对于新的转录本发现,IsoQuant 使Oxford Nanopore(ONT)数据在有参或无参模式下的假阳性率分别降低了5倍和2.5倍。IsoQuant 同时也提高了Pacific Biosciences数据的性能。

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