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如何去掉数据中的离群样本?

引言 当我们拿到一组数据想要开始分析时,做的第一件事情就是质控,看一下数据怎么样,是否适用于我们的分析流程,以及某些低表达或极端表达的基因和样本是否应该删除更利于分析结果。...自己的表达量矩阵数据绘制主成分分析图 #加载R包 library("FactoMineR") library("factoextra") #载入数据 load(file = 'symbol_matrix.Rdata...Squamous_cell_carcinoma Adenocarcinoma ## 501 526 pro = 'test' exp=t(dat)#画PCA图时要求是名时样本名...04 差异分析结果比较 两组数据分别用的DESeq2包进行差异分析(这个代码省略,因为太简单了),有了差异结果矩阵,就可以比较一下删除离群样本之后是否会对差异分析的结果产生影响。...#导入差异分析结果 load(file = 'DEG_deseq2.Rdata')#原始数据 summary(DEG_deseq2) deg_DESeq2 = na.omit(as.data.frame

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sql DISTINCT去掉重复的数据统计方法

sql DISTINCT去掉重复的数据统计方法(2009-01-13 15:05:43)转载 标签:sqldistinct杂谈 分类:sql SELECT指令让我们能够读取表格中一个或数个栏位的所有资料...我們就鍵入, SELECT DISTINCT store_name FROM Store_Information 結果: 1 2 3 DISTINCT 关键字可从 SELECT 语句的结果中除去重复的。...如果没有指定 DISTINCT,那么将返回所有,包括重复的。...,可以用下面语句获取到去掉重复数据后的记录: select distinct * from 表名 可以将查询的记录放到临时表中,然后再将原来的表记录删除,最后将临时表的数据导回原来的表中。...,可以先建一个临时表,将去掉重复数据后的数据导入到临时表,然后在从临时表将数据导入正式表中,如下: INSERT INTO t_table_bak select distinct * from t_table

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怎样去掉list里重复的数据(多种方法)

如何去掉list里重复的数据 去掉list重复的数据,目前总结的以下三种方法,分别是采用set集合来做、两层循环不用任何方法来做,以及一层循环采用contains()方法来做,如下: 我在这里用Integer...类型的list进行展示 方法1: /** * @author 程龙 *用双重循环去掉重复,不用任何方法,也不用那个:外层 循环从0到长度-1,后面那个相反的那个 */ public static List...(3); list.add(4); list.add(3); list.add(2); list.add(1); System.out.println(list); //上面的list里装的有重复的数据...,我要用set来去掉重复 Set set=new HashSet(list); System.out.println(set);//这里的set里的值已经是去掉了重复的了...,如果我还想要将原有的list去重复,如下: System.out.println(list); list.clear();//将原来的list的数据全部清空 System.out.println(list

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Linux 删除文本中的重复

在进行文本处理的时候,我们经常遇到要删除重复的情况。那怎么解决呢? 下面就是三种常见方法? 第一,用sort+uniq,注意,单纯uniq是不行的。...shell> sort -k2n file | uniq 这里我做了个简单的测试,当file中的重复不再一起的时候,uniq将服务删除所有的重复。...经过排序后,所有相同的行都在相邻,因此unqi可以正常删除重复。 第二,用sort+awk命令,注意,单纯awk同样不行,原因同上。...P; D' 最后附一个必须先用sort排序的文本的例子,当然,这个需要用sort排序的原因是很简单,就是后面算法设计的时候的“局部性”,相同的可能分散出现在不同的区域,一旦有新的相同行出现,那么前面的已经出现的记录就被覆盖了...参考推荐: 删除文本中的重复(sort+uniq/awk/sed)

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hive textfile 数据

Hive TextFile数据问题解决方案在使用Hive进行数据分析时,有时候会遇到TextFile格式的数据的情况,这会导致数据解析出现问题,影响分析结果的准确性。...本文将介绍如何处理Hive中TextFile数据的情况。问题描述TextFile格式的数据在存储和处理过程中,可能会因为文本文件本身的格式问题或者数据写入时的异常情况,导致数据的情况出现。...自定义serde处理使用Hive自定义serde(序列化/反序列化)处理数据的情况。通过自定义serde,可以更灵活地控制数据的解析过程,从而处理数据的情况。2....预处理数据数据导入Hive前,可以对原始数据进行预处理,将错数据修复或者丢弃,确保数据符合预期格式。可以使用脚本或者第三方工具对数据进行清洗和修复。3....结语在实际数据处理过程中,数据是一个常见的问题,特别是在处理大规模文本数据时更容易出现。

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代码如何隐藏 Linux 进程?

作者 | dog250 原文 | https://blog.csdn.net/dog250/article/details/108032383 总有朋友问隐藏Linux进程的方法,我说你想隐藏到什么程度...本文介绍一种将Linux进程小隐于用户的非常规方法,仅仅一代码: 修改掉进程的pid即可。 注意是小隐,所以,不值得反制,逗一下高级会议工程师搞个恶作剧玩玩得了。...如果你觉得 guru 模式的 stap 怪怪的,那么你完全可以编写自己独立的 Linux kernel module,采用修改完即退的方法: target->pid = xxxx; return -1;...是不是比各种hook法简单多了,所谓的动数据而不要动代码!...是不是比各种 hook 法简单多了,所谓的动数据而不要动代码! 简单的说一下原理: task被创建的时候,根据其pid注册procfs目录结构。

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