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cutadapt去除adapter序列

对于NGS数据分析而言,第一步都是进行质量控制,质量控制包括去除adapter序列,去除低质量序列等内容。在文库构建阶段,为了能够上机测序,会在插入片段两端添加adapter序列。...,同时也可以过滤低质量,去除长度太短的序列。...去除3’端引物序列 对于3’端序列,可能存在以下情况 ?...绿色部分为adapter序列,灰色部分为软件会去除掉的序列,可以看到,无论是只读取到部分adapter序列还是完整的adapter序列,软件都能够有效的去除3’端adapter序列。...绿色部分为adapter序列,灰色部分为软件会去除掉的序列,前两种格式和,无论是只读取到部分adapter序列还是完整的adapter序列,软件都能够有效的去除5’端adapter序列。

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