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Linux:转录组分析1-建立工作目录

转录组测序分析本笔记主要是针对转录组测序分析专题上游分析,需要有Linux基础知识,目标是养成一个良好的分析习惯,熟悉转录组分析上游流程,重点是针对分析的结果能有自己的思考和解读能力。...cd ~## 1.建立数据库目录:在数据库下建立参考基因组数据库,注意命名习惯:参考基因组版本信息mkdir -p database/GRCh38.105## 2.建立项目分析目录mkdir projectcd...projectmkdir Human-16-Asthma-Trans # 注意项目命名习惯:物种-样本数-疾病-分析流程cd Human-16-Asthma-Trans# 建立数据存放目录mkdir...-p data/rawdata data/cleandata/trim_galore data/cleandata/fastp# 建立比对目录mkdir -p Mapping/Hisat2 Mapping.../Subjunc# 建立定量目录mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon# 查看整个分析目录准备结构tree├── data│   ├──

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Linux 如何查看目录大小

du命令 参考文章:how to check directory size in Linux 用于显示目录或文件的大小。...显示当前目录文件或者文件占用空间:du 显示指定文件或文件夹的大小:du test.txt 方便阅读的格式查看目录所占空间情况:du -h test 仅显示当前文件夹的总计:du -s * 以方便阅读的方式查看指定目录层级的空间占用情况...:du -lh --max-depth=1 du命令排序 查看目录大小的命令是du(当然也可以查看文件大小),例如:du ems_data,就是查看ems_data目录下各子目录的大小;du,就是查看当前目录下各子目录的大小...;du *,就是查看当前目录下各子目录和文件的大小。...10个:du ems_data | sort -rn | head 选出排在后面的10个:du ems_data |sort -rn | tail 当前目录的大小:du -sh .

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给Excel工作表建立目录

有时候我们会在一个工作簿中建立很多工作表,怎样才能简单明了的管理工作表呢,当然能建一个目录最好了,这里我们就学习一种给工作表创建目录的方法。 1、在工作簿中新建一个工作表,命名为“目录”。...(A1))&T(NOW()) 3、在B1单元格中输入公式,并向下复制: =IFERROR(HYPERLINK(目录&"!...A1",MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)),"") 现在可以看到效果了,单击目录中的工作表名称,就会自动跳转到相应工作表。...FIND("]",目录)部分,用于查找符号"]"在自定义名称“目录”计算结果中的位置。...MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)部分,从“目录”中的"]"符号后一个字符处取值,取值长度为99个字符,这里的99可以写成任意一个较大的数值。

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Linux如何高效切换目录

本文授权转自 | 良许 Linux ID | liangxuxiansheng ? ☞ 程序员进阶架构师必备资源免费送 ☜ Linux 下对于目录的切换,大家肯定会想到一个命令:cd 命令。...这个是 Linux 下再基本不过的命令,如果这个命令都不知道的话,赶紧剖腹自尽去吧。...cd 命令确实很方便,但如果需要频繁在下面的目录切换,你可能要怀疑人生了: /home/alvin/projects/blogdemos/linux-system-programming/thread...在这种情况下,我们如何高效进行目录切换呢?良许给大家介绍三个命令:pushd 、 popd 、 dirs 。...如果是加号的话,将从目录栈由上往下数,而用减号的话,将从目录栈由下往上数。 接下来就回到了我们本文开头的问题,如果我们要在两个或多个路径很长的目录之间频繁切换,该如何操作?

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如何更改 Linux 文件和目录权限?

Linux系统中,文件和目录权限是安全性和访问控制的关键组成部分。正确设置文件和目录的权限可以确保只有授权的用户能够读取、写入或执行这些文件和目录。...图片本文将详细介绍如何Linux系统中更改文件和目录的权限。1. 文件和目录权限概述在Linux系统中,每个文件和目录都有一组权限,用于确定对它们的访问权限。...使用 chmod 命令更改文件和目录权限在Linux系统中,可以使用chmod命令更改文件和目录的权限。...修改文件和目录权限示例下面是一些示例,演示如何使用chmod命令修改文件和目录的权限。...使用以下命令验证目录权限的更改:ls -ld directory终端会显示目录的详细信息,包括权限。4. 总结本文详细介绍了如何Linux系统中更改文件和目录的权限。

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如何Linux 中强制删除目录

Linux系统中,有时候可能会遇到无法正常删除目录的情况,例如目录包含非空文件、没有删除权限等。在这种情况下,我们可以使用一些强制删除的方法来解决问题。...本文将详细介绍在Linux如何强制删除目录的几种常见方法。图片方法一:使用 rm 命令rm 命令是Linux中常用的删除文件和目录的命令。...以下是使用 rm 命令强制删除目录的语法:rm -rf 其中,-r 选项表示递归删除目录及其子目录和文件,-f 选项表示强制删除,不提示确认。...以下是使用 rmdir 命令结合 rm 命令强制删除目录的步骤:首先,使用 rmdir 命令删除目录中的所有子目录和文件,直到目录变为空目录。...结语在Linux中,有时候需要强制删除目录,例如目录包含非空文件、没有删除权限等情况。

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如何Linux 中查看目录大小?

这是一篇关于如何通过一些常用的命令,显示 CentOS 或 RedHat 中的 Linux 目录大小,以及哪些文件夹占用的空间最大的教程。...在命令行中向下搜索当前文件夹的大小: du -h --max-depth=1 |grep -v -e [0-9].[0-9]K -e [0-9][0-9]K -e ^0 | sort -n 在 Linux...文件夹中查找前 10 个大文件 find /home/shenweiyan/Downloads -xdev -type f -exec du -sk {} \; |sort -rn | head -10 在 Linux...中查找使用率高的磁盘 df -P | awk '0+$5 >= 70 {print}' # 其实 du -Th 就可以直接看 将限制更改为 10% 的示例 安装软件包以检查 Linux...结论 如您所见,Linux 目录大小可以通过多种不同的方法来确定,如果您还有其他一些经常使用的相关命令,欢迎在下面的评论中添加。

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Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ① ( arch 目录 | block 目录 | certs 目录 | crypto 目录 | Documentation 目录 )

文章目录 一、arch 目录 二、block 目录 三、certs 目录 四、crypto 目录 五、Documentation 目录 在上一篇博客 【Linux 内核】Linux 内核源码结构 ( 下载...Linux 内核源码 | 使用 VSCode 阅读 Linux 内核源码 ) 中 , 使用了 Visual Studio Code 查看 Linux 内核源码 , 本篇博客开始分析 Linux 内核源码结构...; 一、arch 目录 ---- arch 目录是 针对 不同 CPU 体系架构平台 的代码 , 将 与 平台 相关的代码 放在该目录中 , 如某些代码只针对 x86 架构的平台 , 那么放在 arch.../x86 目录下 ; 每种体系结构 , 都有 相应的子目录 , 如 arm , arm64 分别是 arm 32 位和 64 位平台 ; 二、block 目录 ---- block 目录 , 是子系统目录..., 其中存储了 块设备驱动 相关代码 ; 三、certs 目录 ---- certs 目录中存储了 认证 和 签名 相关代码 ; 四、crypto 目录 ---- crypto 目录中存储了 内核中常用的

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linux的服务与如何建立自己的服务

一般来说,当我们以文本模式或图形模式 (非单人维护模式) 完整开机进入 Linux 主机后, 系统已经提供我们很多的服务了!包括打印服务、工作排程服务、邮件管理服务等等; 那么这些服务是如何被启动的?...不过,无论如何,这些服务的名称被建立之后,被挂上 Linux 使用时,通常在服务的名称之后会加上一个 d 例如例行性命令的建立的 at, 与 cron 这两个服务,他的程序文件名会被取为 atd 与 crond...然后在该目录建立配置文件即可。另外,配置文件最好附档名取名为 .conf较佳!...那么我暂时需要启动 tty8 时,又该如何处理呢?需要重新建立一个脚本吗?不需要啦!可以这样作!...此外,如果你的 Linux 本来就在虚拟机的环境下,那这些服务对你就没有用!因为这些服务是让实体机器来建立虚拟机的!

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Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ② ( drivers 目录 | fs 目录 | include 目录 | init 目录 | ipc 目录 | kernel 目录 )

文章目录 一、drivers 目录 二、fs 目录 三、include 目录 四、init 目录 五、ipc 目录 六、kernel 目录 一、drivers 目录 ---- drivers 目录中存储了...驱动程序 相关代码 , 如 USB 总线驱动程序 , PCI 总线驱动程序 , 显卡驱动程序 , 网卡驱动程序 等 ; 二、fs 目录 ---- fs 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual...目录 ---- include 目录中存储了 内核源码 依赖 的 大部分头文件 代码 ; include 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual File System ) 相关代码 ; 四、...init 目录 ---- init 目录中存储了 Linux 内核的初始化 相关代码 ; 该 初始化代码 关联到了 内存的各个组件 的入口 ; 五、ipc 目录 ---- ipc 目录中存储了 进程间通信...相关代码 ; 如 : 信号量 , 共享内存 等 ; 六、kernel 目录 ---- kernel 目录中存储了 内核核心代码 ; 其中包含了 进程管理 , IRQ 中断 等模块 ;

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Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ③ ( lib 目录 | LICENSES 目录 | mm 目录 | net 目录 | samples 目录 | scripts 目录 )

文章目录 一、lib 目录 二、LICENSES 目录 三、mm 目录 四、net 目录 五、samples 目录 六、scripts 目录 一、lib 目录 ---- lib 目录中存储了 C 语言标准库的子集...相关代码 ; 二、LICENSES 目录 ---- LICENSES 目录中存储了 开源许可协议 相关协议文本 ; 该目录拿下都是文本文件 ; 三、mm 目录 ---- mm 目录中存储了 内存管理...( Memory Management ) 相关代码 ; 四、net 目录 ---- net 目录中存储了 网络协议 相关代码 ; 如 : TCP , WIFI , IPV4 , IPV6 等 ;...五、samples 目录 ---- samples 目录中存储了 Linux 内核参考示例代码 ; 六、scripts 目录 ---- scripts 目录中存储了 内核 编译 配置 相关脚本 ;

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Linux目录结构

Linux 目录结构 装完Linux,首先需要弄清Linux 标准目录结构 / root —?启动Linux时使用的一些核心文件。如操作系统内核、引导程序Grub等。 home —?...设备文件目录 etc — 配置文件 skel — home目录建立,该目录初始化 sysconfig — 网络,时间,键盘等配置目录 var file lib — 该目录下的文件在系统运行时,会改变...一般情况下这个目录是空的,而在我们将要挂载分区时在这个目录建立目录,再将我们将要访问的设备挂载在这个目录上,这样我们就可访问文件了。.../boot:放置linux系统启动时用到的一些文件。/boot/vmlinuz为linux的内核文件,以及/boot/gurb。...Linux Directory Structure 2.?Linux’s directory structure 3.?Linux目录结构

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