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linux上简单好用的并行软件ParaFly

一般我们都是在服务器上跑任务,服务器都是多核心多线程的,再不济也是自己的多核多线程笔记本,其实可以让任务并行的跑起来。...今天给大家介绍一个很好用的小工具ParaFly,只需要很简单的操作就可以让linux上的任务并行化。 ? ? ?...事实上,只需要把需要操作的命令写在一个文件里面,使用-c指定这个文件,-CPU指定并行的总核数(需要同时执行几条命令)即可。...split-3 SRR1004285.1fastq-dump --split-3 SRR1004284.1fastq-dump --split-3 SRR1510125.1 总体来看ParaFly方便易学,比linux...自带的parallel更易上手,大家在linux上做多任务处理时可以考虑加入它的使用,会大大的缩短数据处理时间。

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聊聊并行并行编程

并行编程主要聚焦于性能,生产率和通用性上。 所谓性能,更像是可扩展性以及效率。不再聚焦于单个CPU的性能,而是在于平均下来CPU的性能。...并行和并发有着小小的区别:并行意味着问题的每个分区有着完全独立的处理,而不会与其他分区进行通信。并发可能是指所有的一切事务, 这可能需要紧密的,以锁的形式或其他的互相通信的方式形成的相互依赖。...因为并行编程的相对较难,导致工程师的生产率不会太高,会聚焦于更精密的细节,花费大量的时间。...并行任务变得复杂不仅仅在于之上的原因,更因为: 1.对代码,对任务的分割,这会导致错误处理以及事件处理更为复杂。如果并行程序之间会牵扯到交互,通信的时间成本,共享资源的分配和更新更为复杂。...2.并行访问控制,单线程的应用程序可以对本实例中的所有资源具有访问权,例如内存中的数据结构,文件之类的。

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数据并行和任务并行

OpenCL并行加减乘除示例——数据并行与任务并行 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载。...https://blog.csdn.net/zhouxuanyuye/article/details/79949409 OpenCL并行加减乘除示例——数据并行与任务并行 关键词:OpenCL; data...parallel; task parallel 数据并行化计算与任务并行化分解可以加快程序的运行速度。...这种办法对不同的数据使用相同的核函数,称为数据并行。 ? 图3....(task parallel) 另外还有一种就是任务并行化,可以使所有功能函数内部的语句并行执行,即任务并行化,如本文中的功能函数可以分解为“加减乘除”这四个任务,可以产生“加减乘除”四个核函数,让四个函数同时执行

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Seurat4.0系列教程19:多线程并行策略

在Seurat,我们选择使用future框架进行并行。如果您有兴趣了解更多有关future框架的内容,请点击future[1]了解全面而详细的描述。...如何在Seurat4.0使用并行 要访问 Seurat 中的并行函数版本,您需要加载future包并设置plan 。plan将指定如何运行该函数。默认行为是以非并行方式(按顺序)进行。...为了实现并行,我们通常建议"多线程"策略。默认情况下,这将调用所有可用的核,但可以设置workers参数以限制同时活动future的数量。...这里,我们将执行一个简单的比较,比较有和没有并行运行的时间差异。...如果要监控函数进度,则需要放弃并行化,选择使用plan("sequential")。 如果我不断看到以下错误,该怎么办?

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TPU中的指令并行和数据并行

高性能的多来自于并行,因此本文分别讨论了指令并行和数据并行的设计方法。...为了获得更高的性能,可以采用一系列的常规方法进行设计,包括 指令并行,即一次性处理更多指令,让所有执行单元高效运行 数据并行,即一次性处理多组数据,提高性能 后文会针对这两点做进一步描述,并简单讨论...根据指令流和数据流之间的对应关系,可以将处理器分为以下几个类别 SISD,单指令流单数据流,顺序执行指令,处理数据,可以应用指令并行方法 SIMD,单指令流多数据流,同一指令启动多组数据运算,可以用于开发数据级并行...MISD,多指令流单数据流,暂无商业实现 MIMD,多指令流多数据流,每个处理器用各种的指令对各自的数据进行操作,可以用在任务级并行上,也可用于数据级并行,比SIMD更灵活 由于TPU应用在规则的矩阵.../卷积计算中,在单个处理器内部的设计上,SIMD是数据并行的最优选择。

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Linux零拷贝_Linux开发教程

Linux  中传统服务器进行数据传输的流程 Linux  中传统的 I/O 操作是一种缓冲 I/O,I/O 过程中产生的数据传输通常需要在缓冲区中进行多次的拷贝操作。...对于 Linux 来说,现存的零拷贝技术也比较多,这些零拷贝技术大部分存在于不同的 Linux 内核版本,有些旧的技术在不同的 Linux 内核版本间得到了很大的发展或者已经渐渐被新的技术所代替。...总结 本系列文章介绍了 Linux 中的零拷贝技术,本文是其中的第一部分,介绍了零拷贝技术的基本概念,Linux 为什么需要零拷贝这种技术以及简要概述了 Linux 中都存在哪些零拷贝技术这样一些基本背景知识...第一部分主要介绍了一些零拷贝技术的相关背景知识,简要概述了 Linux 为什么需要零拷贝技术以及 Linux 中都有哪几种零拷贝技术。...该技术在 Linux 中还停留在实验阶段。

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深度学习框架OneFlow的并行特色(附框架源码和教程

下混合并行流程示意 混合并行的优势及适用场景 OneFlow混合并行实例 2、网络模型训练的逻辑图 我们先设定一个简单的多层网络,作为我们我们讨论并行方式的载体,其结构如下图所示: ?...、模型并行与混合并行,我们将依次进行介绍,其中混合并行是重点。...3、Consistent 视角下的并行特色 纯数据并行 我们已经知道,consistent 视角下,默认的并行方式是数据并行;而如果选择 mirrored 视角,则只能采用数据并行;若在调用作业函数时直接传递...实际上,也可以使用 混合并行,在同一个分布式训练的不同部分,组合使用数据并行、模型并行。...5、混合并行实例 代码示例 以下,在 consistent 视角下,我们对 MLP 模型采用了混合并行方案:输入层与隐藏层采用(默认的)数据并行;输出层采用模型并行并进行列切分。

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C#并行与多线程——Parallel并行

并行Parallel 在Parallel下面有三个常用的方法invoke,For和ForEach。 先说下StopWatch,这个类主要用于测速,记录时间。...很直观的看出,使用Parallel.Invoke()之后,Run1和Run2是并行执行的,一共用时3s(3000ms左右),而直接运行Run1和Run2则耗时5s。...Parallel.For实际上是并行执行了循环,因为内部只是一个单纯的累加,因此效率差异明显,但是并非所有的场景都适合使用并行循环。 修改一下上面的方法。...."); } 改为操作一个全局变量的累加,这个时候由于并行请求,需要等待调用内存中的全局变量num,效率反而降低。...同样的,由于并行处理的原因,For的结果并不是按照原有顺序进行的: public void ParallelForCW() { Parallel.For(0, 100, i => { Console.Write

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Flink零基础教程并行度和数据重分布

读者可以使用Flink Scala Shell或者Intellij Idea来进行练习: Flink Scala Shell使用教程 Intellij Idea开发环境搭建教程 Flink单数据流基本转换...如下图所示,各个算子并行地在多个子任务上执行,假如算子的并行度为2,那么它有两个实例。 ?...并行度可以在一个Flink作业的执行环境层面统一设置,这样将设置该作业所有算子并行度,也可以对某个算子单独设置其并行度。...如果不进行任何设置,默认情况下,一个作业所有算子的并行度会依赖于这个作业的执行环境。如果一个作业在本地执行,那么并行度默认是本机CPU核心数。...当我们将作业提交到Flink集群时,需要使用提交作业的客户端,并指定一系列参数,其中一个参数就是并行度。 下面的代码展示了如何获取执行环境的默认并行度,如何更改执行环境的并行度。

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