Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言,运行在超过 100 种计算机平台上,适用广泛,从大型机到便携设备,从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux(主要是 CentOS)、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
linux的发行版非常多,其实本质上差别不大,哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用,当然ubuntu本身也有版本的区别,目前是16,我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端,建立目录: Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
在某些情况下,你可能想要将一个服务器上的软件包列表安装到另一个服务器上。例如,你已经在服务器 A 上安装了 15 个软件包并且这些软件包也需要被安装到服务器 B、服务器 C 上等等。
如果你和我一样,你可能在某一个地方有一个“沙盒”,你可以在那里进行你正在做的任何项目。随着时间的推移,沙盒会变得杂乱无章,充斥着各种想法、工具链元素、你不使用的代码模块,以及其他你不需要的东西。当你完成某件事情时,这会使你的部署变得复杂,因为你可能不确定项目的实际依赖关系 —— 随着时间推移你在沙盒中已经有了一些工具,但是你忘了必须安装它。你需要一个干净的环境,将所有的依赖关系放在一个地方,以便以后更方便。
周末宅在家里,捣鼓了一天,在本地用虚拟机搭建了 4 个 Linux 的集群环境,机器之间实现了相互访问。从此以后我的本地就有一套集群环境了,真正意义上可以模拟分布式的环境了!后面还可以模拟大型电商项目的高并发场景,美滋滋!
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样,用QQ、微信的客户端,都是通过命令行来进行聊天交流的,大概是为了提升逼格吧。
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题,因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的,尤其是分量很重的VEP,所以即使你再如何如何的讨厌perl,也不得不与之打交道。 这种细节问题问我,我当然无法直接给出答案咯。毕竟,我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客,才意识到,我竟然已经写了7篇教程,关于perl的模块。目录如下: ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
该安装方式适合:mysql-5.6.33-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz 这个版本
微星笔记本(SMI)相对于常规的GPU服务器要便携很多,对于需要经常搬动的场景,确实很适用。但毕竟微星笔记本定位是玩游戏的,不是做linux服务器,所以尝试把它变成GPU服务器的过程遇到不少坑,这里记录下相关经验。
Qt 5.9 之后的安装包与之前相比,不再区分 VS 版本和 MinGW 版本,而是全都整合到了一个安装包中。因此,与之前的安装包相比,体积也是大了不少,以前是 1G 多,现在是 2G 多。
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最近双十一剁手,退役了跟了自己 7 年多神舟承运本本,很肉痛的入手了一台 Macbook Air 13.3。在研究新鲜玩意之前,先缅怀一下这个见证我从电脑小白成长到以电脑作为饭碗的 NB 本本。 曾经为了验证某个蓝屏问题,一天内将它重装了十多次!直到现在,虽然用起来略卡,可偶尔还能用 35 帧的姿态过一把撸瘾。不过,此时它正安静的躺在那个角落。。。 回到 MBA,上手并没有想象中的那么难,方便的触控板让我直接扔掉了鼠标,进行此文的撰写。 入手的目的是为了工作,所以第一件事就是找寻一个替代 windows 下
这篇文章中,将会介绍如何利用 Metasploitable 2 上 Unreal IRCd service 存在的漏洞;学习如何对网络服务进行枚举,及如何定义和检索关键信息;分析和使用 msfvenom 来生成 payload 。 为了获取更多关于 Unreal IRCd 的信息,我们还将使用 hexchat IRC 客户端,连接进入到 IRC 频道。 例如:有时我们使用 Nmap 无法获取到具体的版本号时,我们仍可以继续通过当前处理的信息,进行近一步的漏洞评估和发现。在这篇文章中,我们同样将通过,手动
每个手册页面都有一个简短的描述。whatis 搜索手册页,显示匹配的手册页中 NAME 一节内容。
通过部署nginx_lua_waf,具有使用简单、高性能、轻量级的优势,能够有效的防范sql注入、文件包含、XSS、fuzzing等web攻击,屏蔽异常的网络请求,防止webshell上传,相比于安全狗等商业版WAF,能够根据实际需求调整过滤规则,编辑符合企业自身业务需求的过滤规则。
我们使用纯文本写代码,有了Markdown又可以使用纯文本写文档,那么对于更直观的信息表达方式——图片,能不能使用纯文本描述呢?
这当然是最基本的黑客技能。如果你还不会任何编程语言,我建议你从Python开始。它设计清晰,文档齐全,合适初学者入门。它是一门很好的入门语言,并且不仅仅只是个玩具;它非常强大、灵活,也适合做大型项目。好的教程可以在Python网站得到。 Java也是好的入门语言。它比Python难得多,但是生成的代码速度也快得多。它同时也是一种优秀的计算机语言,不止是用来入门。 但是注意,如果你只会一两门语言,你将不会达到黑客所要求的技术水平,甚至也不能达到一个程序员的水平——你需要学会如何以抽象的方式思考编程问题,独立于任何语言。要做一名真正的黑客,你需要学会在几天内通过一些手册,结合你现在所知,迅速掌握一门新语言。这意味着你应该学会几种截然不同的语言。
OTRS是一个开源的票证请求系统。它为用户,客户,IT人员,IT服务和任何外部组织提供单点联系。该程序是用Perl编写的,支持各种数据库(MySQL,PostgreSQL等),并且可以与LDAP目录集成。
B. 当IIS中的ASP仅用于后台,同时使用人数较少.前台页面主要以HTML静态页面展示,ASP用来做的事情较少,本身对系统的负担很轻
1、在主机上,从 Workstation Pro 菜单栏中选择 虚拟机 -> 安装 VMware Tools。 如果安装了早期版本的 VMware Tools,则菜单项是 更新 VMware Tools。 此时虚拟机界面底部会弹出帮助信息,如下图所示:
LAMP架构是目前成熟的企业网站应用模式之一,指的是协同工作的一整台系统和相关软件,能够提供动态web站点服务及其应用开发环境。 LAMP是一个缩写词,具体包括Linux操作系统,Apache网站服务器,MySQL数据库服务器,PHP(或perl,Python)网页编程语言。
Bugzilla 是一个基于 Web 的,开源的,用来记录跟踪缺陷数据库的 bug 跟踪软件。它可以管理软件开发中缺陷的提交(new)、修复(resolve)和关闭(close)等整个生命周期,它允许个人和团队有效地记录下他们产品的一些突出问题。
CentOS 8操作附带一个定制内核,以确保其完整性和与支持的硬件的兼容性。CentOS 8 Linux中附带的内核版本为4.18。Linux内核包括基本内核本身和许多内核模块。
1、rpm包安装的,可以用 rpm -qa 看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep "软件或者包的名字"
环境: [root@redis ~]# uname -a Linux redis 2.6.32-696.el6.x86_64 #1 SMP Tue Mar 21 19:29:05 UTC 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux [root@redis ~]# cat /etc/redhat-release CentOS release 6.9 (Final) [root@redis ~]# getenforce Disabled [root@redis ~]# /etc/
第一个“#”表示是这一行是注释 第二个“!”表示这一行不是普通注释,而是解释器路径的声明行 后面的“/usr/bin/perl”是perl解释器的安装路径,也有可能是:“/usr/local/bin/perl”,如果那个不行,就换这个 use strict是严格检查语法
对于 Linux 虚拟机,您可以从命令行手动安装 VMware Tools。对于Centos集成环境,可以使用下面安装方法,centos7和8都通用。
Perl是高端、通用、解释型、动态的编程语言家族。Perl借用了C、sed、awk、shell脚本、Lisp以及很多其他编程语言的特性。其中最重要的特性是Perl内部集成了正则表达式的功能,以及巨大的第三方代码库CPAN。
最近PHP爆出漏洞,老高也在升级PHP版本,并加入一些支持,但是遇到这个问题很蛋疼
图 1. Webmin 配置屏幕 用户也可以使用 Webmin有一个图标用来配置可选的 Usermin 软件包,这个软件包提供了一个基于 Web 的工具,用户可以借助它完成修改密码、管理系统邮件等任务。使用 Usermin 不能访问系统配置文件。Usermin 和 Webmin 都将是免费的产品。 System 窗体可以进行操作系统的总体配置。在这里,您可以配置文件系统、用户、组和系统通常的引导行为。您可以控制系统中运行的服务,通过选择 Bootup 和 Shutdown 图标来决定它们是否自动启动。不过,对那些服务的具体配置是由 Servers 窗体完成的。尤其要注意“Software Package”工具,它可以方便地查看您系统中已经安装的软件包,以及到发行版本升级库和 rpmfind.net 的接口,rpmfind.net 是 Internet 上的一个公用的 RPM 库。 Servers 窗体可以对您可能会在系统中运行的各个服务进行配置。BIND 和 DHCP 工具非常便捷。同时 Samba 工具也很好用,可以为 Windows 和其他客户机配置文件和打印机的共享。SMTP 服务器 Sendmail 以其极复杂的配置文件而出名。Webmin Sendmail 工具同样为您解决了这一问题。
CustomLog ” /var/log/httpd/access_log” combined
Apache(音译为阿帕奇)是世界使用排名第一的Web服务器软件。它可以运行在几乎所有广泛使用的计算机平台上,由于其跨平台和安全性被广泛使用,是最流行的Web服务器端软件之一。它快速、可靠并且可通过简单的API扩充,将Perl/Python等解释器编译到服务器中。
本文主要介绍的是让python包管理变得更加容易的实际应用方法,就是运用easy_install这一软件,下面是文章的具体介绍。
下载: http://mirrors.kernel.org/gnu/m4/m4-1.4.13.tar.gz 拷贝到centos系统上,并解压:
git bash 是 Windows 用户安装 git 时默认安装的命令行工具,不仅界面漂亮功能也不错,大多数情况下可以替代 Windows 原生的 cmd 命令行.
最近的MHA验证时,遭遇了DBD::mysql::dr::imp_data_size unexpectedly这个错误。而DBD这个包已经是安装过了的。下面是这个问题的描述和解决方案。
Cron Job是操作系统中基于时间的作业调度程序。它允许在指定的时间,日期,间隔等自动定期运行作业。例如:假设用户具有Shell或Perl脚本,该脚本计算UNIX / Linux中磁盘的人均磁盘空间使用情况。在UNIX / Linux中为此脚本以指定的频率(或时间)设置Cron Job将确保该脚本在计划的时间(或频率)下自动运行,而用户无需每次都手动运行它。
Linux+Apache+Mysql/MariaDB+Perl/PHP/Python一组常用来搭建动态网站或者服务器的开源软件,本身都是各自独立的程序,但是因为常被放在一起使用,拥有了越来越高的兼容度,共同组成了一个强大的Web应用程序平台。LAMP是指一起使用来运行动态网站或者服务器的自由软件名称首字母缩写:
随着基因组和宏基因组的测序成本逐渐降低,直接获取环境中微生物的基因组变得越来越容易,大大促进了科学家们对微生物尤其是无法纯培养微生物的了解。当我们通过基因组测序或者宏基因组测序binning获得一个新的基因组时,我们如何判断其处于哪一个系统发育分支?也许搜寻其中的16S序列并与数据库进行比对是个可行的方法,然而宏基因组binning获得的基因组(bins)常常丢失16S序列。本文将介绍两个基于全基因组的系统发育分类工具PhyloPhlAn与GTDB-Tk。
在渗透测试实战中,我们经常会遇到Linux系统环境,而让Linux主机反弹个shell是再常见不过的事情了。
下载地址:http://www.erlang.org/download.html
然后在 搜狗输入法Linux官网 下载 64位程序,解压并移动到当前目录下,执行如下指令:
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目,包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具,您可以安装,删除,并在之间切换Perl版本。
SecureCRT是一款支持SSH的终端仿真程序,同时支持Telnet和rlogin协议等, 之前在Windows用过一段时间,之后切换到Linux平台,minicom替代了SecureCRT, minicom的功能太弱了. 无意中浏览官网,发现支持linux版本,果断回归.
Qt Creator是一个IDE,就是一个平台,一个开发环境,类似的比如说VS,也可以进行Qt开发,当然VS中的Qt是作为一个插件插入VS平台的。
包管理器是方便软件安装、卸载,解决软件依赖关系的重要工具,在不同发行版本的Linux系统中,有着不同的软件包管理器:
目前最新版本是1.1.1,可以通过修改版本号的方式下载最新版本,最新版本可以在这个网站下载:https://www.openssl.org/source
并发量小,用户使用的少,所以在低并发的情况下,一个jar包启动应用就够了,然后内部tomcat返回内容给用户。
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