前面我们简单介绍过什么是gmt文件，基因矩阵转置文件格式（* .gmt）。今天我们就用R来去读gmt文件。...首先我们从GESA(https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp)的官网上，下载一个gmt文件。...这里以KEGG的gmt文件为例，其他gmt文件的读取方法一样。 ? c2.cp.kegg.v7.0.symbols.gmt这个文件里面保存的是基因的名字， ?...而c2.cp.kegg.v7.0.entrez.gmt这个文件里面保存的是基因的Entrez gene id， ?...下面我们会用两种不同的方法来将KEGG symbol的gmt文件读到R里，并转换成列表。由于gmt文件的每一行都是不一样长的，所以传统的read.table在这里是毫无用武之地的。
UTC（Coordinated Universal Time，世界协调时间） 多数的两地时间表都以GMT来表示，但也有些两地时间表上看不到GMT字样，出现的反而是UTC这3个英文字母，究竟何谓UTC？...”为单位的国际原子时所综合精算而成的时间，计算过程相当严谨精密，因此若以「世界标准时间」的角度来说，UTC比GMT来得更加精准。...所以基本上UTC的本质强调的是比GMT更为精确的世界时间标准，不过对于现行手表来说，GMT与UTC的功能与精确度是没有差别的。...一个简单的时间转换，如北京东8区为例： GMT + 8 = UTC + 8 = CST GMT与UTC区别 GMT和UTC都以伦敦格林威治时间为准，不同点是UTC比GMT更精准！...在UTC中，每一年或两年会有一个“闰秒”，而我们一般不理会这个“闰秒” 参考推荐： GMT，UTC，DST，CST时间表示的区别 UCT和GMT时间 双重标准？ Retina屏科学原理
GMT GMT是指格林尼治标准时间，它对应位于英国伦敦郊区的皇家格林威治天文台的标准时间。 理论上来说，格林威治标准时间的正午是指当太阳横穿格林威治子午线时（也就是在格林威治上空最高点时）的时间。
3、完善分发器的代码，这是由于app.py需要修复问题，但是分发器才完成一半，Push上服务器没有什么意义，这时候就需要使用stash
，编辑器打开可以看到就是一行的内容，如下所示： Splicing_factors_geneset NA TARDBP SRRM1 PPP1R8 PPIE 后面的基因省略掉 写出gmt文件 假如你目前的基因列表在...R里面，就可以自己写一个函数，比如 write.gmt 进行输出到gmt文件（本质上仍然是文本文件）： library(msigdbr) all_gene_sets = msigdbr(species...(gs,file) 读取gmt文件 假如你拿到了gmt文件，很容易读取它并且去做分析，下面有两个不同包的函数： file="Homo-H-examp.txt" gmt <- GSEABase::getGmt...( file ) #GeneSetCollection 对象 gmt clusterProfiler::read.gmt( file ) # 普通数据框 跨越gmt文件 其实完全没必要写出gmt文件...和GSEA 首先呢，clusterProfiler重新改写了gmt文件和做gsea的方法，所以代码稍微有一点点不同。
某次突然关闭连接…..会出现swp文件,那么就要使用ll -a找到swp文件然后 rm -f swp文件,就可以正常打开文件了 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn
GMT-格林尼治标准时 GMT 的全名是格林威治标准时间或格林威治平时 （Greenwich Mean Time），这个时间系统的概念在 1884 年确立，由英国伦敦的格林威治皇家天文台计算并维护，并在往后的几十年往欧陆其他国家扩散...在刚开始的几十年，GMT 的测量方法非常简单：观测者随时监控太阳在天空的位置，并且把每天太阳爬升到仰角最高的时候记录下来，这个时间点称呼为“过中天”。...这个就是 GMT。 GMT 12:00 就是指的是英国伦敦郊区的皇家格林尼治天文台当地的中午12:00，而GMT+8 12:00，则是指的东八区的北京当地时间的12:00。...如果上述时间指的是纽约时间，那么纽约是GMT-5，所在地北京GMT+8，相差13个小时,转换成北京时间为2019年2月1号09:00。...如果上述时间指的是东京时间，那么东京是GMT+9，所在地北京GMT+8，相差1个小时,转换成北京时间为2019年2月1号21:00。
gmt文件可能对于很多人来说比较陌生，但是对于使用GSEA（https://www.gsea-msigdb.org/）做过基因富集分析的人应该并不陌生。...gmt（Gene Matrix Transposed，基因矩阵转置）文件，里面保存的是一些基因列表的信息。每一行代表一个基因列表，基因之间以制表符隔开。下面是一个gmt文件的示例。...下期我们将来谈谈如何用R读取gmt文件，为后续富集分析做准备。
在探索Linux的世界中，"Linux I/O" 或 Linux 输入/输出，是个让数据动起来的魔法。...✨ 就像我们通过眼睛看世界、用嘴巴说话️一样，计算机也需要读取数据（输入）和输出数据（输出），而Linux I/O正是这个过程的大管家。1. 什么是Linux I/O？...简单来说，Linux I/O就是处理这些数据输入和输出的机制。2. 为什么需要Linux I/O？Linux I/O的设计和实现对于操作系统的性能至关重要。...Linux I/O打开了这扇窗户，让数据流动起来，使得我们能够通过计算机与世界互动。它确保了我们能够存取信息，让我们的应用程序能够运行和响应我们的需求。3. 如何理解Linux I/O?...要深入理解Linux I/O，我们可以从以下几个方面入手：I/O模型：Linux支持多种I/O模型，如阻塞I/O、非阻塞I/O、I/O复用、信号驱动I/O和异步I/O。
Ctrl+Shift+T 打开多个终端 Ctrl+D 关闭终端 ！！想开几个就按几次快捷键
前言 我们都知道，在linux下，“一切皆文件”，因此有时候查看文件的打开情况，就显得格外重要，而这里有一个命令能够在这件事上很好的帮助我们-它就是lsof。...linux下有哪些文件 在介绍lsof命令之前，先简单说一下，linux主要有哪些文件： 普通文件 目录 符号链接 面向块的设备文件 面向字符的设备文件 管道和命名管道 套接字 以上各类文件类型不多做详细介绍...linux就比较容易了，使用lsof命令就可以了，例如要查看当前哪些程序打开了hello.c: $ lsof hello.c COMMAND PID USER FD TYPE DEVICE...查看某个目录文件被打开情况 $ lsof +D ./ 查看当前进程打开了哪些文件 使用方法：lsof -c 进程名 通常用于程序定位问题，例如用于查看当前进程使用了哪些库，打开了哪些文件等等。...linux是一个多用户操作系统，怎么知道其他普通用户打开了哪些文件呢？
linux学习(六) linux防火墙的关闭与打开 强烈推介IDEA2020.2...破解激活，IntelliJ IDEA 注册码，2020.2 IDEA 激活码 CentOS（Community ENTerprise Operating System）是Linux发行版之一，当我们使用...CentOS时，我建议大家配置一个iptables，iptables 是与最新的 2.6.x 版本Linux 内核集成的 IP 信息包过滤系统.非常好用。...在Linux中设置防火墙，以CentOS为例，打开iptables的配置文件： ?...4.打开主动模式21端口 ? 5.打开被动模式49152~65534之间的端口 ?
linux查看3306端口号是否打开 在Linux使用过程中，需要了解当前系统开放了哪些端口，并且要查看开放这些端口的具体进程和用户，可以通过netstat命令进行简单查询。
前言 为什么要学习 Linux ？ 目前企业有超过 80% 甚至更多的系统都是 Linux 操作系统，所以不管是做开发还是运维，不会点 Linux 知识肯定是无法进入到企业里工作。...而且，很多企业的岗位职责里写要需要精通 Linux 。 Linux 的从业方向也比较广，主要分为 运维 和 开发 ，细分下来就数不胜数了，基本都会涉及，因此学好 Linux 刻不容缓。...Linux 有上百种不同的发行版，如基于社区开发的 debian、archlinux，和基于商业开发的 Red Hat Enterprise Linux、SUSE、Oracle Linux 等。...语法： 语法格式：tail [参数] 常用参数： 参数 描述 –retry 即是在tail命令启动时，文件不可访问或者文件稍后变得不可访问，都始终尝试打开文件。...lsblk命令包含在util-linux-ng包中，现在该包改名为util-linux。
无论您是使用 Linux 作为服务器还是桌面，了解开放端口或正在使用的端口在各种情况下都会有所帮助。...在 Linux 中有多种检查端口的方法，我将在这个快速提示中分享我最喜欢的两种方法。...方法一：使用 lsof 命令查看当前登录的 Linux 系统中打开的端口 如果您直接或通过 SSH 登录到系统，则可以使用 lsof 命令检查其端口。...这将显示计算机上打开的所有端口，这些端口可由网络上的另一台计算机访问。 结论 在这两种方法中，我更喜欢 lsof 命令，它比 nc 命令更快。但是，您需要登录系统并拥有 sudo 访问权限。...这两个命令都可用于根据您所处的场景检查 Linux 中的开放端口。
如果linux已经部署好了，但是页面打不开，可能是因为在上传war包时没有彻底关闭tomact，可执行以下步骤 1，先关闭toamct 2，执行 ps -ef|grep java 查看进程，如果出现以下
Linux 查看、关闭、打开防火墙命令 以下截图中的操作均在Centos7上进行。 1.
最近我在阿里云ESC上购买了一台服务器，但是在安装完redis后，我在本地的电脑上怎么也没法调用这台服务器上面的redis服务。
也可以链接一个本机的libstdc++: ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 'yourPath'/Sdk/emulator/lib64//libstdc...++.so.6 但是依然打不开哦，打开闪退了。
在Linux中，您可以更改打开文件的最大数量。您可以使用ulimit命令修改此数字。它授予您控制shell启动的资源或由其启动的进程的能力。...另请参阅： 按用户级别设置Linux运行进程限制 在这个简短的教程中，我们将向您展示如何检查打开文件和文件描述的当前限制，但为此，您需要具有对系统的root访问权限。...首先，让我们看看我们如何找到Linux系统上打开的文件描述符的最大数量。...查找Linux打开文件限制 该值存储在： [root@localhost ~]# cat /proc/sys/fs/file-max 483438 您将看到的数字显示用户每次登录会话可以打开的文件数。...您可以通过编辑内核指令来增加Linux中打开文件的限制 fs.file-max。为此，您可以使用sysctl实用程序。 Sysctl用于在运行时配置内核参数。
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