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批量运行多个R脚本

里面就有很多R代码 : 代码文件很多 如果把这些R代码文件一个个打开,然后一个个运行,工作量也不小,所以我们推荐一个技巧: fs=list.files('....其实理论上应该是在运行每个脚本的时候加上try catch,不过咱们的目标是批量运行每个代码并且保证成功,所以跳过那些运行失败的解决不了问题,反而应该是勇往直前解决问题。...,然后批量运行成功为止。...需要基本生信背景知识 当然需要读者具备计算机基础知识,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门...Linux(2019更新版)》 其中,R语言可能更重要一点,我把R的知识点路线图搞定,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵

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批量运行多个R脚本并打印运行状态

曾老师曾经有一篇推文《批量运行多个R脚本》,介绍了批量运行R脚本的思路,同时也提出了一些问题,今天就这个学徒作业,我们来探究一下。 首先前往github[1]下载R脚本。...打开以后可以发现这里有19个R脚本,如果把这些R代码文件一个个打开再运行,无疑增加了很多工作量。...实测在我的R环境下,运行到第3个代码遇到了报错,此时Fig 1A和Fig 1B的结果已经产生。 这个时候我们希望脚本继续运行,同时打印各个脚本的运行情况。...我们参考教程R语言tryCatch使用方法:判断Warning和Error[2]和中断运行 r 忽略报错 继续运行[3](这个教程中的代码有些问题,需要自己修改调试),使用「tryCatch」来解决这个问题...,如果运行过程中有warning,就会提示「warning @ 脚本名 @ warning的具体内容」,如果运行中有error,就会提示「error @ 脚本名 @ error的具体内容」。

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使用Django批量监控Oracle Job运行情况

然后将获得的数据库处理后再前端显示 往期可以到我的个人网页查看 http://www.zhaibibei.cn/oms/ http://www.zhaibibei.cn/domanager/ 这期讲如何使用Django批量监控...Oracle Job运行情况 开发环境 操作系统:CentOS 7.3 Python版本 :2.7 Django版本: 1.10.5 操作系统用户:oracle 1....程序原理 原理为通过Django来批量连接Oracle数据库,然后查看dba_jobs视图,如果发现问题则报警出来 2 . 程序主体 ?...获取Job执行信息的函数 我们通过如下函数获取Job的执行情况,该程序可单独于Django运行 路径为: mysite/monitor/command/checkoraclejob.py def checkjob...设置自动运行 这里我们设置每天凌晨进行一次,并重定向所有日志至一个文件 这样我们可以通过检查该日志文件判断脚本是否正常运行 59 23 * * * /usr/bin/python2.7

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teprunner测试平台测试计划批量运行用例

本文开发内容 上一篇文章已经把pytest引入到测试平台中,通过多线程和多进程的方式,运行测试用例。有了这个基础,做批量运行用例的功能就很简单了,只需要前端传入一个CaseList即可。...具体开发内容如下: 测试计划增删改查 测试计划动态添加移除测试用例 运行测试计划,批量运行用例 计划运行结果、用例运行结果 编写后端代码 编辑teprunner/urls.py文件,添加测试计划的路由:...最后,编辑teprunner/views/run.py文件,增加批量运行用例的功能: ?...值得注意的是中间那段代码,根据plan_id从PlanCase中找到关联用例,生成了case_list,这样就复用run_case的多线程和多进程代码,批量运行测试用例了。...小结 本文进一步完善了测试平台的功能,除了单条用例运行,还能批量用例运行(催更的小伙伴可以拉代码尝试下哦)。

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使用Django批量监控Oracle Job运行情况

然后将获得的数据库处理后再前端显示 往期可以到我的个人网页查看 http://www.zhaibibei.cn/oms/ http://www.zhaibibei.cn/domanager/ 这期讲如何使用Django批量监控...Oracle Job运行情况 开发环境 操作系统:CentOS 7.3 Python版本 :2.7 Django版本: 1.10.5 操作系统用户:oracle 1....程序原理 原理为通过Django来批量连接Oracle数据库,然后查看dba_jobs视图,如果发现问题则报警出来 2 ....获取Job执行信息的函数 我们通过如下函数获取Job的执行情况,该程序可单独于Django运行 路径为: mysite/monitor/command/checkoraclejob.py def checkjob...设置自动运行 这里我们设置每天凌晨进行一次,并重定向所有日志至一个文件 这样我们可以通过检查该日志文件判断脚本是否正常运行 59 23 * * * /usr/bin/python2.7

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