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Linux:转录组分析1-建立工作目录

转录组测序分析本笔记主要是针对转录组测序分析专题上游分析,需要有Linux基础知识,目标是养成一个良好的分析习惯,熟悉转录组分析上游流程,重点是针对分析的结果能有自己的思考和解读能力。...cd ~## 1.建立数据库目录:在数据库下建立参考基因组数据库,注意命名习惯:参考基因组版本信息mkdir -p database/GRCh38.105## 2.建立项目分析目录mkdir projectcd...projectmkdir Human-16-Asthma-Trans # 注意项目命名习惯:物种-样本数-疾病-分析流程cd Human-16-Asthma-Trans# 建立数据存放目录mkdir...-p data/rawdata data/cleandata/trim_galore data/cleandata/fastp# 建立比对目录mkdir -p Mapping/Hisat2 Mapping.../Subjunc# 建立定量目录mkdir -p Expression/featureCounts Expression/Salmon# 查看整个分析目录准备结构tree├── data│   ├──

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    给Excel工作表建立目录

    有时候我们会在一个工作簿中建立很多工作表,怎样才能简单明了的管理工作表呢,当然能建一个目录最好了,这里我们就学习一种给工作表创建目录的方法。 1、在工作簿中新建一个工作表,命名为“目录”。...(A1))&T(NOW()) 3、在B1单元格中输入公式,并向下复制: =IFERROR(HYPERLINK(目录&"!...A1",MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)),"") 现在可以看到效果了,单击目录中的工作表名称,就会自动跳转到相应工作表。...FIND("]",目录)部分,用于查找符号"]"在自定义名称“目录”计算结果中的位置。...MID(目录,FIND("]",目录)+1,99)部分,从“目录”中的"]"符号后一个字符处取值,取值长度为99个字符,这里的99可以写成任意一个较大的数值。

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    【Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ① ( arch 目录 | block 目录 | certs 目录 | crypto 目录 | Documentation 目录 )

    文章目录 一、arch 目录 二、block 目录 三、certs 目录 四、crypto 目录 五、Documentation 目录 在上一篇博客 【Linux 内核】Linux 内核源码结构 ( 下载...Linux 内核源码 | 使用 VSCode 阅读 Linux 内核源码 ) 中 , 使用了 Visual Studio Code 查看 Linux 内核源码 , 本篇博客开始分析 Linux 内核源码结构...; 一、arch 目录 ---- arch 目录是 针对 不同 CPU 体系架构平台 的代码 , 将 与 平台 相关的代码 放在该目录中 , 如某些代码只针对 x86 架构的平台 , 那么放在 arch.../x86 目录下 ; 每种体系结构 , 都有 相应的子目录 , 如 arm , arm64 分别是 arm 32 位和 64 位平台 ; 二、block 目录 ---- block 目录 , 是子系统目录..., 其中存储了 块设备驱动 相关代码 ; 三、certs 目录 ---- certs 目录中存储了 认证 和 签名 相关代码 ; 四、crypto 目录 ---- crypto 目录中存储了 内核中常用的

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    【Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ② ( drivers 目录 | fs 目录 | include 目录 | init 目录 | ipc 目录 | kernel 目录 )

    文章目录 一、drivers 目录 二、fs 目录 三、include 目录 四、init 目录 五、ipc 目录 六、kernel 目录 一、drivers 目录 ---- drivers 目录中存储了...驱动程序 相关代码 , 如 USB 总线驱动程序 , PCI 总线驱动程序 , 显卡驱动程序 , 网卡驱动程序 等 ; 二、fs 目录 ---- fs 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual...目录 ---- include 目录中存储了 内核源码 依赖 的 大部分头文件 代码 ; include 目录中存储了 虚拟文件系统 ( Virtual File System ) 相关代码 ; 四、...init 目录 ---- init 目录中存储了 Linux 内核的初始化 相关代码 ; 该 初始化代码 关联到了 内存的各个组件 的入口 ; 五、ipc 目录 ---- ipc 目录中存储了 进程间通信...相关代码 ; 如 : 信号量 , 共享内存 等 ; 六、kernel 目录 ---- kernel 目录中存储了 内核核心代码 ; 其中包含了 进程管理 , IRQ 中断 等模块 ;

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    【Linux 内核】Linux 内核源码目录说明 ③ ( lib 目录 | LICENSES 目录 | mm 目录 | net 目录 | samples 目录 | scripts 目录 )

    文章目录 一、lib 目录 二、LICENSES 目录 三、mm 目录 四、net 目录 五、samples 目录 六、scripts 目录 一、lib 目录 ---- lib 目录中存储了 C 语言标准库的子集...相关代码 ; 二、LICENSES 目录 ---- LICENSES 目录中存储了 开源许可协议 相关协议文本 ; 该目录拿下都是文本文件 ; 三、mm 目录 ---- mm 目录中存储了 内存管理...( Memory Management ) 相关代码 ; 四、net 目录 ---- net 目录中存储了 网络协议 相关代码 ; 如 : TCP , WIFI , IPV4 , IPV6 等 ;...五、samples 目录 ---- samples 目录中存储了 Linux 内核参考示例代码 ; 六、scripts 目录 ---- scripts 目录中存储了 内核 编译 配置 相关脚本 ;

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    Linux目录结构

    Linux 目录结构 装完Linux,首先需要弄清Linux 标准目录结构 / root —?启动Linux时使用的一些核心文件。如操作系统内核、引导程序Grub等。 home —?...设备文件目录 etc — 配置文件 skel — home目录建立,该目录初始化 sysconfig — 网络,时间,键盘等配置目录 var file lib — 该目录下的文件在系统运行时,会改变...一般情况下这个目录是空的,而在我们将要挂载分区时在这个目录下建立目录,再将我们将要访问的设备挂载在这个目录上,这样我们就可访问文件了。.../boot:放置linux系统启动时用到的一些文件。/boot/vmlinuz为linux的内核文件,以及/boot/gurb。...Linux Directory Structure 2.?Linux’s directory structure 3.?Linux目录结构

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    Linux(一)目录

    作者:小徐 制作时间:20180601 联系方式:xiaoxubigdata@163.com 目录 目录 2 1 Linux总结 20 1.1 概述 20 1.2 常用的Linux下载网址 20...1.3 中国镜像 20 2 Linux 目录结构说明 21 2.1 目录树 21 2.2目录树介绍 21 3 VMware安装教程 22 3.1安装虚拟机 22 3.2在虚拟机中安装Centos 23...以可读的单位显示内存 54 7.4.3.2 以MB为单位显示 54 7.5 mount 命令 55 7.5.1 命令详解 55 7.5.2 参数说明 55 7.5.3 常用命令 55 7.5.3.1 挂载目录...参数说明 57 8.1.2.1 unzip 命令参数说明 57 8.1.2.2 zip 命令参数说明 57 8.1.3 常用命令 57 8.1.3.1 解压zip文件 57 8.1.3.2 解压文件到制定的目录...11.17.3.10打印 UID 和 和 GID 122 11.17.3.11不带颜色打印 122 11.17.3.12 打印每个文件的索引号 122 11.17.3.13增加 / ( 斜线) 标记目录

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    Linux目录操作

    Linux目录操作 本文目录 1 路径名、文件名、工作目录 2 绝对路径、相对路径、四个路径缩写 3 目录中移动 cd pwd、移动目录 mv、重命名目录 mv 4 创建目录 mkdir、删除目录 rmdir...目前所在的目录称为工作目录(当前目录)。.../home/tom/homework homework 对于路径,当使用/开头的名称时,Linux假定这个名称是一个完整的路径名,从根目录开始;当只是用文件名时,Linux假定使用工作目录中的文件。...假设您目前在/home/tom中,那么下面两条命令是等效的: /home/tom/gamelist.txt # 绝对路径名 gamelist.txt # 相对路径名 Linux中有四个路径缩写.....和.是实际的目录,由文件系统提供;~是shell提供的便利写法;-是命令cd提供的便利写法。 Linux认为根目录的父目录就是根目录本身。

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