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Linux - awk

生信技能树学习笔记 图片 在读取一行文本时,会用预定的字段分隔符划分每个数据字段,并分配给一个变量 默认的字段分隔符是任意空白字符(如空格或制表符),也可以用 -F 参数自定义分隔符 $0 代表整个文本行...$NF 代表文本行中的最后一个数据字段 less -S Data/example.gtf | cut -f 9 | head less -S Data/example.gtf | awk -F '\t'...cat Data/example.gtf | awk '{print $9$10}' | head ## 直接连接 cat Data/example.gtf | awk '{print $9"@"$10...}' | head cat Data/example.gtf | awk '{print $9"\t"$10}' | head 匹配模式 cat Data/example.gtf | awk '/UTR...OFS=":"} {print NR,$9}' | head -5 awk 条件和循环语句 图片 ##判断第三列是否是基因 cat Data/example.gtf | awk '{if($3=="gene

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linux——awk(7):awk数组详解

awk中数组的使用。我们在其他语言中经常会使用到数组,awk中也可以使用。...示例如下: 与其他不同的是,awk中的数组元素值可以设置为”空字符串“,当设定某一个元素为”空字符串“时,打印出的值就是为”空“(注:”空格“不为”空“)。...鉴于awk中,元素的值可以为”空“,我们就不能根据元素的值是否为”空“去判断元素是否存在了。...那在awk中如何判断元素的存在呢: 可以使用if(下标 in 数组名),从而判断数组元素是否存在,如上所示,虽然test[1]=””,但是该数组元素依旧存在,只是为”空“。...在awk中,数组的下标不仅可以为”数字“,还可以为”任意字符“。

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Linux 命令 | awk

Linux 命令 awk命令解析 awk 命令是一种强大的文本处理工具,它可以根据指定的模式对文本进行处理、分析和格式化。...awk 的一般形式如下: awk 'pattern1 {action1} pattern2 {action2}...' filename pattern 是模式,用来匹配处理文本的内容; action...为方便读者理解,林一写个具体的 demo 现有有一个文件 linyi.txt,格式如下,计算文本文件中第一列数字的和: 1 abc 2 def 3 ghi 可以使用以下 awk 命令: awk '...Linux 命令 awk 命令注意事项 读者需要注意模式和动作的书写顺序不能颠倒;模式和动作可以省略,但大括号不能省略。 awk 命令还有许多内置变量和函数,可以用于进一步处理文本。...awk 命令还支持正则表达式,可以用来匹配复杂的文本模式。

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Linux awk学习

awkLinux三剑客之一,在我们处理文件等方面还是特别方便的 介绍 我们先来说一说awk是用来干什么的,awk是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时...awk是通过一行一行来处理文件的,上面这条语句执行的过程就是: 1.awk读入一行内容 2.判断是否符合模式中的条件(NR>=2),如果匹配到则执行对应的动作({print $0}),如果没有匹配到,继续读取下一行...3.继续读取下一行 4.重复1-3,直到读取到最后一行 其中的$0实际上是awk的内置变量,代表的是当前一整行记录,awk的内置变量有很多,我们这里举出其中的几个来进行说明,可以借用这些内容来进行各种方式的分割操作...使用NR控制了只要2-5行的内容,使用冒号进行分割,然后输出第一段和第三段的内容,上面对比一下就很清楚了 上面是使用冒号进行分割是在一行进行分割的,也是支持在多行进行分割的,awk对每个要处理的输入数据认为都是具有格式和结构的...这里再解释一下那个BEGIN是做什么的 BEGIN{}: 读入第一行文本之前执行的语句,一般用来初始化操作{}: 逐行处理END{}: 处理完最后以行文本后执行,一般用来处理输出结果 接下来再说一下正则表达式的应用

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Linux awk 命令

这两个功能是Bell实验室版awk的扩展功能,在标准awk中不适用。...test 3 Are awk This's a 10 There apple用法三:awk -v # 设置变量实例: $ awk -va=1 '{print $1,$1+a}' log.txt --...-f {awk脚本} {文件名}实例: $ awk -f cal.awk log.txt运算符运算符描述= += -= *= /= %= ^= **=赋值?...完整的输入记录ARGC命令行参数的数目ARGIND命令行中当前文件的位置(从0开始算)ARGV包含命令行参数的数组CONVFMT数字转换格式(默认值为%.6g)ENVIRON环境变量关联数组ERRNO最后一个系统错误的描述...BEGIN{ 这里面放的是执行前的语句 }END {这里面放的是处理完所有的行后要执行的语句 }{这里面放的是处理每一行时要执行的语句}假设有这么一个文件(学生成绩表):$ cat score.txtMarry

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Linux awk命令

除了使用 sed 命令,Linux 系统中还有一个功能更加强大的文本数据处理工具,就是 awk。 曾有人推测 awk 命令的名字来源于 awkward 这个单词。...和 sed 命令类似,awk 命令也是逐行扫描文件(从第 1 行到最后一行),寻找含有目标文本的行,如果匹配成功,则会在该行上执行用户想要的操作;反之,则不对行做任何处理。...awk 使用数据字段变量 awk 的主要特性之一是其处理文本文件中数据的能力,它会自动给一行中的每个数据元素分配一个变量。...前面说过,在 awk 中,默认的字段分隔符是任意的空白字符(例如空格或制表符)。 在文本行中,每个数据字段都是通过字段分隔符划分的。awk 在读取一行文本时,会用预定义的字段分隔符划分每个数据字段。...注意,在程序文件中,也可以指定多条命令,只要一条命令放一行即可,之间不需要用分号。 awk BEGIN关键字 awk 中还可以指定脚本命令的运行时机。

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Linux Awk用法总结

Awk是什么 Awk、sed与grep,俗称Linux下的三剑客,它们之前有很多相似点,但是同样也各有各的特色,相似的地方是它们都可以匹配文本,其中sed和awk还可以用于文本编辑,而grep则不具备这个功用...BEGIN是一个特殊的pattern,它在awk处理输入之前就会执行,可以认为是一个初始化语句,与此对应的还有END。 好像还没介绍如何指定处理的文件,是不是最后的argument就是指定的文件?...Awk将一个文本文件视为一个文本数据库,因此它也有记录和字段的概念。默认情况下,记录的分隔符是回车,字段的分隔符是空白符,所以文本文件的每一行表示一个记录,而每一行中的内容被空白分隔成多个字段。...内置变量NF记录着字段的个数,所以$NF表示最后一个字段: 当然,$(NF-1)表示倒数第二个。...n可以为一个变量,例如$NF代码最后一个字段,而$(NF-1)表示倒数第二个字段。 数组 数组是一种特殊的变量,在awk中,比较特殊地是,数组的下标可以为数字或者字符串。

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linux AWK学习

awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。  ...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。...     /bin/sh sys     /bin/sh   如果只是显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有行添加列名name,shell,在最后一行添加...接着开始读入第二条记录······直到所有的记录都读完,最后执行END操作。

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linux awk命令详解

awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。.../bin/sh sys /bin/sh 如果只是显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有行添加列名name,shell,在最后一行添加...接着开始读入第二条记录······直到所有的记录都读完,最后执行END操作。

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Linux--awk命令

linux 系统日常处理工作中,发挥很重要的作用,掌握了 awk将会使你的工作变的高大上。 awk 是三剑客的老大,利剑出鞘,必会不同凡响。...awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。 三:awk 的原理 通过一个简短的命令,我们来了解其工作原理。...现在,解释 awk 做了些什么。调用 awk时,我们指定/etc/passwd 作为输入文件。执行 awk 时,它依次对/etc/passwd 中的每一行执行 print 命令。...再次说明, awk 对输入文件中的每一行都执行这个脚本。 ?

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linux awk命令详解

今天说一说linux awk命令详解,希望能够帮助大家进步!!! 简介 awk是一个强大的文本分析工具,相对于grep的查找,sed的编辑,awk在其对数据分析并生成报告时,显得尤为强大。...awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。.../bin/sh sys /bin/sh 如果只是显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有行添加列名name,shell,在最后一行添加

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Linux-awk数组

闲话: Linux 从来没有系统的学过,AWK 这个高端的东西更没有系统全面的学过,知道真正项目中遇到的时候才会想着系统的学习一下,今天先写一下AWK的数组使用,网上有很多这样的文章,但是很多地方都没有讲的很细...) 先简单说明一下awk吧 1....官方解释AWK awk :适用程序,一种unix工具 就是一个强大的文本分析工具,相对于grep查找、sed的编辑,awk在对数据分析并生成报告的时候,显得尤为强大。...翻译为代码就是 (b[1″ “2” “3]==1){++c[1” “ 再看一下:处理方法就是: 依次加载一行(for 循环/awk) 如果以1″ “2为关键字的。...url为关键字的访问IP肯定要+1 ,但是如果不是第一次出现,什么都不需要做 {b[1″ “2” “3]++}(b[1” “2” “3]==1){++c[1” “2]} 现在再看是不是就好理解了,最后结果为

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linux awk命令详解

awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息,awk抽取信息后,才能进行其他文本操作。完整的awk脚本通常用来格式化文本文件中的信息。 通常,awk是以文件的一行为处理单位的。...awk每接收文件的一行,然后执行相应的命令,来处理文本。...在awk中,文件的每一行中,由域分隔符分开的每一项称为一个域。通常,在不指名-F域分隔符的情况下,默认的域分隔符是空格。.../bin/sh sys /bin/sh 如果只是显示/etc/passwd的账户和账户对应的shell,而账户与shell之间以逗号分割,而且在所有行添加列名name,shell,在最后一行添加...接着开始读入第二条记录······直到所有的记录都读完,最后执行END操作。

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linux awk指令详解

awk的指令格式通常是这样的: [root@linux ~]# awk '条件类型 1{动作 1} 条件类型 2{动作 2} ...' filename 其中条件类型可有可无,比如像最上面这个例子,只存在指令不存在条件...awk指令执行的顺序是下面这样的: 1. 读入第一行,将第一行存放在$0中,将第一列,第二列等分别存放在,$1, $2…. 等变数当中; 2....awk中一些内建变量 变量名称 代表含义 NF 每一行 ($0) 拥有的字段总数 NR 目前 awk 所处理的是『第几行』数据 FS 目前的分隔字符,预设是空格键 例1:获取目前所处理的行数和该行的字段数量...]值做++操作,所以最后得到的number是以课程名称为index,课程的选课人数为value的数组。...这些都是awk的高级特性,详细可以参考http://linux.vbird.org/linux_basic/0330regularex/awk.pdf

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