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使用FreeSurfer进行脑区分割

FreeSurfer 是美国哈佛-麻省理工卫生科学与技术部和马萨诸塞州总医院共同开发的一款磁共振数据处理软件包,是基于 Linux 平台的全免费开源软件。FreeSurfer 能完成对高分辨率的 MRI 图像进行分割、配准及三维重建,其处理过程主要包含去头骨、B1 偏差场校正、体数据配准、灰白质分割、面数据配准等。FreeSurfer 可以方便地处理大脑 MRI 图像,并生成高精度的灰、白质分割面和灰质、脑脊液分割面,根据这两个表面可以计算任何位置的皮质厚度及其他面数据特征如皮质 外表面积、曲率、灰质体积等,这些参数可以映射到通过白质膨胀算法得到的大脑皮质表面上直观显示。另外,FreeSurfer 还具有特征的组间差异分析及结果的可视化功能。

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