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python比较两个文件差异

使用python脚本比较两个文件差异内容并输出到html文档中,可以通过浏览器打开查看。...fromlines和tolines,用于比较的内容,格式为字符串组成的列表 fromdesc和todesc,可选参数,对应的fromlines,tolines的差异文件的标题,默认为空字符串 context...为false时,控制不同差异的高亮之间移动时“next”的开始位置 3.使用argparse传入两个需要对比的文件 """ import difflib import argparse import sys...        return text     except IOError as e:         print("Read file Error:", e)         sys.exit() # 比较两个文件并输出到...    parser = argparse.ArgumentParser(description="传入两个文件参数")     parser.add_argument('-f1', action='

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Vmdiff比较文件差异入门

,比如Eclipse, Rational ClearCase都提供了内建的功能来支持文件比较和合并; 当远程工作在Unix/Linux平台上的时候,恐怕最简单而且到处存在的就是命令行工具,比如diff...+w #光标左右切换两个文件之间来回跳转 :set noscrollbind # 如果不想要这个特性,可以设置 #使用快捷键在各个差异点之间快速移动。...Ctrl - w - L(把当前窗口移到最右边) 文件合并 文件比较的最终目的之一就是合并,以消除差异。...,之所以不用dg,是因为dg已经被另一个命令占用了) #在修改一个或两个文件之后,vimdiff会试图自动来重新比较文件,来实时反映比较结果。...之所以用z这个字母,是因为它看上去比较像折叠着的纸:) zo (folding open) #重新折叠起来 zc (folding close) 基础示例 描述:两个文件中都存在但是包含差异的行显示为粉色背景

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Vmdiff比较文件差异入门

,比如Eclipse, Rational ClearCase都提供了内建的功能来支持文件比较和合并; 当远程工作在Unix/Linux平台上的时候,恐怕最简单而且到处存在的就是命令行工具,比如diff...+w #光标左右切换两个文件之间来回跳转 :set noscrollbind # 如果不想要这个特性,可以设置 #使用快捷键在各个差异点之间快速移动。...Ctrl - w - L(把当前窗口移到最右边) 文件合并 文件比较的最终目的之一就是合并,以消除差异。...,之所以不用dg,是因为dg已经被另一个命令占用了) #在修改一个或两个文件之后,vimdiff会试图自动来重新比较文件,来实时反映比较结果。...之所以用z这个字母,是因为它看上去比较像折叠着的纸:) zo (folding open) #重新折叠起来 zc (folding close) 基础示例 描述:两个文件中都存在但是包含差异的行显示为粉色背景

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python比较两个excel表格的差异

一个同事有两个excel表格要比较差异, 找了一下有相关软件,如: beyond compare, excel compare 但这两个似乎都是直接排序再比较的....这个脚本先读入要比较文件中的表. 读的时候 ,如果没有空行就把它和它前面的加一起,直到有空行. 这样比较的话, 不能得到具体那一行有差异, 只有一个大概的位置. 如果表格中间空行越少,越精确....):   f = open(filename, 'w')   f.write(excel_diff)   f.close() def diff_content(table1,table2): #检查两个差异...    else:       diff_tmp.append(i)   return list(set(diff_tmp))   def get_rows(diff, all_data): #获取差异位置...strip() == i.strip():         tmp.append(j)         break   return tmp         for i in range(0,2):  # 比较几个表

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linux 文件比较

Creating new file" date > $HOME/testing fi else echo "sorry .you do not have a home directory" fi 第一个检查用-e比较来判断用户是否有...如过有,下一个-e比较会检查并判断testing文件是否存在与$home目录中。如果不存在,shell脚本会用单个大于号(输出重定向符号)来用date命令的输出创建一个新文件。...第二次运行这个shell脚本时,他会使用双大于号,这样他就能将date的输出追加到已经存在的文件后面。 '>'表示如果文件不存在 则创建文件,如果文件存在 则清空文件并输出。'...>>'表示 如果文件存在 则追加输出到文件后。 检查文件 -e比较适用于文件和目录。要确定指定的对象是个文件,必须用-f比较: #!...-r比较判断出我没有这个文件的读权限,所以test 命令失败了,而且bash shell 执行了if-then语句的else部分。 检查空文件 #!

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比较两个vcf文件的多种实现方法

有粉丝邮件求助,给了我两个vcf文件,旧的vcf文件走的是标准的bwa+gatk流程,参考基因组是hg19,新的文件参考基因组是hg38,也是gatk标准流程。...想有比较它们,首先得保证两个vcf文件的参考基因组一致,因为版本不一致,所以需要使用CrossMap等软件进行参考基因组版本转换,然后里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令比较它们...突变位点区域分类百分比 可以看到,两个vcf文件的变异位点在intron和exon区域的比例差异是最大的,其实是因为它们两个区域本来就长度很大。 另外一个统计指标 ?...image-20200711195600818 最后看专业的软件进行两个vcf文件比较 这里使用 SnpSift 软件的 Concordance 命令,代码如下: java -Xmx1g -jar...但是可以继续细致的探索 comp.results.txt 文件,拆分染色体后,继续统计上面提到的6种情况发生的频次。那就出一个学徒作业吧,比较两个vcf文件,然后区分染色体绘制韦恩图。

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linux命令讲解大全】058.comm命令:比较和分析已排序文件的行差异

comm 按行比较两个已排序的文件。 概要 comm [OPTION]... FILE1 FILE2 主要用途 按行比较两个已排序的文件。当FILE1或FILE2为-时,读取标准输入。...bbb ccc ddd eee 111 222 文本 bbb.txt 内容: [root@localhost text]# cat bbb.txt bbb ccc aaa hhh ttt jjj 比较结果...比较排序过的文档 先通过 sort 将文件内容排序: [root@localhost ~]# sort aaa.txt > aaa1.txt [root@localhost ~]# sort bbb.txt...> bbb1.txt 比较结果: [root@localhost ~]# comm aaa1.txt bbb1.txt 111 222 aaa bbb ccc ddd eee hhh...jjj ttt 交集 打印两个文件的交集,需要删除第一列和第二列: [root@localhost text]# comm aaa.txt bbb.txt -1 -2 bbb ccc 差集 通过删除不需要的列

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