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linux环境下的软件安装

_64.sh 在linux环境下复制粘贴点击右键,不动键盘安装的详细过程linux安装脚本运行的代码:bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh然后开始安装过程,中间会出现很多的版权信息...每一个项目都需要不同的软件,另外软件之间的结合也是需要版本要求的,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件的V 1.5版本,就可以按照项目定制不同的分身,安装不同的软件,互不干扰...查看当前的conda有哪些环境conda info --envs前面有*的就是当前激活的环境实操代码(base) bio10@ecm-cefa:~/biosoft$ conda info --envs#...-n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y创建完之后,再次查看一下我conda环境,看是否多了一个rna-seqconda info --envs此时默认的环境还是...conda activate rna-seq这时默认的*就会转移到rna-seq前面;另外在用户名root前面出现(rna-seq) 输入fastqc,如果出现下面的一大片信息就说明可以使用了(了解一下:

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linux环境下的时间编程

Linux下提供了丰富的api以供开发者们处理和时间相关的问题。然而这些接口看似各自为政实则有有着千丝万缕的联系,在学习和时间中引发了各种各样的混乱。...在程序看来时间的定义是灵活多变的,不同的定义下时间的计算是不同的,因此有必要仔细区分。...对于Linux世界来说这个时间的起点是1970年1月1日0时(UTC),又被叫做Epoch,Linux上以此为起点的均为UTC时间。...同时c11和c++17标准还将其纳入了标准库,因此它现在不再只是posix标准下的了。...在不引入第三方库和自己手动计算的情况下,Linux处理时区的手段只有以下两种: 函数自己定义参数和返回值使用local time还是UTC time; 系统根据环境变量TZ以及配置文件/etc/localtime

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    C语言文件编程-Linux环境下运行

    文件编程函数介绍 如果在Linux系统下学习C语言,就会了解到两套文件编程接口函数: C语言标准的文件编程函数: fopen、fread、fwrite、fclose Linux下提供的文件编程函数: open...C语言标准库提供的文件编程函数 下面介绍C语言标准库提供的文件编程函数,一般对文件常用的操作就是:创建(打开)、读、写、关闭。...Linux下的系统函数: 文件编程函数 Linux下也有一套系统函数,用于文件操作,这些函数在Linux下常用于读写设备文件;当然,读写普通文件也是一样,普通文件也是磁盘上的数据,也是操作块设备驱动。...如果是在windows下IED软件里运行,可以将传参代码屏蔽掉,改成让用户输入,或者直接把参数固定也可以。

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    DAY3-linux环境下的软件安装

    linux内的“应用商店”----conda 精华版conda----miniconda的下载和安装 miniconda的下载 进入miniconda 清华 查看服务器是多少位的:输入命令 uname...-a 安装最新版本(latest) 右键-复制下载链接 进入cd ~/biosoft(我的软件下载区) wget 复制的下载链接 (一共以上六步完成下载) miniconda的安装和激活 bash...Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh  #输入这个开始下载,有要选择的地方输入yes #完成安装后,还需要激活 source ~/.bashrc #来激活conda conda...conda install fastqc -y #安装软件 fastqc为软件名 conda install fastqc=0.11.7 -y # 0.11.7为版本号 如要安装fastqc...0.11.7版本的软件则需要特殊标明 fastqc --help #确认是否安装成功,如果出现帮助文档则为成功 conda remove fastqc -y #卸载软件

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    DAY3-Linux环境下的软件安装

    conda介绍Conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,主要用于Python程序,但也可以用于其他编程语言。它能够跨平台运行,支持多种操作系统,如Linux、OS X和Windows。...Conda主要用于安装和管理软件包及其依赖关系,可以在不同环境中轻松切换,使得软件包的安装和管理更加方便。...(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ conda install fastqc -y #install,在当前环境下安装某个程序包,-y是yes,安装过程中conda问题全部回答...yes(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ fastqc --help #--help检查软件是否安装成功2.conda 环境(base) bio07@ecm-cefa...#创建新的环境ran-seq,并在该环境下下载Python,fastqc,trimmomatic软件(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ conda info --envs

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    Day3-linux环境下的软件安装

    程序包至服务器首先,查看服务器位数,选择合适的版本uname -a进入链接,https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ ,选择安装在linux...,还需要安装,开始安装,输入命令bash 安装包.sh即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shpress ENTER即ENTER,yes即yes,几顿操作完成之后,...-yconda环境:就是进行不同项目(转录组,基因组组装等等)分析的时候,需要不同的软件和同一软件的不同版本,需要进行conda环境分开互不干扰。...是-name,新建名叫rna-seq的环境,指定python版本为3,并且安装软件fastqc、trimmomatic。...退出当前环境,conda deactivateTips:xx.sh,后缀为软件程序的脚本,相当于安装软件的压缩包linux下,左键复制,右键粘贴

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    远远day3-linux环境下的软件安装

    、输入指令【bash+软件名】开始安装2、激活conda,指令【source ~/.bashrc】三、使用conda1、查看当前服务器上安装的所有软件列表【指令: conda list】2、安装软件 【...-y】四、查看当前conda有哪些环境生信实战中,需要分析转录组、基因组组装、重测序等多个项目。...每一个项目都需要不同的软件,另外软件之间的结合也是需要版本要求的,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件的V 1.5版本,按照项目,定制不同的分身,安装不同的软件,互不干扰...1、查看当前conda环境【指令:conda info --envs】2、建立conda环境例一个名叫rnaseq的conda环境【指令:conda create -n rna-seq python=3...4、激活新的conda环境【conda activate rna-seq】这时默认的*就会转移到rna-seq前面5、退出当前环境【指令:conda deactivate】

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    Day3 Linux环境下的软件安装--hola

    复制下载链接在终端 biosoft文件夹下wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86..._64.sh下载sh脚本文件通过bash命令运行sh文件bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh最后source ~/.bashrc激活conda,进一步在base...环境下输入conda,出现满屏的信息说明成功了设置镜像所谓镜像网站,相当于主网站的副本,conda在国外,我们在国内下载软件速度会很慢,因此配置镜像,从镜像网站下载,可以加快下载速度把下面的代码全部复制到命令行...conda list安装软件 conda install fastqc -y【-y是yes,安装过程中conda问你的问题全部回答yes,不加yes需要手动键入确认安装】,键入fastqc --help...查看是否安装成功,即出现大片帮助文档查看环境 conda info --envs (前面带*的就是当前激活的)激活环境conda activate 环境名关闭环境 conda deactivate 环境名

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    day3-linux环境下的软件安装-土

    linux环境下的软件安装软件管理Miniconda搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)登录服务器,查看服务器是多少位:uname -a图片在镜像网站中找到对应软件最新版本(last...)edge出错,chrome能正常查找,也可能是我电脑或软件版本问题wget命令wget 复制的链接 下载图片安装minicondabash Miniconda3-latest-Linux-x86_64...fastqc --help,查看帮助文档,若出现一大片文字,则安装成功图片卸载软件conda remove fastqc -y图片conda环境生信星球::生信实战中,需要分析转录组、基因组组装、重测序等多个项目...查看当前conda有哪些环境图片建立新环境例如:conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y比如我们要处理转录组数据了,好,先建立一个名叫...rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic(这两个可以一步完成)(这里指定python版本是因为有的软件是基于python开发的,不是要你学

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    Linux C编程之一:Linux下c语言的开发环境

    今天开始根据Linux C编程相关视频的学习所做的笔记,希望能一直坚持下去。。。...1、开发环境的构成 编辑器:VI; 编译器:选择GNU C/C++编译器gcc; 调试器:应用广泛的gdb; 函数库:glibc ; 系统头文件:glibc_header; 2、在安装Linux时需要注意事项...3、IDE(集成开发环境:集编辑、编译、调试等功能于一身的工具) Kylix:号称Linux下的dephi; Kdevelop RHIDE:类似与Turbo C++ 4、编译器:gcc(GNU CCompiler...假如用户在安装过程中少装了这些包,就无法编译c源程序,这时候可以通过rpm包来迅速安装Linux的C开发语言环境的。...7、Linux下C程序开发过程: (1)使用vi工具编辑写源程序; (2)保存为*.c; (3)使用gcc编译成二进制可执行文件; (4).

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    Linux C编程之一:Linux下c语言的开发环境

    ---恢复内容开始--- 今天开始根据Linux C编程相关视频的学习所做的笔记,希望能一直坚持下去。。。...; 2、在安装Linux时需要注意事项   在安装时选上“程序开发”中的“开发工具”,就可以自动安装gcc/gdb;   若想开发图形界面,还需要选上GNOME/KDE软件开发。...3、IDE(集成开发环境:集编辑、编译、调试等功能于一身的工具)   Kylix:号称Linux下的dephi;   Kdevelop   RHIDE:类似与Turbo C++ 4、编译器:gcc...假如用户在安装过程中少装了这些包,就无法编译c源程序,这时候可以通过rpm包来迅速安装Linux的C开发语言环境的。...7、Linux下C程序开发过程:   (1)使用vi工具编辑写源程序;   (2)保存为*.c;   (3)使用gcc编译成二进制可执行文件;   (4).

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