_64.sh 在linux环境下复制粘贴点击右键,不动键盘安装的详细过程linux安装脚本运行的代码:bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh然后开始安装过程,中间会出现很多的版权信息...每一个项目都需要不同的软件,另外软件之间的结合也是需要版本要求的,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件的V 1.5版本,就可以按照项目定制不同的分身,安装不同的软件,互不干扰...查看当前的conda有哪些环境conda info --envs前面有*的就是当前激活的环境实操代码(base) bio10@ecm-cefa:~/biosoft$ conda info --envs#...-n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y创建完之后,再次查看一下我conda环境,看是否多了一个rna-seqconda info --envs此时默认的环境还是...conda activate rna-seq这时默认的*就会转移到rna-seq前面;另外在用户名root前面出现(rna-seq) 输入fastqc,如果出现下面的一大片信息就说明可以使用了(了解一下:
Linux下提供了丰富的api以供开发者们处理和时间相关的问题。然而这些接口看似各自为政实则有有着千丝万缕的联系,在学习和时间中引发了各种各样的混乱。...在程序看来时间的定义是灵活多变的,不同的定义下时间的计算是不同的,因此有必要仔细区分。...对于Linux世界来说这个时间的起点是1970年1月1日0时(UTC),又被叫做Epoch,Linux上以此为起点的均为UTC时间。...同时c11和c++17标准还将其纳入了标准库,因此它现在不再只是posix标准下的了。...在不引入第三方库和自己手动计算的情况下,Linux处理时区的手段只有以下两种: 函数自己定义参数和返回值使用local time还是UTC time; 系统根据环境变量TZ以及配置文件/etc/localtime
文件编程函数介绍 如果在Linux系统下学习C语言,就会了解到两套文件编程接口函数: C语言标准的文件编程函数: fopen、fread、fwrite、fclose Linux下提供的文件编程函数: open...C语言标准库提供的文件编程函数 下面介绍C语言标准库提供的文件编程函数,一般对文件常用的操作就是:创建(打开)、读、写、关闭。...Linux下的系统函数: 文件编程函数 Linux下也有一套系统函数,用于文件操作,这些函数在Linux下常用于读写设备文件;当然,读写普通文件也是一样,普通文件也是磁盘上的数据,也是操作块设备驱动。...如果是在windows下IED软件里运行,可以将传参代码屏蔽掉,改成让用户输入,或者直接把参数固定也可以。
安装miniconda1.进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/2.选择Miniconda3-latest-Linux-x86..._64.sh5.运行bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,开始安装6.激活condasource ~/.bashrc7.命令行输入conda,出现conda介绍信息...1.查看所有软件列表conda list2.安装软件conda install 软件名称 -y,如conda install fastqc -y 指定软件版本号:conda install fastqc...=0.11.7 -y3.输入fastqc --help,出现软件帮助文档,即安装成功创建不同环境1.查看当前环境conda info --envs (*表示当前激活的环境)(base) bio04@...,指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomaticconda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y 3.激活新的环境
#安装说明:Nginx 安装前需要提前安装相关命令和工具包: make 命令、gcc g++、pcre、zlib、openssl 1、安装 gcc g++ #ubuntu 环境下安装 apt-get install...build-essential apt-get install libtool #centos 环境下安装 安装 make: yum -y install gcc automake autoconf
linux内的“应用商店”----conda 精华版conda----miniconda的下载和安装 miniconda的下载 进入miniconda 清华 查看服务器是多少位的:输入命令 uname...-a 安装最新版本(latest) 右键-复制下载链接 进入cd ~/biosoft(我的软件下载区) wget 复制的下载链接 (一共以上六步完成下载) miniconda的安装和激活 bash...Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #输入这个开始下载,有要选择的地方输入yes #完成安装后,还需要激活 source ~/.bashrc #来激活conda conda...conda install fastqc -y #安装软件 fastqc为软件名 conda install fastqc=0.11.7 -y # 0.11.7为版本号 如要安装fastqc...0.11.7版本的软件则需要特殊标明 fastqc --help #确认是否安装成功,如果出现帮助文档则为成功 conda remove fastqc -y #卸载软件
conda介绍Conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,主要用于Python程序,但也可以用于其他编程语言。它能够跨平台运行,支持多种操作系统,如Linux、OS X和Windows。...Conda主要用于安装和管理软件包及其依赖关系,可以在不同环境中轻松切换,使得软件包的安装和管理更加方便。...(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ conda install fastqc -y #install,在当前环境下安装某个程序包,-y是yes,安装过程中conda问题全部回答...yes(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ fastqc --help #--help检查软件是否安装成功2.conda 环境(base) bio07@ecm-cefa...#创建新的环境ran-seq,并在该环境下下载Python,fastqc,trimmomatic软件(base) bio07@ecm-cefa:~/biosoft$ conda info --envs
Miniconda安装 将miniconda安装到biosoft文件夹 ls cd biosoft 搜索引擎搜索“miniconda清华” 进入miniconda清华镜像 找到最新版64位Linux版本...miniconda,复制下载链接 运行 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86..._64.sh 运行bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,期间停顿yes,进入协议点击q退出。...不同生信项目下的Conda分身 Conda环境 在生信实战中,每个项目可能需要不同的软件,甚至同一软件要求不同的版本。...,后自动进入环境 conda activate rna-seq#激活环境 fastqc#可查看该环境fastqc软件的帮助文档 conda deactivate#退出该环境 内容参考微信公众号 生信星球
程序包至服务器首先,查看服务器位数,选择合适的版本uname -a进入链接,https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/ ,选择安装在linux...,还需要安装,开始安装,输入命令bash 安装包.sh即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shpress ENTER即ENTER,yes即yes,几顿操作完成之后,...-yconda环境:就是进行不同项目(转录组,基因组组装等等)分析的时候,需要不同的软件和同一软件的不同版本,需要进行conda环境分开互不干扰。...是-name,新建名叫rna-seq的环境,指定python版本为3,并且安装软件fastqc、trimmomatic。...退出当前环境,conda deactivateTips:xx.sh,后缀为软件程序的脚本,相当于安装软件的压缩包linux下,左键复制,右键粘贴
wget命令,wget + 刚才复制的链接wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86..._64.sh安装miniconda运行:bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 生信星球安装成功标志:生信星球最后还需要激活,source ~/.bashrc来激活.../mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes使用conda查看当前服务器上安装的所有软件列表...conda list安装软件fastqcconda install fastqc -y确认astqc软件是否安装成功fastqc --help出现一大片文字,是软件的帮助文档,确定安装成功
出处:http://blog.csdn.net/lijun538/article/details/52549159 使用过哪些进程间通讯机制,并详细说明 主要介绍一下Linux下面的几种进程通讯方式。...SIGRTMAX-4 61) SIGRTMAX-3 62) SIGRTMAX-2 63) SIGRTMAX-1 64) SIGRTMAX 5.套接字:socket,上面介绍的通讯手段限制了作用域,套接字编程应用则更为广泛...《unix网络编程卷一》对socket编程有详细的介绍。...默认情况下, 有N*1MB的栈预留空间, 和小于这个数字的实际使用. 堆和Heap管理有关, 默认存在系统堆和CRT堆....而线程的栈空间大小在linux下可以使用ulimit -s查询,我的环境下默认是8192字节。windows下一说默认1M,一说2M。
anaconda/miniconda/中找到最新的 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86...biosoft先进入biosoft文件夹wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86..._64.sh下载Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.shbash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh看到“Thank you for...//mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes配置镜像conda list查看所有的软件...conda install fastqc -y 安装软件fastqc --help ###帮助文档参考生信星球学习小组第169期 (umu.cn)
、输入指令【bash+软件名】开始安装2、激活conda,指令【source ~/.bashrc】三、使用conda1、查看当前服务器上安装的所有软件列表【指令: conda list】2、安装软件 【...-y】四、查看当前conda有哪些环境生信实战中,需要分析转录组、基因组组装、重测序等多个项目。...每一个项目都需要不同的软件,另外软件之间的结合也是需要版本要求的,比如A项目你需要用a软件V 1.0版本,但是处理B项目又需要用到a软件的V 1.5版本,按照项目,定制不同的分身,安装不同的软件,互不干扰...1、查看当前conda环境【指令:conda info --envs】2、建立conda环境例一个名叫rnaseq的conda环境【指令:conda create -n rna-seq python=3...4、激活新的conda环境【conda activate rna-seq】这时默认的*就会转移到rna-seq前面5、退出当前环境【指令:conda deactivate】
linux环境下的软件安装1、conda是什么?...清华”,进入进入上图的网址:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/直接ctrl+F,输入latest,找到以下最新版本,安装linux...,右键点一下是粘贴3、安装和配置miniconda运行 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 按指示一步步来,遇到yes/no就输入yes,然后按回车激活source...conda list如下图所示安装软件conda install fastqc -yps:我觉得这个安装需要一点点时间,不是一下子就好了,当它停止于下图红色框框那行字时,不必管它检验fastqc软件是否安装成功输入...fastqc --help如果出现一大片文字,这是软件的帮助文档。
复制下载链接在终端 biosoft文件夹下wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86..._64.sh下载sh脚本文件通过bash命令运行sh文件bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh最后source ~/.bashrc激活conda,进一步在base...环境下输入conda,出现满屏的信息说明成功了设置镜像所谓镜像网站,相当于主网站的副本,conda在国外,我们在国内下载软件速度会很慢,因此配置镜像,从镜像网站下载,可以加快下载速度把下面的代码全部复制到命令行...conda list安装软件 conda install fastqc -y【-y是yes,安装过程中conda问你的问题全部回答yes,不加yes需要手动键入确认安装】,键入fastqc --help...查看是否安装成功,即出现大片帮助文档查看环境 conda info --envs (前面带*的就是当前激活的)激活环境conda activate 环境名关闭环境 conda deactivate 环境名
linux环境下的软件安装软件管理Miniconda搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)登录服务器,查看服务器是多少位:uname -a图片在镜像网站中找到对应软件最新版本(last...)edge出错,chrome能正常查找,也可能是我电脑或软件版本问题wget命令wget 复制的链接 下载图片安装minicondabash Miniconda3-latest-Linux-x86_64...fastqc --help,查看帮助文档,若出现一大片文字,则安装成功图片卸载软件conda remove fastqc -y图片conda环境生信星球::生信实战中,需要分析转录组、基因组组装、重测序等多个项目...查看当前conda有哪些环境图片建立新环境例如:conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y比如我们要处理转录组数据了,好,先建立一个名叫...rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic(这两个可以一步完成)(这里指定python版本是因为有的软件是基于python开发的,不是要你学
本文主要是介绍在Linux平台下的Eclipse下编写shell脚本所需要的配置,主要的步骤如下: 1、下载并配置好Eclipse。...安装完成; 3、下载并安装ShellEd组件 地址:http://sourceforge.net/projects/shelled/files/shelled/ 将组件解压后,放入Eclipse安装路径下/...-> Install New Software来进行安装 ---------------------------------------------以下便可以开始在eclipse进行shell脚本的编程了...----------------------------------------- 1、新建一个Shell工程 File----》new----》other 这时你会看到一下界面: image.png
–zxvf mysql-5.6.34-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz 2、拷贝到相应目录 cp -R /usr/local/src/ mysql-5.6.34-linux-glibc2.5...1)创建 mysql 用户 useradd mysql 2)mysql 目录改为 mysql 读写权限 chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql --如果没有目录就建立一下...mysql_install_db --user=mysql --basedir=/usr/local/mysql --datadir=/usr/local/mysql/data 6、准备 mysql 启动环境...在 mysql 文件下的 my.cnf 里[mysqld]下加入时区:default-time-zone = '+8:00' 将 mysql 加入到可控制启动服务的文件夹内 cd /usr/local...vi /etc/profile export MYSQL_HOME="/usr/local/mysql" export PATH=" 环境变量生效 source /etc/profile 启动数据库
今天开始根据Linux C编程相关视频的学习所做的笔记,希望能一直坚持下去。。。...1、开发环境的构成 编辑器:VI; 编译器:选择GNU C/C++编译器gcc; 调试器:应用广泛的gdb; 函数库:glibc ; 系统头文件:glibc_header; 2、在安装Linux时需要注意事项...3、IDE(集成开发环境:集编辑、编译、调试等功能于一身的工具) Kylix:号称Linux下的dephi; Kdevelop RHIDE:类似与Turbo C++ 4、编译器:gcc(GNU CCompiler...假如用户在安装过程中少装了这些包,就无法编译c源程序,这时候可以通过rpm包来迅速安装Linux的C开发语言环境的。...7、Linux下C程序开发过程: (1)使用vi工具编辑写源程序; (2)保存为*.c; (3)使用gcc编译成二进制可执行文件; (4).
---恢复内容开始--- 今天开始根据Linux C编程相关视频的学习所做的笔记,希望能一直坚持下去。。。...; 2、在安装Linux时需要注意事项 在安装时选上“程序开发”中的“开发工具”,就可以自动安装gcc/gdb; 若想开发图形界面,还需要选上GNOME/KDE软件开发。...3、IDE(集成开发环境:集编辑、编译、调试等功能于一身的工具) Kylix:号称Linux下的dephi; Kdevelop RHIDE:类似与Turbo C++ 4、编译器:gcc...假如用户在安装过程中少装了这些包,就无法编译c源程序,这时候可以通过rpm包来迅速安装Linux的C开发语言环境的。...7、Linux下C程序开发过程: (1)使用vi工具编辑写源程序; (2)保存为*.c; (3)使用gcc编译成二进制可执行文件; (4).
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