第一个“#”表示是这一行是注释 第二个“!”表示这一行不是普通注释，而是解释器路径的声明行 后面的“/usr/bin/perl”是perl解释器的安装路径，也有可能是：“/usr/local/bin/perl”，如果那个不行，就换这个 use strict是严格检查语法
在 Linux 中，你可以使用多种命令来统计文件的行数。以下是其中一些常用的命令：
Linux命令中的rename命令主要用于给文件重命名，与mv命令有些类似，但rename可以对批量文件进行重命名，而mv命令则只能对单个文件重命名，下面就给大家详细介绍下Linux rename命令的使用方法吧。
linux的发行版非常多，其实本质上差别不大，哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用，当然ubuntu本身也有版本的区别，目前是16，我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端，建立目录： Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言，运行在超过 100 种计算机平台上，适用广泛，从大型机到便携设备，从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域，Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发，系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux（主要是 CentOS）、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
Generate a strong password in Linux using pwgen
相信大家对于正则表达式都不陌生，在文本处理中或多或少的都会使用到它。但是，我们在使用linux下的文本处理工具如awk、sed等时，正则表达式的语法貌似还不一样，在awk中能正常工作的正则，在sed中总是不起作用，这是为什么呢？
Perl5是一种全功能的编程语言。它用于所有类型的生产项目，包括世界各地的商业业务系统。Perlbrew是Perl5的安装和版本切换工具，您可以安装，删除，并在之间切换Perl版本。
在某些情况下，你可能想要将一个服务器上的软件包列表安装到另一个服务器上。例如，你已经在服务器 A 上安装了 15 个软件包并且这些软件包也需要被安装到服务器 B、服务器 C 上等等。
当需要一次执行多个命令的时候，可以同时输入，不同命令之间可以使用分号“；”隔开，示例如下：
CentOS 8操作附带一个定制内核，以确保其完整性和与支持的硬件的兼容性。CentOS 8 Linux中附带的内核版本为4.18。Linux内核包括基本内核本身和许多内核模块。
关于Th3inspector Th3inspector是一款功能强大的网络侦查信息收集工具，该工具整合了多种信息收集组件，可以帮助广大研究人员在网络侦查活动中完成各种信息收集任务。 值得一提的是，该工具支持在Linux和Windows，甚至是Android操作系统平台上运行。 工具安装 Linux安装 广大研究人员可以使用下列命令将该项目源码克隆至本地： git clone https://github.com/Moham3dRiahi/Th3inspector.git（向右滑动，查看更多）
周末宅在家里，捣鼓了一天，在本地用虚拟机搭建了 4 个 Linux 的集群环境，机器之间实现了相互访问。从此以后我的本地就有一套集群环境了，真正意义上可以模拟分布式的环境了！后面还可以模拟大型电商项目的高并发场景，美滋滋！
centos7不支持mysql，内部集成了mariadb， 而安装mysql的话会和mariadb文件冲突，所以需要先卸载mariadb， 以下为卸载mariadb，安装mysql的步骤
大多数人可能在系统磁盘存储不足的情况下执行释放空间这个操作，也可能在 Linux 系统磁盘存储满了的情况下执行这个操作。
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题，因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的，尤其是分量很重的VEP，所以即使你再如何如何的讨厌perl，也不得不与之打交道。 这种细节问题问我，我当然无法直接给出答案咯。毕竟，我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客，才意识到，我竟然已经写了7篇教程，关于perl的模块。目录如下： ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
这里上传文件会直接进行展示，到这里就没了= = 只能看看师傅们的wp 师傅们猜测这里后台perl上传代码使用了param(）函数
ed命令是文本编辑器，用于文本编辑，ed是Linux中功能最简单的文本编辑程序，一次仅能编辑一行而非全屏幕方式的操作。ed命令并不是一个常用的命令，一般使用比较多的是vi指令，但ed文本编辑器对于编辑大文件或对于在shell脚本程序中进行文本编辑很有用。如果使用文件名参数调用ed，则文件的副本将被读入编辑器的缓冲区，对该副本进行更改，而不是直接对文件本身进行更改。退出ed后，任何未使用w命令显式保存的更改都将丢失。编辑有两种不同的模式：命令和输入。第一次调用时，ed处于命令模式，在这种模式下，命令从标准输入中读取并执行以操作编辑器缓冲区的内容。
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样，用QQ、微信的客户端，都是通过命令行来进行聊天交流的，大概是为了提升逼格吧。
本文介绍使用XtraBackup工具，将云mysql数据库物理备份恢复到自建数据库
使用方法: gen_crc.pl 输入数据位宽 多项式 多项式输入方法： 从低位向高位依次输入，以USB TOKEN为例，x^5 + x^2 + 1，从低到高位输入为101001 usb token的crc生成方法： gen_crc.pl 8 101001 usb data的crc(x^16+x^15+x^2+1)生成方法： gen_crc.pl 8 10100000000000011
利用转录组数据比对到细胞器参考基因组得到vcf文件，比对工具使用GSNAP或者BWA，检测变异使用GATK或者SAMtools.
某日开发说，一台测试用虚机可以PING通SSH不能连了。运维同学就赶紧去查，SSHD_CONFIG配置文件都正确啊，一点错误都没有，那为什么呢？
静态模板是固定的 数据库中的数据全量喧嚷到模板中，下次请求来了直接返回，速度也很快；
ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器。它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎，基于RESTful web接口。Elasticsearch是用Java开发的，并作为Apache许可条款下的开放源码发布，是第二最流行的企业搜索引擎。设计用于云计算中，能够达到实时搜索，稳定，可靠，快速，安装使用方便。目前网络公开部署Elasticsearch大概有数万台服务器，内部网络部署就不计其数了。Elasticsearch用了两个危险性的脚本MVEL和Groovy。2014年5月MVEL爆出来命
vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0
最近一段时间在研究后台服务器测试技术，需要对后台服务器的各项性能指标进行实时监控和统计，也由此让我回运维
相信大家对于linux常用的命令一定都不陌生，但是一些简单，好玩，有趣，虽然可能没有实际作用的命令，你又有了解多少呢？话不多说，本期文章为大家带来15个好玩的linux命令，希望大家能够喜欢！
Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics) was used to identify centromeres
安装CentOS步骤略。其中注意：安装默认选择Minimal，可以选择Desktop，或者选择现在自定义，添加一些必要的组件，注意如果选择以后自定义，虚拟机可能因为缺少组件上不了网，虽然后期可设置，但对于菜鸟来说，想配置好有点麻烦，因此这里选择自定义，添加一些必要的组件。Perl是必选的，否则无法安装VMware Tools，system managerment tools，network tools必选的，否则无法上网，其他的看着选吧。 ----------------------------------
本文介绍了git在windows和linux下的安装方法，包括下载、编译和安装步骤，并提供了安装过程中可能出现的错误的解决方法。
Oracle 11g R2 Grid Infrastructure 的安装与配置较之前的版本提供了更多的灵活性。在Grid Infrastructure安装完毕前执行root.sh经常容易出现错误，并且需要修复该错误才能得以继续。在这个版本中我们可以直接通过执行脚本rootcrs.pl来重新配置Grid Infrastructure而无需先卸载Grid Infrastructure，然后修复故障后进行再次安装。下面描述了rootcrs.pl的用法以及使用deinstall彻底卸载Grid Infrastructure。
重命名文件和目录是你经常需要在Linux系统上执行的最基本任务之一。 重命名单个文件很简单，但一次重命名多个文件可能是一个挑战，特别是对于刚接触Linux的用户而言。你可以使用GUI文件管理器或命令行终端重命名文件。 在本教程中，我们将向你展示如何使用mv和rename命令重命名文件和目录。 使用mv命令重命名文件 mv命令（移动时间短）用于将文件从一个位置重命名或移动到另一个位置。mv命令的语法如下： mv [OPTIONS] source destination source可以是一个或多个文件或目录
git bash 是 Windows 用户安装 git 时默认安装的命令行工具,不仅界面漂亮功能也不错,大多数情况下可以替代 Windows 原生的 cmd 命令行.
CustomLog ” /var/log/httpd/access_log” combined
下载： http://mirrors.kernel.org/gnu/m4/m4-1.4.13.tar.gz 拷贝到centos系统上，并解压：
背景 最近正在拓展 MySQL 数据库知识 发现很多提及 "PerconaTookit" 管理工具的建议 会方便对数据库在线状态下的结构调整 在此，先进行安装一番 … 环境 MySQL版本： mysql 5.7.32 Linux 版本： CentOS7.9 PerconaTookit : 3.0.7 安装步骤 1). 安装第三方依赖包 首先需要安装几个第三方依赖包 yum install -y perl-DBI perl-DBD-MySQL perl-IO-Socket-SSL perl-
Linux中删除文件的命令及其示例用法 在 Linux 中删除文件，最常用的命令是 rm 命令。让我们看一些 rm 命令的例子。 [root@rumenz ~]# rm -f testfile -f在上面的命令中使用，将在不要求确认的情况下强行删除文件。 [root@rumenz ~]# rm -rf testdirectory 上述命令将删除名为 testdirectory 的目录 以及该目录中的所有内容（使用的-r选项是递归删除文件） [root@rumenz ~]# rmdir testdire
作者：kamly，腾讯 CDC 应用开发工程师 前言 正则表达式在我们日常的软件开发过程中被广泛使用，例如编写 Nginx 配置文件、在 Linux 与 macOS 下查找文件，然而不同软件不同操作系统对于正则的应用有着不一样的行为，主要原因是正则表达式演进过程中，出现 POSIX 与 PCRE 派系之分。 一、历史 先了解一下正则表达式的演进史。 20 世纪 40 年代，两位神经生理学家 Warren McCulloch 和 Walter Pitts，研究出了一种用数学方式来描述神经网络的方法，可
Cron Job是操作系统中基于时间的作业调度程序。它允许在指定的时间，日期，间隔等自动定期运行作业。例如：假设用户具有Shell或Perl脚本，该脚本计算UNIX / Linux中磁盘的人均磁盘空间使用情况。在UNIX / Linux中为此脚本以指定的频率（或时间）设置Cron Job将确保该脚本在计划的时间（或频率）下自动运行，而用户无需每次都手动运行它。
准备用3-5篇文章的篇幅，将一些必备的技能cover一遍，期望对于入职IC的新同学有一些帮助。这些东西，每一项其实在网络上的介绍资源都非常丰富，但是IC新同学常常面对的问题是，并不知道“原来这个事情是这么做的”。所以，长话短说。
这篇文章中，将会介绍如何利用 Metasploitable 2 上 Unreal IRCd service 存在的漏洞；学习如何对网络服务进行枚举，及如何定义和检索关键信息；分析和使用 msfvenom 来生成 payload 。 为了获取更多关于 Unreal IRCd 的信息，我们还将使用 hexchat IRC 客户端，连接进入到 IRC 频道。 例如：有时我们使用 Nmap 无法获取到具体的版本号时，我们仍可以继续通过当前处理的信息，进行近一步的漏洞评估和发现。在这篇文章中，我们同样将通过，手动
Linux带有一个非常强大的内置工具，称为rename.这rename命令用于重命名多个或一组文件,将文件重命名为小写，将文件重命名为大写以及使用 perl 表达式覆盖文件。 这 rename 命令是Perl脚本，它驻留在/usr/bin/在许多Linux发行版上。你可以运行which命令找出重命名命令的位置。 $ which rename /usr/bin/rename 重命名命令的基本语法 rename 's/old-name/new-name/' files 重命名命令带有几个可选参数以及强制性p
我们写完一个正则表达式后，并不知道是否与预期结果相符。比如：在 Nginx 中使用的正则表达式。这时我们一般会用 service nginx reload 命令来不断尝试，以判断其中的正则表达式是否符合预期，这样做显而易见效率极低。如果使用一些在线正则表达式测试工具，可能又会因为使用的正则表达式的库不同，存在差异。
MySQL目录概要 MySQL的几个常用安装包：rpm、源码、二进制免编译 cd /usr/local/src //切换到下载源码包的目录 wget http://mirrors.sohu.com/mysql/MySQL-5.6/mysql-5.6.35-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz tar zxvf mysql-5.6.35-linux-glibc2.5-x86_64.tar.gz //解压 mv mysql-5.6.35-linux-glibc2.
CentOS-6.4-minimal版中源码安装Apache-2.2.29 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 源码安装软件时常见的三个步骤 1)配置环境:通常命令为./configure --prefix=DIR(即指定软件安装目录),如果还想启用其它功能,可在后面接着添加指令 比如下面的--enable-ssl用于启用Apache的SSL模块 若不想使用操作系统缺省的SSL库,还可通过--with-ssl=DIR指定自己编译的SSL库 2)编译源码:通常命令为make 3)安装应用:通常命令为make install ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 注意事项 1)httpd-2.2.29目录下的configure工具是GNU软件基金会推出的专门用于源码发布的工具 2)配置环境时若出现这个错误[configure: error: no acceptable C compiler found in $PATH],是说明缺少GCC编译环境 这时执行[yum -y install gcc]命令安装编译源码所需的工具和库就可以了 3)执行yum命令时若出现这个错误[Error: database disk image is malformed],是说明yum的缓存出错,需要清理缓存 这时执行[yum clean dbcache]命令即可 4)配置环境时configure的主要工作就是生成Makefile,编译源码时的make命令就是根据Makefile来进行编译的 5)最好以root安装和启动Apache,以root运行之后,apache就会把它的派生进程切换到非root用户 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 安装Perl5 [root@CentOS64 software]# yum -y install wget [root@CentOS64 software]# wget http://www.cpan.org/src/5.0/perl-5.20.1.tar.gz [root@CentOS64 software]# tar zxvf perl-5.20.1.tar.gz [root@CentOS64 software]# cd perl-5.20.1 [root@CentOS64 perl-5.20.1]# ./Configure -des -Dprefix=/app/perl [root@CentOS64 perl-5.20.1]# make [root@CentOS64 perl-5.20.1]# make install [root@CentOS64 perl-5.20.1]# perl -v ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 安装OpenSSL [root@CentOS64 software]# tar zxvf openssl-1.0.1i.tar.gz [root@CentOS64 software]# cd openssl-1.0.1i [root@CentOS64 openssl-1.0.1i]# ./config --prefix=/app/openssl [root@CentOS64 openssl-1.0.1i]# make [root@CentOS64 openssl-1.0.1i]# make install [root@CentOS64 openssl-1.0.1i]# /app/openssl/bin/openssl version ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 安装Apache [root@CentOS64 software]# tar z
这篇文章主要介绍了 24 种编程语言的 Hello World 程序，包括熟知的 Java、C 语言、C++、C#、Ruby、Python、PHP 等编程语言，需要的朋友可以参考下。
circos对于小伙伴们应该都不会陌生，现在应用场景非常的广泛。小编在工作的时候也为了做出惊艳的circos曾大伤脑筋。为了能够让小伙伴们不再做重复性的基础工作，小编系统的整理分享perlcircos 的安装、配置和使用。perl 版本的circos 是Martin Krzywinski在2009年发表在Genome Research 上的一篇题为“Circos: An information aesthetic for comparative genomics”开发的软件。从发表到今天（2019/05/03）引用次数竟高达4296次。很多作图都是非常好看，甚至让人惊艳的。下边小编从官网转过来一些，请大家鉴赏。
一、下载 1.官网下载 官网地址:https://dev.mysql.com/downloads/file/?id=482460 2.wget直接下载 wget http://dev.mysql.
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