格式:函数必须要放在最前面,function 后是函数的名字,并且 function 这个单词是可以省略掉的,花括号{} 里面为具体的命令
已总结Pig系列的学习文档,点击末尾处,阅读原文即可查看所有,希望对大家有用,感谢关注! 在Hadoop的生态系统中,如果我们要离线的分析海量的数据,大多数人都会选择Apache Hive或Apache Pig,在国内总体来说,Hive使用的人群占比比较高, 而Pig使用的人相对来说,则少的多,这并不是因为Pig不成熟,不稳定,而是因为Hive提供了类数据库SQL的查询语句,使得大多人上手Hive非常容易,相反而Pig则提供了类Linux shell的脚本语法,这使得大多数人不喜欢使用。 如果在编程界
原文:https://opensource.com/article/19/10/advanced-awk
在Linux / UNIX操作系统下,如何使用bash for loop重复执行某些任务?
以上就是Linux基础入门的主要内容。这些内容能够帮助你建立起对Linux系统的基本理解,并掌握基本的操作技能。
bmon 是类 Unix 系统中一个基于文本,简单但非常强大的 网络监视和调试工具,它能抓取网络相关统计信息并把它们以用户友好的格式展现出来。它是一个可靠高效的带宽监视和网速估测工具。
看门狗时钟控制寄存器 ( WATCHDOG TIMER CONTROL (WTCON) REGISTER ) 详细参数 :
其中有一个资源是最新的(2023年10月)NC文章《Genome-wide association analysis of plasma lipidome identifies 495 genetic associations》里面的数据在GWAS catalog ,里面的索引号是 GCST90277238-GCST90277416,但是这个公众号的小伙伴却不知道该如何批量下载, 或者说发现规律去写代码,而且手动整理好全部的链接后下载然后把它当做是宝贝来宣传。。。。
作者:厉辉,腾讯 CSIG 后台开发工程师 本文主要分享火焰图使用技巧,介绍 systemtap 的原理机制,如何使用火焰图快速定位性能问题原因,同时加深对 systemtap 的理解。 让我们回想一下,曾经作为编程新手的我们是如何调优程序的?通常是在没有数据的情况下依靠主观臆断来瞎蒙,稍微有些经验的同学则会对差异代码进行二分或者逐段调试。这种定位问题的方式不仅耗时耗力,而且还不具有通用性,当遇到其他类似的性能问题时,需要重复踩坑、填坑,那么如何避免这种情况呢? 俗语有曰:兵欲善其事必先利其器,个人认
随着Linux社区对命令行的依赖不断增长,UNIX shell(如bash和zsh)已发展成为极其强大的工具,可以补充UNIX shell的经验。使用bash和其他类似的shell,可以使用许多强大的功能,例如管道,文件名通配符以及从称为脚本的文件中读取命令的功能。
在Linux系统的Shell中,if 是用于条件判断的关键字,用于根据给定条件执行不同的代码块。以下是if语句的一般用法:
这里介绍两种限流的实现方案:Nginx Lua分布式计数器限流和RedisLua分布式计数器限流。
在 Bash shell 中,每一个变量的值都是字符串,无论你给变量赋值时有没有使用引号,值都会以字符串的形式存储。
一定要确保你有一个可以引导的光盘或者是 U 盘以备不时之需,否则万一电脑真的不能启动谁都救不了你。如果你需要建立可引导的设备,可以按照以下方法操作(跳转到 BLFS 从 libisoburn 软件包安装 xorriso)。 (其实你手头可以备一个其它发行版的 LiveCD 制作的可引导 U盘,以备不时之需。Ubuntu、Fedora之类的都是上佳之选。)
在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面,我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频,也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能,IT的发展程度远超于我们,再加上各种马哥鸟叔,还有黑马训练营公开30天完整教学视频,按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的, 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了!不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设,而它作为一个典型的教交叉学科,想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师,我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。
我们的转录组数据分析流程的脚本当然并不能是每次都对每个项目运行全部的环节的每个步骤,通常情况下就是选择性的跑几个步骤即可。有一些小伙伴也许会把流程里面的每个步骤拆分成为多个脚本,这样就绕过选择了。但如果全部是拆分,我们脚本管理起来难度很大。
今天在查看服务器日志的时候无意间发现我 nginx 的日志文件有一天很大,于是猜测应该是有人在用脚本请求平台,进行想看看到底是个什么情况,所以有了这篇与 ChatGPT 的聊天记录。
是不是不想装虚拟机,还想体验一下 Linux?是不是自己的电脑不在,又想搞事情?今天给大家推荐几个在线就可以玩的 Linux 环境以及学习 Shell 的地方。 在线 Linux 环境 如果你不想安装虚拟机,这里提供几个在线就能把玩 Linux 的网站, 他们不需要注册用户,可以直接使用。 Unix Terminal Online 地址: https://www.tutorialspoint.com/unix_terminal_online.php 📷 这个网站也支持代码的编译运行,而且速度还可以。 JS/
Linux的浩瀚无垠,使人总能每次都提交与众不同的内容。这些内容不仅对他们的职业生涯很有用,同时也让他们增长知识。在此,我们就尝试这么去做,至于能取得多大的成功,就由我们的读者朋友们来判断吧。
可以让你摆脱对底层语言的恐惧感,脚本语言可以让你很快开发出能用得上的小程序。实践项目:
Python 是由 Guido van Rossum 在八十年代末和九十年代初,在荷兰国家数学和计算机科学研究所设计出来的。Python是免费的开源软件,是一门简单易学且功能强大的编程语言,可以进行面向对象编程,有高效的高级数据结构。
一、简介 Python是一门功能强大的高级脚本语言,它的强大不仅表现在其自身的功能上,而且还表现在其良好的可扩展性上,正因如此,Python已经开始受到越来越多人的青睐,并且被屡屡成功地应用于各类大型软件系统的开发过程中。 与其它普通脚本语言有所不同,Python程序员可以借助Python语言提供的API,使用C或者C++来对Python进行功能性扩展,从而即可以利用Python方便灵活的语法和功能,又可以获得与C或者C++几乎相同的执行性能。执行速度慢是几乎所有脚本语言都具有的共性,也是倍受人们指责的一个
linux命令流程语句 if语句 在linux中可以通过help命令查看if的格式 [root@CentOS6 shell]# help ifif: if COMMANDS; then COMMANDS; [ elif COMMANDS; then COMMANDS; ]... [ else COMMANDS; ] fi 解释: if 后面跟命令 ; then 如果命令成立,在这里可以在执行命令; [还可以写多个 elif 语句] [最后也可以写 else 语句] 最终以 fi 结束i
内核维护着各种统计信息,被称为Counters,用于对事件进行计数。例如,接收的网络数据包数量,发出的磁盘I/O请求,执行的系统调用次数。常见的这类工具有:
本文是一篇关于一些有趣但鲜为人知的工具 termsaver、pv 和 calendar 的文章。 -- Carla Schroder 本文导航 ◈ 终端屏保 08% ◈ pv 38% ◈ /usr/bin/calendar 73% 编译自 | https://www.linux.com/learn/intro-to-linux/2017/4/more-unknown-linux-commands 作者 | Carla Schroder 译者 | ucasFL 在这篇文章中和 Carla Schroder
实际项目中,需要在Linux下通过shell脚本并发读写同一个文件,但是希望同一时刻,只有一个进程可以在读、写目标文件。
1. test01 test02 1 200 1 100 2 500 2 300 3 200 3 50 4 100 4 150 输出 200 100 100 500 300 200 300 50 150 100 150 -50 awk 减法数组 awk ‘ NR == FNR { a[NR]=$2 } NR != FNR { print a[FNR], $2,(a[FNR]-$2)} ' /root/test* 2. 123abc456 45
运行非常成功!结果正常输出!然后我就愉快地去重并call variant,但是当我查看g.vcf文件时发现样本名为W0
对于Git项目开发,有一些可视化的工具,如gitk,giggle等,来查看项目的开发历史。但这些简单的可视化工具远远不足以了解项目完整的开发历史,类似于gitstats的定量统计数据工具则(如每日提交量,行数等)更能反映项目的开发进程和活跃性。
在之前的一篇博文<<Linux Kernel模块内存泄露的一种查找思路>>中,我介绍了一种查找内核内存泄露的一种方法。这不才几个月,又有客户埋怨:使用了产品5天左右后,Suse服务器由于内存耗尽而Crash。O My God,不会吧,在我机器上跑的好好的哇(程序员常用名言 嘿嘿)。 那么就让我们一起来看看,苦逼的博主是如何确定问题并且找到问题的....
Swissknife是一个脚本化的VSCode扩展,可以帮助广大研究人员生成或修改数据,并防止在Web页面中泄露敏感数据。
全部bioconductor流程链接在;http://www.bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___GeneExpressionWorkflow
需要根据自己需要,填写服务器,计数文件路径,发送人邮箱和收件人邮箱,这里采用的是post请求,需要填写传参参数。
在对系统或应用程序速度减慢或行为异常进行故障排除时,首先要检查的问题之一是系统内存使用情况。
如果将运维比作手链,将珍珠比作服务,那么将珍珠串起来的线就是Shell,作为实现Linux系统自动管理以及自动化运维所必备的Shell脚本,其重要性便不言而喻。
其实这个项目背后的故事还有很多,我安排给一个萌新负责跑这个流程。因为确实超级简单,我写了一个脚本,文件名是 run-cellranger.sh ,内容如下所示 :
bpftrace是基于BPF和BCC构建的开源跟踪程序。与BCC一样,bpftrace附带了许多性能工具和支持文档。但是,它还提供了高级编程语言,使您可以创建功能强大的单行代码和简短的工具。
在 Linux 中,你可以使用多种命令来统计文件的行数。以下是其中一些常用的命令:
今天推荐的这个项目是「bk-job」—— 蓝鲸作业平台 (Job),一套腾讯开源的运维脚本管理系统,具备海量任务并发处理能力。
OpenIM包含多个关键组件,每个都是系统功能必不可少的一部分。具体来说,MongoDB 用于持久化存储;Redis 用作缓存;Kafka 用于消息队列;Zookeeper 用于服务发现;Minio 用于对象存储。这些组件的众多可能会增加部署的复杂性。此外,系统包含多个微服务模块,这要求有效管理进程的启动、停止和监控。为了简化这一过程,我们放弃了传统脚本,转而采用了 mage 这一跨平台方案,兼容所有主流平台和 CPU 架构。本文将详细介绍整个源码部署过程。
linux的ip命令和ifconfig类似,但前者功能更强大,并旨在取代后者。使用ip命令,只需一个命令,你就能很轻松地执行一些网络管理任务。ifconfig是net-tools中已被废弃使用的一个命
Shell 是一个用 C 语言编写的程序,它是用户使用 Linux 的桥梁。Shell 既是一种命令语言,又是一种程序设计语言。
本文为awk入门系列的第二篇文章,在本篇文章中,你可以了解到有关字段,记录和一些功能强大的awk变量。
为了了解 Linux 或 macOS 上的内存使用情况,人们通常使用 top 或 htop。我很想看到一个单一的数字:一个进程占用了多少内存。但这些工具所显示的统计数据可能很难理解。对于网页浏览器来说,它甚至更加复杂,因为它们经常运行许多独立的进程。它们在 top 输出中显示为一个长长的列表,每一个都有自己的单独指标。
Alevin 是一个专为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据设计的软件工具,它是Salmon软件的一个组成部分,由Rob Patro及其研究团队开发。其具有以下特性
JMeter与Java程序一样,会记录事件日志,日志文件保存在bin目录中,名称为jmeter.log。当然,我们也可以在面板中直接察看日志,点击右上角黄色标志物可以打开日志面板,再次点击收起。
作者:cyningsun 链接:https://juejin.im/post/6875110082724659213
原文:https://juejin.im/post/6875110082724659213 作者:有疑说
系统级性能优化通常包括两个阶段:性能剖析(performance profiling)和代码优化。性能剖析的目标是寻找性能瓶颈,查找引发性能问题的原因及热点代码。代码优化的目标是针对具体性能问题而优化代码或编译选项,以改善软件性能。本篇主要讲性能分析中常用的工具——perf。
本文介绍了一种在 Shell 循环中实现展示进度百分比的脚本方法。通过使用 wc、sed 和 cut 等命令,可以方便地获取文件的行数,并在每行输出一个进度百分比。该脚本在 Mac 系统下测试通过,并可在 Linux 系统下使用。
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