blast+本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便，blast+是将blast模块化，分为了蛋白质序列比对蛋白数据库(blastp)、核酸序列比对核酸数据库(blastn)、核酸序列比对蛋白质数据库...ncbi-blast-2.9.0+-x64-win64.tar.gz 对安装包进行解压: [wangh@master Softbacks]$ tar -zxvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz...master ncbi-blast-2.9.0+]$ source ~/.bashrc #刷新你的环境配置文件，使得系统识别你刚加入的环境变量(也可以关闭当前终端再次打开，系统自动刷新环境配置文件) blastp...): blastp –query name.fasta –out name.blast –db PDB –outfmt 6 –evalue 1e-5 –num_threads 11 –max_target_seqs...e-value值; -max_target_seqs:找到最大的目标的数目，也可以用-num_descriptions,tabular格式输出结果的条数; -num_threads :线程数，并行运行时
运行级别（Runlevel）指的是Unix或者Linux等类Unix操作系统下不同的运行模式，本文记录相关内容。...运行级别 运行级别（Runlevel）指的是Unix或者Linux等类Unix操作系统下不同的运行模式。运行级别通常分为7等，分别是从0到6。...在大多数linux操作系统下一共有如下6个典型的运行级别： 0 停机 1 单用户，Does not configure network interfaces, start daemons,...3或者5，切换至 0 就是关机， 6 就是重启 用户在同一时间只能处于一种运行级别下，但是可以相互切换 查看级别 在Ubuntu下可以通过 $runlevel 查看当前运行级别 $ runlevel.../ezhengnan/p/3674624.html https://www.linuxprobe.com/linux-dyxjb.html
#筛选共有基因 #建立索引 makeblastdb -in ref.faa -dbtype prot -parse_seqids -out ref.faa #blastp比对 blastp -query...install -y diamond #现在预编译程序 wget http://github.com/bbuchfink/diamond/releases/download/v2.0.13/diamond-linux64.... tar.gz tar xzf diamond-linux64.tar.gz 2 选项参数 https://github.com/bbuchfink/diamond/wiki/3....-Command-line-options 功能选项： makedb ：建立索引 blastp：blastp 模式比对 blastx：blastx 模式比对...help：帮助信息 version：显示版本 getseq：从库文件中提取序列 dbinfo：数据库信息 、 test ：运行测试
0：关机 1：单用户：找回丢失密码 2：多用户无网络服务 3：多用户有网络服务 4：保留 5：图形界面 6：重启 常用的运行级别是3和5.。...运行可以在/etc/inittab中进行配置，也可以使用init [012356]指令进行切换。对于centos7，这里已经失效了： ?
有两种方式： 1. command & ： 后台运行，你关掉终端会停止运行 2. nohup command & ： 后台运行，你关掉终端也会继续运行 一、 简介 Linux...而 Linux 提供了 fg 和bg 命令，让你轻松调度正在运行的任务。...將前台任务丟到后台中暂停 jobs 查看后台的工作状态 fg %jobnumber 将后台的任务拿到前台来处理 bg %jobnumber 将任务放到后台中去处理 kill 管理后台的任务 二、& 在Linux...中，当在前台运行某个作业时，终端被该作业占据；而在后台运行作业时，它不会占据终端。.../test.sh 515 12483 21734 0 11:59 pts/12 00:00:00 grep test 注：本文试验环境为Red Hat Enterprise Linux
虚拟机自带的firefox版本太旧了，于是在官网上下载了最新的安装包，运行后提示： $ firefox XPCOMGlueLoad error for file /home/parallels/firefox...提示说缺少libgtk-3.so.0的库，网上查找后，说是软件位数和操作系统位数不一致，但是我的Linux是32位的，firefox也是32位的，按道理说可以运行的呀。
hexo是一个非常高效的博客，但由于其设计特点，目的是为了转换为静态页面，因此不必要一直在后台运行，但是我想随时随地写博客同步到github，使用hexo admin编辑器，这就需要hexo一直在后台运行...首先安装pm2 $ npm install -g pm2 第二步，写一个运行脚本，在博客根目录下面创建一个hexo_run.js //run const { exec } = require('child_process...console.log('stdout: ${stdout}'); console.log('stderr: ${stderr}'); }) 第三步，cd到博客根目录下运行脚本...# pm2 start hexo_run.js 参考文献 让hexo一直在后台运行 --------------------- Author: Frytea Title: Linux后台运行hexo
图1 BLAST blastn:核酸搜核酸数据库 blastp：蛋白质搜蛋白质数据库 blastx：DNA用所有可能的阅读框翻译成翻译成蛋白后搜蛋白数据库 tblastn：查询的蛋白序列搜索核酸数据库中...---- 二： LINUX下BLAST的安装与运行 优点：速度快，灵活性大，可自己配置库 缺点：序列数据库下载量大，并且更新麻烦，需要重新下载 1 安装配置BLAST 1.1 利用conda安装，关于...deltablast makeblastdb rpsblast tblastx blastdbcheck blastp...要进行序列比对，得有以下几个条件 第一，有查询序列，并有特定格式 第二，有目标序列库，蛋白库还是DNA库 第三，确定查询工具，blastn,blastp,blastx,tblastx,tblastn...查看update_blastdb.pl是否还在运行：执行ps -aef | grep update_blastdb.pl | grep -v update_blastdb.pl 命令，如过没有结果，则说明没有运行了
三、运行级别 运行模式也可以称之为运行级别（Running Level）。 在linux中存在一个进程：init （initialize，初始化），进程id是1。...查看进程：#ps -ef|grep init 该进程存在一个对应的配置文件：inittab（系统运行级别配置文件，位置/etc/inittab） 文件的主要内容： 根据上述的描述，可以得知，Centos6.5...中存在7种运行级别/模式。...0 — 表示关机级别（不要将默认的运行级别设置成这个值） 1 — 单用户模式（找回root密码的） 2 — 多用户模式，不带NFS（Network File Syetem） 3 — 多用户模式，完全的多用户模式...这些命令其实都是调用的init进程，将数字（运行级别）传递给进程，进程去读配置文件执行对应的操作。
方式一： java -jar shareniu.jar 特点：当前ssh窗口被锁定，可按CTRL + C打断程序运行，或直接关闭窗口，程序退出 那如何让窗口不锁定？...方式二 java -jar shareniu.jar & &代表在后台运行。 特定：当前ssh窗口不被锁定，但是当窗口关闭时，程序中止运行。 继续改进，如何让窗口关闭时，程序仍然运行？...方式三 nohup java -jar shareniu.jar & nohup 意思是不挂断运行命令,当账户退出或终端关闭时,程序仍然运行 当用 nohup 命令执行作业时，缺省情况下该作业的所有输出被重定向到...可通过jobs命令查看后台运行任务 jobs 那么就会列出所有后台执行的作业，并且每个作业前面都有个编号。 如果想将某个作业调回前台控制，只需要 fg + 编号即可。
Linux下运行jar包 首先查看将要运行的端口是否被其他java进程占用 sudo netstat -plten |grep java 如果端口存在java进程，需要终止进程，否则无法运行SpringBoot...项目. kill 进程PID Linux下进入jar包目录，使用 nohup java -jar 包名 & 命令可以将jar包运行，关闭终端不会停止，该命令会返回java进程的PID，并且在jar包目录下会生成
导言 多种后台运行方法总结，nohup, disown, setsid, (...&), screen, tmux 问题现象 远程登录服务器时常需要长时间运行任务，由于网络不稳定或logout等因素造成连接断开...，会导致前台任务运行中断。...SIGHUP信号有关 在POSIX-compliant平台（Solaris，MacOS 等）[1]上，当终端logout时，该终端下所有进程会收到SIGHUP信号 在Android, FreeBSD, Linux...当前台已经执行任务时，使用Ctrl z将当前进程挂起到后台暂停运行，使用bg %1命令使后台挂起命令继续运行，再使用disown -h %1使进程忽略SIGHUP信号。...3886/difference-between-nohup-disown-and [3] man 7 signal [4] https://www.ibm.com/developerworks/cn/linux
背景： linux系统运行动态小火车 实现： 首先安装sl包 然后运行sl （大火车）或sl -l （小火车） 在火车跑完一次后，会自动退出 sl,是一个高度先进的动画程序 -l，一只小型的火车在奔跑...-F，小火车从右下角跑到左上角 [root@hf-01 ~]# yum install -y sl [root@hf-01 ~]# sl 会运行一个火车 [root@hf-01 ~]# sl -l...会运行一个小火车 ?
首先把tomcat解压到linux 文件夹下：如/usr/local下 #vi(gedit) /etc/profile 在其中加入 ##########first tomcat########### CATALINA_BASE...这样就可以在linux下同时运行两个tomcat了。运行更多tomcat方法是一样的。
Linux运行定时作业的方法 当使用shell脚本时，你可能想在某个特定的时间运行shell脚本，Linux系统中提供了多个在特定时间运行shell脚本的方法：at命令和cron表。...2. at命令 at命令允许指定Linux系统何时运行脚本，at命令会将作业提交到队列中，指定shell何时运行该作业。at的守护进程atd会以后台模式运行，检查作业队列来运行作业。...中，如果要在预设时间执行shell脚本，at命令非常好用，但如果需要定期执行shell任务，例如每天一次、每周一次，则需要Linux的cron程序来安排定期执行的作业。...$ crontab -l crontab: no crontab for *** cron时间表是假设Linux系统是7*24小时运行的，如果到了时间系统关机，则作业不会被执行，开机后，cron程序不会执行错过的作业...参考文献 Linux命令行与shell脚本编程
指定运行级别 1.1 基本介绍 1.2 应用实例 1.3 CentOS7后运行级别说明 1....指定运行级别 1.1 基本介绍 运行级别说明: 0 :关机 1 :单用户【找回丢失密码】 2:多用户状态没有网络服务 3:多用户状态有网络服务 4:系统未使用保留给用户 5:图形界面 6:系统重启...常用运行级别是3和5 ，也可以指定默认运行级别. 1.2 应用实例 命令: init [0123456]应用案例:通过init来切换不同的运行级别，比如动5-3，然后关机。...1.3 CentOS7后运行级别说明 在centos7以前，配置运行级别在/etc/inittab 文件中 centos7之后进行了简化，如下: multi-user.target: analogous...）, run（运行）: systemctl get-default ?
在部署 Java 程序的时候，最简单的方式就打成 jar 并使用 java -jar xxxx.jar 运行，但是如果是一台 Linux 服务器，执行远程上去之后，如果断开链接会中断服务，经过测试，可以通过下面的命令执行
描述 linux 系统中，当 cpu 上没有要执行的任务时，往往会运行 swapper 进程，即 idle 状态，这时我们可以说 cpu 处于空闲状态。...为什么在 cpu 处于无任务时要运行 swapper 而不是直接停止呢或者运行其他任务呢？...link：Why do we need a swapper task in linux?
Linux后台运行jar程序在Linux系统中，有时候我们需要将Java程序以后台进程的方式运行，以便在关闭终端或退出登录时仍然保持程序的运行状态。...本文将介绍如何在Linux中后台运行一个Java的jar程序。准备工作在开始之前，确保您的Linux系统中已经安装了Java运行环境（JRE 或 JDK）。...通过以上步骤，您就可以在Linux系统中成功地将一个Java的jar程序以后台进程的方式运行起来。示例代码，以帮助理解：shellCopy code#!...null; then echo "程序已在后台运行。"...然后，使用pgrep命令检查是否已有同名的后台进程在运行。如果已经有同名的进程在运行，输出提示信息并结束脚本的执行。
最近在做一个项目，由于项目团队很多人，分工给我打包了一个jar服务器端的文件，然后用本地测试可以，然后再服务器运行，由于服务器是Linux的，这就体现了java的可移植性强的优点，但是执行运行命令后，关闭...ssh窗口再次我请求数据的时候，程序自动关闭了，后来查阅资料才知道，这是Linux的原因。...一些简单的操作linux jar包命令 1、执行jar包的命令和在windows操作系统上是一样的，都是java -jar xxxx.jar。...2、将jar程序设置成后台运行，并且将标准输出的日志重定向至文件consoleMsg.log。...nohup java -jar arserver-0.0.1-SNAPSHOT.jar >consoleMsg.log 2>&1 & 3、如果想杀掉运行中的jar程序，查看进程命令为： ps aux|
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