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Linux服务器里面安装GISTIC软件

GISTIC这个软件在TCGA计划里面被频繁使用者,用这个软件的目的很简单,就是你研究了很多癌症样本,通过芯片或者肿瘤外显子测序+得到了每个样本的拷贝数变化信息,一般是segment结果,可以解释为CNV...GISTIC软件的使用有两个难点,一是在linux下面安装matlab工作环境,二是如何制作输入文件。...c 安装MCR_Installer 因为GISTIC软件是一个MATLAB程序,在Linux环境下运行需要MCR_Installer。matlab毕竟是收费软件,而且是有界面的。...但是考虑到大多研究者用不起matlab,或者不会用,所以就用linux系统里面安装matlab运行环境来解决这个问题,我们仍然可以把人家写的matlab程序,在linux命令行下面,当做一个脚本来运行!...我们前面下载的GISTIC软件离线包里面是有一个 MCR_Installer 文件夹,里面就有 MCR_Installer压缩包可以解压然后安装。

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使用xShell如何搜索查找Linux日志文件里面内容

并且支持批量管理管理windows及linux服务器、vps。让服务器真正实现了一站式管理,真的是非常方便。需要的可以看一下。...正文:在Linux系统中使用xShell如何搜索查找文件里面的内容是查找问题、系统维护当中最常见的需求。...搜索、查找文件当中的内容,一般最常用的是grep命令,另外还有egrep, vi命令也能搜索文件里面内容 假如是非压缩包文件,可以用grep命令去搜索,例如: grep –i “被查找的字符串” 文件名...假如是.gz压缩包类型的话,可以用zgrep命令去搜索,例如: zgrep –i “被查找的字符串” 文件名 1:搜索某个文件里面是否包含字符串,使用grep “search content” filename1

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springboot系列学习(十六):springboot项目里面,springmvc里面的配置类里面配置格式化转换器

在springboot项目里面,我们导入web的依赖,就有了springmvc,里面有人家已经封装的springmvc的配置,现在我们想要自定义自己的配置,比如格式化转换器。...源码里面默认的是哪个? 既然要看源码,那么找spring.factoryies 文件,找到关于springmvc的类 ?...找到对应的类,全局搜索关于转换的代码,看里面涉及到的配置,关于配置的后缀就是properties 这个里面的就是MVCProperties.。进入这个配置的源码 ? ?...这样就看到关于springmvc里面的配置了。我们在这个里面找和格式化相关的配置 ? 默认的就是这样的,现在我们想要修改,就直接在yml里面进行修改就可以了 ?

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