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COG:直系同源蛋白数据库

每个COG是一组同源蛋白的集合,具有相同的生物学功能。...所以COG这个概念指的是细菌中的同源蛋白。 随着测序技术的发展,越来越多的物种拥有了完整的基因组序列。2003年的时候,又根据66个细菌物种的蛋白序列,对之前的COG结果进行了补充和拓展。...之后又陆续在不同类型的物种中建立起相关的同源蛋白簇。...古菌中的同源蛋白簇简称为arCOG, 噬菌体中的同源蛋白簇简称为POG,感染真核生物的病毒中的同源蛋白簇简称为NCVOG,巨型病毒的同源蛋白簇简称为mimiCOG。 在官网上,提供了下载功能。...MIIFKRHSQAILFSHNKQEKALLGIEGMHCEGCAIAIETALKNVKGIIDTKVNYSRGSAI VTFDDTLVSINDILEHYIFKVPSNYRAKLVSFIS 通过比对COG数据库

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浅谈同源策略

一、什么叫做同源 首先要厘清的是,怎么样的页面被称为同源的页面——如果两个页面的协议、端口以及域名都相同,那这两个页面就被称之为同源,如果其中有一项不同,那也将不会满足同源的定义。...; 第三条因为使用的是 https 协议,协议不同,所以不是同源; 第四条因为使用了 81 端口,端口不同,所以不是同源; 第五条因为域名,也就是域名不相同,所以不是同源。...那么为什么会对于同源做出如此严格的限制呢,其实是否同源主要是为了防止两类事件: 限制跨源脚本的 APIs 的访问; 阻止跨源数据存储的访问。...二、跨源网络访问 同源策略会对于跨域的资源和数据的访问做出限制。...现代浏览器在安全性和可用性之间选择了一个平衡点,在遵循同源策略的基础上,选择性地为同源策略“开放了后门。这也解释了为什么放在公共图床上的图片能够被正确的浏览的问题。

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文档代码同源

目录 1、问题起源 2、解决方案 2.1、需求和代码对应 2.2、每日检查 2.3、飞行检查 2.4、公共模块 3、补充说明 4、遗留问题 ---- 文档代码同源,故名思意,就是文档和代码都写在源代码文件里...这是我们实现文档代码同源的基础。但文档代码的同源不仅仅是把代码和文档合成一个源代码文件。...代码同源的模块如何被复用呢?首先,公司内部要有完善的版本控制机制。任何代码,全局只有一份。对于svn的版本库、git的版本库,有不同的办法。...3、补充说明 文档代码同源的思路,可解决实践中的文档代码不一致的问题,但这不是最终目的。长期坚持,达到一个良好的开发习惯和开发氛围。从而提高项目交付质量和内部的管理水平。达到组织和个人的共同成长。

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什么是同源策略

---同源策略同源策略是指浏览器的一种安全机制,用于限制来自不同源(即域、协议或端口)的文档或脚本之间的交互操作。根据同源策略,浏览器只允许当前网页与同一源下的其他资源进行交互,包括读取和修改。...同源策略的目的同源策略的主要目的是保护用户的安全和隐私。通过限制跨域操作,同源策略有以下几个关键目标:防止信息泄露: 同源策略阻止恶意网站通过跨域请求获取用户在其他站点上的敏感信息。...同源策略分类同源策略可以根据其限制范围和机制分类,主要有以下几种类型:域名(Domain-based)同源策略: 这是同源策略最基本的形式,它依据两个网页的域名是否相同来判断是否同源。...如果两个网页的协议、域名和端口号完全相同,则它们被认为是同源的。协议(Protocol-based)同源策略: 协议同源策略将协议(如 HTTP 或 HTTPS)作为判断两个网页是否同源的依据。...即使两个网页的域名和端口不同,只要协议相同,它们仍被视为同源。端口(Port-based)同源策略: 端口同源策略将端口号作为判断两个网页是否同源的依据。

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什么是同源策略

同源策略 同源策略是指浏览器的一种安全机制,用于限制来自不同源(即域、协议或端口)的文档或脚本之间的交互操作。 根据同源策略,浏览器只允许当前网页与同一源下的其他资源进行交互,包括读取和修改。...同源策略的目的 同源策略的主要目的是保护用户的安全和隐私。通过限制跨域操作,同源策略有以下几个关键目标: 防止信息泄露:同源策略阻止恶意网站通过跨域请求获取用户在其他站点上的敏感信息。...同源策略分类 同源策略可以根据其限制范围和机制分类,主要有以下几种类型: 域名(Domain-based)同源策略:这是同源策略最基本的形式,它依据两个网页的域名是否相同来判断是否同源。...如果两个网页的协议、域名和端口号完全相同,则它们被认为是同源的。 协议(Protocol-based)同源策略:协议同源策略将协议(如 HTTP 或 HTTPS)作为判断两个网页是否同源的依据。...即使两个网页的域名和端口不同,只要协议相同,它们仍被视为同源。 端口(Port-based)同源策略:端口同源策略将端口号作为判断两个网页是否同源的依据。

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同源策略与JSONP

同源策略”限制了JavaScript的跨站点调用,这必然导致Web API不能垮域提供资源。...同源策略的存在,限制了“源”自A的脚本只能操作“同源”页面的DOM,“跨源”操作来源于B的页面将会被拒绝。所谓的“同源”,必须要求相应的URI在如下3个方面均是相同的。...同源策略以及跨域资源共享在大部分情况下针对的是Ajax请求。...如果运行我们的程序,我们将会得到如右图所示的空白页面,这就是“同源策略”导致的后果。值得一提的是,我们并不会得到任何的错误信息,这是因为大部分浏览器针对同源策略的支持都是隐性和透明的。...对于一段通过标签的src属性加载的JavaScript脚本,它与当前页面同源

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eggNOG:从COG延伸出来的同源蛋白数据库

直系同源蛋白的预测在系统发育,比较基因组学等多个领域都占用重要地位,COG数据库开创了同源蛋白数据库的先河,后续又不断有新的数据库涌现,而eggNOG就是目前使用最广泛的数据库之一。...genealogy of genes:Non-supervised Orthologous, 在COG算法的基础上进行了拓展和延伸,采用基于图状结构的非监督聚类算法,构建了真核,原核,病毒等不同物种的同源蛋白簇...该数据库最新版本为eggNOG 4.5.1, 涵盖了2031种真核和原核生物,352种病毒,构建了19万个同源蛋白簇。...本地版的eggNOG-mapper 的安装和使用可以参考如下文档 https://github.com/jhcepas/eggnog-mapper/wiki 官网提供了下载服务,可以下载完整数据库,也可以根据物种挑选合适的子数据库进行下载...通过eggNOG数据库,我们可以对新的蛋白序列进行同源蛋白的注释, 挖掘其功能。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—

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跨物种比较(同源基因)

不同物种中的同源基因指的是直系同源基因(rotholog genes,例如从一个共同祖先基因因为物种进化来的基因),通常在进化中保留了非常相似的功能。...相反的,paralog genes旁系同源genes来自于同一个基因组(通过基因复制获得)。旁系同源基因可能有相似的功能但是也可以进化成不同的特征。...有时,我们想比较同源基因,或许,给你一个基因symbol,你想获取以下信息: 哪些是它的旁系同源基因(在同一个基因组) 那些是他的直系同源genes(不同的基因组) 我们可以使用biomaRt获取这些信息...BiomaRt 提供了有力且简单的用户界面来或许不断增长的数据库信息,包括ensembl,uniprot和hapmap。biomaRt允许和检索不同类型的广泛的信息。...总共4036个同源genes都出现在微阵列中。我们选择表达变化差异大的同源genes进行下一步分析(1650个基因)。总共4036个直系同源genes在两个microarrays都出现。

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浏览器的同源策略

同源策略 同源策略是一个重要的安全策略,它用于限制同一个 origin 的文档或者它加载的脚本如何能与另一个源的资源进行交互,它能帮助阻隔恶意文档,减少可能被攻击的媒介 Origin 源 源的组合 协议...http://store.company.com/dir/page.html 的源进行对比的示例 URL 结果 原因 http://store.company.com/dir2/other.html 同源...但是不能将 cnblogs.com 改成 cnblogscool.com ,因为它不是 cnblogs.com 的父域 两种同源策略 DOM 同源策略:禁止对不同源页面 DOM 进行操作。...这里主要场景是 iframe 跨域的情况,不同域名的 iframe 是限制互相访问的 XMLHttpRequest 同源策略:禁止使用 XHR 对象向不同源的服务器地址发起 HTTP 请求 为什么要有同源策略...,不是说有了同源策略就安全,只是说同源策略是一种浏览器最基本的安全机制 能提高一点攻击的成本 CORS https://i.cnblogs.com/posts/edit-done;postId=15345871

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如何寻找同源基因---OrthoFinder

构建物种的系统发育树,计算kaks值或者比较基因组学和进化的其他分析都少不了需要寻找同源基因。...同时在OrthoFinder运行之后,不仅仅寻找了同源基因,它也构建了gene tree和species tree。...结果文件 在结果文件夹中,Orthogroups文件夹里面有所有的同源基因信息,还贴心的单独给出了单拷贝同源基因信息。...Gene_Trees 和 Species_Tree 文件夹分别是单独的同源基因构建的tree已经整合所有同源基因构建的物种树。 Note: 1. 可以指定-M参数来指定物种树的构建算法。...STAG整合了所有的同源基因(包括多拷贝基因),这种方法特别适合物种遗传距离较远,单拷贝同源基因很少甚至没有的情况。

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同源策略与跨域请求

说到跨域,与浏览器的同源策略是密不可分的。那我们先来理解一下浏览器为什么要设置同源策略。...同源策略存在的意义就是为了保护用户的信息的安全。...由此可见,同源策略是非常必要的,可以说是浏览器安全的基石。...除了 cookie 的访问受到同源策略的限制外,还有一些操作也同样受到同源策略的限制: (1) 无法读取非同源网页的 Cookie 、sessionStorage 、localStorage 、IndexedDB...(2) 无法读写非同源网页的 DOM (3) 无法向非同源地址发送 AJAX请求(可以发送,但浏览器会拒绝响应而报错) 虽然所有的页面都有浏览器的同源策略的保护,但我们仍然有一些办法绕过浏览器的同源策略限制

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MySQL数据库(一):安装MySQL数据库

安装环境: 操作系统版本:RHEL 6.5 安装版本:MYSQL 5.1 升级版本:MYSQL 5.6 一、简述MYSQL 1.什么是数据库?...DB DataBase :数据库 依照某种数据模型进行组织并存放到存储器的数据集合 DBMS DataBase Manager System :数据库管理系统 用来操作和管理数据库的大型服务软件...DBS DataBase System :数据库系统 即DB+DBMS指带有数据库并整合了数据库管理软件的计算机系统 2.E-R数据模型 3.常见数据库软件服务商 甲骨文:MYSQL...[确定] 6.登陆mysql并查询当前数据库 [root@svr5 mysql]# mysql ERROR 1045 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost...需要注意的是这里的root用户不是Linux系统的root用户,而是mysql数据库的管理员root。

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