首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

TCGA tRNA延伸片段数据库

所以今天就给大家推荐一个已经利用TCGA数据库分析好的tRFs数据库:OncotRF[http://bioinformatics.zju.edu.cn/OncotRF/index.html]。...数据库分析流程 通过以上的介绍其实已经了解了这个数据库是怎么进行分析的。对于数据的获取,这个数据库使用TCGA当中miR-seq的bam数据来进行重新比对。进而就可以获得tRFs的表达情况。...数据库使用 数据库主要提供了四种使用的方式:tRFs基本检索;具体肿瘤类型所有结果预览;自定义分组比较以及预后分析 基本检索 假如我们有一个目标的tRF想要进行分析。就可以使用这个功能来进行定向检索。...数据库使用场景 以上就是这个数据库的主要功能了。比较可惜的是作者没有提供所有原始数据下载的功能。不然的话,还可以下载所有的原始数据来进行自己的DIY分析。不过其实功能已经很全了。

56930
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

MySQL排序字段数据相同不能分页问题

MySQL排序字段数据相同不能分页问题,最近同事遇到一个列表的分页有bug,点击第1行,第2行数据会出现重复的,初步怀疑是数据重复了,通过SQL查询,确认数据都没重复。...不过分页时候会出现重复,所以怀疑是分页问题,因为我之前遇到过order by的字段有null值的情况,排序也会有问题,所以通过经验去排查排序的字段数据,发现并没有null值的数据。...只是数据很多都是一样的,因为是通过批量导入的,新增时间都保存为一样的,然后分页再根据这个新增时间去排序,就会出现好像“数据重复”的现象 通过查询MySQL官方的资料,https://dev.mysql.com...所以,问题就知道了,通过官网资料,可以知道可以在order by后面加上一个唯一的id mysql> SELECT * FROM ratings ORDER BY category, id; +---...2 | 3.5 | | 6 | 2 | 3.5 | +----+----------+--------+ 当然,方法并非唯一,也可以新增数据时候,保证这个字段数据不相同

2.3K40

日常问题:MySQL排序字段数据相同不能分页问题

【问题日期】 2022-11-14 22:45:12 【问题描述】 MySQL 排序字段数据相同不能分页问题:在分页查询数据时,按创建时间排序,由于数据是批量创建的,导致部分数据创建时间一样,而此时分页查询数据...,翻页后出现重复数据 【问题拆解】 分页查询数据 按照创建时间排序&存在创建时间相同的数据 翻页后出现重复数据 【问题来源】 朋友遇到的 【可能原因】 是因为排序字段只有创建时间 【参考链接】 MySQL...51CTO 博客 - 《MySQL排序字段数据相同不能分页问题》: https://blog.51cto.com/u_15704340/5439010 如果 order by 排序的字段有相同的数据...在 MySQL 5.7.33 之前,无法覆盖此行为,即使在使用其他优化可能更快的情况下也是如此。...从 MySQL 5.7.33 开始,可以通过将 optimizer_switch系统变量的 prefer_ordering_index标志设置为off.

1.7K40

MySQL Explain关键

一、Explain是什么 使用 EXPLAIN 关键可以模拟优化器执行 SQL 查询语句,从而知道 MySQL 是如何处理你的 SQL 语句的。分析你的查询语句或是表结构的性能瓶颈。...因为只匹配一行数据,所以很快 如将主键置于 where 列表中,MySQL 就能将该查询转换为一个常量。 eq_ref 唯一性索引扫描,对于每个索引键,表中只有一条记录与之匹配。...8、rows rows 列显示 MySQL 认为它执行查询时必须检查的行数。越少越好!...9、extra Using filesort 说明 mysql 会对数据使用一个外部的索引排序,而不是按照表内的索引顺序进行读取。MySQL 中无法利用索引 完成的排序操作称为“文件排序”。...Using temporary 使用临时表保存中间结果,MySQL 在对查询结果排序时使用临时表。常见于排序 order by 和分组查询 group by。

1.7K20

MySQL 数据库优化,看这篇就够了 | 不长不短,2000 小结

前言 数据库优化一方面是找出系统的瓶颈,提高MySQL数据库的整体性能,而另一方面需要合理的结构设计和参数调整,以提高用户的相应速度,同时还要尽可能的节约系统资源,以便让系统提供更大的负荷. 1....,而连接查询不会创建临时表,因此效率比嵌套子查询高. 2.1.3 使用索引 索引是提高数据库查询速度最重要的方法之一,关于索引可以参高笔者一文,介绍比较详细,此处记录使用索引的三大注意事项: LIKE关键匹配...OR关键的两个字段必须都是用了索引,该查询才会使用索引....MEDIUM:扫描行,以验证被删除的连接是有效的,也可以计算各行关键校验和. EXTENDED:最全面的的检查,对每行关键全面查找. 3....优化数据库参数可以提高资源利用率,从而提高MySQL服务器性能.MySQL服务的配置参数都在my.cnf或my.ini,下面列出性能影响较大的几个参数. key_buffer_size:索引缓冲区大小

67350

详述 MySQL ProxySQL

User Auth 为底层后端数据库认证提供了用户凭证。 Hostgroup manager – 负责管理发送SQL请求都后端数据库并跟踪SQL请求状态。...Monitoring – 负责监控后端数据库健康状态主从复制延时并临时下线不正常的数据库实例。 1. 启动过程 ?...无法直接修改这里的配置,必须要从下一层load进来 MEMORY层 是平时在mysql命令行修改的 main 里头配置,可以认为是SQLite数据库在内存的镜像。...小结 这些数据库的功能实现了实用化内容: 允许轻松动态更新配置,便于运维管理,与MySQL兼容的管理界面可用于此目的。...MySQL里创建账号 数据库段创建访问用户,监控用户 [root@ss30 ~]# mysql -uroot -p123456 -h127.0.0.1 -P3410 mysql> GRANT ALL

1.5K11

innodb实例损坏情况下恢复数据及相关工具的开发

作者介绍:谢浩,现任职于云和恩墨(北京)信息技术有限公司,具有多年oracle数据库企业级运维经验,擅长结合业务、硬件系统制定各种项目方案,具有丰富mysql相关的工作经验。...案例描述 某门户mysql innodb数据库实例损坏,数据库服务无法启动,使用文件系统上的数据库frm及bid文件恢复数据库内的业务数据。...相关知识点 Mysql innodb数据库将实例的基础字典信息存储在data目录下的ibdata1文件以及mysql实例中,可以将其理解为oracle数据库的system表空间以及数据字典,如果损坏数据实例将无法启动...1、分析frm文件格式获得表字段个数 分析mysql源代码中位于table.cc文件中的open_binary_frm函数获得frm文件中记录字段数的位置: ?...至此字段数量信息读取完成。 2、获得表对应的space_id space_id 可以从ibd文件的第38~39节、42~43节两处处获得: ? 两处完全一样,读取其中一个即可。

1.3K81

MySQL数据库(一):安装MySQL数据库

安装环境: 操作系统版本:RHEL 6.5 安装版本:MYSQL 5.1 升级版本:MYSQL 5.6 一、简述MYSQL 1.什么是数据库?...DB DataBase :数据库 依照某种数据模型进行组织并存放到存储器的数据集合 DBMS DataBase Manager System :数据库管理系统 用来操作和管理数据库的大型服务软件...DBS DataBase System :数据库系统 即DB+DBMS指带有数据库并整合了数据库管理软件的计算机系统 2.E-R数据模型 3.常见数据库软件服务商 甲骨文:MYSQL...[确定] 6.登陆mysql并查询当前数据库 [root@svr5 mysql]# mysql ERROR 1045 (28000): Access denied for user 'root'@'localhost...需要注意的是这里的root用户不是Linux系统的root用户,而是mysql数据库的管理员root。

22.7K80

MySQL数据库介绍以及MySQL数据库

目录 数据库介绍 数据库概述 数据表 MySql数据库 MySql安装 登录MySQL数据库 ​​​​​​​SQLyog(MySQL图形化开发工具) 数据库介绍 数据库概述 什么是数据库(DB:DataBase...数据库的保护、维护 通信 数据库数据库管理系统的关系 常见的数据库管理系统 MYSQL :开源免费的数据库,小型的数据库.已经被Oracle收购了.MySQL6.x版本也开始收费。...SQLite : 嵌入式的小型数据库,应用在手机端。 上课会学:MYSQL 这里使用MySQL数据库MySQL中可以有多个数据库数据库是真正存储数据的地方。...表记录与java类对象的对应关系 数据库跟数据表的关系:一个数据库中可以有若干张表 MySql数据库​​​​​​​ MySql安装 安装 参考MySQL安装图解.doc 安装后,MySQL会以windows...也可以在DOS窗口,通过命令完成MySQL服务的启动和停止(必须以管理运行cmd命令窗口) 登录MySQL数据库 MySQL是一个需要账户名密码登录的数据库,登陆后使用,它提供了一个默认的root

23.8K21

MySQL中的describe关键

今天写代码的时候,老是提示在You have an error in your SQL syntax; check the manual that corresponds to your MySQL server...语句的时候删掉这个字段就不会报错,加上这个字段添加和查询又会报错,纠结了很久,最后终于试着把describe改为describes,可以正常插入数据,也可以正常查询了,后面在网上一查,describe竟然是mysql...中的关键词,我们不能用这个作为数据库中的表的字段。...在SQL语句中出现的关键和保留字 如果要使用人他们的字符意思而不是作为关键、保留字使用,关键可以正常使用,但是保留字必须使用`(键盘tab键上面,数字1左边的那个按键)来分割。...所以我们要尽量避免使用关键和保留字来作为表名和字段名。

1.3K20
领券