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输出人类全部基因的全名和别名

protein p53的简称,其实它还有很多别名,比如BCC7;LFS1;P53;TRP53; 如果你通过数据分析拿到了一系列感兴趣的基因,但是只有类似于TP53这样的基因标准symbol名字,想批量拿到全部的基因的全名和别名...function(x){ifelse(is.null(eg2alis_list[[x]]),"no_alias",eg2alis_list[[x]])}) 借助于 org.Hs.eg.db 包,我们已经拿到了全部的人类全部基因的全名和别名...,就是如下所示的4个变量: geneIds symbols geneNames geneAlias 接下来可以做一个简单的HTML报表输出,代码如下所示: createLink <- function(...all_gene_bioconductor.html' y <- DT::datatable(gene_info,escape = F,rownames=F) DT::saveWidget(y,file) 可以看到输出的报表清晰简洁...,而且还支持搜索: 清晰简洁 学徒作业 把我上面的代码扩充,给全部的基因同步加上对应的go和kegg信息,也是借助于R里面的包即可。

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MySQL全部知识点(1)

2 安装MySQL数据库 2.1 安装MySQL 参考:MySQL安装图解.doc 2.2 MySQL目录结构 MySQL的数据存储目录为data,data目录通常在C:\Documents and Settings...MySQL的安装目录下: bin目录中都是可执行文件; my.ini文件是MySQL的配置文件; 3 基本命令 3.1 启动和关闭mysql服务器 启动:net start mysql; 关闭:net...stop mysql; 在启动mysql服务后,打开windows任务管理器,会有一个名为mysqld.exe的进程运行,所以mysqld.exe才是MySQL服务器程序。...3.2 客户端登录退出mysql 在启动MySQL服务器后,我们需要使用管理员用户登录MySQL服务器,然后来对服务器进行操作。...登录MySQL需要使用MySQL的客户端程序:mysql.exe 登录:mysql -u root -p 123 -h localhost; -u:后面的root是用户名,这里使用的是超级管理员root

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MySQL全部知识点(2)

提示符后都要去修改这两个编码,但可以通过修改配置文件来处理这一问题:配置文件路径:D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.1\ my.ini ?...3 MySQL工具 使用MySQL工具是不会出现乱码的,因为它们会每次连接时都修改character_set_client、character_set_results、character_set_connection...注意,mysqldump命令是在Windows控制台下执行,无需登录mysql!!! 2 执行SQL脚本 执行SQL脚本需要登录mysql,然后进入指定数据库,才可以执行SQL脚本!!!...还可以通过下面的方式来执行脚本文件: mysql -uroot -p123 mydb1<c:\mydb1.sql mysql –u用户名 –p密码 数据库<要执行脚本文件路径 ?...这种方式无需登录mysql! 多表查询 多表查询有如下几种: 合并结果集; 连接查询 内连接 外连接 左外连接 右外连接 全外连接(MySQL不支持) 自然连接 子查询 1 合并结果集 1.

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MySQL 之 Explain 输出分析

MySQL 之 Explain 输出分析 背景 前面的文章写过 MySQL 的事务和锁,这篇文章我们来聊聊 MySQL 的 Explain,估计大家在工作或者面试中多多少少都会接触过这个。...通过图片我们可以看到执行过后会输出 12 个字段,那么每个字段是什么意思呢?...我们来一一看下 Explain 输出的字段内容 id, select_type, table, partitions, type, possible_keys, key, key_len, ref, rows...在这种情况下,输出行中的 key 列包含使用的索引列表,key_len包含所用索引的最长 key 部分列表•unique_subquery: 在使用 in 查询的情况下会取代 eq_ref•range:...小结 今天简单的给大家介绍了一些 Explain 的输出信息,很多时候我们可能在平时很少接触,但是很多时候我们还是要掌握的。

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MySQL EXPLAIN SQL 输出信息描述

EXPLAIN 语句输出通常包括id列,select_type,table,type,possible_keys,key等等列信息 MySQL 5.6.3后支持SELECT, DELETE, INSERT...EXPLAIN EXTENDED支持一些额外的执行计划相关的信息 EXPLAIN PARTITIONS支持基于分区表查询执行计划的相关信息 二、EXPLAIN输出列描述 -- 下面通过示例来展示EXPLAIN...输出列 (root@localhost) [sakila]> explain select sum(amount) from customer a, -> payment b where 1=1...uncacheable subquery (see UNCACHEABLE SUBQUERY) table: 从哪个表(表名)上输出行记录...如果改列为NULL,说明该查询不会使用到当前表上的相关索引,考虑是否有必要添加索引 key 显示MySQL在查询中实际使用的索引,若没有使用索引,显示为NULL 也可能存在key不等于

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MySQL:解析SHOW ENGINE INNODB STATUS输出

MySQL的SHOW ENGINE INNODB STATUS命令是一个强大的工具,它提供了InnoDB存储引擎的内部运行状态和性能信息。...下面,我们将通过分析SHOW ENGINE INNODB STATUS的输出来理解InnoDB的各种关键属性和值的意义。 1....总结 通过分析SHOW ENGINE INNODB STATUS命令的输出,我们可以获得InnoDB存储引擎的许多内部运行状态和性能信息。...通过定期检查此命令的输出,并与MySQL的官方文档和社区资源一起使用,我们可以更好地理解和优化InnoDB的性能。...这篇文章仅仅触及了SHOW ENGINE INNODB STATUS命令输出中的一些基本信息,实际上,每个部分都包含了大量的详细信息,需要数据库管理员深入理解和分析,以便在日常运维和优化中做出正确的决策

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MySQL命令,一篇文章替你全部搞定

MySQL的基本操作可以包括两个方面:MySQL常用语句如高频率使用的增删改查(CRUD)语句和MySQL高级功能,如存储过程,触发器,事务处理等。...注意:数据是从第0行开始计数的; ORDER BY子句取一个或者多个列,据此对输出进行排序:SELECT cust_id,cust_name FROM customers ORDER BY cust_id...,RIGHT JOIN会全部返回右表数据,FULL JOIN会将左右两个表的数据全部返回; 联结查询与聚集函数一起使用。...索引 MySQL索引的建立对于MySQL的高效运行是很重要的,索引可以大大提高MySQL的检索速度。索引分单列索引和组合索引。单列索引,即一个索引只包含单个列,而组合索引,即一个索引包含多个列。...只能使用OLD来访问数据; 在BEFORE UPDATE触发器中,NEW中的值可以被改变,即允许更改将用于UPDATE的数据; OLD中的行数据只能读,不能被更新; 一个UPDATE触发器示例如下: 、输出

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