前言 当处理多年暴雨的 TIF 数据集时，我们可以使用 rioxarray 库将这些数据合成为一个 NetCDF (nc) 文件。...NetCDF 是一种常用的科学数据格式，它具有跨平台、可扩展和自描述的特点，非常适合存储和共享地理空间数据。...我们需要首先定义一个包含多个 TIF 文件路径的列表，并使用 rioxarray.open_rasterio 函数打开这些文件，得到相应的 xarray 数据集。...然后，通过使用 xr.concat 函数将这些数据集沿时间维度进行合并，形成一个大的数据集。最后，我们可以使用 to_netcdf 方法将合并后的数据集保存为 NetCDF 文件。...(file_list[0]) # 获取 TIF 文件中的变量 dataset 合并nc文件 In [14]: xds_list = [] time_coord = pd.date_range(start
有个朋友需要把json格式的气象风场数据转成指定的nc格式，尝试了一下，代码如下。...datetime64类型 dt = np.datetime64(data['header']['refTime']) # 将datetime64类型转换为数组 time = np.array([dt]) #调整数据...U = np.array(data['dataU']).reshape((nt,ny,nx)) V = np.array(data['dataV']).reshape((nt,ny,nx)) #将数据从...json转换成nc格式 ds = xr.Dataset( data_vars={ 'U10': (('time', 'latitude', 'longitude'), U),...netCDF文件 ds_target.to_netcdf('target_data.nc')
使用ArcGIS读取nc文件步骤： 1.打开ArcGIS，在多维工具下选择“创建NetCDF栅格图层” 2.输入nc文件，其他参数可忽略，点击确定 3.创建好后，右键点击图层，点击属性，选择“...4.如果处理的数据没有定义坐标系，则需要自己定义栅格文件的坐标系。 5.输出NC转换成的栅格数据，右键栅格图层导出栅格数据，保存为tif格式。
降水温度蒸散发等气象数据通常以NC格式存储，可以用Matlab和ArcGIS读取数据。常为逐年逐月逐日数据。在用GIS进行数据分析时，需要将其转换为栅格数据。 （1）打开nc数据。...注意nc文件路径一定要全英文。 （2）右键导入的nc数据生成的raster图层，选择properties-NetCDF-Band Dimension选择时间。...（3）如果处理的数据没有定义坐标系，则需要自己定义栅格文件的坐标系注意这里是定义整个数据框的坐标系而不是栅格图层的右键Layers-Properties-Coordinate System-new Project...System （4）输出NC转换成的栅格数据，右键栅格图层选择Data-Export Data, Spatial reference 选择Data Frame, 数据格式Format可以选择TIFF...我这里保存为tif格式。之后就可以作为栅格数据在GIS中进行后续分析了。
使用 EarthPy 堆叠和裁剪tif栅格数据 温馨提示 本文镜像 ：气象分析3.9 由于可视化代码过长隐藏，可点击以下链接运行Fork查看 使用 EarthPy 堆叠和裁剪tif栅格数据若没有成功加载可视化图...，点击运行可以查看 ps:隐藏代码在【代码已被隐藏】所在行，点击所在行，可以看到该行的最右角，会出现个三角形，点击查看即可 使用 EarthPy 堆叠和裁剪tif栅格数据 注意 下面的示例将向您展示如何使用...下面使用颜色条将数据绘制为连续数据 使用 ''plot_bands（）'' 函数 当然，小编手头没有卫星波段数据，只好拿之前的暴雨tif数据顶顶。...安装与导入库 我们将结合多个库堆叠与裁剪tif数据 In [ ]: !...看得出erathpy对于tif数据处理较为便利，堆叠和掩膜都比较简短
MOD043km的hdf数据转为tifc尝试了两种办法，1是靠 gdal.open(r'D:/Thesis/ML/modis3km/MOD04_3K.A2018001.0320.061.2018003202214...#5 driver = gdal.GetDriverByName(format)#6 outDataRaster = driver.Create("D:/Thesis/ML/aodband2/aod5.tif...ds.GetProjection())##sets same projection as input9 outDataRaster.GetRasterBand(1).WriteArray(aod)#10，5-10都是赋值给新数据...3K.A2018001.0320.061.2018003202214.hdf":mod04:Image_Optical_Depth_Land_And_Ocean"'+''+' "D:/Thesis/ML/aodband2/aod5.tif
，于是经过不太充分的研究后总结成此文，以记录如何使用 python 处理 nc 数据。...既然 nc 可以用来一系列的数组，所以经常被用来存储科学观测数据，最好还是长时间序列的。...所以看到这里，各位应该已经明白了，可以直接使用 GDAL 处理 nc 数据，比如直接使用 gdalwarp 将某个 SUBDATASET 转成 GeoTiff 等等，此处暂且不表，各位只需要查阅一下 gdalwarp...2.2 rasterio rasterio 是 Mapbox 开源的空间数据处理框架，功能非常强大，此处不细说，只表如何处理我们的 nc 数据。...三、总结 本文简单介绍了 nc 数据的特点及如何使用 python 处理 nc 数据。
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今天就给大家介绍一个最近刚刚发表的Nature Communication(NC)上的泛癌分析文章 ?...在文章当中的分析当中，作者 使用了两个大的泛癌数据来分析PBAF复合物在不同肿瘤当中的情况 使用了其中一个泛癌数据来分析了PBAF复合物突变和预后的关系 使用多个转录组数据来分析PBAF复合物突变的功能...在这里，作者没有使用TCGA这样的表达数据，这里作者使用了三个其他的"公共数据集"。这几个公共数据集是基于临床试验的过程当中产生的测序数据。 ? 关于文章的感想 以上就是文章的基本内容。...文章对于我们的提示在于文章使用了多个公共的数据集。其中TCGA是我们常用的。另外也使用了MSK-IMPACT这个公共数据集。这个数据集当中有和免疫治疗有关的信息。...这三个数据主要还是来自于European Genome-Phenome Archive (EGA)这个组织。这个组织里面存放了很多临床试验相关的测序数据。有想要临床实验相关测序数据的可以在这里看看。
写入快数据 //noData获取 double nodata = reader.read(null).getSampleDimension(0).getNoDataValues()[0]; //scalex
strPoints) throws IOException, TransformException { String demPath = "G:/weitu/download/xian/xian.tif..."; // String demPath = "F:/Data/yanta/YanTaDOM.tif"; File file = new File(demPath); Hints...PlanarImage)sourceImage; //获取左上右下，包含仿射影子的左上角 Envelope env = coverage.getEnvelope(); //创建输出tif...String outputPath = "D:/testTiff.tif"; float[][] slopeData = new float[1000][1000]; for(...sourceRaster.getPixel(1500, 800,adsaf); float ibandvalue = sourceRaster.getSampleFloat(0,0,0); //获取源数据类型
创建简单sparkcontent 根据geotrellis sparkutils 创建sparkcontent 通过sc.hadoopMultibandGeoTiffRDD(读取本地/hadoop tif...文件 拼接瓦片数据，凭借单通道瓦片数据 保持金字塔到本地文件系统 保持金字塔到hadoop文件系统 通过通过HadoopGeoTiffRDD 读取本地/hadoop 文件系统 二....读取本地TIF文件为RDD //支持打开hadoop/local filesystem 文件 def read_file(implicit sc: SparkContext) = {...").getAbsolutePath // 输出文件的路径,栅格（金字塔）数据和属性数据存放的文件夹 val outputFilePath = "data/catalog_file"...) = read_file //save_stitch_tif(tiled, data) save_file_pyramid(tiled, data)
首先我们先导入所需的数据，本次使用的是经扩展重构的海表面温度 v5 数据集（Extended Reconstructed Sea Surface Temperature, abbr....这个数据集可追溯到 1854 年的海表面温度，并被广泛使用。 ? ERSST v5 下载完毕数据后，我们利用.open_dataset函数导入 NetCDF 数据 path = "......\\sst.mnmean.nc" # 删除一些不必要的变量 ds = xr.open_dataset(path, drop_variables=["time_bnds"]) # 提取1960年~2018...ds 下面我们来做一下数据的基本制图，通过图形来检查下载数据的正确性。 ds.sst.isel(time=0).plot(vmin=-2, vmax=30) ?...下面我们将上述海温数据的摄氏温度改写为开尔文温度为例说明上述问题。
生信技能树已经很贴心地把sra格式数据全部下载。共5.3个T。...base) pc@pc-System-Product-Name:/data/fudan_TNBC$ ls -l |grep "^-"|wc -l 727 把/data/fudan_TNBC/下的sra文件转成
fastjson的简单用法，fastjson转换相对语法简单点，不过如果出现Bean类过大，或者在ie模式有时候会出现一些报错
因为课题处理30年的降雨和蒸发的遥感资料（.NC格式），而想要在Arcgis中处理要求的是raster格式的，所以需要批量转化为tif文件，所以在此分享自己改编之后的代码，可以简洁明了的实现这个过程：...我所参考和借鉴的文章的链接如下： 《 MATLAB读取.nc文件》 《matlab批量处理nc文件》 《Matlab读取气象驱动数据.nc格式的数据》 感谢他们的分享 版本：MATLAB_2018b...clc; clear; %% 批读取NC文件的准备工作 datadir = 'G:\Global_P_ET\MSWEP_V2.2\'; %指定批量数据所在的文件夹 filelist = dir([datadir...\MSWEP_V2.2\',filelist(i).name]; %设定NC路径 num = filelist(i).name(1:6); %读取数据编号，以便于保存时以此编号储存tif...,'tif') %% 存为tif格式 data=flipud(sum_pre'); %很重要，这是镜像反转，否则最后的图像的南北朝向是错的
pytorch读取图像数据转成opencv格式方法：先转成numpy通用的格式，再将其转换成opencv格式。 pytorch读取的数据使用loaddata这类函数实现。...代码如下：三通道的数据 image_idx = x[idx].cuda().data.cpu().float().numpy() #经过上面处理的数据 在gpu上给取出来放在cpu上。...image_idx = image_idx.transpose(1,2,0) img1 = cv2.cvtColor(image_idx * 255,cv2.COLOR_RGB2BGR)#转成...array3 = transforms.ToTensor()(image3).numpy() # Image自带的属性，但是会打乱数据为一维 list1 = list(image3.getdata(...后续更新解决opecv，matplotlib显示中文问题，以及分类模型中加入评价指标confusion matrix 欢迎大家留言批评指正 以上这篇pytorch读取图像数据转成opencv格式实例就是小编分享给大家的全部内容了
1.下载NASA数据 这里不在赘述，参考如何获取NASA数据，下面的例子根据下载的LandCover与Rainfall数据进行展示，如何利用R语音进行读取，然后绘图。...A2011001.006.2018053185321.hdf；这里的gdalinfo(hdf_filesname) 可以显示该hdf文件的详细列表信息，经纬度，坐标系，年份及卫星信息；sds就是我们想要的数据...hdf_filesname=hdf[2] hdf_tif_name=paste0(unlist(str_split(hdf_filesname,".hdf"))[1],".tif") gdalinfo(...然后读取tiff到raster就可以了 gdal_translate(sds[1], dst_dataset = hdf_tif_name) # change hdf to tiff hdf_raster...WGS84 +towgs84=0,0,0 source : /Users/Desktop/NASA/Landcover/MCD12C1.A2011001.006.2018053185321.tif
.nc是NetCDF（Network Common Data Form）文件的扩展名，表示一种常用的科学数据存储格式。...NetCDF是一种自描述的、可移植的二进制文件格式，用于存储科学和工程领域的大型数据集；由于其自身的特性，.nc数据被广泛应用于气象学、海洋学、地球科学、气候研究、大气科学、地理信息系统等领域。 ...在函数中，首先创建一个空列表nc_dates，用于存储每个.nc文件及其对应的日期列表；随后，使用os.listdir()函数遍历文件夹中的所有文件，通过检查文件名是否以.nc结尾来筛选出.nc文件。...其次，使用Dataset类打开.nc文件，并将打开的文件对象赋值给dataset变量；随后，获取.nc文件的时间，在本文的.nc数据中，也就是名为time的变量，并将时间变量的值读取到time_values...此外，这里还将.nc文件名和对应的日期列表作为元组添加到nc_dates列表中，方便我们后期对日期的核对。函数的最后，返回包含每个.nc文件及其对应日期的列表。
目录 1 生成nc 格式的文件 1.1 代码 2 简单读取nc 格式的文件 1 生成nc 格式的文件 1 首先是生成的nc格式文件使用panoply 软件打开的数据是： 第一个图解释： 以上就是使用代码生成的...就是数组长度，就是这个数组里面可以存放多少数据； 第二个图解释： 这个nc文件里面存放的使一个二维数组，里面有具体的值； 有多少个值，就是维度相乘 ，因为当前有两个维度X和Y； 通过第一个图可知X的值为...6，y的值为12 ，所以，这个nc文件 里面会存放 6*12=72 个数据；通过第二个图可知，一共72个 数据； X的值为6，代表x这个数组，里面可以存放6个数据，那么存放 哪6个数据，从第二个图可以看到...//将虚拟数据写入文件。虽然netCDF支持//读取和写入数据的子集，但在本例中，我们在一个操作中写入所有//数据。...NetcdfFile dataFile = null; String filename = "D:\\格点数据\\nc\\simple_xy.nc"; // Open the
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