要总结ODPS下一个 写map / reduce 并进行购买预测过程. 首先这里的hadoop输入输出都是表的形式, 我们须要一张输入表和一张输出表....(略) 在ODPS中创建资源并执行 执行完毕 接下来就能够设计更复杂的模型来进银行预测 版权声明：本文博客原创文章。博客，未经同意，不得转载。
各种测序数据的分析流程都要对原始数据进行“标准化”，以符合下游分析的需求，单细胞数据也不例外。
如果r->out没有完全发送，则r->out指向未发送节点。 u->out_bufs回收： 调用ngx_chain_update_chains。...2）遍历u->busy_bufs，通过判断cl->buf的pos和last位置，确定该节点是否被发送。...对于已发送节点，将ngx_chain_t（ngx_buf_t未释放）放至u->free_bufs；对于已发送节点，保存在u->busy_bufs
添加参考资料帮助理解 重点推陈出新，如果原推文足够详细且我没遇到其他问题，可能会直接带过这篇学习推文，只在推文中展示结果，但是仍会告诉大家我看了啥，以便梳理小白学习路径 前面我们详细地分开学习了单细胞上游、下游...outputs下面的matrix文件夹，而报表在outputs下面的html文件夹 ---- 后面的代码，曾老师封装了脚本，感兴趣的同学可以去原文底下获取 我们这里简单了解每个封装起来的函数基本功能，继续分析 下游分析...可以发现也是我们之前学习的基本流程 初探单细胞下游 12.输出活跃标识(active.ident)的频数统计表格。 13.将整合和降维后的数据对象保存为RDS文件。...降维结果一块比较查看 ③可视化细胞的上述比例情况 ④使用COSG（Cell Marker Gene Identification）方法对给定数据集中的细胞组进行标记基因的识别 我们前面初探单细胞下游识别高变基因使用的是...这对于对细胞进行分组或分类非常有用，可以进一步进行聚类、差异表达分析和其他下游分析 我在分析代码时拿到分辨率为0.1的结果后，发现与当前 marker_cosg变量等其他包含分组信息变量，对不上，其实是因为在代码执行的过程中
outputs下面的matrix文件夹，而报表在outputs下面的html文件夹 ---- 后面的代码，曾老师封装了脚本，感兴趣的同学可以去原文底下获取 我们这里简单了解每个封装起来的函数基本功能，继续分析 下游分析...可以发现也是我们之前学习的基本流程 初探单细胞下游 12.输出活跃标识(active.ident)的频数统计表格。 13.将整合和降维后的数据对象保存为RDS文件。...降维结果一块比较查看 ③可视化细胞的上述比例情况 ④使用COSG（Cell Marker Gene Identification）方法对给定数据集中的细胞组进行标记基因的识别 我们前面初探单细胞下游识别高变基因使用的是...这对于对细胞进行分组或分类非常有用，可以进一步进行聚类、差异表达分析和其他下游分析 我在分析代码时拿到分辨率为0.1的结果后，发现与当前 marker_cosg变量等其他包含分组信息变量，对不上，其实是因为在代码执行的过程中
set odps.sql.joiner.instances=1000; //表示join 的并行度加到1000 SELECT count(*) FROM tbl_0 a JOIN tbl...第二次优化 重新分析两张表数据量，a 表数据量750w+, b 表数据量350w+， 在未做任何优化情况下数据是需要经过shuffle， 将相同的key分布到相同的节点上， 首先考虑使用mapjoin...对于这样的情况，普通的mapjoin 或者是sort-merge已经不适合了，需要尽可能的将key分散，分发到不同的节点去处理，因此使用随机前缀+扩容的方式处理。 什么是随机前缀+扩容？...对其中一张表数据量扩容n倍，另外一张表对join-key生成随机0~n的随机前缀数据，通过这种方式将join-key充分打散到下游不同的节点处理，以达到优化效果。...} } @Override public void close() throws UDFException { } } 然后重新执行SQL: set odps.sql.joiner.instances
RNAseq分析可以用hisat2+samtools+stringtie得到表达矩阵，后面可以通过edgeR + clusterprofiler分析。
#RSEM定量后直接生成FPKM，无需标准化#RNA-seq下游-1有些混乱，重新整理#与原文存在差异的原因是原文mRNA-seq要对注释gtf文件对进行过滤甲基化区域和polyA尾以及原文用的hg19...---title: "RNAseq-下游分析-2"output: html_documentdate: "2023-10-26"---R Markdown#RSEM定量后直接生成FPKM，无需标准化#RNA-seq...下游-1有些混乱，重新整理#与原文存在差异的原因是mRNA-seq要对gtf文件去database <- read.table(file = "D:/huage1/rnaseq1014/xiaohe/output.matrix
pearson:对离异值非常敏感，如果有一个值与正常值差很远会导致数据相关性很低，所以通常进行log处理之后再进行pearson分析。 pearson计算出的相...
jquery的节点操作说明 前面的篇章对于jquery的元素操作大部分是使用html()的方式来操作，这种直接使用字符串创建的方式也是性能最高的。...使用html()操作节点 首先编写一个div包含一个a标签，如下： ? 下面来给这个a的后面加上一个span标签看看，如下： ?...另外还有其他创建节点、插入节点、删除节点的方法，如下： var $div2 = $('这是一个div元素'); # 创建节点 append() appendTo() #在现存元素的内部...在现存元素的内部，从前面插入元素 after() insertAfter() #在现存元素的外部，从后面插入元素 before() insertBefore() #在现存元素的外部，从前面插入元素 创建节点...// 删除节点 $('a').remove();
背景 2022年上半年期间，全球虚拟世界相关的应用已获得1.7亿下载，其中游戏应用下载量高达1.1亿，占比67.3%。虚拟世界的爆发式发展也带来了游戏行业的改变...
, file = "step4_design.Rdata") } 取MAD前2W转录本进行： 可以发现MRgreen模块与表型关联很强 可以进一步找hub，这里就直接看看作者的网络中的34个节点在不在这...hgnc_symbol] [1] "NFIX" "EPB41" "TCF4" "IFNGR1" "RNASEH2B" 虽然我们只取MAD前2W转录本进行WGCNA，发现作者的mRNA节点中只有..."SUPT20H" "UBA52" 所以无论是共表达网络、PPI还是WGCNA都是我们寻找hub gene进行narrow down的手段 ---- 以上就是初探mRNA、lncRNA联合分析下游的全部内容
Github网址 https://xiayh17.top/RNAseqStat/index.html 简单来说"RNAseqStat"是用来对RNAseq上游分析得到的表达矩阵进行下游分析，只需要将表达矩阵整理成示例数据的格式...，一行代码即可跑通下游分析。
像我们经常说的『上下游』便是经常发生混淆的一对名词。 以前，我经常说『梳理一下我们依赖的下游』，后来发现这种说法是错误的。正确的是：梳理一下我们依赖的上游。 是不是听着很奇怪？...对于互联网服务用户而言，数据沿着源头、上游、下游，一直流到用户的设备上。源头可能是数据库，上游可能是后端服务、下游可能是 gateway。...对于某个微服务的 owner 也一样：你的服务做的事就是从上游获取某项数据，然后经过一些加工处理，吐出加工后的数据，数据会流向下游。...我们记住这张图就可以了： 上面这张图来自这篇文章[1]，文中介绍了好几种 downstream/upstream，但对于后端研发来说，弄清服务调用间的上下游就足够了。...最后，在有可能要频繁说起上下游的场合，一定要先和大家约定好名词的定义。这时用 upstream、downstream 可能会更好一些；或者改叫调用方、被调用方也很清晰。
08.19自我总结 js|jq获取兄弟节点,父节点,子节点 一.js var parent = test.parentNode; // 父节点 var chils = test.childNodes;...// 全部子节点 var first = test.firstChild; // 第一个子节点 var last = test.lastChile; // 最后一个子节点 var previous =...; // 父节点元素 var first = test.firstElementChild; // 第一个子节点元素 var last = test.lastElementChile; // 最后一个子节点...注意操作父来控制子必须给子元素赋予一个变量 二.jq $("#test1").parent(); // 父节点 $("#test1").parents(); // 全部父节点 $("#test1")....").prevAll(); // 之前所有兄弟节点 $("#test1").next(); // 下一个兄弟节点 $("#test1").nextAll(); // 之后所有兄弟节点 $("#test1
1、jquery 获取元素(父节点,子节点,兄弟节点) $("#test1").parent(); // 父节点 $("#test1").parents(); // 全部父节点 $("#test1")....parents(".mui-content"); $("#test").children(); // 全部子节点 $("#test").children("#test1"); $("#test").contents...(); // 返回#test里面的所有内容，包括节点和文本 $("#test").contents("#test1"); $("#test1").prev(); // 上一个兄弟节点 $("#test1...").prevAll(); // 之前所有兄弟节点 $("#test1").next(); // 下一个兄弟节点 $("#test1").nextAll(); // 之后所有兄弟节点 $("#test1...").siblings(); // 所有兄弟节点 $("#test1").siblings("#test2"); $("#test").find("#test1"); 2、元素筛选 // 以下方法都返回一个新的
前言 上一篇文章 我用休眠做并发控制，搞垮了下游服务 发出去后得到不少网友的回应，有人问自己平时用的方案行不行，有人建议借鉴TCP的拥塞控制策略，动态地调整发起的并发数，还有人问为啥我要管下游抗不抗得住...今天我就来总结几种调用下游服务时做并发控制的方案。...因为我们这篇文章是科普向的文章，主要目的是总结一下应该怎么在享受并发带来效率提升的同时做好并发控制让整个系统的上下游都能更稳定一些，不对限流、控制到底该哪个服务加，出了事故谁负责做讨论。...并发控制方案 前面我们提到用休眠做并发控制的最大弊端是，没有考虑下游服务的感受，每次开固定数量的goroutine 去执行任务后，调用者休眠 1s 再来，而不是等待下游服务的反馈再开启下一批任务执行。...所以我们应该从等待下游反馈和请求分配尽量均匀两个角度去做并发控制，当然实际项目中应该是两方面结合才行。
本地论文 3D RNA seq a powerful and flexible tool for rapid and accurate differential...
学习完snakemake后写的第一个流程是RNA-seq上游定量和下游的质控和差异分析。
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
