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GENE ONTOLOGY-基因本体功能查询数据库

所以今天就来了解一下鼎鼎大名的GO ONTOLOGY数据库:Gene Ontology Resource: http://geneontology.org/ 背景数据集介绍 GO ONTOLOGY是一个基于已经发表的的研究结果...GO ONTOLOGY将物种中基因的功能分成了三个部分:分子功能 (Molecular Function, MF);细胞组分 (Cellular Component, CC);生物过程 (Biological...比如「细胞周期调控」这个条目就属于「细胞周期」的大条目当中 ---- 数据库使用 在GO ONTOLOGY中,可以直接输入想要检索的内容 (某一个关键词或者基因名)。...同样可以进行筛选 ---- 总的来说 以上就是关于GO ONTOLOGY数据库的主要介绍。通过对GO ONTOLOGY的介绍,首先可以了解关于BP,CC以及MF的具体信息。

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本体网络Ontology Zero入选国家工信部区块链开源项目计划

新一代分布式链网体系“本体网络”的许可链开源项目Ontology Zero入选国家工信部区块链开源项目计划,将助力国家区块链技术与产业发展。...本体网络的开源许可链项目Ontology Zero,于近日正式纳入工信部“分布式应用账本”(DAppLedger)进行孵化。...Ontology Zero是本体网络面向企业级,开源、自主、可控、可配置的分布式账本技术框架,以开放心态链接各类区块链底层技术解决方案,标准化行业解决方案提供Dapp As a Service (DAAS...Ontology Zero经由万达网络、分布科技、复星金服等4家成员单位发起入驻孵化,项目代码与国外开源项目重合度低于5%,自主可控程度名列前茅,已有超过 50名社区成员向本体项目开展了700多次的代码贡献...重要通知 本体网络(Ontology Network)开启“邮件订阅”! 您将第一时间获得本体网络的重要公告和新闻!

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本体技术视点 | Wasm重磅登陆Ontology主网!Wasm合约开发必读入门教程(4)

而就在本体 Ontology 2.0 发布前夕,Ontology v1.8.0于10月29日重磅发布。经过数月在测试网上的稳定运行,Wasm 功能也正式登陆了主网。...在往期的技术视点中,我们已推出多部 Ontology Wasm 相关教程,社区伙伴们纷纷表示受益匪浅。本期我们将介绍如何基于 Wasm合约使用 Runtime API,相信你会有所收获。...图 | 网络 Runtime API 简述 Ontology Wasm 合约开发工具库 ontology-wasm-cdt-rust 里面 Runtime 模块封装了合约与 Ontology 链交互的...Ontology 率先支持 Wasm 合约将会大大提高混合虚拟机的性能,也将吸引众多不同语言的技术开发者加入本体社区,共同推进区块链技术的研发,丰富本体强大的技术生态。...同时,基于本体强大的技术研发团队,也可将现有的优秀技术整合到本体生态上来,为合约开发者增加更多选项。欢迎各位技术伙伴与我们共同前行!

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>>人工智能:知识图谱基础知识

本体知识图谱 本体就是对那些可能相对于某一智能体(agent)或智能体群体而存在的概念和关系的一种描述。 ​ ——汤姆·格鲁伯——《迈向知识共享型本体的设计原则》。 ​...——王昊奋老师 本体ontology)主要应用于:人工智能、语义网、软件工程、 生物医学信息学、图书馆学以及信息架构。...本体从分类上来说,分为: 领域本体 domain ontology或者说domain-specific ontology,即领域特异性本体。 所建模的是某个特定领域。...如医学领域的氨基酸本体(Amino Acid Ontology)、细胞周期本体(Cell-Cycle Ontology,CCO)、疾病本体(Disease Ontology)等。...上层本体 ​ upper ontology或者说foundation ontology,即基础本体。 指一种由那些在各种各样的领域本体之中都普遍适用的共同对象所构成的模型。

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本体发布领先智能合约虚拟机Ontology Wasm-JIT,实现全网最高速度与性能

近日,新一代公有基础链 & 分布式信任协作平台——本体Ontology)在其最新底层版本 Ontology 2.0 中推出了全球执行速度最快的区块链 Wasm 虚拟机 Ontology Wasm-JIT...与同样采用高速 Wasm 的 EOS 公链相比,Ontology Wasm-JIT 在性能上展现出领先优势。 下表展示的是基于 Ontology 和 EOS 开源代码虚拟机上的同环境测试。...由于 EOS 无 gas 收费模式,本次测试基于 Ontology 无需计费的版本进行。...开发者在使用 Ontology 各项技术时能够在更短时间内获得更高性能,大大提升开发效率。 Ontology Wasm-JIT 和解析执行版本完全兼容,对开发者是透明且友好,无需投入任何新的学习成本。...目前,Ontology Wasm-JIT 已经上线本体测试网,开发者可以便捷进行体验。

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本体技术视点 | 关于本体EVM合约开发,你必须知道的事(四)

上一期,我们展开了本体 EVM 合约开发流程演示。相信大家已经跃跃欲试,计划在本体上搭建自己的去中心化应用了。...那这一期,我们就直接为您提供一系列 Web3 API 参考,并手把手地指导您使用 Ontology Bridge 本体跨链桥,希望您在阅读完这一系列教程后,能够真正实现“活学活用”。...第五部分 Web3 API 参考 由于以太坊与本体交易的结构体和存储结构存在差异,目前本体只支持了以下 RPC 接口。...6.2 ONG 在 Ethereum 账户地址和 Ontology 账户地址的互换 ONG 可以同时存在于本体账户地址(A 开头地址)和以太坊账户地址(0x 开头地址)。...添加本体小姐姐微信(ontology_2020)并备注【技术】可进行技术探讨或加入社群。 ▿点击阅读原文查看往期精彩

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主网三周年特辑 | 全面兼容以太坊生态的Ontology EVM亮相

早在今年伊始,本体技术团队开始了本体版本 EVM 的研发。在已有的三种多虚拟机(NeoVM、Native 和 Wasm)的基础上,增加最具有广泛适用性的 EVM(以太坊虚拟机)。...时值本体主网上线三周年之际,我们宣布 Ontology EVM 开发完成,现有版本新增以太坊账户体系、以太交易类型和 Web 3 API 等,同时对虚拟机层和交易池等进行优化增强,并对区块链浏览器进行同步更新...Ontology EVM 设计的目标是尽可能地保证本体和以太坊平台的无缝衔接,并不是照搬或雷同,而是做到高度一致,从而显著降低开发者的迁移成本,同时避免对本体平台本身的较大程度的更改,使得生态发展具备连贯性...目前,Ontology 合约开发具备多项领先优势: 合约支持:提供包含4种合约(NeoVM、Native、Wasm、EVM)的 Multi-VM,属行业前列; 费率 & 速度:用户在本体链上即可体验 Ethereum...图 | 网络 本体技术团队将在 Ontology EVM 底层功能基本完备的前提下,进行更多 Ethereum 工具链的兼容性测试和增强,进一步满足数据可信交互的需求,为开发者和用户带来更加便捷与高效的使用体验

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本体节点现已登陆Libra协会创始成员Bison Trails的基础设施平台

为企业提供无缝部署本体节点的高效体验 近日,本体北斗节点基础设施已集成至专注于 IaaS (Infrastructure as a Service)服务的 Bison Trails 平台。...Bison Trails 和 Ontology 的合作奠定了实现这一目标的基础。” 目前,本体在全球拥有40多个北斗节点,其中包括11个共识节点。...对于本次合作,本体创始人李俊表示:“与很多项目不同的是,本体从一开始就专注于企业解决方案和实体产业的部署,并在2018年正式发布了主网。...对此,Accomplice 合伙人 Ash Egan 表示:“我们很高兴成为 Bison Trails 和 Ontology 节点基础设施解决方案的首位客户,期待看到 Ontology 和 Bison...了解更多 Bison Trails 与本体集成的信息,请访问:https://bisontrails.co/ontology/ 关于 Bison Trails Bison Trails 总部位于纽约,是一家专注于区块链领域的领先

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本体入门(一):本体构建 101

本文旨在介绍本体的基本概念和通用构建方法。 1 为什么构建本体?...我们要用这个本体来干什么? 本体中的信息应该为何种类型的问题提供答案? 谁将来使用并维护本体?...在确定了本体的基本范围后,一种确定本体具体范围的方法是,列出一系列本体应该能够回答的问题,这些问题被称为 competency questions,其专注于本体所涉及的领域,但也不用过于具体,我们将用这些问题来对已完成的本体进行测试...第二步 考虑重用现有的本体 在从头开始构建本体之前,最好先调研是否有相关的本体已经被构建出来了。我们可以基于这些本体进行进一步的改进和扩展。...7 结语 本文简单介绍了如何构建一个本体,最重要的信息是:任何领域都没有单一的正确本体。构建本体是一个创造性的过程,本体的质量只能通过实际应用来评价。

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Cell Ontology:解析细胞类型新维度

这就像基因的命名和功能一样,于是我们开发出了一套本体论(Ontology):GO(Gene Ontology )。...显然是可以的,也是必要的,今天运来小哥哥就拉着你来看看细胞本体论:Cell Ontology。...细胞周期本体 细胞周期本体(The Cell Cycle Ontology, http://www.CellCycleOntology.org)是一个应用程序本体,它自动捕获和集成关于细胞周期过程的详细知识...我们使用本体论(Ontology)来表示概念领域中使用的术语的系统组织。细胞本体(Cell Ontology)是一种图形化的数据结构,将精心注释的术语作为节点,并按照惯例定义术语之间的语义关系作为边。.../cl.html [11] Gene Ontology overview: http://geneontology.org/docs/ontology-documentation/ [12] Cell

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4种通过LLM进行文本知识图谱的构建方法对比介绍

在LLM提示中添加本体 在大多多情况下,我们希望使用非标准或自定义本体。LLM不太可能在这样的本体上进行预训练,因此我们需要在提示中包含完整的本体。...Use the properties and classes in the schema1: ontology....使用本体进行微调 前两种方法的主要问题是局限于预训练的本体,或者在提示中包含自定义本体时开销很大。...I want to fine-tune an LLM on this Schema1 ontology....改进微调的提示 通常情况下,单个本体/模式不足以捕获文本的完整语义,所以需要使用两个或更多本体。这里的一个好消息是经过微调,LLM并没有忘记预训练的本体,所以我们可以将它们结合使用。

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开源 | 谷歌开放大规模音频数据集 AudioSet,加速音频识别研究

项目地址:https://github.com/audioset/ontology AudioSet 包含了 632 类的音频类别以及 2084320 条人工标记的每段 10 秒长度的声音剪辑片段(片段来自...音频本体 (ontology) 被确定为事件类别的一张层级图,覆盖大范围的人类与动物声音、乐器与音乐流派声音、日常的环境声音。 ?...在我们的音频本体中,得到的数据集在音频事件类上有极好的覆盖。 ? 图:每类别样本的数量 在我们 ICASSP 2017 论文中音频本体和数据集的构建有更加具体的描述。...你可以在我们 GitHub 知识库中为音频本体作更多补充。...ICASSP 2017 大会上: 论文:Audio Set: An ontology and human-labeled dataset for audio events ?

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语义Web,Web3流派一--Web3简析系列之(2)

Web Language 本体网络语言 SKOS(Simple Knowledge Organization System)简单知识组织系统 这里,Ontology本体本体论)的概念很抽象,下面稍作解释...1.2 Ontology本体本体论) 简单地说,本体Ontology是格式规范的、对客观实体本质的抽象描述, 是对某一领域可共享的、通用的理解,其目标是使知识能够在人与人之间、人和系统之间、以及各种异构系统之间进行广泛的交流...在语义网中,Ontology可以起到如下的作用: (1)本体可以在不同的建模方法、范式、语言和软件工具之间进行翻译和映射,以实现不同系统之间的互操作和继承。 (2)从功能上来讲,本体和数据库有些相似。...但是本体比数据库表达的知识丰富得多。首先,定义本体的语言,在词法和语义上都比数据库所能表示的信息丰富得多;最重要的,本体提供的是一个领域严谨丰富的理论,而不单单是一个存放数据的结构。...(Ontology)分析互联网上的所有数据,允许机器在没有人工干预的情况下处理许多任务,语义网是关于数据集成的。

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本体入门(二):OWL 本体构建指南f

1 OWL 本体简介 OWL 是由 W3C 开发的一种本体描述语言,按照表达性可以被分为三类: OWL-Lite:可表达性最低 OWL-DL:可表达性中等(本指南使用) OWL-Full:可表达性最高...OWL 本体的组件与 Protege 框架下的本体组件相对应,包括: Individuals:对应 Instances Properties:对应 Slots Classes:对应 Classes 1.1...2 构建一个 OWL 本体 本章节以创建一个披萨本体为例,介绍如何通过 protoge 构建一个 OWL 本体。...2.1 创建本体 File -> New 新建一个本体,修改其 IRI(每个本体唯一): ? 以 OWL 形式保存为 "pizza.owl": ? 在 Annotation 中可以添加评论: ?...断言本体(手工创建)和推理本体如下图所示: ? 2.12 值分割 本章节我们将介绍值分割(Value Partitions),它并不是 OWL 的特性,而是一种本体构建中的设计模式。

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