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ORCA做结构优化及轨迹查看

ORCA做结构优化的关键词非常简单,与Gaussian类似,直接写上opt即可,同样也可以使用opt freq的组合,在优化完结构之后进行频率计算。示例如下: !...ORCA没有官方的可视化程序可以观看优化轨迹。...其操作非常简单,只需将ORCA的输出文件拖入OfakeG打开后的界面,即可生成一个fake的Gaussian输出文件,具体介绍可参看卢老师的帖子: http://sobereva.com/498 ORCA...的结构优化功能并没有高斯强大,但是ORCA在RI近似方面却比高斯做得要好,对于大体系,在ORCA中使用纯泛函加RI近似,计算速度是非常快的。...可以将ORCA的能量和力传给Gaussian进行结构优化,具体可参看《使用external关键词将其他程序与高斯对接进行结构优化、IRC分析等计算》一文。

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ORCA做DLPNO-CCSD(T)计算

在我们平时的计算中,需要用高精度方法的电子能量时,如果体系较大,无法做标准CCSD(T)计算,可以考虑使用ORCA的DLPNO-CCSD(T)方法。 在J. Chem....ORCA中DLPNO-CCSD(T)的输入文件书写很简单: %pal nprocs 16 end !...如果体系很大,也可以配合ORCA的RIJK或RIJCOSX近似来加快Hartree-Fock计算,此时的关键词分别为: !...而不使用SC近似,对(T)部分进行迭代求解,这部分功能在ORCA中应该写为DLPNO-CCSD(T1),这样结果与标准CCSD(T)更为接近。在J. Chem....注意:似乎ORCA无法设置临时文件存放的目录,实际运行中临时文件产生在工作目录,因此,为了获得更好的性能,建议将DLPNO-CCSD(T)作业放到高速硬盘上提交。

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rpm linux安装(linux安装mysql)

linux下,如何安装rpm命令? 更新时间:2019-05-20 07:50 最满意答案 rpm默认就安装在了发行版本里,比如RedHat和centos。...RPM是一种用于互联网下载包的打包及安装工具,它包含在某些Linux分发版中。它生成具有.RPM扩展名的文件。与Dpkg类似。 RPM文件在Linux系统中的安装最为简便。...RPM是一种用于互联网下载包的打包及安装工具,它包含在某些Linux分发版中。它生成具有.RPM扩展名的文件。与Dpkg类似。 RPM文件在Linux系统中的安装最为简便。...RPM是一种用于互联网下载包的打包及安装工具,它包含在某些Linux分发版中。它生成具有.RPM扩展名的文件。与Dpkg类似。 RPM文件在Linux系统中的安装最为简便。...rpm软件包的信息 2 查询rpm软件包安装文件的信息 3 安装rpm软件包到当前linux系统 4 从linux系统中卸载已安装的rpm软件包 5 升级当前linux系统的rpm软件包 (1)#rpm

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利用MOKIT从ORCA向其他量化程序传轨道

本文介绍如何使用MOKIT从ORCA向其他量化程序传轨道,有以下可能的用途: (1)在ORCA中进行了RIJK或RIJCOSX加速的大体系HF/DFT计算,想传轨道给其他程序进行后续计算,或想产生fch...用ORCA算完后运行orca_2mkl h2o -mkl转化生成h2o.mkl文件,下面我们以该文件为例展示如何传轨道,读者若使用本文功能,请务必顺带阅读文末注意事项。 1....对于ORCA产生的.mp2nat,.mdci.nat和.nbo这些实际上是gbw格式的文件,转化成mkl文件前除了修改文件名外,还有一种办法 orca_2mkl h2o.mp2nat h2o_mp2no.mkl...mkl文件有个缺点是不含赝势信息,笔者曾在ORCA官方论坛上发帖建议未来ORCA在mkl文件中增加赝势信息,但ORCA开发者表示目前没兴趣。...我们用ZnMe2_o.inp文件在ORCA中做目标计算,最后把轨道传回已存在的fch文件 orca_2mkl ZnMe2_o -mkl # 假设ZnMe2_o.gbw已被更新,重新产生mkl cp

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Linux安装jdk步骤_jdk linux安装

Linux的使用相信大家都要用到java吧!...在使用java前我们得先安装jdk以及配置环境变量等工作;下面小编给大家分享关于Linux安装jdk的详细步骤: 一、登录虚拟机进入终端切换到root用户,输入:su 接着输入密码 再输入:cd … 回到...root用户 二、查看Linux系统是否有自带的jdk: 1、输入:java -version 2、发现有输入:rpm -qa | grep java 检测jdk的安装包,(注意:rpm命令符没有时记得下载一个输入...六、下载完后用FileZilla文件传输器,把jdk安装包传到虚拟机对应的文件夹当中;或者直接在Linux下载即可 七、在终端进入对应的文件的目录,进一步解压,输入tar -zxvf...、输入:javac 3、输入:java 到此Linux安装jdk就完成啦!

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Linux 安装nodejs_pe安装linux

linux安装Node.js(详细)Node.js安装教程 文章目录 linux安装Node.js(详细)Node.js安装教程 1:下载 2:解压 3:移动目录 1:创建目录 2:移动目录并重命名 4...:设置环境变量 5:刷新修改 6:安装完成,查看版本号 1:下载 wget https://nodejs.org/dist/v14.17.4/node-v14.17.4-linux-x64.tar.xz...更多版本选择: ===》更多nodejs版本下载 2:解压 tar xf node-v14.17.4-linux-x64.tar.xz 可以查看当前目录下的文件,执行:ls (命令) 解压成功后可以选择删除压缩包...:rm -rf node-v14.17.4-linux-x64.tar.xz 其中:-f 会提醒是否删除 ;-rf 会强制删除,不会提醒。...5:刷新修改 source /etc/profile 6:安装完成,查看版本号 node版本号: node -v npm版本号: npm -v 注意:配合pm2使用npm可以让程序在后台运行。

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ORCA计算旋轨耦合矩阵元

在常见的量子化学程序中,能在TD-DFT级别下进行旋轨耦合计算的程序有ADF、BDF、Dalton和ORCA等。此外,用Gaussian结合PySOC程序也可以实现SOC的计算。...本文以ORCA 5.0.1为例介绍旋轨耦合矩阵元的计算。 二、计算实例1 体系一来自文献Chem. Sci., 2019, 10, 5031–5038一文中的mBrPhCz分子,分子结构如下: ?...在%tddft区域内设置TD-DFT计算的相关参数:nroots表示计算6个激发态;dosoc设为true表示计算旋轨耦合,并且此时会自动计算三重态;ORCA中TD-DFT默认使用TDA近似,此处将tda...对RI不了解的读者可阅读往期文章《在ORCA的SCF计算中使用RI近似》。...四、小结 本文简单介绍了用ORCA计算SOC矩阵元的方法,希望对大家的研究有帮助。目前不少论文中对ISC过程还仅仅是拿能量接近来说事,显然是不太够的,用SOC更有说服力。

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Orca: A Modular Query Optimizer Architecture for Big Data(翻译)

ORCA 架构 Orca是Pivotal数据管理产品(包括GPDB和HAWQ)的新查询优化器。Orca是基于Cascades优化框架[13]的现代自顶向下查询优化器。...DXL的一个主要优点是将Orca打包为一个独立的产品。图片图2显示了Orca与外部数据库系统之间的交互。Orca的输入是一个DXL查询。Orca的输出是一个DXL计划。...这些转换器的实现完全在Orca之外进行,这使得多个系统可以通过提供适当的转换器来使用Orca。图片Orca的架构具有高度的可扩展性;所有组件都可以单独替换并单独配置。图3显示了Orca的不同组件。...操作系统为Red Hat Enterprise Linux 5.5。 我们安装了两个隔离的GPDB相同版本的实例(一个使用Orca,另一个使用Planner)。...操作系统为Red Hat Enterprise Linux 6.2。

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安装linux的基本步骤_linux安装oracle

文章目录 一、下载Python包 二、安装依赖环境 三、安装Python3 四、建立Python3和pip3的软链 五、检查是否安装成功 ---- 【Python测试交流群:8140 78962】 --...所以这里建议通过国内镜像进行下载 例如:淘宝镜像 http://npm.taobao.org/mirrors/python/ ---- 大部分版本和各系统包都提供,这里的教程用Python3.9.6来举例: 1)Linux...可以通过wget命令进行下载(在任意目录执行下面的命令,如果找提示找不到wget可以使用yum -y install wget进行安装): wget http://npm.taobao.org/mirrors.../python/3.9.6/Python-3.9.6.tgz ---- 2)如果没有wget又不想额外安装的话可以先通过网页下载到本地,然后上传到Linux服务器: ---- 二、安装依赖环境 1...gcc:yum install gcc 3.Python3.7版本之后需要安装libffi-devel:yum install libffi-devel -y ---- 三、安装Python3 1.创建

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linux安装opencv_linux安装pycharm

二、下载RabbitMQ所需要的安装包,即Erlang 和 RabbitMQ 1、RabbitMQ是Erlang语言编写的,所以在安装RabbitMQ之前,需要先安装Erlang。...RabbitMQ downloads链接并点击,进入到RabbitMQ的下载页面 6、在右边的In This Section 下找到 Install:Generic binary build下载链接并点击,进入到Linux...Download下的 rabbitmq-server-generic-unix-3.7.16.tar.xz下载链接并点击,开始进行下载RabbitMQ 三、把下载好的RabbitMQ 和 Erlang上传到Linux...服务器上 1、打开WinSCP,把我们下载好的RabbitMQ 和 Erlang安装包,上传到Linux的 /mnt/ 文件目录下 2、使用putty连接到我们的Linux服务器,进入到/mnt/ 文件目录中...PID file not written; -detached was passed. 5、在浏览器的地址栏中输入你 服务器的ip地址:15672,即可访问RabbitMQ的管理登录界面,例如我的Linux

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